Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 6 | FE (II) ION × 6 2-OXOGLUTARIC ACID × 6 GLYCEROL × 2 (2S,5S)-7-oxo-1-azabicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylic acid × 4 water × 6 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | CARC_PECCC |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 21–293； UniProt 1–273 作者链 B； PDB构建体 21–293； UniProt 1–273 作者链 C； PDB构建体 21–293； UniProt 1–273 |
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| 条目编号 entry_id | 4oj8 |
| 沉积日期 deposition_date | 2014-01-20 |
| 结构标题 title | Crystal structure of carbapenem synthase in complex with (3S,5S)-carbapenam |
| 关键词 keywords | oxidoreductase, oxygenase, iron, 2-oxoglutaric acid, antibiotic biosynthesis, carbapenam; OXIDOREDUCTASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 36.24 Å |
| Rg（电子密度） | 35.03 Å |
| 总 Rg | 35.62 Å |
| 原子数 | 13160 |
| 残基数 | 1590 |
| 排除体积 | 233810 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4oj8a1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.82 — Double-stranded beta-helix |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.82.2 — Clavaminate synthase-like |
| 家族 Family family | b.82.2.8 — gamma-Butyrobetaine hydroxylase |
| 结构域编号 domain_id | d4oj8a2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d4oj8b1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.82 — Double-stranded beta-helix |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.82.2 — Clavaminate synthase-like |
| 家族 Family family | b.82.2.8 — gamma-Butyrobetaine hydroxylase |
| 结构域编号 domain_id | d4oj8b2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d4oj8c1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.82 — Double-stranded beta-helix |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.82.2 — Clavaminate synthase-like |
| 家族 Family family | b.82.2.8 — gamma-Butyrobetaine hydroxylase |
| 结构域编号 domain_id | d4oj8c2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 4oj8A00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — 4-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 130 — Double-stranded beta-helix |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Clavaminate synthase-like |
| 结构域编号 domain_id | 4oj8B00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — 4-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 130 — Double-stranded beta-helix |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Clavaminate synthase-like |
| 结构域编号 domain_id | 4oj8C00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — 4-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 130 — Double-stranded beta-helix |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Clavaminate synthase-like |