Mammalian orthoreovirus 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 6 | Junctional adhesion molecule A × 3 （Q9Y624） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SIGM1_REOVL |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–165； UniProt 308–470 作者链 B； PDB构建体 3–165； UniProt 308–470 作者链 C； PDB构建体 3–165； UniProt 308–470 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 6 | Outer capsid protein sigma-1 × 3 （P04506） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | JAM1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 D； PDB构建体 3–104； UniProt 28–129 作者链 E； PDB构建体 3–104； UniProt 28–129 作者链 F； PDB构建体 3–104； UniProt 28–129 |
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| 条目编号 entry_id | 4odb |
| 沉积日期 deposition_date | 2014-01-10 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the T1L reovirus attachment protein sigma1 in complex with Junctional Adhesion Molecule-A |
| 关键词 keywords | ;immunoglobulin fold, greek key motif, beta spiral, viral attachment protein, capsid protein, viral receptor, cell adhesion molecule, VIRAL PROTEIN ;; VIRAL PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 30.23 Å |
| Rg（电子密度） | 29.41 Å |
| 总 Rg | 30.10 Å |
| 原子数 | 6276 |
| 残基数 | 792 |
| 排除体积 | 110960 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4odbA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 90 — Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Virus attachment protein , globular domain |
| 结构域编号 domain_id | 4odbB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 90 — Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Virus attachment protein , globular domain |
| 结构域编号 domain_id | 4odbC00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 90 — Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Virus attachment protein , globular domain |
| 结构域编号 domain_id | 4odbD00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Immunoglobulins |
| 结构域编号 domain_id | 4odbE00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Immunoglobulins |
| 结构域编号 domain_id | 4odbF00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Immunoglobulins |