4l1m

Structure of the first RCC1-like domain of HERC2

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E3 ubiquitin-protein ligase HERC2

Homo sapiens

UniProt O95714

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 417–790 未记录 SO4 SULFATE ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 9 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;291 K;1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-hydrochloride, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 291K 分辨率 2.60 Å R-free 0.238
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 417–790 未记录 SO4 SULFATE ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 12 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;291 K;1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-hydrochloride, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 291K 分辨率 2.60 Å R-free 0.238
3 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 417–790 未记录 SO4 SULFATE ION × 3 UNX UNKNOWN LIGAND × 13 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;291 K;1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-hydrochloride, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 291K 分辨率 2.60 Å R-free 0.238

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 14 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HERC2_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 19–392; UniProt 417–790 作者链 B; PDB构建体 19–392; UniProt 417–790 作者链 C; PDB构建体 19–392; UniProt 417–790

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4l1m
沉积日期 deposition_date2013-06-03
结构标题 titleStructure of the first RCC1-like domain of HERC2
关键词 keywordsRCC1, RLD, beta-propeller, HERC2, Structural Genomics Consortium, SGC, LIGASE; LIGASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id4l1mA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Regulator of chromosome condensation 1/beta-lactamase-inhibitor protein II
结构域编号 domain_id4l1mB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Regulator of chromosome condensation 1/beta-lactamase-inhibitor protein II
结构域编号 domain_id4l1mC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Regulator of chromosome condensation 1/beta-lactamase-inhibitor protein II

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (0)