Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | HEME C × 1 SULFATE ION × 4 TERTIARY-BUTYL ALCOHOL × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | HEME C × 1 SULFATE ION × 4 TERTIARY-BUTYL ALCOHOL × 2 GLYCEROL × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | CYC1_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–108； UniProt 2–109 作者链 B； PDB构建体 1–108； UniProt 2–109 |
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| 条目编号 entry_id | 4mu8 |
| 沉积日期 deposition_date | 2013-09-20 |
| 结构标题 title | Crystal structure of an oxidized form of yeast iso-1-cytochrome c at pH 8.8 |
| 关键词 keywords | ;oxidized form at pH 8.8, All alpha proteins, cytochrome C, electron carrier, Peroxidase Activity, HEME Binding, mitochondria, ELECTRON TRANSPORT ;; ELECTRON TRANSPORT |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 14.43 Å |
| Rg（电子密度） | 12.93 Å |
| 总 Rg | 14.48 Å |
| 原子数 | 1728 |
| 残基数 | 107 |
| 排除体积 | 16003 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4mu8a_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.3 — Cytochrome c |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.3.1 — Cytochrome c |
| 家族 Family family | a.3.1.1 — monodomain cytochrome c |
| 结构域编号 domain_id | d4mu8b_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.3 — Cytochrome c |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.3.1 — Cytochrome c |
| 家族 Family family | a.3.1.1 — monodomain cytochrome c |
| 结构域编号 domain_id | 4mu8A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Cytochrome c-like domain |
| 结构域编号 domain_id | 4mu8B00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Cytochrome c-like domain |