4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE
Pseudomonas putida
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–62 链 B; UniProt 1–62 链 C; UniProt 1–62 链 D; UniProt 1–62 链 E; UniProt 1–62 链 F; UniProt 1–62 | 未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7;pH 7.0 | 分辨率 2.75 Å R-free 0.266 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 | 链 G; UniProt 1–62 链 H; UniProt 1–62 链 I; UniProt 1–62 链 J; UniProt 1–62 链 K; UniProt 1–62 链 L; UniProt 1–62 | 未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7;pH 7.0 | 分辨率 2.75 Å R-free 0.266 |
| 3 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 | 链 M; UniProt 1–62 链 N; UniProt 1–62 链 O; UniProt 1–62 链 P; UniProt 1–62 链 Q; UniProt 1–62 链 R; UniProt 1–62 | 未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7;pH 7.0 | 分辨率 2.75 Å R-free 0.266 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 4OTA | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BJP CRYSTAL STRUCTURE OF 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE INACTIVATED BY 2-OXO-3-PENTYNOATE AT 2.4 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1998-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–62(62 aa)
链 B
1–62(62 aa)
|
未记录 | OXP 2-OXO-3-PENTENOIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.244 |
| 1BJP CRYSTAL STRUCTURE OF 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE INACTIVATED BY 2-OXO-3-PENTYNOATE AT 2.4 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1998-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–62(62 aa)
链 D
1–62(62 aa)
|
未记录 | OXP 2-OXO-3-PENTENOIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.244 |
| 1BJP CRYSTAL STRUCTURE OF 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE INACTIVATED BY 2-OXO-3-PENTYNOATE AT 2.4 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1998-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 E
1–62(62 aa)
|
未记录 | OXP 2-OXO-3-PENTENOIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.244 |
| 2FM7 Evolution of Enzymatic Activity in the Tautomerase Superfamily: Mechanistic and Structural Consequences of the L8R Mutation in 4-Oxalocrotonate Tautomerase 提交 2006-01-08 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–62(62 aa)
链 B
1–62(62 aa)
链 C
1–62(62 aa)
链 D
1–62(62 aa)
链 E
1–62(62 aa)
链 F
1–62(62 aa)
|
突变:L8R 突变:L8R 突变:L8R 突变:L8R 突变:L8R 突变:L8R | CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;3 microlitres of protein (20 mg/mL solution in 10 mM Tris-Cl, pH 7.0) mixed with an equal volume of reservoir buffer [30% O-(2-aminopropyl)-O-(2-methoxyethyl)polypropylene glycol 500, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid, pH 6.5, and 50 mM CsCl]. The resulting mixture was allowed to equilibrate against 50 microlitres of reservoir solution, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.301 |
| 2FM7 Evolution of Enzymatic Activity in the Tautomerase Superfamily: Mechanistic and Structural Consequences of the L8R Mutation in 4-Oxalocrotonate Tautomerase 提交 2006-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–62(62 aa)
链 B
1–62(62 aa)
|
突变:L8R 突变:L8R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;3 microlitres of protein (20 mg/mL solution in 10 mM Tris-Cl, pH 7.0) mixed with an equal volume of reservoir buffer [30% O-(2-aminopropyl)-O-(2-methoxyethyl)polypropylene glycol 500, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid, pH 6.5, and 50 mM CsCl]. The resulting mixture was allowed to equilibrate against 50 microlitres of reservoir solution, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.301 |
| 2FM7 Evolution of Enzymatic Activity in the Tautomerase Superfamily: Mechanistic and Structural Consequences of the L8R Mutation in 4-Oxalocrotonate Tautomerase 提交 2006-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 E
1–62(62 aa)
链 F
1–62(62 aa)
|
突变:L8R 突变:L8R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;3 microlitres of protein (20 mg/mL solution in 10 mM Tris-Cl, pH 7.0) mixed with an equal volume of reservoir buffer [30% O-(2-aminopropyl)-O-(2-methoxyethyl)polypropylene glycol 500, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid, pH 6.5, and 50 mM CsCl]. The resulting mixture was allowed to equilibrate against 50 microlitres of reservoir solution, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.301 |
| 2FM7 Evolution of Enzymatic Activity in the Tautomerase Superfamily: Mechanistic and Structural Consequences of the L8R Mutation in 4-Oxalocrotonate Tautomerase 提交 2006-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–62(62 aa)
链 B
1–62(62 aa)
|
突变:L8R 突变:L8R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;3 microlitres of protein (20 mg/mL solution in 10 mM Tris-Cl, pH 7.0) mixed with an equal volume of reservoir buffer [30% O-(2-aminopropyl)-O-(2-methoxyethyl)polypropylene glycol 500, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid, pH 6.5, and 50 mM CsCl]. The resulting mixture was allowed to equilibrate against 50 microlitres of reservoir solution, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.301 |
| 2FM7 Evolution of Enzymatic Activity in the Tautomerase Superfamily: Mechanistic and Structural Consequences of the L8R Mutation in 4-Oxalocrotonate Tautomerase 提交 2006-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
1–62(62 aa)
链 F
1–62(62 aa)
|
突变:L8R 突变:L8R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;3 microlitres of protein (20 mg/mL solution in 10 mM Tris-Cl, pH 7.0) mixed with an equal volume of reservoir buffer [30% O-(2-aminopropyl)-O-(2-methoxyethyl)polypropylene glycol 500, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid, pH 6.5, and 50 mM CsCl]. The resulting mixture was allowed to equilibrate against 50 microlitres of reservoir solution, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.301 |
| 2FM7 Evolution of Enzymatic Activity in the Tautomerase Superfamily: Mechanistic and Structural Consequences of the L8R Mutation in 4-Oxalocrotonate Tautomerase 提交 2006-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–62(62 aa)
链 D
1–62(62 aa)
|
突变:L8R 突变:L8R | CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;3 microlitres of protein (20 mg/mL solution in 10 mM Tris-Cl, pH 7.0) mixed with an equal volume of reservoir buffer [30% O-(2-aminopropyl)-O-(2-methoxyethyl)polypropylene glycol 500, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid, pH 6.5, and 50 mM CsCl]. The resulting mixture was allowed to equilibrate against 50 microlitres of reservoir solution, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.301 |
| 4OTB 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, RHOMBOHEDRAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–62(62 aa)
链 B
1–62(62 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.258 |
| 4OTB 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, RHOMBOHEDRAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–62(62 aa)
链 D
1–62(62 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.258 |
| 4OTB 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, RHOMBOHEDRAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 E
1–62(62 aa)
链 F
1–62(62 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.258 |
| 4OTB 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, RHOMBOHEDRAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 G
1–62(62 aa)
链 H
1–62(62 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.258 |
| 4OTB 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, RHOMBOHEDRAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 I
1–62(62 aa)
链 J
1–62(62 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.258 |
| 4OTB 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, RHOMBOHEDRAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 K
1–62(62 aa)
链 L
1–62(62 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.258 |
| 4OTC 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–62(62 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.265 |
| 4OTC 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–62(62 aa)
链 C
1–62(62 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.265 |
| 4OTC 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1–62(62 aa)
链 E
1–62(62 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.265 |
| 4OTC 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
1–62(62 aa)
链 G
1–62(62 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.265 |
| 4OTC 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 H
1–62(62 aa)
链 I
1–62(62 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.265 |
| 4OTC 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 B
1–62(62 aa)
链 C
1–62(62 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.265 |
| 4OTC 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 F
1–62(62 aa)
链 G
1–62(62 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.265 |
| 4OTC 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE OBSERVED AS AN OCTODECAMER, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1998-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 D
1–62(62 aa)
链 E
1–62(62 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.265 |
| 4X19 Crystal structure of native 4-OT from Pseudomonas putida mt-2 at 1.94 Angstrom 提交 2014-11-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 B
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 C
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 D
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 E
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 F
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
|
未记录 | NCO COBALT HEXAMMINE(III) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;Hexaamine cobalt chloride, Bis-Tris Propane, 20% PEG3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.289 |
| 4X19 Crystal structure of native 4-OT from Pseudomonas putida mt-2 at 1.94 Angstrom 提交 2014-11-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 G
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 H
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 I
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 J
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 K
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 L
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;Hexaamine cobalt chloride, Bis-Tris Propane, 20% PEG3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.289 |
| 4X19 Crystal structure of native 4-OT from Pseudomonas putida mt-2 at 1.94 Angstrom 提交 2014-11-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 M
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 N
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 O
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 P
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 Q
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 R
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;Hexaamine cobalt chloride, Bis-Tris Propane, 20% PEG3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.289 |
| 4X19 Crystal structure of native 4-OT from Pseudomonas putida mt-2 at 1.94 Angstrom 提交 2014-11-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 S
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 T
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 U
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 V
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 W
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 X
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;Hexaamine cobalt chloride, Bis-Tris Propane, 20% PEG3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.289 |
| 4X19 Crystal structure of native 4-OT from Pseudomonas putida mt-2 at 1.94 Angstrom 提交 2014-11-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 Y
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 Z
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 a
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 b
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 c
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
链 d
2–63(62 aa)
片段:UNP residues 2-263
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;Hexaamine cobalt chloride, Bis-Tris Propane, 20% PEG3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.289 |
| 4X1C Crystal structure of 4-OT from Pseudomonas putida mt-2 with an enamine adduct on the N-terminal proline at 1.7 Angstrom resolution 提交 2014-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
2–63(62 aa)
链 B
2–63(62 aa)
链 C
2–63(62 aa)
链 D
2–63(62 aa)
链 E
2–63(62 aa)
链 F
2–63(62 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NCO COBALT HEXAMMINE(III) × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;Hexaamine cobalt chloride, Bis-Tris Propane, 20% PEG3350, co-crystallised with Acetaldehyde
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.227 |
| 4X1C Crystal structure of 4-OT from Pseudomonas putida mt-2 with an enamine adduct on the N-terminal proline at 1.7 Angstrom resolution 提交 2014-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 G
2–63(62 aa)
链 H
2–63(62 aa)
链 I
2–63(62 aa)
链 J
2–63(62 aa)
链 K
2–63(62 aa)
链 L
2–63(62 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;Hexaamine cobalt chloride, Bis-Tris Propane, 20% PEG3350, co-crystallised with Acetaldehyde
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.227 |
| 4X1C Crystal structure of 4-OT from Pseudomonas putida mt-2 with an enamine adduct on the N-terminal proline at 1.7 Angstrom resolution 提交 2014-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 M
2–63(62 aa)
链 N
2–63(62 aa)
链 O
2–63(62 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;Hexaamine cobalt chloride, Bis-Tris Propane, 20% PEG3350, co-crystallised with Acetaldehyde
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.227 |
| 5CLN Crystal structure of a 4-oxalocrotonate tautomerase mutant at 2.7 Angstrom 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 B
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 C
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 D
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 E
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 F
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
|
突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M sodium formate, 0.1 M Bis-Tris Propane, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.263 |
| 5CLN Crystal structure of a 4-oxalocrotonate tautomerase mutant at 2.7 Angstrom 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 G
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 H
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 I
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
|
突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M sodium formate, 0.1 M Bis-Tris Propane, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.263 |
| 5CLN Crystal structure of a 4-oxalocrotonate tautomerase mutant at 2.7 Angstrom 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 J
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 K
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 L
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
|
突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M sodium formate, 0.1 M Bis-Tris Propane, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.263 |
| 5CLN Crystal structure of a 4-oxalocrotonate tautomerase mutant at 2.7 Angstrom 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 J
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 K
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 L
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
|
突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M sodium formate, 0.1 M Bis-Tris Propane, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.263 |
| 5CLN Crystal structure of a 4-oxalocrotonate tautomerase mutant at 2.7 Angstrom 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 J
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 K
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
链 L
2–58(57 aa)
片段:UNP residues 2-58
|
突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M sodium formate, 0.1 M Bis-Tris Propane, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.263 |
| 5CLO Crystal structure of a 4-oxalocrotonate tautomerase mutant in complex with nitrostyrene at 2.3 Angstrom 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 B
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 C
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 D
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 E
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 F
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
|
突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1 M PCTP buffer, 25% PEG 1500, 5 mM nitrostyrene, 5 % (v/v) DMSO
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.276 |
| 5CLO Crystal structure of a 4-oxalocrotonate tautomerase mutant in complex with nitrostyrene at 2.3 Angstrom 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 G
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 H
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 I
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 J
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 K
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 L
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
|
突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1 M PCTP buffer, 25% PEG 1500, 5 mM nitrostyrene, 5 % (v/v) DMSO
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.276 |
| 5CLO Crystal structure of a 4-oxalocrotonate tautomerase mutant in complex with nitrostyrene at 2.3 Angstrom 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 M
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 N
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 O
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 P
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 Q
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
链 R
2–60(59 aa)
片段:UNP residues 2-60
|
突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A 突变:M45Y, F50A | NS8 trans beta nitrostyrene × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1 M PCTP buffer, 25% PEG 1500, 5 mM nitrostyrene, 5 % (v/v) DMSO
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.276 |
| 5TIG CRYSTAL STRUCTURE OF 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE INACTIVATED BY BrHPD 提交 2016-10-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
2–63(62 aa)
链 B
2–63(62 aa)
链 C
2–63(62 aa)
链 D
2–63(62 aa)
链 E
2–63(62 aa)
链 F
2–63(62 aa)
|
未记录 | 7DH (3E)-5-hydroxy-2-oxopent-3-enoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;100 mM TRIS, pH 8, with 17.5% PEG 4600 (w/v) and 0.1 M potassium acetate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
| 5TIG CRYSTAL STRUCTURE OF 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE INACTIVATED BY BrHPD 提交 2016-10-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 G
2–63(62 aa)
链 H
2–63(62 aa)
链 I
2–63(62 aa)
链 J
2–63(62 aa)
链 K
2–63(62 aa)
链 L
2–63(62 aa)
|
未记录 | 7DH (3E)-5-hydroxy-2-oxopent-3-enoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;100 mM TRIS, pH 8, with 17.5% PEG 4600 (w/v) and 0.1 M potassium acetate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
| 5TIG CRYSTAL STRUCTURE OF 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE INACTIVATED BY BrHPD 提交 2016-10-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 M
2–63(62 aa)
链 N
2–63(62 aa)
链 O
2–63(62 aa)
链 P
2–63(62 aa)
链 Q
2–63(62 aa)
链 R
2–63(62 aa)
|
未记录 | 7DH (3E)-5-hydroxy-2-oxopent-3-enoic acid × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;100 mM TRIS, pH 8, with 17.5% PEG 4600 (w/v) and 0.1 M potassium acetate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
| 5TIG CRYSTAL STRUCTURE OF 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE INACTIVATED BY BrHPD 提交 2016-10-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 S
2–63(62 aa)
链 T
2–63(62 aa)
链 U
2–63(62 aa)
链 V
2–63(62 aa)
链 W
2–63(62 aa)
链 X
2–63(62 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;100 mM TRIS, pH 8, with 17.5% PEG 4600 (w/v) and 0.1 M potassium acetate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
| 5TIG CRYSTAL STRUCTURE OF 4-OXALOCROTONATE TAUTOMERASE INACTIVATED BY BrHPD 提交 2016-10-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 Y
2–63(62 aa)
链 Z
2–63(62 aa)
链 a
2–63(62 aa)
链 b
2–63(62 aa)
链 c
2–63(62 aa)
链 d
2–63(62 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;100 mM TRIS, pH 8, with 17.5% PEG 4600 (w/v) and 0.1 M potassium acetate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 10 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 J
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 NO3 NITRATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 11 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 K
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 12 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 L
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 13 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 M
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 14 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 N
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 15 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 O
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 G
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 2 NO3 NITRATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 H
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 2 NO3 NITRATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6BGN Crystal Structure of 4-Oxalocrotonate Tautomerase After Incubation with 5-Fluoro-2-hydroxy-2,4-pentadienoate 提交 2017-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 9 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 I
2–61(60 aa)
|
未记录 | 6Y5 5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pentanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, with 20% PEG 4600 (w/v), and 0.1 M sodium nitrate
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.169 |
| 6FPS Crystal structure of 4-oxalocrotonate tautomerase triple mutant L8Y/M45Y/F50A 提交 2018-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
2–63(62 aa)
链 B
2–63(62 aa)
链 C
2–63(62 aa)
链 D
2–63(62 aa)
链 E
2–63(62 aa)
链 F
2–63(62 aa)
|
突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M bistris-propane HCl, pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 6FPS Crystal structure of 4-oxalocrotonate tautomerase triple mutant L8Y/M45Y/F50A 提交 2018-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 G
2–63(62 aa)
链 H
2–63(62 aa)
链 I
2–63(62 aa)
链 J
2–63(62 aa)
链 K
2–63(62 aa)
链 L
2–63(62 aa)
|
突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M bistris-propane HCl, pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 6FPS Crystal structure of 4-oxalocrotonate tautomerase triple mutant L8Y/M45Y/F50A 提交 2018-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 M
2–63(62 aa)
链 N
2–63(62 aa)
链 O
2–63(62 aa)
链 P
2–63(62 aa)
链 Q
2–63(62 aa)
链 R
2–63(62 aa)
|
突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A 突变:L8Y, M45Y, F50A | PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M bistris-propane HCl, pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 6GHW Substituting the prolines of 4-oxalocrotonate tautomerase with non-canonical analogue (2S)-3,4-dehydroproline 提交 2018-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
3–63(61 aa)
链 B
3–63(61 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;88% of 1-45 Morpheus condition (0.12M Alcohols, 0.1M Tris (base), BICINE pH 8.5, 50% v/v Precipitant mix composed of 40% v/v PEG 500 MME; 20 % w/v PEG 20000).
protein concentration 6 mg/ml n 0.1M PCTP buffer pH 7.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.320 |
| 6GHW Substituting the prolines of 4-oxalocrotonate tautomerase with non-canonical analogue (2S)-3,4-dehydroproline 提交 2018-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
3–63(61 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;88% of 1-45 Morpheus condition (0.12M Alcohols, 0.1M Tris (base), BICINE pH 8.5, 50% v/v Precipitant mix composed of 40% v/v PEG 500 MME; 20 % w/v PEG 20000).
protein concentration 6 mg/ml n 0.1M PCTP buffer pH 7.0
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分辨率 2.30 Å R-free 0.320 |
| 9HZI X-ray Crystallographic Structure of 4-OT (F11) in complex with 2-Hydroxycinnamaldehyde 提交 2025-01-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
2–63(62 aa)
链 B
2–63(62 aa)
链 C
2–63(62 aa)
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未记录 | A1IZH (1~{Z},2~{S})-1-[(~{E})-3-(2-hydroxyphenyl)prop-2-enylidene]-1$l^{4}-azolidine-2-carbaldehyde × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;Reservoir Volume = 500 microliter
Reservoir Composition
PEG 2000 (15%)
Urea (13 mM)
Bis-Tris pH 7.0 (0.1 M)
Drop Preparation
2-Hydroxycinnamaldehyde was saturated in 5mM KH2PO4 pH 7.3. 4-OT (F11) was diluted from the storage stock (104.6 mg/mL) to the working stock (16mg/mL) using the above saturated solution.
Drop Volume= 1microliter protein solution (protein in 5mM KH2PO4 pH 7.3 (16 mg/ml) + 1microliter precipitant solution
Drop Composition
PEG 2000 (7.5%)
Urea (6.5 mM)
Bis-Tris pH 7.0 (0.05 M)
Guanidine Hydrochloride (0.08 M)
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分辨率 2.27 Å R-free 0.275 |
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| UniProt名称 | 4OT1_PSEPU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 B; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 C; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 D; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 E; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 F; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 G; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 H; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 I; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 J; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 K; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 L; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 M; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 N; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 O; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 P; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 Q; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 作者链 R; PDB构建体 1–62; UniProt 1–62 |