H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain
Mus musculus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 22–299 | 片段:heavy chain, UNP residues 22-299 | Beta-2-microglobulin × 1 (P01887) Sendai virus nucleoprotein × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;sodium/potassium phosphate buffer 1.9M, MPD 1%, glycerol (cryoprotection) | 分辨率 2.70 Å R-free 0.259 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 4PGD | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BQH MURINE CD8AA ECTODOMAIN FRAGMENT IN COMPLEX WITH H-2KB/VSV8 提交 1998-08-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:ALPHA CHAIN
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;20-25% PEG 4K, 0.2M LI2SO4, 0.1M TRIS PH8.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |
| 1BQH MURINE CD8AA ECTODOMAIN FRAGMENT IN COMPLEX WITH H-2KB/VSV8 提交 1998-08-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 D
22–295(274 aa)
片段:ALPHA CHAIN
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;20-25% PEG 4K, 0.2M LI2SO4, 0.1M TRIS PH8.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |
| 1FO0 MURINE ALLOREACTIVE SCFV TCR-PEPTIDE-MHC CLASS I MOLECULE COMPLEX 提交 2000-08-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
22–296(275 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS (ALPHA1, ALPHA2, ALPHA3)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;PEG 6000 10% HEPES 0.1M PH 7.0
MGAC 0.25 M NACL 0.25M, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.276 |
| 1FZJ MHC CLASS I NATURAL MUTANT H-2KBM1 HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND VESICULAR STOMATITIS VIRUS NUCLEOPROTEIN 提交 2000-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
突变:A152E, Y155R, Y156L 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.4;290 K;K/Na phosphate, MPD, pH 6.40, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 1FZJ MHC CLASS I NATURAL MUTANT H-2KBM1 HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND VESICULAR STOMATITIS VIRUS NUCLEOPROTEIN 提交 2000-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
突变:A152E, Y155R, Y156L 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.4;290 K;K/Na phosphate, MPD, pH 6.40, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 1FZK MHC CLASS I NATURAL MUTANT H-2KBM1 HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND SENDAI VIRUS NUCLEOPROTEIN 提交 2000-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
突变:A152E, Y155R, Y156L 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.4;290 K;K/Na phosphate, MPD , pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.213 |
| 1FZK MHC CLASS I NATURAL MUTANT H-2KBM1 HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND SENDAI VIRUS NUCLEOPROTEIN 提交 2000-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
突变:A152E, Y155R, Y156L 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 4 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.4;290 K;K/Na phosphate, MPD , pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.213 |
| 1FZM MHC CLASS I NATURAL MUTANT H-2KBM8 HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND VESICULAR STOMATITIS VIRUS NUCLEOPROTEIN 提交 2000-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
突变:Y22F, M23I, E24S, D30N 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.4;290 K;K/Na phosphate, MPD , pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.223 |
| 1FZO MHC CLASS I NATURAL MUTANT H-2KBM8 HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND SENDAI VIRUS NUCLEOPROTEIN 提交 2000-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
突变:Y22F, M23I, E24S, D30N 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.4;290 K;K/Na phosphate, MPD , pH 6.40, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.211 |
| 1G6R A FUNCTIONAL HOT SPOT FOR ANTIGEN RECOGNITION IN A SUPERAGONIST TCR/MHC COMPLEX 提交 2000-11-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.2;295 K;0.2 M Tris/acetate, 10% PEG 6000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 22K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.327 |
| 1G6R A FUNCTIONAL HOT SPOT FOR ANTIGEN RECOGNITION IN A SUPERAGONIST TCR/MHC COMPLEX 提交 2000-11-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 I
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.2;295 K;0.2 M Tris/acetate, 10% PEG 6000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 22K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.327 |
| 1G7P CRYSTAL STRUCTURE OF MHC CLASS I H-2KB HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND YEAST ALPHA-GLUCOSIDASE 提交 2000-11-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS, RESIDUES 22-295
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.25;295 K;sodium/potassium phosphate, MPD, pH 7.25, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.222 |
| 1G7Q CRYSTAL STRUCTURE OF MHC CLASS I H-2KB HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND MUC1 VNTR PEPTIDE SAPDTRPA 提交 2000-11-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS, RESIDUES 22-295
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.25;295 K;sodium/potassium phosphate, MPD, pH 7.25, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.221 |
| 1KBG MHC Class I H-2KB Presented Glycopeptide RGY8-6H-GAL2 提交 1998-08-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
22–295(274 aa)
片段:PEPTIDE-BINDING DOMAIN
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.4;2.3M Na/K PHOSPHATE, 2% MPD, pH 6.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.279 |
| 1KJ3 Mhc Class I H-2Kb molecule complexed with pKB1 peptide 提交 2001-12-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
22–299(278 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS (ALPHA1, ALPHA2, ALPHA3)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;1.5M K2HPO4/N2HPO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 1KJ3 Mhc Class I H-2Kb molecule complexed with pKB1 peptide 提交 2001-12-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 I
22–299(278 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS (ALPHA1, ALPHA2, ALPHA3)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;1.5M K2HPO4/N2HPO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 1KPU High resolution crystal structure of the MHC class I complex H-2Kb/VSV8 提交 2002-01-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:extracellular domain, sequence database residues 22-295, numbered 1-274
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;K/NA PHOSPHATE, MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.208 |
| 1KPV High resolution crystal structure of the MHC class I complex H-2Kb/SEV9 提交 2002-01-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:extracellular domain, sequence database residues 22-295, numbered 1-274
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;K/NA PHOSPHATE, MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.204 |
| 1KPV High resolution crystal structure of the MHC class I complex H-2Kb/SEV9 提交 2002-01-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:extracellular domain, sequence database residues 22-295, numbered 1-274
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;K/NA PHOSPHATE, MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.204 |
| 1LEG Crystal Structure of H-2Kb bound to the dEV8 peptide 提交 2002-04-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN, SEQUENCE DATABASE RESIDUES 22-295, NUMBERED 1-274
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.8;298 K;sodium potassium phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.241 |
| 1LEK Crystal Structure of H-2Kbm3 bound to dEV8 提交 2002-04-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN, SEQUENCE DATABASE RESIDUES 22-295, NUMBERED 1-274
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.8;298 K;sodium potassium phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.258 |
| 1LK2 1.35A crystal structure of H-2Kb complexed with the GNYSFYAL peptide 提交 2002-04-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN, SEQUENCE DATABASE RESIDUES 22-295, NUMBERED 1-274
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;K/Na-Phosphate, MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.164 |
| 1MWA 2C/H-2KBM3/DEV8 ALLOGENEIC COMPLEX 提交 2002-09-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
22–296(275 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ACY ACETIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.8;277.16 K;0.1M TRIS ACETATE, 12% PEG4000, 18% glycerol, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.16K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.313 |
| 1MWA 2C/H-2KBM3/DEV8 ALLOGENEIC COMPLEX 提交 2002-09-27 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 I
22–296(275 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.8;277.16 K;0.1M TRIS ACETATE, 12% PEG4000, 18% glycerol, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.16K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.313 |
| 1N59 Crystal structure of the Murine class I Major Histocompatibility Complex of H-2KB, B2-Microglobulin, and A 9-Residue immunodominant peptide epitope gp33 derived from LCMV 提交 2002-11-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–297(276 aa)
片段:Extracellular fragment
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;PEG8000, magnesium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.287 |
| 1N59 Crystal structure of the Murine class I Major Histocompatibility Complex of H-2KB, B2-Microglobulin, and A 9-Residue immunodominant peptide epitope gp33 derived from LCMV 提交 2002-11-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–297(276 aa)
片段:Extracellular fragment
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;PEG8000, magnesium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.287 |
| 1NAM MURINE ALLOREACTIVE SCFV TCR-PEPTIDE-MHC CLASS I MOLECULE COMPLEX 提交 2002-11-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
22–296(275 aa)
片段:Extracellular Domains (alpha1, alpha2, alpha3)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;PEG6000 13-17%, MgAc 0.1M, NaCl 0-0.1M, Hepes 0.1M, pH 7.0 to 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.298 |
| 1NAN MCH CLASS I H-2KB MOLECULE COMPLEXED WITH PBM1 PEPTIDE 提交 2002-11-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 H
22–299(278 aa)
片段:Extracellular Domains (alpha1, alpha2, alpha3)
链 L
22–299(278 aa)
片段:Extracellular Domains (alpha1, alpha2, alpha3)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;293 K;PEG6000 16-17%, NaAc 0.2M, NaCl 0.3M, Mes 0.1M, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 1OSZ MHC CLASS I H-2KB HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND AN (L4V) MUTANT OF THE VESICULAR STOMATITIS VIRUS NUCLEOPROTEIN 提交 1998-06-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.293 |
| 1P1Z X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE LECTIN-LIKE NATURAL KILLER CELL RECEPTOR LY-49C BOUND TO ITS MHC CLASS I LIGAND H-2Kb 提交 2003-04-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
22–295(274 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;277 K;10% PEG 20000, 2% DIOXANE, 0.1 M Bicine, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.26 Å R-free 0.316 |
| 1P4L Crystal structure of NK receptor Ly49C mutant with its MHC class I ligand H-2Kb 提交 2003-04-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:extracellular alpha-1, alpha-2, alpha-3
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;Protein 8mg/ml, 0.1 M HEPES-Na pH 7.5, 2% v/v PEG400, 2.0 M Ammonium Sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.295 |
| 1RJY Mhc Class I Natural Mutant H-2Kbm8 Heavy Chain Complexed With beta-2 Microglobulin and Herpes Simplex Virus Glycoprotein B Peptide 提交 2003-11-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–301(280 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;PEG 8000, ca Acetate, sodium chloride, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.257 |
| 1RJY Mhc Class I Natural Mutant H-2Kbm8 Heavy Chain Complexed With beta-2 Microglobulin and Herpes Simplex Virus Glycoprotein B Peptide 提交 2003-11-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–301(280 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;PEG 8000, ca Acetate, sodium chloride, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.257 |
| 1RJZ Mhc Class I Natural Mutant H-2Kbm8 Heavy Chain Complexed With beta-2 Microglobulin and Herpies Simplex Virus Mutant Glycoprotein B Peptide 提交 2003-11-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–301(280 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;PEG 8000, ca Acetate, sodium chloride, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.288 |
| 1RJZ Mhc Class I Natural Mutant H-2Kbm8 Heavy Chain Complexed With beta-2 Microglobulin and Herpies Simplex Virus Mutant Glycoprotein B Peptide 提交 2003-11-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–301(280 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;PEG 8000, ca Acetate, sodium chloride, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.288 |
| 1RK0 Mhc Class I H-2Kb Heavy Chain Complexed With beta-2 Microglobulin and Herpes Simplex Virus Glycoprotein B peptide 提交 2003-11-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;K/NA PHOSPHATE, MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.238 |
| 1RK1 Mhc Class I Natural H-2Kb Heavy Chain Complexed With beta-2 Microglobulin and Herpes Simplex Virus Mutant Glycoprotein B Peptide 提交 2003-11-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;K/NA PHOSPHATE, MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.230 |
| 1S7Q Crystal structures of the murine class I major histocompatibility complex H-2Kb in complex with LCMV-derived gp33 index peptide and three of its escape variants 提交 2004-01-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–369(348 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;sodium/potassium phosphate, Methyl pentane diol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.209 |
| 1S7R Crystal structures of the murine class I major histocompatibility complex H-2Kb in complex with LCMV-derived gp33 index peptide and three of its escape variants 提交 2004-01-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–369(348 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;sodium/potassium phosphate, Methyl pentane diol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.290 |
| 1S7R Crystal structures of the murine class I major histocompatibility complex H-2Kb in complex with LCMV-derived gp33 index peptide and three of its escape variants 提交 2004-01-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–369(348 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;sodium/potassium phosphate, Methyl pentane diol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.290 |
| 1S7S Crystal structures of the murine class I major histocompatibility complex H-2Kb in complex with LCMV-derived gp33 index peptide and three of its escape variants 提交 2004-01-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–369(348 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;sodium/potassium phosphate, Methyl pentane diol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.232 |
| 1S7T Crystal structures of the murine class I major histocompatibility complex H-2Kb in complex with LCMV-derived gp33 index peptide and three of its escape variants 提交 2004-01-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–369(348 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;sodium/potassium phosphate, Methyl pentane diol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.252 |
| 1S7T Crystal structures of the murine class I major histocompatibility complex H-2Kb in complex with LCMV-derived gp33 index peptide and three of its escape variants 提交 2004-01-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–369(348 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;sodium/potassium phosphate, Methyl pentane diol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.252 |
| 1T0M Conformational switch in polymorphic H-2K molecules containing an HSV peptide 提交 2004-04-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
片段:residues 1-278
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;PEG 8000, calcium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.271 |
| 1T0M Conformational switch in polymorphic H-2K molecules containing an HSV peptide 提交 2004-04-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–299(278 aa)
片段:residues 1-278
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;PEG 8000, calcium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.271 |
| 1T0N Conformational switch in polymorphic H-2K molecules containing an HSV peptide 提交 2004-04-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
片段:residues 1-278
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;PEG 8000, calcium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.232 |
| 1T0N Conformational switch in polymorphic H-2K molecules containing an HSV peptide 提交 2004-04-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–299(278 aa)
片段:residues 1-278
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;PEG 8000, calcium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.232 |
| 1VAC MHC CLASS I H-2KB HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND CHICKEN OVALBUMIN 提交 1994-11-01 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 1VAD MHC CLASS I H-2KB HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND YEAST ALPHA-GLUCOSIDASE 提交 1994-11-01 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 1WBZ CRYSTAL STRUCTURES OF MURINE MHC CLASS I H-2 Db AND Kb MOLECULES IN COMPLEX WITH CTL EPITOPES FROM INFLUENZA A VIRUS: IMPLICATIONS FOR TCR REPERTOIRE SELECTION AND IMMUNODOMINANCE 提交 2004-11-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–296(275 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS, RESIDUES 22-296
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.254 |
| 1WBZ CRYSTAL STRUCTURES OF MURINE MHC CLASS I H-2 Db AND Kb MOLECULES IN COMPLEX WITH CTL EPITOPES FROM INFLUENZA A VIRUS: IMPLICATIONS FOR TCR REPERTOIRE SELECTION AND IMMUNODOMINANCE 提交 2004-11-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–296(275 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS, RESIDUES 22-296
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.254 |
| 2CKB STRUCTURE OF THE 2C/KB/DEV8 COMPLEX 提交 1998-01-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
22–295(274 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.2;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.2 M TRIS ACETATE PH 7.2 0.1 M SODIUM CHLORIDE 12 % PEG 4000 AND TRANSFERRED IN ETHYLENE GLYCOL CONTAINING PRECIPITANT SOLUTION, FROM 4% TO 22%, BEFORE DATA COLLECTION.
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.322 |
| 2CKB STRUCTURE OF THE 2C/KB/DEV8 COMPLEX 提交 1998-01-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 I
22–295(274 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.2;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.2 M TRIS ACETATE PH 7.2 0.1 M SODIUM CHLORIDE 12 % PEG 4000 AND TRANSFERRED IN ETHYLENE GLYCOL CONTAINING PRECIPITANT SOLUTION, FROM 4% TO 22%, BEFORE DATA COLLECTION.
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.322 |
| 2CLV MHC Class I Natural Mutant H-2Kbm8 Heavy Chain Complexed With beta-2 Microglobulin and pBM8 peptide 提交 2006-05-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–300(279 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS (ALPHA1, ALPHA2, ALPHA3), RESIDUES 22-300
|
突变:YES | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.3;14% PEG 10000, 100 MM MES PH 6.3
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.251 |
| 2CLV MHC Class I Natural Mutant H-2Kbm8 Heavy Chain Complexed With beta-2 Microglobulin and pBM8 peptide 提交 2006-05-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
22–300(279 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS (ALPHA1, ALPHA2, ALPHA3), RESIDUES 22-300
|
突变:YES | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.3;14% PEG 10000, 100 MM MES PH 6.3
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.251 |
| 2CLZ Mhc Class I Natural Mutant H-2Kbm8 Heavy Chain Complexed With beta-2 Microglobulin and pBM1 peptide 提交 2006-05-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–300(279 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS (ALPHA1, ALPHA2, ALPHA3), RESIDUES 22-300
|
突变:YES | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.3;14% PEG 6000 ; 100 MM MES PH 6.3
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.247 |
| 2CLZ Mhc Class I Natural Mutant H-2Kbm8 Heavy Chain Complexed With beta-2 Microglobulin and pBM1 peptide 提交 2006-05-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
22–300(279 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS (ALPHA1, ALPHA2, ALPHA3), RESIDUES 22-300
|
突变:YES | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.3;14% PEG 6000 ; 100 MM MES PH 6.3
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.247 |
| 2FO4 Enhanced MHC class I binding and immune responses through anchor modification of the non-canonical tumor associated MUC1-8 peptide 提交 2006-01-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS, RESIDUES 1-274
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;291 K;1.9M sodium/potasium phosphate, 2% MPD, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.248 |
| 2MHA CRYSTAL STRUCTURE OF THE MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX CLASS I H-2KB MOLECULE CONTAINING A SINGLE VIRAL PEPTIDE: IMPLICATIONS FOR PEPTIDE BINDING AND T-CELL RECEPTOR RECOGNITION 提交 1993-07-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–291(270 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 2MHA CRYSTAL STRUCTURE OF THE MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX CLASS I H-2KB MOLECULE CONTAINING A SINGLE VIRAL PEPTIDE: IMPLICATIONS FOR PEPTIDE BINDING AND T-CELL RECEPTOR RECOGNITION 提交 1993-07-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–291(270 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 2OL3 crystal structure of BM3.3 ScFV TCR in complex with PBM8-H-2KBM8 MHC class I molecule 提交 2007-01-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
22–300(279 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS (ALPHA1, ALPHA2, ALPHA3)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;12 % PEG 6000, 100 mM Hepes, pH 7.5, and 150 mM Magnesium Acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.284 |
| 2QRI Crystal structure of a single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb WT, beta-2microglobulin, and ovalbumin-derived peptide. 提交 2007-07-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–301(280 aa)
片段:;Fusion protein of ovalbumin-derived peptide, linker, Beta-2 microglobulin, linker, and H-2 class I histocompatibility antigen K-B alpha chain extracellular domain
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;298 K;13% PEG 10000, 100 mM MES, pH 6.2, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 2QRI Crystal structure of a single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb WT, beta-2microglobulin, and ovalbumin-derived peptide. 提交 2007-07-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
22–301(280 aa)
片段:;Fusion protein of ovalbumin-derived peptide, linker, Beta-2 microglobulin, linker, and H-2 class I histocompatibility antigen K-B alpha chain extracellular domain
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;298 K;13% PEG 10000, 100 mM MES, pH 6.2, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 2QRS Crystal Structure of a single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb Y84A, beta-2microglobulin, and ovalbumin-derived peptide. 提交 2007-07-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–301(280 aa)
片段:;Fusion protein of ovalbumin-derived peptide, linker, Beta-2 microglobulin, linker, and H-2 class I histocompatibility antigen K-B alpha chain extracellular domain
;
|
突变:Y105A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;298 K;14% PEG 6000, 100 mM MES, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 2QRS Crystal Structure of a single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb Y84A, beta-2microglobulin, and ovalbumin-derived peptide. 提交 2007-07-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
22–301(280 aa)
片段:;Fusion protein of ovalbumin-derived peptide, linker, Beta-2 microglobulin, linker, and H-2 class I histocompatibility antigen K-B alpha chain extracellular domain
;
|
突变:Y105A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;298 K;14% PEG 6000, 100 mM MES, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 2QRT Crystal Structure of a disulfide trapped single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb Y84C, beta-2microglobulin, and ovalbumin-derived peptide. 提交 2007-07-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–301(280 aa)
片段:;Fusion protein of ovalbumin-derived peptide, linker, Beta-2 microglobulin, linker, and H-2 class I histocompatibility antigen K-B alpha chain extracellular domain
;
|
突变:Y105C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;298 K;13% PEG 6000, 100 mM MES, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 2QRT Crystal Structure of a disulfide trapped single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb Y84C, beta-2microglobulin, and ovalbumin-derived peptide. 提交 2007-07-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
22–301(280 aa)
片段:;Fusion protein of ovalbumin-derived peptide, linker, Beta-2 microglobulin, linker, and H-2 class I histocompatibility antigen K-B alpha chain extracellular domain
;
|
突变:Y105C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;298 K;13% PEG 6000, 100 mM MES, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 2VAA MHC CLASS I H-2KB HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND VESICULAR STOMATITIS VIRUS NUCLEOPROTEIN 提交 1994-11-01 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 2VAB MHC CLASS I H-2KB HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND SENDAI VIRUS NUCLEOPROTEIN 提交 1994-11-01 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 2ZSV Crystal structure of H-2Kb in complex with JHMV epitope S598 提交 2008-09-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 CYS CYSTEINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.6;294 K;0.1M cacodylate, 16% PEG 8K, 0.2M Ca(OAc)2, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.250 |
| 2ZSV Crystal structure of H-2Kb in complex with JHMV epitope S598 提交 2008-09-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–299(278 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.6;294 K;0.1M cacodylate, 16% PEG 8K, 0.2M Ca(OAc)2, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.250 |
| 2ZSW Crystal structure of H-2Kb in complex with the Q600Y variant of JHMV epitope S598 提交 2008-09-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.1M cacodylate, 13% PEG 8K, 0.2M Ca(OAc)2, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 2ZSW Crystal structure of H-2Kb in complex with the Q600Y variant of JHMV epitope S598 提交 2008-09-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 E
22–299(278 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.1M cacodylate, 13% PEG 8K, 0.2M Ca(OAc)2, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 2ZSW Crystal structure of H-2Kb in complex with the Q600Y variant of JHMV epitope S598 提交 2008-09-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–299(278 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.1M cacodylate, 13% PEG 8K, 0.2M Ca(OAc)2, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 2ZSW Crystal structure of H-2Kb in complex with the Q600Y variant of JHMV epitope S598 提交 2008-09-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
22–299(278 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.1M cacodylate, 13% PEG 8K, 0.2M Ca(OAc)2, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 3C8K The crystal structure of Ly49C bound to H-2Kb 提交 2008-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:UNP residues 22-295
|
突变:S171G, E193G, R223K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;277 K;2.0 M ammonium sulfate, 2% (volume/volume) PEG 400 and 0.1 M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.263 |
| 3CVH How TCR-like antibody recognizes MHC-bound peptide 提交 2008-04-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
22–295(274 aa)
片段:sequence database residues 21-295
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;293 K;0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M NaOAc, pH 4.6 containing 25% w/v polyethylene glycol 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.296 |
| 3CVH How TCR-like antibody recognizes MHC-bound peptide 提交 2008-04-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 M
22–295(274 aa)
片段:sequence database residues 21-295
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;293 K;0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M NaOAc, pH 4.6 containing 25% w/v polyethylene glycol 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.296 |
| 3P4M Crystal Structure of H2-Kb in complex with the NP205-LCMV epitope YTVKYPNL, an 8-mer peptide from the LCMV 提交 2010-10-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–298(277 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | ACE ACETYL GROUP × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.2M ammonium acetate, 16-24% PEG 3350, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 3P4M Crystal Structure of H2-Kb in complex with the NP205-LCMV epitope YTVKYPNL, an 8-mer peptide from the LCMV 提交 2010-10-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–298(277 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | ACE ACETYL GROUP × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.2M ammonium acetate, 16-24% PEG 3350, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 3P4N Crystal Structure of H2-Kb in complex with the NP205-PV epitope YTVKFPNM, an 8-mer peptide from PV 提交 2010-10-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–298(277 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | ACE ACETYL GROUP × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.2M ammonium acetate, 16-24% PEG 3350, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.308 |
| 3P4N Crystal Structure of H2-Kb in complex with the NP205-PV epitope YTVKFPNM, an 8-mer peptide from PV 提交 2010-10-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–298(277 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | ACE ACETYL GROUP × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.2M ammonium acetate, 16-24% PEG 3350, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.308 |
| 3P4O Crystal Structure of H2-Kb in complex with the mutant NP205-LCMV-V3A epitope YTAKYPNL, an 8-mer modified peptide from the LCMV 提交 2010-10-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–298(277 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.2M ammonium acetate, 16-24% PEG 3350, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.275 |
| 3P4O Crystal Structure of H2-Kb in complex with the mutant NP205-LCMV-V3A epitope YTAKYPNL, an 8-mer modified peptide from the LCMV 提交 2010-10-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–298(277 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | ACE ACETYL GROUP × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.2M ammonium acetate, 16-24% PEG 3350, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.275 |
| 3P9L Crystal Structure of H2-Kb in complex with the chicken ovalbumin epitope OVA 提交 2010-10-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.2M calcium acetate, 15% PEG 8K, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.243 |
| 3P9L Crystal Structure of H2-Kb in complex with the chicken ovalbumin epitope OVA 提交 2010-10-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–299(278 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.2M calcium acetate, 15% PEG 8K, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.243 |
| 3P9M Crystal Structure of H2-Kb in complex with a mutant of the chicken ovalbumin epitope OVA-G4 提交 2010-10-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–298(277 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.2M calcium acetate, 15% PEG 8K, 0.1M Na-malonate, pH 6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 3P9M Crystal Structure of H2-Kb in complex with a mutant of the chicken ovalbumin epitope OVA-G4 提交 2010-10-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–298(277 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.2M calcium acetate, 15% PEG 8K, 0.1M Na-malonate, pH 6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 3PAB Crystal Structure of H2-Kb in complex with a mutant of the chicken ovalbumin epitope OVA-E1 提交 2010-10-19 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.2M calcium acetate, 15% PEG 8K, 0.1M Na-malonate, pH 6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.260 |
| 3PAB Crystal Structure of H2-Kb in complex with a mutant of the chicken ovalbumin epitope OVA-E1 提交 2010-10-19 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–299(278 aa)
片段:Extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.2M calcium acetate, 15% PEG 8K, 0.1M Na-malonate, pH 6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.260 |
| 3RGV A single TCR bound to MHCI and MHC II reveals switchable TCR conformers 提交 2011-04-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 C
22–296(275 aa)
片段:Residues 22-296
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 7;298 K;PEG 3350, pH 7, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 3RGV A single TCR bound to MHCI and MHC II reveals switchable TCR conformers 提交 2011-04-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–296(275 aa)
片段:Residues 22-296
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 7;298 K;PEG 3350, pH 7, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 3ROL Murine class I major histocompatibility complex H-2Kb in complex with post-translationally modified LCMV-derived gp34-41 peptide, comprising a nitrotyrosine at position 3 提交 2011-04-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–296(275 aa)
片段:unp residues 22-296
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.7;293 K;1.8 M NaH2PO4/K2HPO4, 1.5% MPD, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.295 |
| 3ROL Murine class I major histocompatibility complex H-2Kb in complex with post-translationally modified LCMV-derived gp34-41 peptide, comprising a nitrotyrosine at position 3 提交 2011-04-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–296(275 aa)
片段:unp residues 22-296
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.7;293 K;1.8 M NaH2PO4/K2HPO4, 1.5% MPD, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.295 |
| 3ROO Murine class I major histocompatibility complex H-2Kb in complex with immunodominant LCMV-derived gp34-41 peptide 提交 2011-04-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–296(275 aa)
片段:unp residues 22-296
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.1 M NaH2PO4/K2HPO4, 1.5% MPD, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.267 |
| 3ROO Murine class I major histocompatibility complex H-2Kb in complex with immunodominant LCMV-derived gp34-41 peptide 提交 2011-04-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–296(275 aa)
片段:unp residues 22-296
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.1 M NaH2PO4/K2HPO4, 1.5% MPD, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.267 |
| 3TID Crystal structure of the LCMV derived peptide GP34 in complex with the murine mhc class I H-2 Kb 提交 2011-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–297(276 aa)
片段:UNP residues 22-297
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;PEG 8K, Cacodylate, Magnesium Acetate, DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.192 |
| 3TIE Crystal structure of the vaccinia derived peptide A11R in complex with the murine MHC CLASS I H-2 KB 提交 2011-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–297(276 aa)
片段:UNP residues 22-297
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;PEG 8K, Cacodylate, Magnesium Acetate, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.219 |
| 3TIE Crystal structure of the vaccinia derived peptide A11R in complex with the murine MHC CLASS I H-2 KB 提交 2011-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–297(276 aa)
片段:UNP residues 22-297
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;PEG 8K, Cacodylate, Magnesium Acetate, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.219 |
| 4HKJ Structure of Cowpox CPXV203 in complex with MHCI (H-2Kb) 提交 2012-10-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
22–301(280 aa)
片段:extracellular domain (UNP residues 22-301)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.55;293 K;10% PEG6000, 4% glucose, 2% ethylene glycol, 0.1 M tri-potassium citrate, 0.01% azide, pH 5.55, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.253 |
| 4HKJ Structure of Cowpox CPXV203 in complex with MHCI (H-2Kb) 提交 2012-10-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 E
22–301(280 aa)
片段:extracellular domain (UNP residues 22-301)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.55;293 K;10% PEG6000, 4% glucose, 2% ethylene glycol, 0.1 M tri-potassium citrate, 0.01% azide, pH 5.55, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.253 |
| 4HKJ Structure of Cowpox CPXV203 in complex with MHCI (H-2Kb) 提交 2012-10-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 I
22–301(280 aa)
片段:extracellular domain (UNP residues 22-301)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.55;293 K;10% PEG6000, 4% glucose, 2% ethylene glycol, 0.1 M tri-potassium citrate, 0.01% azide, pH 5.55, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.253 |
| 4HKJ Structure of Cowpox CPXV203 in complex with MHCI (H-2Kb) 提交 2012-10-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 M
22–301(280 aa)
片段:extracellular domain (UNP residues 22-301)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.55;293 K;10% PEG6000, 4% glucose, 2% ethylene glycol, 0.1 M tri-potassium citrate, 0.01% azide, pH 5.55, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.253 |
| 4HS3 Crystal structure of H-2Kb with a disulfide stabilized F pocket in complex with the LCMV derived peptide GP34 提交 2012-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–297(276 aa)
片段:UNP residues 22-297
|
突变:A139C, Y84C | PO4 PHOSPHATE ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;Crystallization assays were performed in 24 well plates at 25 C using the vapor diffusion, hanging drop method. Best-diffracting crystals obtained from 7 mg/ml protein concentration in 2 M NaK phosphate pH 6.5 with 3% MPD, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 4PG9 MHC Class I in complex with Sendai virus nucleoprotein peptide FAPGNYPAL 提交 2014-05-01 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
片段:heavy chain, UNP residues 22-299
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;sodium/potassium phosphate buffer 1.9M, MPD 1%, glycerol (cryoprotection)
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.250 |
| 4PGB MHC Class I in complex with modified Sendai virus nucleoprotein peptide FAPGNWPAL 提交 2014-05-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
片段:heavy chain, UNP residues 22-299
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;sodium/potassium phosphate buffer 1.9M, MPD 1%, glycerol (cryoprotection)
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.281 |
| 4PGB MHC Class I in complex with modified Sendai virus nucleoprotein peptide FAPGNWPAL 提交 2014-05-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–299(278 aa)
片段:heavy chain, UNP residues 22-299
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;sodium/potassium phosphate buffer 1.9M, MPD 1%, glycerol (cryoprotection)
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.281 |
| 4PGC MHC Class I in complex with modified Sendai virus nucleoprotein peptide FAPGN(3,5-diiodotyrosine)PAL 提交 2014-05-01 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
片段:heavy chain, UNP residues 22-299
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;sodium/potassium phosphate buffer 1.9M, MPD 1%, glycerol (cryoprotection)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.243 |
| 4PGC MHC Class I in complex with modified Sendai virus nucleoprotein peptide FAPGN(3,5-diiodotyrosine)PAL 提交 2014-05-01 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–299(278 aa)
片段:heavy chain, UNP residues 22-299
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;sodium/potassium phosphate buffer 1.9M, MPD 1%, glycerol (cryoprotection)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.243 |
| 4PGE MHC Class I in complex with modified Sendai virus nucleoprotein peptide FAPGNYPAW 提交 2014-05-01 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
片段:heavy chain, UNP residues 22-299
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 6 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;sodium/potassium phosphate buffer 1.9M, MPD 1%, glycerol (cryoprotection)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 4PV8 Crystal Structure of H2Kb-Q600F complex 提交 2014-03-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;298 K;16-24% PEG 3350 and 0.2M Na acetate, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.216 |
| 4PV8 Crystal Structure of H2Kb-Q600F complex 提交 2014-03-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–299(278 aa)
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;298 K;16-24% PEG 3350 and 0.2M Na acetate, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.216 |
| 4PV9 Crystal Structure of H2Kb-Q600V complex 提交 2014-03-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–299(278 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;298 K;16-24% PEG 3350 and 0.2M Na acetate, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.218 |
| 4PV9 Crystal Structure of H2Kb-Q600V complex 提交 2014-03-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–299(278 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;298 K;16-24% PEG 3350 and 0.2M Na acetate, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.218 |
| 5OQF Crystal structure of a single chain trimer composed of the MHC 1 heavy chain H2-Kb WT, beta-2microglobulin, and ovalbumin derived peptide 提交 2017-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
23–304(282 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;0.2M Am sulphate, 25% PEG 8K, 0.1M Na cacodylate pH 6
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.250 |
| 5OQF Crystal structure of a single chain trimer composed of the MHC 1 heavy chain H2-Kb WT, beta-2microglobulin, and ovalbumin derived peptide 提交 2017-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
23–304(282 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;0.2M Am sulphate, 25% PEG 8K, 0.1M Na cacodylate pH 6
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.250 |
| 5OQG Crystal structure of a single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb W167A, beta-2microglobulin, and and ovalbumin-derived peptide. 提交 2017-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–304(283 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1M Am sulphate, 23& PEG 8K,
0.1M Bis-tris, pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 5OQG Crystal structure of a single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb W167A, beta-2microglobulin, and and ovalbumin-derived peptide. 提交 2017-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
22–304(283 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1M Am sulphate, 23& PEG 8K,
0.1M Bis-tris, pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 5OQH Crystal Structure of a disulfide trapped single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb Y84C K66A mutant, beta-2microglobulin, and ovalbumin-derived peptide 提交 2017-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–304(283 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;0.2M Am sulphate, 25 % PEG 8K, 0.1M Na cacodylate pH 6
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.242 |
| 5OQH Crystal Structure of a disulfide trapped single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb Y84C K66A mutant, beta-2microglobulin, and ovalbumin-derived peptide 提交 2017-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
22–304(283 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;0.2M Am sulphate, 25 % PEG 8K, 0.1M Na cacodylate pH 6
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.242 |
| 5OQI Crystal Structure of a disulfide trapped single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb Y84C E63A mutant, beta-2microglobulin, and ovalbumin-derived peptide 提交 2017-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–304(283 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.2M Am sulphate, 25% PEG 4K, 0.1M Na cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 5OQI Crystal Structure of a disulfide trapped single chain trimer composed of the MHC I heavy chain H-2Kb Y84C E63A mutant, beta-2microglobulin, and ovalbumin-derived peptide 提交 2017-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
22–304(283 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.2M Am sulphate, 25% PEG 4K, 0.1M Na cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 6GB6 Structure of H-2Kb with dipeptide GL 提交 2018-04-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
22–297(276 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 GLY GLYCINE × 1 LEU LEUCINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;277 K;2.15 M Na/K phosphate, 15% MPD
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.232 |
| 6GB6 Structure of H-2Kb with dipeptide GL 提交 2018-04-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
22–297(276 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 GLY GLYCINE × 1 LEU LEUCINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;277 K;2.15 M Na/K phosphate, 15% MPD
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.232 |
| 6JQ2 Crystal Structure of H2-Kb in complex with a DPAGT1 self-peptide 提交 2019-03-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;4% v/v Tacsimate (pH
573 7.0), 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.275 |
| 6JQ3 Crystal Structure of H2-Kb in complex with a DPAGT1 mutant peptide 提交 2019-03-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–295(274 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;4% v/v Tacsimate (pH 7.0), 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.296 |
| 6WL2 preTCRbeta-pMHC complex crystal structure 提交 2020-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–206(185 aa)
|
突变:G56C, C121Q | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.100 M Bicine pH 9.0, 15% (w/v)PEG 20000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.270 |
| 6WL2 preTCRbeta-pMHC complex crystal structure 提交 2020-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–206(185 aa)
|
突变:G56C, C121Q | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.100 M Bicine pH 9.0, 15% (w/v)PEG 20000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.270 |
| 6WL2 preTCRbeta-pMHC complex crystal structure 提交 2020-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
22–206(185 aa)
|
突变:G56C, C121Q | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.100 M Bicine pH 9.0, 15% (w/v)PEG 20000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.270 |
| 6WL3 preTCRbeta-pMHC complex crystal structure 提交 2020-04-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–206(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.100 M Bicine pH 9.0, 15% (w/v)PEG 20000
|
分辨率 3.45 Å R-free 0.256 |
| 6WL3 preTCRbeta-pMHC complex crystal structure 提交 2020-04-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–206(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.100 M Bicine pH 9.0, 15% (w/v)PEG 20000
|
分辨率 3.45 Å R-free 0.256 |
| 6WL3 preTCRbeta-pMHC complex crystal structure 提交 2020-04-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
22–206(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.100 M Bicine pH 9.0, 15% (w/v)PEG 20000
|
分辨率 3.45 Å R-free 0.256 |
| 6WL4 preTCRbeta-pMHC complex crystal structure 提交 2020-04-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–206(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.100 M Bicine pH 9.5, 15% (w/v)PEG 20000
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.269 |
| 6WL4 preTCRbeta-pMHC complex crystal structure 提交 2020-04-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–206(185 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.100 M Bicine pH 9.5, 15% (w/v)PEG 20000
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.269 |
| 6WL4 preTCRbeta-pMHC complex crystal structure 提交 2020-04-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
22–206(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.100 M Bicine pH 9.5, 15% (w/v)PEG 20000
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.269 |
| 7JI2 Crystal Structure of H2-Kb in complex with a OVA mutant peptide 提交 2020-07-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–301(280 aa)
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未记录 | GOL GLYCEROL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.200 M Potassium Sodium Tartrate 20.000% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.185 |
| 7JI2 Crystal Structure of H2-Kb in complex with a OVA mutant peptide 提交 2020-07-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–301(280 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.200 M Potassium Sodium Tartrate 20.000% (w/v) PEG 3350
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分辨率 1.95 Å R-free 0.185 |
| 7WCY Crystal Structure of H-2Kb with Cryptosporidium parvum gp40/15 epitope 提交 2021-12-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–296(275 aa)
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;12%(w/v) Polyethylene glycol 3350, 0.005M Cobalt(II) chloride hexahydrate; 0.005M Nickel(II) chloride hexahydrate;
0.005M Cadmium chloride hydrate; 0.1M HEPES (PH7.5)
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分辨率 2.36 Å R-free 0.258 |
| 7WCY Crystal Structure of H-2Kb with Cryptosporidium parvum gp40/15 epitope 提交 2021-12-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
22–296(275 aa)
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;12%(w/v) Polyethylene glycol 3350, 0.005M Cobalt(II) chloride hexahydrate; 0.005M Nickel(II) chloride hexahydrate;
0.005M Cadmium chloride hydrate; 0.1M HEPES (PH7.5)
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分辨率 2.36 Å R-free 0.258 |
| 8JHW The first crystal structure of a H-2Kb-restricted decapeptide from Cryptosporidium parvum 提交 2023-05-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–296(275 aa)
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20%(w/v) Polyethylene glycol 3350; 0.2M Lithium acetate dihydrate
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分辨率 3.12 Å R-free 0.288 |
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| UniProt名称 | HA1B_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 27–304; UniProt 22–299 |