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4puo

Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with RNA/DNA and Nevirapine

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 154.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HIV-1 Reverse Transcriptase, p66 subunit

Human immunodeficiency virus type 1

UniProt P03366

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 DNA 1 RNA 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 600–1153 链 B； UniProt 600–1027 片段：UNP residues 600-1153 突变：Q258C, C280S, D498N 片段：UNP residues 600-1027 突变：C280S 5'-R(P*AP*UP*GP*GP*UP*CP*GP*GP*CP*GP*CP*CP*CP*GP*AP*AP*CP*AP*GP*GP*GP*AP*CP*UP*GP*UP*G)-3' × 1 5'-D(*A*CP*AP*GP*TP*CP*CP*CP*TP*GP*TP*TP*CP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*CP*G)-3' × 1 NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mM magnesium chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.90 Å R-free 0.285
2 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 DNA 1 RNA 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 600–1153 链 D； UniProt 600–1027 片段：UNP residues 600-1153 突变：Q258C, C280S, D498N 片段：UNP residues 600-1027 突变：C280S 5'-R(P*AP*UP*GP*GP*UP*CP*GP*GP*CP*GP*CP*CP*CP*GP*AP*AP*CP*AP*GP*GP*GP*AP*CP*UP*GP*UP*G)-3' × 1 5'-D(*A*CP*AP*GP*TP*CP*CP*CP*TP*GP*TP*TP*CP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*CP*G)-3' × 1 NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mM magnesium chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.90 Å R-free 0.285

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4PUO Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AJV HIV-1 PROTEASE IN COMPLEX WITH THE CYCLIC SULFAMIDE INHIBITOR AHA006 提交 1997-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 NMB 2,7-DIBENZYL-1,1-DIOXO-3,6-BIS-PHENOXYMETHYL-[1,2,7]THIADIAZEPANE-4,5-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；277 K；CRYSTALLIZATION WAS PERFORMED BY VAPOR DIFFUSION. PROTEASE (2 MG/ML) AND INHIBITOR (40 MM IN DMSO) WAS MIXED IN A RATIO OF 1:1 AND SUBJECTED TO COCRYSTALLIZATION. DROPS CONSISTING OF 5 MICROLITERS OF THE PROTEASE-INHIBITOR MIXTURE PLUS 5 MICROLITERS OF THE CRYSTALLIZATION BUFFER (50 MM MES PH 5.5, 0.4 M NACL AND 0.02% (W/V) NAN3) WERE EQUILIBRATED AGAINST THE SAME BUFFER AT 4 DEGREES C., vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.247
1AJX HIV-1 PROTEASE IN COMPLEX WITH THE CYCLIC UREA INHIBITOR AHA001 提交 1997-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 AH1 AHA001 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；277 K；CRYSTALLIZATION WAS PERFORMED BY VAPOR DIFFUSION. PROTEASE (2 MG/ML) AND INHIBITOR (40 MM IN DMSO) WAS MIXED IN A RATIO OF 1:1 AND SUBJECTED TO COCRYSTALLIZATION. DROPS CONSISTING OF 5 MICROLITERS OF THE PROTEASE-INHIBITOR MIXTURE PLUS 5 MICROLITERS OF THE CRYSTALLIZATION BUFFER (50 MM MES PH 5.5, 0.4 M NACL AND 0.02% (W/V) NAN3) WERE EQUILIBRATED AGAINST THE SAME BUFFER AT 4 DEGREES C., vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.237
1AXA ACTIVE-SITE MOBILITY IN HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 PROTEASE AS DEMONSTRATED BY CRYSTAL STRUCTURE OF A28S MUTANT 提交 1997-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
突变：A28S 突变：A28S U0E N-[[1-[N-ACETAMIDYL]-[1-CYCLOHEXYLMETHYL-2-HYDROXY-4-ISOPROPYL]-BUT-4-YL]-CARBONYL]-GLUTAMINYL-ARGINYL-AMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.8
分辨率 2.00 Å
1BQM HIV-1 RT/HBY 097 提交 1998-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1154（556 aa）
链 B 599–1028（430 aa）
突变：C280S 突变：C280S HBY (S)-4-ISOPROPOXYCARBONYL-6-METHOXY-3-METHYLTHIOMETHYL-3,4-DIHYDROQUINOXALIN-2(1H)-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.8
分辨率 3.10 Å R-free 0.362
1BQN TYR 188 LEU HIV-1 RT/HBY 097 提交 1998-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1156（558 aa）
链 B 599–1028（430 aa）
突变：Y188L, C280S 突变：Y188L, C280S HBY (S)-4-ISOPROPOXYCARBONYL-6-METHOXY-3-METHYLTHIOMETHYL-3,4-DIHYDROQUINOXALIN-2(1H)-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.8
分辨率 3.30 Å R-free 0.362
1D4H HIV-1 Protease in complex with the inhibitor BEA435 提交 1999-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 BEH 2,5-DIBENZYLOXY-3,4-DIHYDROXY-HEXANEDIOIC ACID BENZYLAMIDE (2-HYDROXY-INDAN-1-YL)-AMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；sodium chloride, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.81 Å R-free 0.231
1D4I HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA425 提交 1999-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 BEG 2,5-DIBENZYLOXY-3-HYDROXY-HEXANEDIOIC ACID BIS-[(2-HYDROXY-INDAN-1-YL)-AMIDE] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；sodium chloride, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.81 Å R-free 0.228
1D4J HIV-1 protease in complex with the inhibitor MSL370 提交 1999-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 MSC 2,5-DIBENZYLOXY-3,4-DIHYDROXY-HEXANEDIOIC ACID 2-CHLORO-6-FLUORO-BENZYLAMIDE (2-HYDROXY-INDAN-1- YL)-AMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；sodium chloride, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.81 Å R-free 0.229
1DLO HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1996-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1154（556 aa）
链 B 599–1025（427 aa）
突变：C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.336
1DW6 Structural and kinetic analysis of drug resistant mutants of HIV-1 protease 提交 2000-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 501–599（99 aa）
链 D 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, L90M, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, L90M, C95A 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHAT25-50%, PROTEIN 2-5 MG/MLE , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.88 Å R-free 0.249
1EBK Structural and kinetic analysis of drug resistant mutants of HIV-1 protease 提交 2000-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 D 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
突变：Q7K, R8Q, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, R8Q, L33I, L63I, C67A, C95A 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHATE (25-50%), PROTEIN 2-5 MG/ML, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.06 Å R-free 0.306
1EBK Structural and kinetic analysis of drug resistant mutants of HIV-1 protease 提交 2000-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 F 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
突变：Q7K, R8Q, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, R8Q, L33I, L63I, C67A, C95A 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHATE (25-50%), PROTEIN 2-5 MG/ML, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.06 Å R-free 0.306
1EBW HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA322 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BEI N,N-[2,5-O-[DIBENZYL]-GLUCARYL]-DI-[ISOLEUCYL-AMIDO-METHANE] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.81 Å R-free 0.219
1EBY HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA369 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BEB N,N-[2,5-O-DIBENZYL-GLUCARYL]-DI-[1-AMINO-INDAN-2-OL] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.29 Å R-free 0.205
1EBZ HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA388 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BEC [5-(2-HYDROXY-INDAN-1-YLCARBAMOYL)-3,4-DIHYDROXY-2,5-[DIBENZYL-OXY]-PENTANOYL]-VALINYL-AMIDO-METHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.01 Å R-free 0.208
1EC0 HIV-1 protease in complex with the inhibitor bea403 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BED N,N-[2,5-O-DI-2-FLUORO-BENZYL-GLUCARYL]-DI-[1-AMINO-INDAN-2-OL] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.79 Å R-free 0.222
1EC1 HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA409 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BEE N,N-[2,5-O-[DI-4-THIOPHEN-3-YL-BENZYL]-GLUCARYL]-DI-[VALYL-AMIDO-METHANE] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.236
1EC2 HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA428 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BEJ N,N-[2,5-O-[DI-4-PYRIDIN-3-YL-BENZYL]-GLUCARYL]-DI-[VALYL-AMIDO-METHANE] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
1EC3 HIV-1 protease in complex with the inhibitor MSA367 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 MS3 N,N-[2,5-O-DIBENZYL-GLUCARYL]-DI-[VALINYL-AMINOMETHANYL-PYRIDINE] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02% (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.260
1EET HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR MSC204 提交 2000-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1155（557 aa） 片段：RESIDUES 1-557
链 B 599–1025（427 aa） 片段：RESIDUES 1001-1427
突变：E478Q BFU 1-(5-BROMO-PYRIDIN-2-YL)-3-[2-(6-FLUORO-2-HYDROXY-3-PROPIONYL-PHENYL)-CYCLOPROPYL]-UREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294 K；Ammonium Sulfate, Potassium chloride, HEPES, Magnesium Chloride , pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.73 Å R-free 0.271
1EET HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR MSC204 提交 2000-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 599–1155（557 aa） 片段：RESIDUES 1-557
链 B 599–1025（427 aa） 片段：RESIDUES 1001-1427
突变：E478Q BFU 1-(5-BROMO-PYRIDIN-2-YL)-3-[2-(6-FLUORO-2-HYDROXY-3-PROPIONYL-PHENYL)-CYCLOPROPYL]-UREA × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294 K；Ammonium Sulfate, Potassium chloride, HEPES, Magnesium Chloride , pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.73 Å R-free 0.271
1HBV A CHECK ON RATIONAL DRUG DESIGN. CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX OF HIV-1 PROTEASE WITH A NOVEL GAMMA-TURN MIMETIC 提交 1995-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 GAN 2-[3-BENZYL-5-(1-ALANYL-AMINOETHYL)-2,3,6,7-TETRAHYDRO-1H-AZEPIN-1-YL]-1-OXOPROPYL-VALINYL-VALINE-METHYLESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1HEF The crystal structures at 2.2 angstroms resolution of hydroxyethylene-based inhibitors bound to human immunodeficiency virus type 1 protease show that the inhibitors are present in two distinct orientations 提交 1992-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 69–167（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1HEG The crystal structures at 2.2 angstroms resolution of hydroxyethylene-based inhibitors bound to human immunodeficiency virus type 1 protease show that the inhibitors are present in two distinct orientations 提交 1992-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 69–167（99 aa）
未记录 PSI methyl N-{(4S,5S)-5-[(L-alanyl-L-alanyl)amino]-4-hydroxy-6-phenylhexanoyl}-L-valyl-L-valinate × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1HIH COMPARATIVE ANALYSIS OF THE X-RAY STRUCTURES OF HIV-1 AND HIV-2 PROTEASES IN COMPLEX WITH CGP 53820, A NOVEL PSEUDOSYMMETRIC INHIBITOR 提交 1995-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 C20 ACETYL-NH-VAL-CYCLOHEXYL-CH2[NCH2CHOH]CH2-BENZYL-VAL-NH-ACETYL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1HMV THE STRUCTURE OF UNLIGANDED REVERSE TRANSCRIPTASE FROM THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1994-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–607（440 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.297
1HMV THE STRUCTURE OF UNLIGANDED REVERSE TRANSCRIPTASE FROM THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1994-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 168–727（560 aa）
链 D 168–607（440 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.297
1HMV THE STRUCTURE OF UNLIGANDED REVERSE TRANSCRIPTASE FROM THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1994-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 168–727（560 aa）
链 F 168–607（440 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.297
1HMV THE STRUCTURE OF UNLIGANDED REVERSE TRANSCRIPTASE FROM THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1994-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 168–727（560 aa）
链 H 168–607（440 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.297
1HNI STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN A COMPLEX WITH THE NONNUCLEOSIDE INHIBITOR ALPHA-APA R 95845 AT 2.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1995-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1156（558 aa）
未记录 AAA (2-ACETYL-5-METHYLANILINO)(2,6-DIBROMOPHENYL)ACETAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1HNV STRUCTURE OF HIV-1 RT(SLASH)TIBO R 86183 COMPLEX REVEALS SIMILARITY IN THE BINDING OF DIVERSE NONNUCLEOSIDE INHIBITORS 提交 1995-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1156（558 aa）
链 B 599–1025（427 aa）
未记录 TBO 5-CHLORO-8-METHYL-7-(3-METHYL-BUT-2-ENYL)-6,7,8,9-TETRAHYDRO-2H-2,7,9A-TRIAZA-BENZO[CD]AZULENE-1-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.356
1HOS INHIBITION OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS-1 PROTEASE BY A C2-SYMMETRIC PHOSPHINATE SYNTHESIS AND CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS 提交 1993-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 PHP (2-PHENYL-1-CARBOBENZYL-OXYVALYL-AMINO)-ETHYL-PHOSPHINIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1HPS RATIONAL DESIGN, SYNTHESIS AND CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF A HYDROXYETHYLENE-BASED HIV-1 PROTEASE INHIBITOR CONTAINING A HETEROCYCLIC P1'-P2' AMIDE BOND ISOSTERE 提交 1994-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 RUN 2-[(1R,3S,4S)-1-BENZYL-4-[N-(BENZYLOXYCARBONYL)-L-VALYL]AMINO-3-PHENYLPENTYL]-4(5)-(2-METHYLPROPIONYL)IMIDAZOLE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1HPZ HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 2000-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 599–1028（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：K103N, C280S 突变：K103N, C280S AAP ALPHA-(2,6-DICHLOROPHENYL)-ALPHA-(2-ACETYL-5-METHYLANILINO)ACETAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；Bis-Tris.propane, ammoniun sulfate, glycerol, PEG 8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.343
1HQE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 2000-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：K103N, C280S 突变：K103N, C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；Bis-Tris.propane, ammoniun sulfate, glycerol, PEG 8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.331
1HQU HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 2000-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：K103N, C280S 突变：K103N, C280S HBY (S)-4-ISOPROPOXYCARBONYL-6-METHOXY-3-METHYLTHIOMETHYL-3,4-DIHYDROQUINOXALIN-2(1H)-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；BIS-TRIS.PROPANE, AMMONIUN SULFATE, GLYCEROL, PEG 8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.345
1HRH CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBONUCLEASE H DOMAIN OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE 提交 1991-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 594–729（136 aa）
链 B 594–729（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å
1HTE X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF A SERIES OF PENICILLIN-DERIVED ASYMMETRIC INHIBITORS OF HIV-1 PROTEASE 提交 1994-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 G23 (2R,4S)-2-[(R)-BENZYLCARBAMOYL-PHENYLACETYL-METHYL]-5,5-DIMETHYL-THIAZOLIDINE-4-CARBOXYLIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1HTF X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF A SERIES OF PENICILLIN-DERIVED ASYMMETRIC INHIBITORS OF HIV-1 PROTEASE 提交 1994-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 G26 2-(BENZYLCARBAMOYL-PHENYLACETYLAMINO-METHYL)-5,5-DIMETHYL-THIAZOLIDINE-4-CARBOXYLIC ACID (HYDROXYMETHYL-2-PHENYLETHYL)AMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1HTG X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF A SERIES OF PENICILLIN-DERIVED ASYMMETRIC INHIBITORS OF HIV-1 PROTEASE 提交 1994-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 G37 2-(BENZYLCARBAMOYL-PHENYLACETYLAMINO-METHYL)-5,5-DIMETHYL-THIAZOLIDINE-4-CARBOXYLIC ACID 3-[(1H-BENZIMIDAZOL-2-YLMETHYLCARBAMOYL)-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYL]-AMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
1HVK INFLUENCE OF STEREOCHEMISTRY ON ACTIVITY AND BINDING MODES FOR C2 SYMMETRY-BASED DIOL INHIBITORS OF HIV-1 PROTEASE 提交 1994-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 A79 N-{1-BENZYL-(2S,3S)-2,3-DIHYDROXY-4-[3-METHYL-2-(3-METHYL-3-PYRIDIN-2-YLMETHYL-UREIDO)-BUTYRYLAMINO]-5-PHENYL-PENTYL}-3-METHYL-2-(3-METHYL-3-PYRIDIN-2-YLMETHYL-UREIDO)-BUTYRAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å
1HVU HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH A 33-BASE NUCLEOTIDE RNA PSEUDOKNOT 提交 1998-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 599–1152（554 aa）
链 B 603–1025（423 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.75 Å R-free 0.413
1HVU HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH A 33-BASE NUCLEOTIDE RNA PSEUDOKNOT 提交 1998-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 D 599–1152（554 aa）
链 E 603–1025（423 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.75 Å R-free 0.413
1HVU HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH A 33-BASE NUCLEOTIDE RNA PSEUDOKNOT 提交 1998-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 G 599–1152（554 aa）
链 H 603–1025（423 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.75 Å R-free 0.413
1HVU HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH A 33-BASE NUCLEOTIDE RNA PSEUDOKNOT 提交 1998-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 J 599–1152（554 aa）
链 K 603–1025（423 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.75 Å R-free 0.413
1HYS CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A POLYPURINE TRACT RNA:DNA 提交 2001-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–720（553 aa） 片段：P66
链 B 168–592（425 aa） 片段：P51
突变：C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；297 K；ammonium sulfate, cacodylate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 3.00 Å R-free 0.316
1IKV K103N Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with Efivarenz 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K103N EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1IKV K103N Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with Efivarenz 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K103N EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1IKW Wild Type HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with Efavirenz 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：E478Q EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.00 Å R-free 0.272
1IKW Wild Type HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with Efavirenz 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：E478Q EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.00 Å R-free 0.272
1IKX K103N Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with the Inhibitor PNU142721 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K1103N PNU 6-CHLORO-2-(1-FURO[2,3-C]PYRIDIN-5-YL-ETHYLSULFANYL)-PYRIMIDIN-4-YLAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；Ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.274
1IKX K103N Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with the Inhibitor PNU142721 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K1103N PNU 6-CHLORO-2-(1-FURO[2,3-C]PYRIDIN-5-YL-ETHYLSULFANYL)-PYRIMIDIN-4-YLAMINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；Ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.274
1IKY HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with the Inhibitor MSC194 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K1103N MSD 1-[2-(3-ACETYL-2-HYDROXY-6-METHOXY-PHENYL)-CYCLOPROPYL]-3-(5-CYANO-PYRIDIN-2-YL)-THIOUREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294 K；Ammonium Sulphate, Potassium chloride, HEPES, Magnesium Chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
1IKY HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with the Inhibitor MSC194 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K1103N MSD 1-[2-(3-ACETYL-2-HYDROXY-6-METHOXY-PHENYL)-CYCLOPROPYL]-3-(5-CYANO-PYRIDIN-2-YL)-THIOUREA × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294 K；Ammonium Sulphate, Potassium chloride, HEPES, Magnesium Chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
1J5O CRYSTAL STRUCTURE OF MET184ILE MUTANT OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DOUBLE STRANDED DNA TEMPLATE-PRIMER 提交 2002-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–725（558 aa）
链 B 168–597（430 aa）
突变：M184I,C280S 突变：M184I,C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；30 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 100 MM CACODYLATE PH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.338
1MER HIV-1 MUTANT (I84V) PROTEASE COMPLEXED WITH DMP450 提交 1997-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 57–155（99 aa）
链 B 57–155（99 aa）
突变：I84V 突变：I84V DMQ [4-R-(-4-ALPHA,5-ALPHA,6-BETA,7-BETA)]-HEXAHYDRO-5,6-BIS(HYDROXY)-1,3-BIS([(3-AMINO)PHENYL]METHYL)-4,7-BIS(PHENYLMETHYL)-2H-1,3-DIAZEPINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
1MES HIV-1 MUTANT (I84V) PROTEASE COMPLEXED WITH DMP323 提交 1997-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 57–155（99 aa）
链 B 57–155（99 aa）
突变：I84V 突变：I84V DMP [4-R-(-4-ALPHA,5-ALPHA,6-BETA,7-BETA)]-HEXAHYDRO-5,6-BIS(HYDROXY)-[1,3-BIS([4-HYDROXYMETHYL-PHENYL]METHYL)-4,7-BIS(PHEN YLMETHYL)]-2H-1,3-DIAZEPINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
1MET HIV-1 MUTANT (V82F) PROTEASE COMPLEXED WITH DMP323 提交 1997-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 57–155（99 aa）
链 B 57–155（99 aa）
突变：V82F 突变：V82F DMP [4-R-(-4-ALPHA,5-ALPHA,6-BETA,7-BETA)]-HEXAHYDRO-5,6-BIS(HYDROXY)-[1,3-BIS([4-HYDROXYMETHYL-PHENYL]METHYL)-4,7-BIS(PHEN YLMETHYL)]-2H-1,3-DIAZEPINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
1MEU HIV-1 MUTANT (V82F, I84V) PROTEASE COMPLEXED WITH DMP323 提交 1997-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 57–155（99 aa）
链 B 57–155（99 aa）
突变：V82F, I84V 突变：V82F, I84V DMP [4-R-(-4-ALPHA,5-ALPHA,6-BETA,7-BETA)]-HEXAHYDRO-5,6-BIS(HYDROXY)-[1,3-BIS([4-HYDROXYMETHYL-PHENYL]METHYL)-4,7-BIS(PHEN YLMETHYL)]-2H-1,3-DIAZEPINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.193
1N5Y HIV-1 Reverse Transcriptase Crosslinked to Post-Translocation AZTMP-Terminated DNA (Complex P) 提交 2002-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–725（558 aa）
链 B 168–597（430 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；cacodylate, SAS, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.285
1N6Q HIV-1 Reverse Transcriptase Crosslinked to pre-translocation AZTMP-terminated DNA (complex N) 提交 2002-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–725（558 aa）
链 B 168–597（430 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280C MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；ammonium sulfate, cacodylate , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.284
1QE1 CRYSTAL STRUCTURE OF 3TC-RESISTANT M184I MUTANT OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE 提交 1999-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–725（558 aa） 片段：SUBUNIT A (P66), RESIDUES 168-725
链 B 168–594（427 aa） 片段：SUBUNIT B (P51), RESIDUES 168-594
突变：M184I,C280S 突变：M184I,C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, GLYCEROL, BIS-TRIS, AMMONIUM SULFATE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.346
1QMC C-terminal DNA-binding domain of HIV-1 integrase, NMR, 42 structures 提交 1999-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 947–997（51 aa） 片段：C-TERMINAL DNA-BINDING DOMAIN
链 B 947–997（51 aa） 片段：C-TERMINAL DNA-BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.7；298 K
分辨率未提供
1R0A Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase covalently tethered to DNA template-primer solved to 2.8 angstroms 提交 2003-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–725（558 aa） 片段：HIV-1 RT
链 B 168–596（429 aa） 片段：HIV-1 RT
未记录 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；100 mM cacodylatic acid pH, 5.6; 33% ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.272
1RDH CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSES OF AN ACTIVE HIV-1 RIBONUCLEASE H DOMAIN SHOW STRUCTURAL FEATURES THAT DISTINGUISH IT FROM THE INACTIVE FORM 提交 1993-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 594–727（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1RDH CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSES OF AN ACTIVE HIV-1 RIBONUCLEASE H DOMAIN SHOW STRUCTURAL FEATURES THAT DISTINGUISH IT FROM THE INACTIVE FORM 提交 1993-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 594–727（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1RTD STRUCTURE OF A CATALYTIC COMPLEX OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE: IMPLICATIONS FOR NUCLEOSIDE ANALOG DRUG RESISTANCE 提交 1998-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–721（554 aa） 片段：P61
突变：P1K, Q258C, E478Q MG MAGNESIUM ION × 4 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1RTD STRUCTURE OF A CATALYTIC COMPLEX OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE: IMPLICATIONS FOR NUCLEOSIDE ANALOG DRUG RESISTANCE 提交 1998-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 168–721（554 aa） 片段：P61
突变：P1K, Q258C, E478Q MG MAGNESIUM ION × 2 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1S6P CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R100943 提交 2004-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：YES 突变：YES MG MAGNESIUM ION × 1 IET 1-(4-CYANO-PHENYL)-3-[2-(2,6-DICHLORO-PHENYL)-1-IMINO-ETHYL]-THIOUREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.80
分辨率 2.90 Å R-free 0.312
1S6Q CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R147681 提交 2004-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：YES 突变：YES TPB 4-[4-(2,4,6-TRIMETHYL-PHENYLAMINO)-PYRIMIDIN-2-YLAMINO]-BENZONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.80
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1S9E CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R129385 提交 2004-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：YES 突变：YES ADB 4-[4-AMINO-6-(2,6-DICHLORO-PHENOXY)-[1,3,5]TRIAZIN-2-YLAMINO]-BENZONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；300 K；PEG 8000, ammonium sulfate, glycerol, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.60 Å R-free 0.316
1S9G CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R120394. 提交 2004-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：YES 突变：YES ABZ 4-[4-AMINO-6-(5-CHLORO-1H-INDOL-4-YLMETHYL)-[1,3,5]TRIAZIN-2-YLAMINO]-BENZONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；280 K；PEG 8000, Ammonium Sulfate, Glycerol, Tris, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 2.80 Å R-free 0.312
1SBG AN ORALLY-BIOAVAILABLE HIV-1 PROTEASE INHIBITOR CONTAINING AN IMIDAZOLE-DERIVED PEPTIDE BOND REPLACEMENT. CRYSTALLOGRAPHIC AND PHARMACOKINETIC ANALYSIS 提交 1994-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–122（99 aa）
链 B 24–122（99 aa）
未记录 IM1 (2R,4S,5S,1'S)-2-PHENYLMETHYL-4-HYDROXY-5-(TERT-BUTOXYCARBONYL)AMINO-6-PHENYL HEXANOYL-N-(1'-IMIDAZO-2-YL)-2'-METHYLPROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1SUQ CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R185545 提交 2004-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：L31V, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 185 (6-[4-(AMINOMETHYL)-2,6-DIMETHYLPHENOXY]-2-{[4-(AMINOMETHYL)PHENYL]AMINO}-5-BROMOPYRIMIDIN-4-YL)METHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.80
分辨率 3.00 Å R-free 0.325
1SV5 CRYSTAL STRUCTURE OF K103N MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R165335 提交 2004-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：K103N,C280S 突变：K103N,C280S 65B 4-({6-AMINO-5-BROMO-2-[(4-CYANOPHENYL)AMINO]PYRIMIDIN-4-YL}OXY)-3,5-DIMETHYLBENZONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.80
分辨率 2.90 Å R-free 0.326
1T03 HIV-1 reverse transcriptase crosslinked to tenofovir terminated template-primer (complex P) 提交 2004-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–725（558 aa） 片段：Reverse transcriptase, p66 subunit
链 B 168–596（429 aa） 片段：Reverse transcriptase, p51 subunit
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；100 mM cacodylate, 33% ammonium sulfate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.295
1T05 HIV-1 reverse transcriptase crosslinked to template-primer with tenofovir-diphosphate bound as the incoming nucleotide substrate 提交 2004-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–725（558 aa） 片段：HIV-1 reverse transcriptase p66 subunit
突变：Q258C, C280S MG MAGNESIUM ION × 2 TNV [2-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-1-METHYLETHOXY]METHYL-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；50 mM MES, pH 6.4, 100 mM ammonium sulfate, 5% sucrose, 5% glycerol, 10% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.292
1TV6 HIV-1 Reverse Transcriptase Complexed with CP-94,707 提交 2004-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–607（440 aa）
未记录 CP9 3-[4-(2-METHYL-IMIDAZO[4,5-C]PYRIDIN-1-YL)BENZYL]-3H-BENZOTHIAZOL-2-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；50 mM bis-Tris-propane, 100 mM ammonium sulfate, 0.2% (w/v) beta-octylglucoside, 10% (v/v) glycerol, 14% (w/v) PEG-8000, pH 7.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.312
1TVR HIV-1 RT/9-CL TIBO 提交 1996-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1156（558 aa）
链 B 599–1025（427 aa）
突变：C280S 突变：C280S TB9 4-CHLORO-8-METHYL-7-(3-METHYL-BUT-2-ENYL)-6,7,8,9-TETRAHYDRO-2H-2,7,9A-TRIAZA-BENZO[CD]AZULENE-1-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1UWB TYR 181 CYS HIV-1 RT/8-CL TIBO 提交 1996-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1156（558 aa）
链 B 599–1025（427 aa）
突变：Y181C, C280S 突变：Y181C, C280S TBO 5-CHLORO-8-METHYL-7-(3-METHYL-BUT-2-ENYL)-6,7,8,9-TETRAHYDRO-2H-2,7,9A-TRIAZA-BENZO[CD]AZULENE-1-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.360
1W5V HIV-1 protease in complex with fluoro substituted diol-based C2- symmetric inhibitor 提交 2004-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
链 B 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
未记录 BE3 N,N-[2,5-O-DI-3-FLUORO-BENZYL-GLUCARYL]-DI-[1-AMINO-INDAN-2-OL] × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.215
1W5W HIV-1 protease in complex with fluoro substituted diol-based C2- symmetric inhibitor 提交 2004-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
链 B 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
未记录 BE4 (2R,3R,4R,5R)-2,5-BIS[(2,4-DIFLUOROBENZYL)OXY]-3,4-DIHYDROXY-N,N'-BIS[(1R,2S)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]HEXAN EDIAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.213
1W5X HIV-1 protease in complex with fluoro substituted diol-based C2- symmetric inhibitor 提交 2004-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
链 B 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
未记录 BE5 (2R,3R,4R,5R)-2,5-BIS[(2,3-DIFLUOROBENZYL)OXY]-3,4-DIHYDROXY-N,N'-BIS[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]HEXAN EDIAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.216
1W5Y HIV-1 protease in complex with fluoro substituted diol-based C2- symmetric inhibitor 提交 2004-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
链 B 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
未记录 BE6 (2R,3R,4R,5R)-2,5-BIS[(2,5-DIFLUOROBENZYL)OXY]-3,4-DIHYDROXY-N,N'-BIS[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]HEXANEDIAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.218
2AQU Structure of HIV-1 protease bound to atazanavir 提交 2005-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：HIV-1 Protease, residues 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：HIV-1 Protease, residues 69-167
未记录 DR7 (3S,8S,9S,12S)-3,12-BIS(1,1-DIMETHYLETHYL)-8-HYDROXY-4,11-DIOXO-9-(PHENYLMETHYL)-6-[[4-(2-PYRIDINYL)PHENYL]METHYL]-2,5, 6,10,13-PENTAAZATETRADECANEDIOIC ACID DIMETHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；298 K；0.17M Ammonium Sulfate, 0.085M Sodium Cacodylate, 25.5% PEG 8000, 15% v/v Glycerol anhydrous, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 298 K
分辨率 2.00 Å R-free 0.238
2B5J Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with JANSSEN-R165481 提交 2005-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：RESIDUES 599-1158
链 B 599–1028（430 aa） 片段：RESIDUES 599-1028
突变：C447S 突变：C447S MN MANGANESE (II) ION × 1 3AC (2E)-3-{3-[(5-ETHYL-3-IODO-6-METHYL-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDIN-4-YL)OXY]PHENYL}ACRYLONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；277 K；PEG8000, AMMINIUM SULPHATE, SODIUM CHLORIDE, Manganese Chloride, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.304
2B6A Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with THR-50 提交 2005-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：RESIDUES 599-1158
链 B 599–1028（430 aa） 片段：RESIDUES 599-1028
突变：C280S 突变：C280S T50 1-(2,6-DIFLUOROBENZYL)-2-(2,6-DIFLUOROPHENYL)-4-METHYL-1H-BENZIMIDAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；296 K；PEG8000, AMMINIUM SULPHATE, SODIUM CHLORIDE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
分辨率 2.65 Å R-free 0.277
2BAN Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with JANSSEN-R157208 提交 2005-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：RESIDUES 599-1158
链 B 599–1028（430 aa） 片段：RESIDUES 599-1028
突变：C447S 突变：C447S MN MANGANESE (II) ION × 1 357 5-ETHYL-3-[(2-METHOXYETHYL)METHYLAMINO]-6-METHYL-4-(3-METHYLBENZYL)PYRIDIN-2(1H)-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG8000, AMMINIUM SULPHATE, SODIUM, CHLORID, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.95 Å R-free 0.305
2BE2 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with R221239 提交 2005-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：residues 599-1158
链 B 599–1028（430 aa） 片段：residues 599-1028
突变：C447S 突变：C447S GOL GLYCEROL × 2 MN MANGANESE (II) ION × 1 R22 4-(3,5-DIMETHYLPHENOXY)-5-(FURAN-2-YLMETHYLSULFANYLMETHYL)-3-IODO-6-METHYLPYRIDIN-2(1H)-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；277 K；50mM bisTris Propane, 100mM Ammonium Sulfate, 12% PEG 8000, 10% Glycerol, pH 6.8, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 6.80
分辨率 2.43 Å R-free 0.265
2HB3 Wild-type HIV-1 Protease in complex with potent inhibitor GRL06579 提交 2006-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 500–598（99 aa） 片段：residues 500-598
链 B 500–598（99 aa） 片段：residues 500-598
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A,C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A,C95A CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 2 GRL (3AS,5R,6AR)-HEXAHYDRO-2H-CYCLOPENTA[B]FURAN-5-YL (2S,3S)-3-HYDROXY-4-(4-(HYDROXYMETHYL)-N-ISOBUTYLPHENYLSULFONAMIDO)-1-PHENYLBUTAN-2-YLCARBAMATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；295 K；reservior contained 0.1M NaOAc buffer (pH=4.2) and 1.4M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.35 Å R-free 0.192
2HMI HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE/FRAGMENT OF FAB 28/DNA COMPLEX 提交 1998-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 599–1156（558 aa）
链 B 599–1028（430 aa）
突变：C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.352
2I5J Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with DHBNH, an RNASE H inhibitor 提交 2006-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1150（552 aa） 片段：residues 599-1150
链 B 599–1027（429 aa） 片段：residues 599-1027
突变：C280S 突变：C280S GLC alpha-D-glucopyranose × 3 K05 (E)-3,4-DIHYDROXY-N'-[(2-METHOXYNAPHTHALEN-1-YL)METHYLENE]BENZOHYDRAZIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；50 mM Imidazole pH 6.4, 100 mM Ammonium Sulfate, 15 mM Magnesium Sulfate, 0.6 mM DHBNH, 4% Glucose, 10.5% PEG 8000, 2 mM NaN3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.15 Å R-free 0.269
2IAJ Crystal Structure of K103N/Y181C Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in Complex with ATP 提交 2006-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：p66
链 B 599–1045（447 aa） 片段：p51
突变：K103N, Y181C, C280S 突变：K103N, Y181C, C280S MN MANGANESE (II) ION × 3 NA SODIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, Bis_Tris propane, ammonium sulfate, glycerol, MnCL2, ATP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.8
分辨率 2.50 Å R-free 0.284
2IC3 Crystal Structure of K103N/Y181C Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in Complex with Nonnucleoside Inhibitor HBY 097 提交 2006-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：p66
链 B 599–1045（447 aa） 片段：p51
突变：C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 1 HBY (S)-4-ISOPROPOXYCARBONYL-6-METHOXY-3-METHYLTHIOMETHYL-3,4-DIHYDROQUINOXALIN-2(1H)-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, BIS_TRIS PROPANE, AMMONIUM SULFATE, GLYCEROL, MNCL2, HBY 097, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.310
2UXZ Two-Carbon-Elongated HIV-1 Protease Inhibitors with a Tertiary- Alcohol-Containing Transition-State Mimic 提交 2007-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
未记录 HI1 METHYL [(1S)-1-({2-[(4R)-4-BENZYL-4-HYDROXY-5-{[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]AMINO}-5-OXOPENTYL]-2-(4-BROMOBENZYL)HYDRAZINO}CARBONYL)-2,2-DIMETHYLPROPYL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；0.7 M NACL, 100 MM MES PH5.0
分辨率 1.75 Å R-free 0.213
2UY0 Two-Carbon-Elongated HIV-1 Protease Inhibitors with a Tertiary- Alcohol-Containing Transition-State Mimic 提交 2007-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
未记录 HV1 METHYL [(1S)-1-({2-[(4R)-4-BENZYL-4-HYDROXY-5-{[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]AMINO}-5-OXOPENTANOYL]-2-(4-BROMOBENZYL)HYDRAZINO}CARBONYL)-2,2-DIMETHYLPROPYL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；0.7 M NACL, 100 MM MES PH 5.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.220
2VG5 Crystal structures of HIV-1 reverse transcriptase complexes with thiocarbamate non-nucleoside inhibitors 提交 2007-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P66 SUBUNIT, RESIDUES 600-1156
链 B 600–1027（428 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P51 SUBUNIT, RESIDUES 600-1027
未记录 NNC O-[2-(1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)ethyl] (4-chlorophenyl)thiocarbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.297
2VG6 Crystal structures of HIV-1 reverse transcriptase complexes with thiocarbamate non-nucleoside inhibitors 提交 2007-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P66 SUBUNIT, RESIDUES 600-1156
链 B 600–1027（428 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P51 SUBUNIT, RESIDUES 600-1027
未记录 NNB O-[2-(1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)ethyl] (4-bromophenyl)thiocarbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.01 Å R-free 0.335
2VG7 Crystal structures of HIV-1 reverse transcriptase complexes with thiocarbamate non-nucleoside inhibitors 提交 2007-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P66 SUBUNIT, RESIDUES 600-1156
链 B 600–1027（428 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P51 SUBUNIT, RESIDUES 600-1027
未记录 NNI O-[2-(1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)ethyl] (4-iodophenyl)thiocarbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.82 Å R-free 0.333
2WKZ HIV-1 Protease Inhibitors Containing a Tertiary Alcohol in the Transition-State Mimic with Improved Cell-Based Antiviral Activity 提交 2009-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
未记录 5AH METHYL [(1S)-1-({2-[(3S)-3-BENZYL-3-HYDROXY-4-{[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]AMINO}-4-OXOBUTYL]-2-(4-PYRIDIN-2-YLBENZYL)HYDRAZINO}CARBONYL)-2,2-DIMETHYLPROPYL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；PROTEASE 2 MG/ML PRECIPITANT 0.7 M NACL, 100 MM MES PH 5.5
分辨率 1.70 Å R-free 0.252
2WL0 HIV-1 Protease Inhibitors Containing a Tertiary Alcohol in the Transition-State Mimic with Improved Cell-Based Antiviral Activity 提交 2009-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES 5AH METHYL [(1S)-1-({2-[(3S)-3-BENZYL-3-HYDROXY-4-{[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]AMINO}-4-OXOBUTYL]-2-(4-PYRIDIN-2-YLBENZYL)HYDRAZINO}CARBONYL)-2,2-DIMETHYLPROPYL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；2 MG/ML PROTEASE, 0.7 M NACL, 100 MM MES PH5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.244
2X4U Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to HIV-1 Peptide RT468-476 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 908–916（9 aa） 片段：REVERSE TRANSCRIPTASE, RESIDUES 908-916
未记录 GOL GLYCEROL × 5 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；100 MM MES PH 5.5, 20% PEG 1500. CRYSTALS WERE FROZEN IN 100 MM MES, 30% PEG 1500, 10% GLYCEROL
分辨率 2.10 Å R-free 0.234
2X4U Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to HIV-1 Peptide RT468-476 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 908–916（9 aa） 片段：REVERSE TRANSCRIPTASE, RESIDUES 908-916
未记录 GOL GLYCEROL × 4 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；100 MM MES PH 5.5, 20% PEG 1500. CRYSTALS WERE FROZEN IN 100 MM MES, 30% PEG 1500, 10% GLYCEROL
分辨率 2.10 Å R-free 0.234
2XYE HIV-1 Inhibitors with a Tertiary-Alcohol-containing Transition-State Mimic and various P2 and P1 prime Substituents 提交 2010-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CXG METHYL N-[(2S)-1-[2-[(4R)-5-[[(2S)-3,3-DIMETHYL-1-METHYLAMINO-1-OXO-BUTAN-2-YL]AMINO]-4-HYDROXY-5-OXO-4-(PHENYLMETHYL)PENTYL]-2-[(4-PHENYLPHENYL)METHYL]HYDRAZINYL]-3,3-DIMETHYL-1-OXO-BUTAN-2-YL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；PROTEASE 2MG/ML. PRECIPITANT 0.7M NACL, 100MM MES PH5.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.257
2XYF HIV-1 Inhibitors with a Tertiary-Alcohol-containing Transition-State Mimic and various P2 and P1 prime Substituents 提交 2010-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES G40 METHYL N-[(2S)-1-[2-[(4R)-5-[[(2S)-3,3-DIMETHYL-1-METHYLAMINO-1-OXO-BUTAN-2-YL]AMINO]-4-HYDROXY-5-OXO-4-(PHENYLMETHYL)PENTYL]-2-[(4-THIOPHEN-3-YLPHENYL)METHYL]HYDRAZINYL]-3,3-DIMETHYL-1-OXO-BUTAN-2-YL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；PROTEASE 2 MG/ML PRECIPITANT 0.7 M NACL, 100 MM MES PH 5.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.250
2YKM Crystal structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in complex with a Difluoromethylbenzoxazole (DFMB) Pyrimidine Thioether derivative, a non-nucleoside RT inhibitor (NNRTI) 提交 2011-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa） 片段：RESIDUES 600-1156
链 B 600–1027（428 aa） 片段：RESIDUES 600-1027
突变：YES YKN 2-[DIFLUORO-[(4-METHYL-PYRIMIDINYL)-THIO]METHYL]-BENZOXAZOLE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å R-free 0.290
2YKN Crystal structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in complex with a Difluoromethylbenzoxazole (DFMB) Pyrimidine Thioether derivative, a non-nucleoside RT inhibitor (NNRTI) 提交 2011-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa） 片段：RESIDUES 600-1156
链 B 600–1027（428 aa） 片段：RESIDUES 600-1027
突变：YES YKN 2-[DIFLUORO-[(4-METHYL-PYRIMIDINYL)-THIO]METHYL]-BENZOXAZOLE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.12 Å R-free 0.279
2ZD1 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in Complex with TMC278 (Rilpivirine), A Non-nucleoside RT Inhibitor 提交 2007-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, MgCl2, imidazole, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.248
2ZE2 Crystal structure of L100I/K103N mutant HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with TMC278 (rilpivirine), a non-nucleoside RT inhibitor 提交 2007-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51
突变：L100I, K103N, K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, IMIDAZOLE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.299
3BGR Crystal structure of K103N/Y181C mutant HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with TMC278 (Rilpivirine), a non-nucleoside RT inhibitor 提交 2007-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51
突变：K103N, K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, IMIDAZOLE, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.269
3DLK Crystal Structure of an engineered form of the HIV-1 Reverse Transcriptase, RT69A 提交 2008-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1153（555 aa） 片段：p66 (UNP residues 599 to 1153)
链 B 605–1027（423 aa） 片段：p51 (UNP residues 605 to 1027)
突变：K172A, K173A, C258Q SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；279.15 K；vapor diffusion, temperature 279.15K
分辨率 1.85 Å R-free 0.250
3HVT STRUCTURAL BASIS OF ASYMMETRY IN THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE HETERODIMER 提交 1994-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1154（556 aa）
链 B 599–1026（428 aa）
未记录 NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
3IG1 HIV-1 Reverse Transcriptase with the Inhibitor beta-Thujaplicinol Bound at the RNase H Active Site 提交 2009-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, residues 600-1027
突变：F759S, C879S 突变：C879S JTH 2,7-dihydroxy-4-(propan-2-yl)cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；277 K；50 mM Bicine pH 8.2, 45 mM Ammonium Sulfate, 15 mM Manganese Sulfate, 10 mM Spermine, 5 mM Taurine, 2% PEG 400, 10% PEG 8000 Combined with equal volume of: 10 mM Tris pH 8.0, 75 mM NaCl, 3.5% DMSO, 0.86 mM b-Thujaplicinol, 0.17 mM Reverse Transcriptase, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
3IRX Crystal Structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with the Non-nucleoside RT Inhibitor (E)-S-Methyl 5-(1-(3,7-Dimethyl-2-oxo-2,3-dihydrobenzo[d]oxazol-5-yl)-5-(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)pent-1-enyl)-2-methoxy-3-methylbenzothioate. 提交 2009-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K771A, K772A 突变：C879S UDR (E)-S-Methyl 5-(1-(3,7-Dimethyl-2-oxo-2,3-dihydrobenzo[d]oxazol-5-yl)-5-(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)pent-1-enyl)-2-methoxy-3-methy lbenzothioate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；50 mM immidazole pH 6.4, 10% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 10 mM spermine and 30 mM magnesium sulfate. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.289
3IS9 Crystal structure of the HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with the alkenyldiarylmethane (ADAM) Non-nucleoside RT Inhibitor dimethyl 3,3'-(6-methoxy-6-oxohex-1-ene-1,1-diyl)bis(5-cyano-6-methoxybenzoate). 提交 2009-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K771A, K772A 突变：C879S AC7 dimethyl 3,3'-(6-methoxy-6-oxohex-1-ene-1,1-diyl)bis(5-cyano-6-methoxybenzoate) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.4；277 K；11% PEG8000, 15 mM MgSO4, 10 mM Spermine, 100 mM Ammonium sulphate, 50 mM imidazole pH 6.4., temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.282
3ISN Crystal structure of HIV-1 RT bound to A 6-vinylpyrimidine inhibitor 提交 2009-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1159（560 aa）
链 D 600–1026（427 aa）
未记录 EDM 6-ethenyl-N,N-dimethyl-2-(methylsulfonyl)pyrimidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100mM Bis-Tris , 25% PEG 3350, 200mM ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.281
3ITH Crystal structure of the HIV-1 reverse transcriptase bound to a 6-vinylpyrimidine inhibitor 提交 2009-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1026（427 aa）
未记录 EDM 6-ethenyl-N,N-dimethyl-2-(methylsulfonyl)pyrimidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；25% PEG 3350, 100mM Hepes, 200mM ammonium acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.270
3ITH Crystal structure of the HIV-1 reverse transcriptase bound to a 6-vinylpyrimidine inhibitor 提交 2009-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1159（560 aa）
链 D 600–1026（427 aa）
未记录 EDM 6-ethenyl-N,N-dimethyl-2-(methylsulfonyl)pyrimidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；25% PEG 3350, 100mM Hepes, 200mM ammonium acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.270
3JSM K65R mutant HIV-1 reverse transcriptase cross-linked to DS-DNA and complexed with tenofovir-diphosphate as the incoming nucleotide substrate 提交 2009-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1157（558 aa）
链 B 600–1028（429 aa）
突变：K65R, Q258C, C280S 突变：C280S TNV [2-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-1-METHYLETHOXY]METHYL-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；10% PEG 8000, 100 MM AMMONIUM SULFATE, 20 MM MGCL2, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
3JYT K65R mutant HIV-1 reverse transcriptase cross-linked to DS-DNA and complexed with DATP as the incoming nucleotide substrate 提交 2009-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1157（558 aa）
链 B 600–1028（429 aa）
突变：K65R, Q258C, C280S 突变：C280S DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；10% PEG 8000, 100 MM AMMONIUM SULFATE, 20 MM MGCL2, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.287
3K2P HIV-1 Reverse Transcriptase Isolated RnaseH Domain with the Inhibitor beta-thujaplicinol Bound at the Active Site 提交 2009-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1026–1159（134 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 JTH 2,7-dihydroxy-4-(propan-2-yl)cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M Formate pH 7.0, 10% PEG 3350, 10mM MnCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.04 Å R-free 0.241
3K2P HIV-1 Reverse Transcriptase Isolated RnaseH Domain with the Inhibitor beta-thujaplicinol Bound at the Active Site 提交 2009-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1026–1159（134 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 JTH 2,7-dihydroxy-4-(propan-2-yl)cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M Formate pH 7.0, 10% PEG 3350, 10mM MnCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.04 Å R-free 0.241
3K2P HIV-1 Reverse Transcriptase Isolated RnaseH Domain with the Inhibitor beta-thujaplicinol Bound at the Active Site 提交 2009-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1026–1159（134 aa）
链 B 1026–1159（134 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 JTH 2,7-dihydroxy-4-(propan-2-yl)cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M Formate pH 7.0, 10% PEG 3350, 10mM MnCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.04 Å R-free 0.241
3K4V New crystal form of HIV-1 Protease/Saquinavir structure reveals carbamylation of N-terminal proline 提交 2009-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K L33I L63I C67A C95A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q7K L33I L63I C67A C95A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；AMMONIUM SULFATE, DMSO, SODIUM CITRATE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.39 Å R-free 0.227
3K4V New crystal form of HIV-1 Protease/Saquinavir structure reveals carbamylation of N-terminal proline 提交 2009-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 501–599（99 aa）
链 D 501–599（99 aa）
突变：Q7K L33I L63I C67A C95A 突变：Q7K L33I L63I C67A C95A DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；AMMONIUM SULFATE, DMSO, SODIUM CITRATE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.39 Å R-free 0.227
3KLE Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 6.8, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, 5 MM SPERMIDINE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
3KLE Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 E 600–1159（560 aa）
链 F 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 6.8, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, 5 MM SPERMIDINE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
3KLE Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 I 600–1159（560 aa）
链 J 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 6.8, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, 5 MM SPERMIDINE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
3KLE Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 M 600–1159（560 aa）
链 N 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 6.8, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, 5 MM SPERMIDINE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
3KLF Crystal structure of wild-type HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH6.4, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, AND 5 MM SPERMIDINE, PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.15 Å R-free 0.288
3KLF Crystal structure of wild-type HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 E 600–1154（555 aa）
链 F 600–1027（428 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH6.4, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, AND 5 MM SPERMIDINE, PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.15 Å R-free 0.288
3KLF Crystal structure of wild-type HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 I 600–1154（555 aa）
链 J 600–1027（428 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH6.4, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, AND 5 MM SPERMIDINE, PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.15 Å R-free 0.288
3KLF Crystal structure of wild-type HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 M 600–1154（555 aa）
链 N 600–1027（428 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH6.4, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, AND 5 MM SPERMIDINE, PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.15 Å R-free 0.288
3KLG Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to pre-translocation AZTMP-Terminated DNA (COMPLEX N) 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.4；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 5.6, 10% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.65 Å R-free 0.350
3KLG Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to pre-translocation AZTMP-Terminated DNA (COMPLEX N) 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 E 600–1159（560 aa）
链 F 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.4；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 5.6, 10% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.65 Å R-free 0.350
3KLH Crystal structure of AZT-Resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to post-translocation AZTMP-Terminated DNA (COMPLEX P) 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 600–1161（562 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；100 MM CACODYLATE PH 6.0, 31-34% SATURATED AMMONIUM SULFATE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.294
3KLI Crystal structure of unliganded AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase 提交 2009-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE, 10% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.294
3NDT HIV-1 Protease Saquinavir:Ritonavir 1:1 complex structure 提交 2010-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–99（99 aa）
链 B 1–99（99 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 CL CHLORIDE ION × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；AMMONIUM SULFATE, DMSO, SODIUM CITRATE, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.72 Å R-free 0.229
3NDT HIV-1 Protease Saquinavir:Ritonavir 1:1 complex structure 提交 2010-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–99（99 aa）
链 D 1–99（99 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；AMMONIUM SULFATE, DMSO, SODIUM CITRATE, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.72 Å R-free 0.229
3NU3 Wild Type HIV-1 Protease with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 2.2 mg/ml protein solution at pH 5.6 with 0.1M MES and 0.6-0.8M sodium chloride. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 5:1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.02 Å R-free 0.142
3NU4 Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant V32I with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, V32I, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, V32I, L33I, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；The vapour diffusion, hanging drop method is applied. Amprenvir was dissolved in DMSO. Protein concentration is 2.2 mg/ml. The ratio of inhibitor to protein is 5:1 in 0.1 M sodium acetate buffer (ph=5.4), with 0.4M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.20 Å R-free 0.200
3NU5 Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant I50V with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, I50V, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, I50V, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 7 ACT ACETATE ION × 2 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 3.5 mg/ml protein solution at pH 5.4 with 1M NaCl, 0.2M NaOAc. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 10:1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.29 Å R-free 0.193
3NU6 Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant I54M with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, I54M, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, I54M, L63I, C67A, C95A CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 2.2 mg/ml protein solution at pH 4.6 with 0.1M sodium acetate, 0.67M sodium chloride. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 5:1 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.16 Å R-free 0.188
3NU9 Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant I84V with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, I84V, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, I84V, C95A 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 IOD IODIDE ION × 30 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 2.2 mg/ml protein solution at pH 4.0 with 0.13M NaI, 0.1M NaOAc. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 5:1 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.85 Å R-free 0.236
3NUJ Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant I54V with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, I54V, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, I54V, L63I, C67A, C95A IOD IODIDE ION × 19 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 2.2 mg/ml protein solution at pH 5.4 with 0.13M NaCl, 0.1M NaOAc. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 5:1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.197
3NUO Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant L90M with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, L90M, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, L90M, C95A IOD IODIDE ION × 19 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 3.7 mg/ml protein solution at pH 4.8 with 0.2M NaI, 0.1M NaOAc. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 5:1 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.35 Å R-free 0.199
3OK9 Crystal structure of wild-type HIV-1 protease with new oxatricyclic designed inhibitor GRL-0519A 提交 2010-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q507K, L533I, L563I, C567A, C595A 突变：Q507K, L533I, L563I, C567A, C595A G52 (3R,3aS,3bR,6aS,7aS)-octahydrodifuro[2,3-b:3',2'-d]furan-3-yl [(1S,2R)-1-benzyl-2-hydroxy-3-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}propyl]carbamate × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；298 K；1.18 M NaCl, 0.1 M Acetate, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.27 Å R-free 0.189
3QAA HIV-1 wild type protease with a substituted bis-Tetrahydrofuran inhibitor, GRL-044-10A 提交 2011-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A G04 (3R,3aS,4R,6aR)-4-methoxyhexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；pH 5.5, 0.1 M Sodium Citrate, 1.2 M Sodium Chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.40 Å R-free 0.230
3QLH HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with Manicol at the RNase H Active Site and TMC278 (Rilpivirine) at the NNRTI Binding Pocket 提交 2011-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：P66 (UNP residues 600-1153)
链 B 605–1027（423 aa） 片段：P51 (UNP residues 605-1027)
未记录 MNK (2S)-5,7-dihydroxy-9-methyl-2-(prop-1-en-2-yl)-1,2,3,4-tetrahydro-6H-benzo[7]annulen-6-one × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；277 K；Protein solution (20 mg/mL in 9.2 mM Tris pH 8.0, 68.7 mM NaCl, 3.6 mM manganese sulfate, 0.7 mM TCEP, 0.9 mM Manicol, 0.7 mM TMC278, 0.27% BOG, 7% DMSO) Mother Liquor (50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM ammonium sulfate, 15 m manganese sulfate, 10 mM spermine, 5 mM TCEP, 11% PEG8000) Cryoprotectant (50 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM manganese sulfate, 10 mM spermine, 0.69 mM Manicol, 0.34 mM TMC278, 15% PEG8000, 5% PEG400, 10% DMSO, 11% ethylene glycol, 6.5% trimethylamine N-oxide), flash-cooled in LN2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.251
3QO9 Crystal structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in complex with TSAO-T, a non-nucleoside RT inhibitor (NNRTI) 提交 2011-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：F160S, C280S 突变：C280S QO9 1-[(5R,6R,8R,9R)-4-amino-9-{[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}-6-({[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}methyl)-2,2-dioxido-1,7-dioxa-2-thiaspiro[4.4]non-3-en-8-yl]-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.8；279 K；PEG8000, 50mM imidazole pH 6.8 and 0.1M ammonium sulfate, EVAPORATION, temperature 279K
分辨率 2.60 Å R-free 0.286
3TLH STRUCTURAL STUDIES OF HIV AND FIV PROTEASES COMPLEXED WITHAN EFFICIENT INHIBITOR OF FIV PR 提交 1998-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
未记录 3TL benzyl [(1S,4S,7S,8R,9R,10S,13S,16S)-7,10-dibenzyl-8,9-dihydroxy-1,16-dimethyl-4,13-bis(1-methylethyl)-2,5,12,15,18-pentaoxo-20-phenyl-19-oxa-3,6,11,14,17-pentaazaicos-1-yl]carbamate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.4；SAMPLE: 3.0MG/ML HIVPR IN 25MM NAACETATE WITH 1MM EDTA AND 10MM DTT AT PH 5.5. WELL SOLUTION: 1.3M AMMONIUM SULFATE IN SODIUM ACETATE BUFFER AT PH 5.3 MIXING SAMPLE AND WELL SOLLUTION 1:1, pH 5.4
分辨率 2.00 Å R-free 0.281
3V4I Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and AZTTP 提交 2011-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：D498N MG MAGNESIUM ION × 1 AZT 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE, pH 7.2, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.262
3V4I Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and AZTTP 提交 2011-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：D498N MG MAGNESIUM ION × 1 AZT 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE, pH 7.2, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.262
3V6D Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) cross-linked with AZT-terminated DNA 提交 2011-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, sucrose, glycerol, magnesium chloride, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3V6D Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) cross-linked with AZT-terminated DNA 提交 2011-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, sucrose, glycerol, magnesium chloride, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3V81 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and the nonnucleoside inhibitor nevirapine 提交 2011-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, sucrose, glycerol, magnesium chloride, Bis-Tris propane , pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.298
3V81 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and the nonnucleoside inhibitor nevirapine 提交 2011-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, sucrose, glycerol, magnesium chloride, Bis-Tris propane , pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.298
3ZPS Design and Synthesis of P1-P3 Macrocyclic Tertiary Alcohol Comprising HIV-1 Protease Inhibitors 提交 2013-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 EQM methyl N-[(2S)-1-[2-[(4-bromophenyl)methyl]-2-[(4R)-5-[[(2S)-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-1-(prop-2-enylamino)butan-2-yl]amino]-4-oxidanyl-5-oxidanylidene-4-(phenylmethyl)pentyl]hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.55 Å R-free 0.210
3ZPT Design and Synthesis of P1-P3 Macrocyclic Tertiary Alcohol Comprising HIV-1 Protease Inhibitors 提交 2013-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 M8Y methyl N-[(2S)-1-[2-[(4-bromophenyl)methyl]-2-[3-[(3Z,8S,11R)-11-oxidanyl-7,10-bis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-6,9-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),3,13(17),14-tetraen-11-yl]propyl]hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.54 Å R-free 0.242
3ZPU Design and Synthesis of P1-P3 Macrocyclic Tertiary Alcohol Comprising HIV-1 Protease Inhibitors 提交 2013-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 M8B methyl N-[(2S)-1-[2-[(4-bromophenyl)methyl]-2-[3-[(3Z,8S,11R)-8-tert-butyl-11-oxidanyl-7,10-bis(oxidanylidene)-6,9-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(15),3,13,16-tetraen-11-yl]propyl]hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.7 M NACL, 100 MM MES PH5.0
分辨率 1.80 Å R-free 0.224
4COE Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 M17 methyl {(2S)-1-[2-(biphenyl-4-ylmethyl)-2-{(4R)-4-hydroxy-5-{[(2S)-3-methyl-1-oxo-1-(prop-2-en-1-ylamino)butan-2-yl]amino}-5-oxo-4-[4-(prop-2-en-1-yl)benzyl]pentyl}hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.45 Å R-free 0.261
4CP7 Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 9MW methyl [(2S)-1-(2-{(4R)-4-hydroxy-5-{[(2S)-3-methyl-1-oxo-1-(prop-2-en-1-ylamino)butan-2-yl]amino}-5-oxo-4-[4-(prop-2-en-1-yl)benzyl]pentyl}-2-[4-(pyridin-4-yl)benzyl]hydrazinyl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.206
4CPQ Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 9MW methyl [(2S)-1-(2-{(4R)-4-hydroxy-5-{[(2S)-3-methyl-1-oxo-1-(prop-2-en-1-ylamino)butan-2-yl]amino}-5-oxo-4-[4-(prop-2-en-1-yl)benzyl]pentyl}-2-[4-(pyridin-4-yl)benzyl]hydrazinyl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å R-free 0.273
4CPR Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 378 methyl ~{N}-[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[2-[(4~{R})-5-[[(2~{S})-3-methyl-1-oxidanylidene-1-(prop-2-enylamino)butan-2-yl]amino]-4-oxidanyl-5-oxidanylidene-4-[(4-prop-2-enylphenyl)methyl]pentyl]-2-[(4-thiophen-2-ylphenyl)methyl]hydrazinyl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.212
4CPS Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 1T8 methyl [(2S)-1-(2-{3-[(3R,6S,10Z)-3-hydroxy-4,7-dioxo-6-(propan-2-yl)-5,8-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(15),10,13,16-tetraen-3-yl]propyl}-2-[4-(pyridin-3-yl)benzyl]hydrazinyl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.55 Å R-free 0.202
4CPT Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 1T8 methyl [(2S)-1-(2-{3-[(3R,6S,10Z)-3-hydroxy-4,7-dioxo-6-(propan-2-yl)-5,8-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(15),10,13,16-tetraen-3-yl]propyl}-2-[4-(pyridin-3-yl)benzyl]hydrazinyl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.70 Å R-free 0.203
4CPU Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 V78 methyl N-[(2S)-1-[2-[[4-[(3S)-3,4-dihydrothiophen-3-yl]phenyl]methyl]-2-[3-[(3Z,8S,11R)-11-oxidanyl-7,10-bis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-6,9-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),3,13(17),14-tetraen-11-yl]propyl]hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.82 Å R-free 0.317
4CPW Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 V78 methyl N-[(2S)-1-[2-[[4-[(3S)-3,4-dihydrothiophen-3-yl]phenyl]methyl]-2-[3-[(3Z,8S,11R)-11-oxidanyl-7,10-bis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-6,9-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),3,13(17),14-tetraen-11-yl]propyl]hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.70 Å R-free 0.197
4CPX Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 J3W methyl ~{N}-[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[2-[3-[(3~{R},6~{S},10~{Z})-3-oxidanyl-4,7-bis(oxidanylidene)-6-propan-2-yl-5,8-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),10,13(17),14-tetraen-3-yl]propyl]-2-[(4-thiophen-2-ylphenyl)methyl]hydrazinyl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.85 Å R-free 0.335
4DG1 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with polymorphism mutation K172A and K173A 提交 2012-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1148（549 aa）
链 B 600–1026（427 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；50 mM bis-tris, 100 mM ammonium sulfate, 10% glycerol, 12% PEG 8000, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.15 Å R-free 0.247
4G1Q Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with Rilpivirine (TMC278, Edurant), a non-nucleoside rt-inhibiting drug 提交 2012-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51, UNP residues 600-1027
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2,IMIDAZOLE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.51 Å R-free 0.193
4H4M Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-3-(3-chloro-5-(4-chloro-2-(2-(2,4-dioxo-3,4- dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ494), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2012-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：HIV-1 Reverse Transcriptase, p66 Subunit
链 B 600–1027（428 aa） 片段：HIV-1 Reverse Transcriptase, p55 Subunit
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 494 (2E)-3-(3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；20% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine-HCl, 50 mM HEPES pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.273
4H4O Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in Complex with (E)-3-(3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)- 4-fluorophenoxy)-5-fluorophenyl)acrylonitrile (JLJ506), A Non-nucleoside inhibitor 提交 2012-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：HIV-1 Reverse Transcriptase, p66 Subunit
链 B 600–1027（428 aa） 片段：HIV-1 Reverse Transcriptase, p51 Subunit
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 506 (2E)-3-(3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-5-fluorophenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine-HCl, 50 mM HEPES pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.265
4I2P Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with rilpivirine (TMC278) based analogue 提交 2012-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 (UNP Residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 (UNP Residues 600-1077)
突变：C879S, K771A, K772A 突变：C879S G73 (2E)-3-[4-({6-[(4-methoxyphenyl)amino]-7H-purin-2-yl}amino)-3,5-dimethylphenyl]prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；301 K；50 mM imidazole pH 6.6, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM manganese sulfate, 10 mM spermine, 5 mM TCEP, 11% (w/w) PEG 8000, and 5% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 301K
分辨率 2.30 Å R-free 0.260
4I2Q Crystal structure of K103N/Y181C mutant of HIV-1 reverse transcriptase in complex with rilpivirine (TMC278) analogue 提交 2012-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 (UNP Residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 (UNP Residues 600-1077)
突变：K702N, K771A, K772A, Y780C, C879S 突变：C879S 1BT (2E)-3-(4-{[6-(1,3-benzothiazol-5-ylamino)-9H-purin-2-yl]amino}-3,5-dimethylphenyl)prop-2-enenitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.277
4ICL HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the incoming dNTP binding site 提交 2012-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 14N 4-(4-methylpiperazin-1-yl)benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE, AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 277.0K , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.80 Å R-free 0.199
4ID5 HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the RNase H primer grip site 提交 2012-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 17 1FF 1-methyl-5-phenyl-1H-pyrazole-4-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.7；pH 6.7
分辨率 1.95 Å R-free 0.209
4IDK HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the 428 site 提交 2012-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 1FE N-(2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl)glycinamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE,AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
4IFV Detecting Allosteric Sites of HIV-1 Reverse Transcriptase by X-Ray Crystallographic Fragment Screening 提交 2012-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 FMQ [1-(4-fluorophenyl)-5-methyl-1H-pyrazol-4-yl]methanol × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE, AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.219
4IFY HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the Knuckles site 提交 2012-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16 1FD 1-[4-(trifluoromethoxy)phenyl]methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE, AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.213
4IG0 HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the 507 site 提交 2012-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S 1FG 2-({[2-(3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-2-oxoethyl](methyl)amino}methyl)quinazolin-4(1H)-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE,AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.243
4IG3 HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment near Knuckles site 提交 2012-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 15 J94 (5S)-6,6-dimethyl-5-[(6R)-8-oxo-6,8-dihydrofuro[3,4-e][1,3]benzodioxol-6-yl]-5,6,7,8-tetrahydro[1,3]dioxolo[4,5-g]isoquinolin-6-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE, AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.203
4KFB HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at NNRTI adjacent site 提交 2013-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66
链 B 604–1027（424 aa） 片段：p51 RT
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S 1QP ethyl pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxylate × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE, AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.85 Å R-free 0.214
4KKO Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 4-((4-methoxy-6-(2-morpholinoethoxy)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)-2-((3-methylbut-2-en-1-yl)oxy)benzonitrile (JLJ513), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 1RE 4-({4-methoxy-6-[2-(morpholin-4-yl)ethoxy]-1,3,5-triazin-2-yl}amino)-2-(3-methylbutoxy)benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；17.5% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.289
4KO0 CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH an anilinylpyrimidine derivative (JLJ-135) 提交 2013-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S JLJ 4-[(4-methoxypyrimidin-2-yl)amino]-2-[(3-methylbut-2-en-1-yl)oxy]benzonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, IMIDAZOLE , pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.275
4LSL Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-3-(3-(4-chloro-2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ476), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 1YQ (2E)-3-(3-{4-chloro-2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；15% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.69 Å R-free 0.270
4LSN Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-3-(3-bromo-5-(4-chloro-2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ518), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 1YR (2E)-3-(3-bromo-5-{4-chloro-2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；15% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.301
4MFB Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ555), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：HIV-1 reverse transcriptase, p66 subunit (chain A)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：HIV-1 reverse transcriptase, p51 subunit (chain B)
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 29T 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12.5% (w/v) PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.88 Å R-free 0.269
4O44 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with 4-((4-(mesitylamino)-6-(3-morpholinopropoxy)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)benzonitrile (JLJ529), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 2RS 4-({4-[3-(morpholin-4-yl)propoxy]-6-[(2,4,6-trimethylphenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}amino)benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20.0% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine-HCl, and 50 mM citric acid pH 5.5 or 50 mM HEPES pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.290
4O4G Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with 4-((4-(mesitylamino)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)benzonitrile (JLJ527), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 2RT 4-({4-[(2,4,6-trimethylphenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}amino)benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20.0% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine-HCl, and 50 mM citric acid pH 5.5 or 50 mM HEPES pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.71 Å R-free 0.299
4OJR Crystal Structure of the HIV-1 Integrase catalytic domain with GSK1264 提交 2014-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1209–1371（163 aa） 片段：UNP residues 1209-1371
突变：F185K 2SQ (2S)-tert-butoxy[4-(8-fluoro-5-methyl-3,4-dihydro-2H-chromen-6-yl)-2-methyl-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-3-yl]ethanoic acid × 2 CAC CACODYLATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；7% Peg 8K, 0.2M Ammonium Sulfate, 0.1M sodiium cacodylate pH 6.5, 5mM MgCl2, 5mM MnCl2, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.82 Å R-free 0.201
4PQU Crystal structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with RNA/DNA and dATP 提交 2014-03-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C,C280S,D498N 突变：C280S DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG8000, Bis-tris propane, magnesium chloride, ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.51 Å R-free 0.266
4PQU Crystal structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with RNA/DNA and dATP 提交 2014-03-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C,C280S,D498N 突变：C280S DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG8000, Bis-tris propane, magnesium chloride, ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.51 Å R-free 0.266
4PWD Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with bulge-RNA/DNA and Nevirapine 提交 2014-03-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mM magnesium chloride, pH 7.2-7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.291
4PWD Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with bulge-RNA/DNA and Nevirapine 提交 2014-03-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mM magnesium chloride, pH 7.2-7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.291
4Q0B Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with gap-RNA/DNA and Nevirapine 提交 2014-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mm magnesium chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.317
4Q0B Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with gap-RNA/DNA and Nevirapine 提交 2014-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mm magnesium chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.317
4QAG Structure of a dihydroxycoumarin active-site inhibitor in complex with the RNASE H domain of HIV-1 reverse transcriptase 提交 2014-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1024–1156（133 aa） 片段：UNP residues 1024-1156
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 F95 (7,8-dihydroxy-2-oxo-2H-chromen-4-yl)acetic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；100 mM Bicine pH 8.2, 10 mM Manganese Sulfate, 1 mM Sodium Azide, 9% PEG 3350, combined with equal volume of 10 mM Tris pH 8.0, 75 mM NaCl, 20 mg/mL (1.34 mM) RNase H, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.71 Å R-free 0.190
4QAG Structure of a dihydroxycoumarin active-site inhibitor in complex with the RNASE H domain of HIV-1 reverse transcriptase 提交 2014-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1024–1156（133 aa） 片段：UNP residues 1024-1156
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 F95 (7,8-dihydroxy-2-oxo-2H-chromen-4-yl)acetic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；100 mM Bicine pH 8.2, 10 mM Manganese Sulfate, 1 mM Sodium Azide, 9% PEG 3350, combined with equal volume of 10 mM Tris pH 8.0, 75 mM NaCl, 20 mg/mL (1.34 mM) RNase H, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.71 Å R-free 0.190
4QAG Structure of a dihydroxycoumarin active-site inhibitor in complex with the RNASE H domain of HIV-1 reverse transcriptase 提交 2014-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1024–1156（133 aa） 片段：UNP residues 1024-1156
链 B 1024–1156（133 aa） 片段：UNP residues 1024-1156
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 F95 (7,8-dihydroxy-2-oxo-2H-chromen-4-yl)acetic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；100 mM Bicine pH 8.2, 10 mM Manganese Sulfate, 1 mM Sodium Azide, 9% PEG 3350, combined with equal volume of 10 mM Tris pH 8.0, 75 mM NaCl, 20 mg/mL (1.34 mM) RNase H, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.71 Å R-free 0.190
4R5P Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and a nucleoside triphosphate mimic alpha-carboxy nucleoside phosphonate inhibitor 提交 2014-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 3 3JY [(1R)-2-methoxy-1-{[(1S,3R)-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)cyclopentyl]oxy}-2-oxoethyl]phosphonic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；10% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% w/v sucrose, 5% w/v glycerol, 20 mM magnesium chloride, 50 mM Bis-Tris propane, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.251
4R5P Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and a nucleoside triphosphate mimic alpha-carboxy nucleoside phosphonate inhibitor 提交 2014-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 3 3JY [(1R)-2-methoxy-1-{[(1S,3R)-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)cyclopentyl]oxy}-2-oxoethyl]phosphonic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；10% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% w/v sucrose, 5% w/v glycerol, 20 mM magnesium chloride, 50 mM Bis-Tris propane, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.251
4RW4 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (K103N,Y181C) variant in complex with (E)-3-(3-chloro-5-(4-chloro-2-(2-(2,4-dioxo-3,4- dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ494), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2014-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S 494 (2E)-3-(3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16-20% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid (pH 7.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.67 Å R-free 0.278
4RW6 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) variant in complex with (E)-3-(3-chloro-5-(4-chloro-2-(2-(2,4-dioxo-3,4- dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ494), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2014-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S 494 (2E)-3-(3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；16-20% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid pH 6.0-6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.63 Å R-free 0.280
4RW7 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (K103N, Y181C) variant in complex with (E)-3-(3-chloro-5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ532), a non-nucleoside inhibitor 提交 2014-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S 3X6 (2E)-3-(3-chloro-5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.01 Å R-free 0.266
4RW8 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with (E)-3-(3-chloro-5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ532), a non-nucleoside inhibitor' 提交 2014-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S 3X6 (2E)-3-(3-chloro-5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.88 Å R-free 0.282
4RW9 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) variant in complex with (E)-3-(3-chloro-5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ532), a non-nucleoside inhibitor 提交 2014-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S 3X6 (2E)-3-(3-chloro-5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；16-20% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid pH 6.0 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.99 Å R-free 0.280
4U8W HIV-1 wild Type protease with GRL-050-10A (a Gem-difluoro-bis-Tetrahydrofuran as P2-Ligand) 提交 2014-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A G10 (3R,3aS,6aS)-4,4-difluorohexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-aminophenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；1M NaCl, 0.1 M Na Acetate, pH 4.8
分辨率 1.30 Å R-free 0.188
4WE1 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ600) 提交 2014-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 3LQ 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18% w/v PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 50 mM Imidazole (pH 6.5), and 5 mM spermine-HCl
分辨率 2.49 Å R-free 0.287
4YE3 Crystal Structure of Multidrug Resistant HIV-1 Protease Clinical Isolate PR20 with Inhibitor GRL-4410A 提交 2015-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K,L10F,I13V,I15V,D30N,V32I,L33F,E35D,M36I,S37N,I47V,I54L,Q58E,I62V,L63P,C67A,C95A,A71V,I84V,N88D,L89T,L90M 突变：Q7K,L10F,I13V,I15V,D30N,V32I,L33F,E35D,M36I,S37N,I47V,I54L,Q58E,I62V,L63P,C67A,C95A,A71V,I84V,N88D,L89T,L90M Y1 YTTRIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 G04 (3R,3aS,4R,6aR)-4-methoxyhexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.2M Sodium Chloride, 0.1M Sodium Acetate pH 5.5, 0.01M Yittrium Chloride
分辨率 1.35 Å R-free 0.200
4YHQ Crystal structure of multidrug resistant clinical isolate PR20 with GRL-5010A 提交 2015-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K,L10F,I13V,I15V,D30N,V32I,L33F,E35D,M36I,S37N,I47V,I54L,Q58E,I62V,L63P,C67A,A71V,I84V,N88D,L89T,L90M,C95A 突变：Q7K,L10F,I13V,I15V,D30N,V32I,L33F,E35D,M36I,S37N,I47V,I54L,Q58E,I62V,L63P,C67A,A71V,I84V,N88D,L89T,L90M,C95A G10 (3R,3aS,6aS)-4,4-difluorohexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-aminophenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 Y1 YTTRIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 5 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.15M sodium chloride, 0.1M sodium acetate pH 5.5 and 0.01M Yittrium chloride
分辨率 1.30 Å R-free 0.210
4ZIP HIV-1 wild Type protease with GRL-0648A (a isophthalamide-derived P2-Ligand) 提交 2015-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 G64 N-[(2,5-dimethyl-1,3-oxazol-4-yl)methyl]-N'-[(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]-N,5-dimethylbenzene-1,3-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；0.95 M NaCl, 0.1 M Sodium Acetate, pH 5
分辨率 1.11 Å R-free 0.154
4ZLS HIV-1 wild Type protease with GRL-096-13A (a Boc-derivative P2-Ligand, 3,-5-dimethylbiphenyl P1-Ligand) 提交 2015-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 G61 tert-butyl [(2S,3R)-1-(3',5'-dimethoxybiphenyl-3-yl)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}butan-2-yl]carbamate × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；1.4M NaCl, 0.1 M Na Acetate, pH 4.8
分辨率 1.53 Å R-free 0.251
5AGZ Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 QHA (3R,3aS,4R,6aR)-4-[(2-fluoroprop-2-en-1-yl)oxy]hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl {(2S,3R)-3-hydroxy-4-[{[2-(methylamino)-1,3-benzoxazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.20 Å R-free 0.221
5AH6 Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 C7U (3R,3aS,4R,6aS)-4-chlorohexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl {(2S,3R)-3-hydroxy-4-[{[2-(methylamino)-1,3-benzoxazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.225
5AH7 Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 C7J (3R,3aS,4R,6aS)-4-chlorohexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-aminophenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.55 Å R-free 0.238
5AH8 Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 C7W (3R,3aS,4R,6aR)-4-(3,3,3-trifluoropropoxy)hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl {(2S,3R)-3-hydroxy-4-[{[2-(methylamino)-1,3-benzoxazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.26 Å R-free 0.221
5AH9 Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 C7L (3R,3aS,4R,6aR)-4-(2-methoxyethoxy)hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-aminophenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.44 Å R-free 0.215
5AHA Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 ZLP (3R,3aS,4R,6aR)-4-(2-methoxyethoxy)hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl {(2S,3R)-3-hydroxy-4-[{[(2Z)-2-(methylimino)-2,3-dihydro-1,3-benzoxazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.35 Å R-free 0.225
5AHB Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 J5L (3R,3aS,4R,6aR)-4-[2-(methylamino)-2-oxoethoxy]hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl {(2S,3R)-3-hydroxy-4-[{[(2Z)-2-(methylimino)-2,3-dihydro-1,3-benzoxazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.220
5AHC Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 VXL (3R,3aS,4R,6aR)-4-[2-(methylamino)-2-oxoethoxy]hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.229
5BRY HIV-1 wild Type protease with GRL-011-11A (a methylamine bis-Tetrahydrofuran P2-Ligand, sulfonamide isostere derivate) 提交 2015-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 4UY (3R,3aS,4R,6aR)-4-(methylamino)hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；1.4 M NaCl, 0.1 M sodium Acetate, pH 4.6
分辨率 1.34 Å R-free 0.205
5BS4 HIV-1 wild Type protease with GRL-047-11A (a methylamine bis-Tetrahydrofuran P2-Ligand, 4-amino sulfonamide derivative) 提交 2015-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 4UX (3R,3aS,4R,6aR)-4-(methylamino)hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-aminophenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；1.0M NaCl, 0.1M NaAcetate, pH=5.0
分辨率 1.29 Å R-free 0.210
5C24 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 7-((4-((4-cyanophenyl)amino)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)-6,8-dimethylindolizine-2-carbonitrile (JLJ605), a non-nucleoside inhibitor 提交 2015-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1144（545 aa） 片段：UNP residues 604-1144
链 B 604–1027（424 aa） 片段：UNP residues 604-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 4XO 6-({4-[(4-cyanophenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}amino)-5,7-dimethylindolizine-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；20% v/v PEG 8000, 50 mM HEPES (pH 7.0),100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine-HCl using hanging drop vaporization
分辨率 2.60 Å R-free 0.258
5C25 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 6-((4-((4-cyanophenyl)amino)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)-5,7-dimethyl-2-naphthonitrile (JLJ639), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2015-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 639 6-({4-[(4-cyanophenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}amino)-5,7- dimethyl-2-naphthonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；14% PEG 8000, 100 mM Ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, 15 mM HEPES pH 7.0
分辨率 2.84 Å R-free 0.263
5C42 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (K101P) Variant in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ555), a non-nucleoside inhibitor 提交 2015-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：K101P, K172A, K173A, C280S 突变：C280S 29T 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；co-crystallization; 15% PEG 8000 (50% (w/v)), in pH 7.0 solution (0.125 M HEPES, 0.0125 M spermine-HCl, 0.04 M magnesium sulfate, 0.04 M ammonium sulfate)
分辨率 3.50 Å R-free 0.282
5CYM HIV-1 reverse transcriptase complexed with 4-iodopyrazole 提交 2015-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 IOD IODIDE ION × 14 PYZ 4-IODOPYRAZOLE × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；50 mM Imidazole pH 6.6, 10% PEG 8k, 5%PEG400, 100 mM A/S, 15 mM MgSO4, 10 mM Spermine, 5 mM TCEP
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
5CYQ HIV-1 reverse transcriptase complexed with 4-bromopyrazole 提交 2015-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 BYZ 4-bromo-1H-pyrazole × 15 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 BR BROMIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；50 mM Imidazole pH 6.6, 10% PEG 8k, 5% PEG400, 100 mM A/S, 15 mM MgSO4, 10 mM Spermine, 5 mM TCEP
分辨率 2.15 Å R-free 0.224
5D3G Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase Bound to a Novel 38-mer Hairpin Template-Primer DNA Aptamer 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；278 K；7% PEG 8000, 25 mM BisTris-Propane pH 6.8, 75 mM BisTris-Propane pH 7.4, 50 mM Ammonium Sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose
分辨率 2.30 Å R-free 0.225
5D3G Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase Bound to a Novel 38-mer Hairpin Template-Primer DNA Aptamer 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；278 K；7% PEG 8000, 25 mM BisTris-Propane pH 6.8, 75 mM BisTris-Propane pH 7.4, 50 mM Ammonium Sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose
分辨率 2.30 Å R-free 0.225
5FDL Crystal Structure of K103N/Y181C Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in Complex with IDX899 提交 2015-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：YES 突变：YES 5DV methyl (R)-(2-carbamoyl-5-chloro-1H-indol-3-yl)[3-(2-cyanoethyl)-5-methylphenyl]phosphinate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Protein was concentrated to 14 mg/ml in the presence of 0.5 mM inhibitor A051606P then used in successive crystal micro-seeding experiments to yield protein crystals of 0.3 mm x 0.3 mm x 0.2 mm in 1.4 M Sodium Malonate.
分辨率 3.10 Å R-free 0.299
5HBM Crystal Structure of a Dihydroxycoumarin RNase H Active-Site Inhibitor in Complex with HIV-1 Reverse Transcriptase 提交 2015-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain, residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain, residues 604-1027
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 F95 (7,8-dihydroxy-2-oxo-2H-chromen-4-yl)acetic acid × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；PEG 8000, (NH4)2SO4, GLYCEROL, BIS TRIS PROPANE
分辨率 3.04 Å R-free 0.274
5HLF STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A 38-MER HAIRPIN TEMPLATE-PRIMER DNA APTAMER AND AN ALPHA-CARBOXYPHOSPHONATE INHIBITOR 提交 2016-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：D498N MG MAGNESIUM ION × 2 64A {[(1S,3R)-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)cyclopentyl]oxy}propanedioic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH, 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.95 Å R-free 0.257
5HLF STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A 38-MER HAIRPIN TEMPLATE-PRIMER DNA APTAMER AND AN ALPHA-CARBOXYPHOSPHONATE INHIBITOR 提交 2016-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：D498N MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH, 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.95 Å R-free 0.257
5HP1 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A DNA aptamer and FOSCARNET, a Pyrophosphate analog 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 PPF PHOSPHONOFORMIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 ATM 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25mM, BISTRIS-PROPANE, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.90 Å R-free 0.273
5HP1 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A DNA aptamer and FOSCARNET, a Pyrophosphate analog 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 PPF PHOSPHONOFORMIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ATM 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25mM, BISTRIS-PROPANE, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.90 Å R-free 0.273
5HRO STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A DNA aptamer and an Alpha-carboxy nucleoside phosphonate inhibitor (alpha-CNP) 提交 2016-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 3JY [(1R)-2-methoxy-1-{[(1S,3R)-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)cyclopentyl]oxy}-2-oxoethyl]phosphonic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；7% PEG 8000, 100 MM BISTRIS-PROPANE, AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
5HRO STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A DNA aptamer and an Alpha-carboxy nucleoside phosphonate inhibitor (alpha-CNP) 提交 2016-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 3JY [(1R)-2-methoxy-1-{[(1S,3R)-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)cyclopentyl]oxy}-2-oxoethyl]phosphonic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；7% PEG 8000, 100 MM BISTRIS-PROPANE, AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
5I3U STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE N-SITE COMPLEX; CATALYTIC INCORPORATION OF AZTMP to A DNA aptamer in CRYSTAL 提交 2016-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.00 Å R-free 0.254
5I3U STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE N-SITE COMPLEX; CATALYTIC INCORPORATION OF AZTMP to A DNA aptamer in CRYSTAL 提交 2016-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.00 Å R-free 0.254
5I42 Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with a DNA aptamer, AZTTP, and CA(2+) ion 提交 2016-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 AZT 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.30 Å R-free 0.247
5I42 Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with a DNA aptamer, AZTTP, and CA(2+) ion 提交 2016-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 AZT 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.30 Å R-free 0.247
5J1E Crystal Structure of a Hydroxypyridone Carboxylic Acid Active-Site RNase H Inhibitor in Complex with HIV Reverse Transcriptase 提交 2016-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain, residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain, residues 600-1027
突变：C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.1；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, MES
分辨率 2.90 Å R-free 0.294
5J1E Crystal Structure of a Hydroxypyridone Carboxylic Acid Active-Site RNase H Inhibitor in Complex with HIV Reverse Transcriptase 提交 2016-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain, residues 600-1154
链 D 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain, residues 600-1027
突变：C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 6FT 5-hydroxy-4-oxo-1-[(4'-sulfamoyl[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-1,4-dihydropyridine-3-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.1；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, MES
分辨率 2.90 Å R-free 0.294
5TER Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-chloro-7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-8-methyl-2-naphthonitrile (JLJ651), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2016-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7AY 5-chloro-7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-8-methyl-2-naphthonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.70 Å R-free 0.267
5TUQ Crystal Structure of a 6-Cyclohexylmethyl-3-hydroxypyrimidine-2,4-dione Inhibitor in Complex with HIV Reverse Transcriptase 提交 2016-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain residues 600-1027
突变：C280S 突变：C280S J63 1-[(benzyloxy)methyl]-6-(cyclohexylmethyl)-3-hydroxy-5-(propan-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.1；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, MES
分辨率 2.71 Å R-free 0.265
5TW3 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ636), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2016-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7N1 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.85 Å R-free 0.273
5TXL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.50 Å R-free 0.225
5TXL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.50 Å R-free 0.225
5TXM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP 提交 2016-11-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DDS 2',3'-dideoxyadenosine triphosphate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE,
分辨率 2.70 Å R-free 0.223
5TXM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP 提交 2016-11-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DDS 2',3'-dideoxyadenosine triphosphate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE,
分辨率 2.70 Å R-free 0.223
5TXN STRUCTURE OF Q151M MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.55 Å R-free 0.226
5TXN STRUCTURE OF Q151M MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.55 Å R-free 0.226
5TXO STRUCTURE OF Q151M complex (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) mutant HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.55 Å R-free 0.228
5TXO STRUCTURE OF Q151M complex (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) mutant HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.55 Å R-free 0.228
5TXP STRUCTURE OF Q151M complex (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) mutant HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DDS 2',3'-dideoxyadenosine triphosphate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.70 Å R-free 0.239
5TXP STRUCTURE OF Q151M complex (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) mutant HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DDS 2',3'-dideoxyadenosine triphosphate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.70 Å R-free 0.239
5UV5 Crystal Structure of a 2-Hydroxyisoquinoline-1,3-dione RNase H Active Site Inhibitor with Multiple Binding Modes to HIV Reverse Transcriptase 提交 2017-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain residues 600-1027
突变：C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 Y55 7-(furan-2-yl)-2-hydroxyisoquinoline-1,3(2H,4H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, TRIS
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
5UV5 Crystal Structure of a 2-Hydroxyisoquinoline-1,3-dione RNase H Active Site Inhibitor with Multiple Binding Modes to HIV Reverse Transcriptase 提交 2017-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain residues 600-1154
链 D 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain residues 600-1027
突变：C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 Y55 7-(furan-2-yl)-2-hydroxyisoquinoline-1,3(2H,4H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, TRIS
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
5VQQ Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-2-fluoro-N-methylacetamide (JLJ683), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 9JP N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-2-fluoro-N-methylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 20% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.55 Å R-free 0.255
5VQR Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacrylamide (JLJ684), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 9KG N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylprop-2-enamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM imidazole pH 6.8, 14% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.55 Å R-free 0.250
5VQS Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)acrylamide (JLJ685), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 9KD N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)prop-2-enamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 14% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.50 Å R-free 0.242
5VQT Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 2-chloro-N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide (JLJ686), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 9K7 2-chloro-N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM imidazole pH 7.0, 16% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.56 Å R-free 0.241
5VQU Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-2-fluoro-N-methylacetamide (JLJ683), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 9JP N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-2-fluoro-N-methylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.60 Å R-free 0.263
5VQV Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacrylamide (JLJ684), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 9J1 N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylpropanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 16% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.58 Å R-free 0.258
5VQW Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)acrylamide (JLJ685), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 9KD N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)prop-2-enamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 16% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.50 Å R-free 0.257
5VQX Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with 2-chloro-N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide (JLJ686), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 9HY N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM imidazole pH 6.8, 16% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.40 Å R-free 0.262
5VQY Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (K103N, Y181C) Variant in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacrylamide (JLJ684), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, K103N, Y181C 突变：C280S 9J1 N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylpropanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM imidazole pH 6.8, 16% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.35 Å R-free 0.256
5VQZ Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (K103N, Y181C) Variant in Complex with 2-chloro-N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide (JLJ686), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, K103N, Y181C 突变：C280S 9HY N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM imidazole pH 6.8, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.23 Å R-free 0.259
6AMO STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.0 提交 2017-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：I63C, C280S 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS (tris(hydroxymethyl)aminomethane), MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.50 Å R-free 0.217
6AMO STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.0 提交 2017-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：I63C, C280S 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS (tris(hydroxymethyl)aminomethane), MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.50 Å R-free 0.217
6AN2 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.5 提交 2017-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.70 Å R-free 0.216
6AN2 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.5 提交 2017-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.70 Å R-free 0.216
6AN8 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.0 提交 2017-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.217
6AN8 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.0 提交 2017-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.217
6ANQ STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.5 提交 2017-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.59 Å R-free 0.219
6ANQ STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.5 提交 2017-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.59 Å R-free 0.219
6AOC Crystal Structure of an N-Hydroxythienopyrimidine-2,4-dione RNase H Active Site Inhibitor with Multiple Binding Modes to HIV Reverse Transcriptase 提交 2017-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain residues 168-722
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain residues 168-595
突变：C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 ZW2 6-benzyl-3-hydroxythieno[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 33 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, TRIS
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
6AOC Crystal Structure of an N-Hydroxythienopyrimidine-2,4-dione RNase H Active Site Inhibitor with Multiple Binding Modes to HIV Reverse Transcriptase 提交 2017-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain residues 168-722
链 D 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain residues 168-595
突变：C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 ZW2 6-benzyl-3-hydroxythieno[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, TRIS
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
6ASW STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.0 提交 2017-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.220
6ASW STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.0 提交 2017-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.220
6AVM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS-LINKING TO SECOND BASE TEMPLATE OVERHANG 提交 2017-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.50 Å R-free 0.229
6AVM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS-LINKING TO SECOND BASE TEMPLATE OVERHANG 提交 2017-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.50 Å R-free 0.229
6AVT STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS-LINKING TO FIRST BASE TEMPLATE OVERHANG 提交 2017-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.211
6AVT STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS-LINKING TO FIRST BASE TEMPLATE OVERHANG 提交 2017-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.211
6B19 Architecture of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core 提交 2017-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa） 片段：UNP residues 600-1159
链 B 600–1039（440 aa） 片段：UNP residues 600-1039
突变：Q260C, C282S, E480Q 突变：C282S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Beta-OG was added just prior to freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3.5 sec before plunging into liquid ethane.
分辨率 4.50 Å
6C0J Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor K-5a2 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S K5A 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 23 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.92 Å R-free 0.226
6C0K Crystal structure of HIV-1 K103N mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor K-5a2 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, K172A, K173A, C280S 突变：C280S K5A 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 10 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.96 Å R-free 0.219
6C0L Crystal structure of HIV-1 E138K mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor K-5a2 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：E138K, C280S K5A 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 26 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.95 Å R-free 0.219
6C0N Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 2.00 Å R-free 0.222
6C0O Crystal structure of HIV-1 K103N mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, K172A, K173A, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 10 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.90 Å R-free 0.209
6C0P Crystal structure of HIV-1 E138K mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：E138K, C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 27 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 2.05 Å R-free 0.215
6C0R Crystal structure of HIV-1 K103N/Y181C mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 31 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 2.05 Å R-free 0.212
6CGF Crystal structure of HIV-1 Y188L mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor K-5a2 提交 2018-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, residues 600-1027
突变：K172A, K173A, Y188L, C280S 突变：C280S K5A 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 23 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.94 Å R-free 0.232
6DTW HIV-1 Reverse Transcriptase Y181C Mutant in complex with JLJ 578 提交 2018-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C282S, K175A, K174A, Y181C 突变：C280S H9Y 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-6-fluoroindolizine-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；MES, PEG 8000, spermine, magnesium sulfate, ammonium sulfate, rilpivirine
分辨率 2.74 Å R-free 0.284
6DTX Wildtype HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with JLJ 578 提交 2018-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K175A, K174A, Y181C 突变：C280S H9Y 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-6-fluoroindolizine-2-carbonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, magnesium sulfate, spermine, MES (pH 6), rilpivirine.
分辨率 3.33 Å R-free 0.237
6DUF Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase V106A/F227L mutant in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：residues 600-1027
突变：V106A, K172A, K173A, F227L, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.96 Å R-free 0.228
6DUG Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase K101P mutant in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：residues 600-1027
突变：K101P, K172A, K173A, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 2.23 Å R-free 0.233
6DUH Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase Y181I mutant in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：residues 168-722
链 B 600–1027（428 aa） 片段：residues 600-1027
突变：K172A, K173A, Y181I, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 28 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 2.00 Å R-free 0.223
6ECL Crystal Structure of a 1,2,4-Triazole Allosteric RNase H Inhibitor in Complex with HIV Reverse Transcriptase 提交 2018-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain
突变：C879S 突变：C879S MN MANGANESE (II) ION × 2 T90 1-[4-methoxy-3-[[5-methyl-4-(phenylmethyl)-1,2,4-triazol-3-yl]sulfanylmethyl]phenyl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；277 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, BIS TRIS PROPANE
分辨率 2.38 Å R-free 0.229
6ELI Structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with rilpivirine and an RNase H inhibitor XZ462 提交 2017-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 BA5 methyl 4-azanyl-1-oxidanyl-2-oxidanylidene-1,8-naphthyridine-3-carboxylate × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, IMIDAZOLE
分辨率 2.20 Å R-free 0.221
6HAK Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with a double stranded RNA represents the RT transcription initiation complex prior to nucleotide incorporation 提交 2018-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 3.95 Å R-free 0.329
6HAK Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with a double stranded RNA represents the RT transcription initiation complex prior to nucleotide incorporation 提交 2018-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 3.95 Å R-free 0.329
6O9E Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA and INDOPY-1 提交 2019-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 4 NH4 AMMONIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 IY1 5-methyl-1-(4-nitrophenyl)-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrido[3,2-b]indole-3-carbonitrile × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.40 Å R-free 0.242
6O9E Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA and INDOPY-1 提交 2019-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 IY1 5-methyl-1-(4-nitrophenyl)-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrido[3,2-b]indole-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.40 Å R-free 0.242
6OE3 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ635), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2019-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S, C258Q 突变：C280S M9A 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.90 Å R-free 0.273
6OUN Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in complex with dsDNA and (-)3TC-TP 提交 2019-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1157（558 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 1RZ Lamivudine Triphosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；3-6% (w/v) PEG 8000, 15 mM magnesium sulfate, and 50 mM MES adjusted at pH 6.0
分辨率 2.66 Å R-free 0.259
6PRF HIV-1 Protease multiple drug resistant clinical isolate mutant PR20 with GRL-14213A 提交 2019-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L10F, I13V, I15V, D30N, V32I, L33F, E35D, M36I, S37N, I47V, I54L, Q58E, I62V, L63P, C67A, A71V, I84V, N88D, L89T, L90M, C95A 突变：Q7K, L10F, I13V, I15V, D30N, V32I, L33F, E35D, M36I, S37N, I47V, I54L, Q58E, I62V, L63P, C67A, A71V, I84V, N88D, L89T, L90M, C95A Y1 YTTRIUM ION × 9 7OA (3S,3aR,5R,7aS,8S)-hexahydro-4H-3,5-methanofuro[2,3-b]pyran-8-yl [(2S,3R)-4-[{[2-(cyclopropylamino)-1,3-benzothiazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-(3,5-difluorophenyl)-3-hydroxybutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.8 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate pH 5.5, 0.01M yittrium chloride
分辨率 1.21 Å R-free 0.190
6UL5 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with 4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]-2-fluorobenzonitrile (24b), a non-nucleoside RT inhibitor 提交 2019-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S QAG 4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]-2-fluorobenzonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；10%(v/v) PEG 8000, 4%(v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.23 Å R-free 0.245
6VUG Diabody bound to a Reverse Transcriptase Aptamer Complex 提交 2020-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, residues 600-1154
未记录 SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 M Ammonium Sulfate 0.1 M HEPES pH 7.8 0.1 M NaCl
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
6WAZ +1 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (pre-translocation state) 提交 2020-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Full complex was prepared 5-8 hours before freezing. Beta-OG was added just prior to freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliters applied, 2s pre-blot, 1.5s blot.
分辨率 4.10 Å
6WB0 +3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (pre-translocation state) 提交 2020-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q 突变：C879S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Full complex was prepared 5-8 hours before freezing. Beta-OG was added just prior to freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliters applied, 2s pre-blot, 2.5s blot.
分辨率 4.20 Å
6WB1 +3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (intermediate state) 提交 2020-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Full complex was prepared 5-8 hours before freezing. Beta-OG was added just prior to freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliters applied, 2s pre-blot, 2.5s blot.
分辨率 4.70 Å
6WB2 +3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (displaced state) 提交 2020-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q 突变：C879S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Full complex was prepared 5-8 hours before freezing. Beta-OG was added just prior to freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliters applied, 2s pre-blot, 2.5s blot.
分辨率 4.50 Å
6X47 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ649), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7AX 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.77 Å R-free 0.267
6X49 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ649), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 7AX 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.75 Å R-free 0.251
6X4A Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with 5-chloro-7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-8-methyl-2-naphthonitrile (JLJ651), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 7AY 5-chloro-7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-8-methyl-2-naphthonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.54 Å R-free 0.269
6X4B Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-5-fluoro-8-methyl-2-naphthonitrile (JLJ655), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S UMY 7-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-5-fluoro-8-methylnaphthalene-2-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.50 Å R-free 0.259
6X4C Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-5,8-dimethyl-2-naphthonitrile (JLJ658), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S UNS 7-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-5,8-dimethylnaphthalene-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.86 Å R-free 0.258
6X4D Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-(cyclopropylmethyl)-7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-8-methyl-2-naphthonitrile (JLJ678), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S UO4 5-(cyclopropylmethyl)-7-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-8-methylnaphthalene-2-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.65 Å R-free 0.258
6X4E Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with methyl 2-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)acetate (JLJ681), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S UMV methyl (6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)acetate × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.60 Å R-free 0.259
6X4F Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with methyl 2-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)acetate (JLJ681), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S UMV methyl (6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)acetate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.72 Å R-free 0.252
7AHX HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 REK D-Aspartate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.73 Å R-free 0.254
7AHX HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 REK D-Aspartate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.73 Å R-free 0.254
7AID HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR 提交 2020-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 3.15 Å R-free 0.250
7AID HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR 提交 2020-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S REK D-Aspartate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 3.15 Å R-free 0.250
7AIF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 RE5 L-Glutamate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.75 Å R-free 0.249
7AIF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 RE5 L-Glutamate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.75 Å R-free 0.249
7AIG HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.95 Å R-free 0.257
7AIG HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S RE5 L-Glutamate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.95 Å R-free 0.257
7AII HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 RFE L-Methionine Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.62 Å R-free 0.255
7AII HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 RFE L-Methionine Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.62 Å R-free 0.255
7AIJ HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.95 Å R-free 0.263
7AIJ HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S RFE L-Methionine Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.95 Å R-free 0.263
7KJV Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core 提交 2020-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q MG MAGNESIUM ION × 1 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7KJW Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core with efavirenz 提交 2020-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q MG MAGNESIUM ION × 1 EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7KJX Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core with nevirapine 提交 2020-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q MG MAGNESIUM ION × 1 NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7KRC Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-4-(3-chloro-5-(2-cyanovinyl)phenoxy)-3-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenyl sulfurofluoridate (JLJ709) 提交 2020-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 X2J 4-{3-chloro-5-[(E)-2-cyanoethenyl]phenoxy}-3-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenyl sulfurofluoridate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.65 Å R-free 0.265
7KRD Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 4-(3-chloro-5-cyanophenoxy)-3-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenyl sulfurofluoridate (JLJ702) 提交 2020-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 X2S 4-(3-chloro-5-cyanophenoxy)-3-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenyl sulfurofluoridate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
7KRE Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 4-((6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy)-3-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenyl sulfurofluoridate (JLJ704) 提交 2020-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 X2V 4-[(6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy]-3-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenyl sulfurofluoridate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.73 Å R-free 0.261
7KRF Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-4-(3-(2-cyanovinyl)-5-fluorophenoxy)-3-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenyl sulfurofluoridate (JLJ710) 提交 2020-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 X2G 4-{3-[(E)-2-cyanoethenyl]-5-fluorophenoxy}-3-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenyl sulfurofluoridate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.60 Å R-free 0.265
7KWU Crystal Structure of HIV-1 RT in Complex with 16c (K07-15) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 K7F 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)-5-(pyridin-4-yl)pyrimidin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%(v/v) PEG 8000, 4%(v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3-6.6, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.02 Å R-free 0.259
7LPW Crystal Structure of HIV-1 RT in Complex with NBD-14189 提交 2021-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 YBA ~{N}-[(1~{S})-2-azanyl-1-[4-(hydroxymethyl)-1,3-thiazol-2-yl]ethyl]-5-[3-fluoranyl-4-(trifluoromethyl)phenyl]-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；10% PEG 8,000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.6,10 mM spermine, 15 mM MgSO4,100 mM (NH4)2SO4, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine(TCEP)
分辨率 2.32 Å R-free 0.248
7LPX Crystal Structure of HIV-1 RT in Complex with NBD-14270 提交 2021-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 4 YB7 ~{N}-[(1~{S})-2-azanyl-1-[5-(hydroxymethyl)-1,3-thiazol-2-yl]ethyl]-3-methyl-5-[5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；10% PEG 8,000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.6,10 mM spermine, 15 mM MgSO4,100 mM (NH4)2SO4, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine(TCEP)
分辨率 2.45 Å R-free 0.250
7LQU Crystal Structure of HIV-1 RT in Complex with NBD-14075 提交 2021-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S YBD ~{N}-[(1~{R})-2-azanyl-1-[5-(hydroxymethyl)-1,3-thiazol-2-yl]ethyl]-5-(4-chloranyl-3-fluoranyl-phenyl)-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；10% PEG 8,000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.6,10 mM spermine, 15 mM MgSO4,100 mM (NH4)2SO4, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine(TCEP)
分辨率 2.60 Å R-free 0.310
7LRI Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, dTTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.05 Å R-free 0.244
7LRI Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, dTTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.05 Å R-free 0.244
7LRM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, dCTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.14 Å R-free 0.244
7LRM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, dCTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.14 Å R-free 0.244
7LRX Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, L-dCTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 1S0 4-amino-1-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one × 1 CA CALCIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
7LRX Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, L-dCTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 1S0 4-amino-1-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one × 1 CA CALCIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
7LRY Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, (-)FTC-TP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 7 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 1RY [[(2R,5S)-5-(4-azanyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)-1,3-oxathiolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.45 Å R-free 0.222
7LRY Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, (-)FTC-TP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 NH4 AMMONIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 1RY [[(2R,5S)-5-(4-azanyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)-1,3-oxathiolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.45 Å R-free 0.222
7LSK Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, L-dTTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 XRF 1-{2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.70 Å R-free 0.253
7LSK Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, L-dTTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 XRF 1-{2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.70 Å R-free 0.253
7OT6 HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND inhibitor RMC-282 提交 2021-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
7OT6 HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND inhibitor RMC-282 提交 2021-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1I4 (R)-N-(1-(6-amino-9H-purin-9-yl)propan-2-yl)-N-(2-phosphonoethyl)glycine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
7OTA HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-230 提交 2021-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.00 Å R-free 0.269
7OTA HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-230 提交 2021-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1I1 ((2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethyl)-L-seryl)phosphoramidic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.00 Å R-free 0.269
7OTK HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-233 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 2.95 Å R-free 0.271
7OTK HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-233 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1IA (2~{R})-2-[2-(6-aminopurin-9-yl)ethylamino]-3-phosphono-propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 2.95 Å R-free 0.271
7OTN HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-247 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 1IH (S)-2-((2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethyl)amino)-3-phosphonopropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
7OTN HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-247 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 1IH (S)-2-((2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethyl)amino)-3-phosphonopropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
7OTX HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-257 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.45 Å R-free 0.251
7OTX HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-257 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1IK (S)-2-((3-(6-amino-9H-purin-9-yl)propyl)amino)-3-phosphonopropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.45 Å R-free 0.251
7OTZ HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-259 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7OTZ HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-259 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1IO (S)-2-(2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethoxy)-3-phosphonopropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7OUT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-264 提交 2021-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.20 Å R-free 0.265
7OUT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-264 提交 2021-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1KK (S)-2-(3-(6-amino-9H-purin-9-yl)propoxy)-3-phosphonopropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.20 Å R-free 0.265
7OXQ Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA in complex with fragment 048 at the transient P-pocket. 提交 2021-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 3.30 Å R-free 0.296
7OXQ Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA in complex with fragment 048 at the transient P-pocket. 提交 2021-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 12 2NU 2-(4-bromanylpyrazol-1-yl)-~{N}-cyclopropyl-~{N}-methyl-ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 3.30 Å R-free 0.296
7OZ2 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA showing a transient P-pocket 提交 2021-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 16 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 2.85 Å R-free 0.257
7OZ2 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA showing a transient P-pocket 提交 2021-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 2.85 Å R-free 0.257
7OZ5 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA in complex with fragment 166 at the transient P-pocket. 提交 2021-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 3.37 Å R-free 0.265
7OZ5 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA in complex with fragment 166 at the transient P-pocket. 提交 2021-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 9 3IR (1~{R},2~{R})-2-phenyl-~{N}-(1,3-thiazol-2-yl)cyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 3.37 Å R-free 0.265
7OZW Cryo-EM structure of HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with fragment 166 at the transient P-pocket 提交 2021-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：P66 subunit
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 subunit
未记录 3IR (1~{R},2~{R})-2-phenyl-~{N}-(1,3-thiazol-2-yl)cyclopropane-1-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7P15 Cryo-EM structure of HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with fragment F04 at the transient P-pocket 提交 2021-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：P66 subunit
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 subunit
未记录 4OI (1~{R},2~{R})-~{N}-(1~{H}-pyrazol-4-yl)-2-pyridin-3-yl-cyclopropane-1-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7SEP Cryo-EM Structure of the RT component of the HIV-1 Pol Polyprotein 提交 2021-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 479–1447（969 aa） 片段：PR-RT portion, residues 479-1447
链 B 479–1447（969 aa） 片段：PR-RT portion, residues 479-1447
突变：D131A, L765D, F766D 突变：D131A, L765D, F766D 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7SIF Crystal Structure of HLA B*3505 in complex with NPDIVIYQY, an 9-mer epitope from HIV-I 提交 2021-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 774–782（9 aa） 片段：UNP residues 774-782
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M BIS-TRIS, 25% PEG3350
分辨率 1.73 Å R-free 0.230
7SIG Crystal Structure of HLA B*3501 in complex with NPDIVIYQY, an 9-mer epitope from HIV-I 提交 2021-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 774–782（9 aa） 片段：UNP residues 774-782
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2M Ammonium Acetate, 20% PEG4000
分辨率 1.74 Å R-free 0.216
7SIH Crystal Structure of HLA B*3503 in complex with NPDIVIYQY, an 9-mer epitope from HIV-I 提交 2021-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 774–782（9 aa） 片段：UNP residues 774-782
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M HEPES, 20% PEG8000
分辨率 1.90 Å R-free 0.232
7SJX Cryo-EM Structure of the PR-RT components of the HIV-1 Pol Polyprotein 提交 2021-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 479–1447（969 aa） 片段：PR-RT portion, residues 479-1447
链 B 479–1447（969 aa） 片段：PR-RT portion, residues 479-1447
突变：D131A, L765D, F766D 突变：D131A, L765D, F766D 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
7SNL Disulfide stabilized HIV-1 CA hexamer in complex with capsid inhibitor N-(1-(3-(4-chloro-1-methyl-3-(methylsulfonamido)-1H-indazol-7-yl)-4-oxo-3,4-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl)-2-(3,5-difluorophenyl)ethyl)-2-(3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazol-1-yl)acetamide 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 133–363（231 aa）
突变：A14C, E45C, W184A, M185A 9VI N-[(1S)-1-(3-{4-chloro-3-[(methanesulfonyl)amino]-1-methyl-1H-indazol-7-yl}-4-oxo-3,4-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl)-2-(3,5-difluorophenyl)ethyl]-2-[3-(trifluoromethyl)-6,7-dihydro-1H-indazol-1-yl]acetamide × 6 IOD IODIDE ION × 24 CL CHLORIDE ION × 42 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2M NaI, 9% peg 3350, 6% glycerol, 0.1M sodium cacodylate trihydrate pH 6.5
分辨率 2.39 Å R-free 0.261
7SNN Disulfide stabilized HIV-1 CA hexamer in complex with capsid inhibitor N-(1-(3-(4-chloro-1-methyl-3-(methylsulfonamido)-1H-indazol-7-yl)-4-oxo-3,4-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl)-2-(3,5-difluorophenyl)ethyl)-2-(3-(difluoromethyl)-5,6-dihydrocyclopenta[c]pyrazol-1(4H)-yl)acetamide 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 133–363（231 aa）
突变：A14C, E45C, W184A, M185A IOD IODIDE ION × 18 9WW N-[(1S)-1-(3-{4-chloro-3-[(methanesulfonyl)amino]-1-methyl-1H-indazol-7-yl}-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-2-yl)-2-(3,5-difluorophenyl)ethyl]-2-[(3aM)-3-(difluoromethyl)cyclopenta[c]pyrazol-1(2H)-yl]acetamide × 6 CL CHLORIDE ION × 42 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.275M NaI, 7.5% peg 3350, 6% glycerol, 0.1M sodium cacodylate trihydrate pH 6.5
分辨率 2.37 Å R-free 0.233
7SNP Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-3-(3-chloro-5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-(2-morpholinoethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ530) 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 9UV (2E)-3-(3-chloro-5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-[2-(morpholin-4-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5
分辨率 2.89 Å R-free 0.272
7SNQ Hexamer HIV-1 CA in complex with CPSF6 peptide and IP6 ligand 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 133–363（231 aa）
链 B 133–363（231 aa）
链 C 133–363（231 aa）
链 D 133–363（231 aa）
链 E 133–363（231 aa）
链 F 133–363（231 aa）
突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1M Tris pH 8.2, 8% peg 8000, 5% Glycerol
分辨率 2.81 Å R-free 0.282
7SNQ Hexamer HIV-1 CA in complex with CPSF6 peptide and IP6 ligand 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 133–363（231 aa）
链 H 133–363（231 aa）
链 I 133–363（231 aa）
链 J 133–363（231 aa）
链 K 133–363（231 aa）
链 L 133–363（231 aa）
突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1M Tris pH 8.2, 8% peg 8000, 5% Glycerol
分辨率 2.81 Å R-free 0.282
7SNZ Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 6-((2-((4-cyanophenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)-5,7-dimethylindolizine-2-carbonitrile (JLJ604) 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 9WI (4R)-6-{[2-(4-cyanoanilino)pyrimidin-4-yl]amino}-5,7-dimethylindolizine-2-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5
分辨率 2.37 Å R-free 0.245
7SO1 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-4-((4-((4-(2-cyanovinyl)-2,6-dimethylphenyl)amino)-6-(3-morpholinopropoxy)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)benzonitrile (JLJ564) 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 9W3 4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylanilino}-6-[3-(morpholin-4-yl)propoxy]-1,3,5-triazin-2-yl)amino]benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5
分辨率 2.73 Å R-free 0.264
7SO2 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase Y181C Variant in Complex with (E)-4-((4-((4-(2-cyanovinyl)-2,6-dimethylphenyl)amino)-6-(3-morpholinopropoxy)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)benzonitrile (JLJ564) 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C 9W3 4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylanilino}-6-[3-(morpholin-4-yl)propoxy]-1,3,5-triazin-2-yl)amino]benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5
分辨率 3.09 Å R-free 0.282
7SO3 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase K103N/Y181C Variant in Complex with (E)-4-((4-((4-(2-cyanovinyl)-2,6-dimethylphenyl)amino)-6-(3-morpholinopropoxy)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)benzonitrile (JLJ564) 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, Y181C 9W3 4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylanilino}-6-[3-(morpholin-4-yl)propoxy]-1,3,5-triazin-2-yl)amino]benzonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5
分辨率 2.77 Å R-free 0.272
7SO4 Crystal Structure of HIV-1 Y181C mutant Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ635), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C M9A 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.95 Å R-free 0.274
7SO6 Crystal Structure of HIV-1 K103N, Y181C mutant Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ635), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 M9A 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；0 mM MES pH 6.0, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.79 Å R-free 0.275
7TAZ Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with VM-1500A, a non-nucleoside RT inhibitor 提交 2021-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C180S 突变：C280S VM5 2-[4-bromo-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)-2-fluorophenyl]-N-(2-chloro-4-sulfamoylphenyl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；PEG 8,000, ammonium sulfate, Bis tris propane, ethylene glycol
分辨率 2.40 Å R-free 0.279
7U5Z Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with JLJ353 提交 2022-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S 突变：C879S LE8 2-chloro-4-({5-[(2,6-difluorophenyl)methyl]-1,3-oxazol-2-yl}amino)benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277.15 K；50 mM imidazole pH 6.4, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.30 Å R-free 0.280
7Z24 Cryo-EM structure of HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with nevirapine 提交 2022-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 subunit
未记录 NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
7Z29 Cryo-EM structure of NNRTI resistant M184I/E138K mutant HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with nevirapine 提交 2022-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M184I 突变：E138K NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7Z2D Cryo-EM structure of HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with rilpivirine 提交 2022-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 subunit
未记录 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7Z2E Cryo-EM structure of NNRTI resistant M184I/E138K mutant HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with rilpivirine 提交 2022-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M184I 突变：E138K T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
7Z2G Cryo-EM structure of HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with doravirine 提交 2022-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 subunit
未记录 2KW 3-chloro-5-({1-[(4-methyl-5-oxo-4,5-dihydro-1H-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-2-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,2-dihydropyridin-3-yl}oxy)benzonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
7Z2H Cryo-EM structure of NNRTI resistant M184I/E138K mutant HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with doravirine 提交 2022-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M184I 突变：E138K 2KW 3-chloro-5-({1-[(4-methyl-5-oxo-4,5-dihydro-1H-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-2-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,2-dihydropyridin-3-yl}oxy)benzonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
8DX2 HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 4-amino-3-bromopyridine at multiple sites 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 V06 3-bromopyridin-4-amine × 4 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
8DX3 HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 3-bromobenzylamine in the thumb subdomain 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S 4JH 1-(3-bromophenyl)methanamine × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.06 Å R-free 0.228
8DX8 HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 2-chloro-6-fluorophenethylamine at the 415 site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S W15 2-(2-chloro-6-fluorophenyl)ethan-1-amine × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.85 Å R-free 0.223
8DXB HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 5-fluoroindole-2-carboxylic acid at the NNRTI Adjacent site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K174A, K175A, C282S 突变：C280S FIC 5-fluoroindole-2-carboxylic acid × 2 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALVEICTEMEKEGKISKIGPENPYNTPVFAIKKKDSTKWRKLVDFREL NKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLDVGDAYFSVPLDEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIF QSSMTKILEPFKKQNPDIVIYQYMDDLYVGSDLEIGQHRTKIEELRQHLLRWGLTTPDKKHQKEPPFLWMGYELHPDKWT VQPIVLPEKDSWTVNDIQKLVGKLNWASQIYPGIKVRQLSKLLRGTKALTEVIPLTEEAELELAENREILKEPVHGVYYD PSKDLIAEIQKQGQGQWTYQIYQEPFKNLKTGKYARMRGAHTNDVKQLTEAVQKITTESIVIWGKTPKFKLPIQKETWET WWTEYWQATWIPEWEFVNTPPLVKLWYQ
分辨率 2.10 Å R-free 0.235
8DXE HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 2-amino-6-fluorobenzonitrile at the NNRTI adjacent site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S 0IF 2-amino-6-fluorobenzonitrile × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.85 Å R-free 0.217
8DXG HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 5-(trifluoromethyl)pyridin-2-ol at W24 site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S U4D 5-(trifluoromethyl)pyridin-2-one × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
8DXH HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 5-fluoroquinazolin-4-ol at W266 site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S JBQ 5-fluoranyl-3,4-dihydroquinazolin-4-ol × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.80 Å R-free 0.213
8DXI HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment [1-(4-fluorophenyl)-5-methyl-1H-pyrazol-4-yl]methanol at multiple sites 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K174A, K175A, C282S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 FMQ [1-(4-fluorophenyl)-5-methyl-1H-pyrazol-4-yl]methanol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.95 Å R-free 0.218
8DXJ HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 1-N-methyl-4-(trifluoromethyl)benzene-1,2-diamine at the NNRTI adjacent site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 U43 N~1~-methyl-4-(trifluoromethyl)benzene-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.80 Å R-free 0.207
8DXK HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 4-bromopyrazole at multiple sites 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 BYZ 4-bromo-1H-pyrazole × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.00 Å R-free 0.215
8DXL HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 4-iodopyrazole at multiple sites 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 PYZ 4-IODOPYRAZOLE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.25 Å R-free 0.208
8DXM HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 4-bromophenol at the Knuckles site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S BML 4-BROMOPHENOL × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.99 Å R-free 0.208
8FE8 Crystal Structure of HIV-1 RT in Complex with the non-nucleoside inhibitor 18b1 提交 2022-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S XRB 5-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}pyrimidin-2-yl)amino]-2-[4-(methanesulfonyl)piperazin-1-yl]benzonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%(v/v) PEG 8000, 4%(v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3-6.6, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.50 Å R-free 0.277
8FFX Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 19980 提交 2022-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 XU9 ethyl (8S)-4-(cyclopropylethynyl)pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxylate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%(v/v) PEG 8000, 4%(v/v) PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.6, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.42 Å R-free 0.266
8STP Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) varient in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ555), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, Y181C, K172A, K173A 29T 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；50 mM HEPES pH 7.5, 12% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 3.09 Å R-free 0.252
8STQ Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) varient in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ600), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, C280S, K172A, K173A 突变：C280S 3LQ 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM MES pH 7.0, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.96 Å R-free 0.278
8STR Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) varient in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ636), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7N1 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM MES/Imidazole/HEPES pH 6.0-7.0, 16-20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.77 Å R-free 0.268
8STS Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) varient in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ636), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1155（556 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, V106A, C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7N1 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 3.02 Å R-free 0.285
8STS Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) varient in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ636), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1155（556 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, V106A, C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7N1 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 3.02 Å R-free 0.285
8STT Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) varient in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ555), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1155（556 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, Y181C, V106A, K172A, K173A 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 1 29T 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.62 Å R-free 0.291
8STT Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) varient in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ555), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1155（556 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C879S, Y181C, V106A, K172A, K173A 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 1 29T 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.62 Å R-free 0.291
8STU Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) variant in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-6-fluoroindolizine-2-carbonitrile (JLJ578), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, V106A, C280S, K172A, K173A 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 H9Y 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-6-fluoroindolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；50 mM MES pH 6.0, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.76 Å R-free 0.280
8STV Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) variant in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ600), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1155（556 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, V106A, C280S, K172A, K173A 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 3LQ 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 16% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.78 Å R-free 0.276
8STV Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) variant in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ600), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1155（556 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, V106A, C280S, K172A, K173A 突变：C280S EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 3LQ 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 16% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.78 Å R-free 0.276
8U69 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-chloro-5-(4-chloro-2-(2-(5-chloro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)benzonitrile (JLJ334), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VQ0 3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(5-chloro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM MES pH 5.5, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.45 Å R-free 0.260
8U6A Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (JLJ729), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VQK N-(3-{2-[5-chloro-2-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenoxy]ethyl}phenyl)prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；50 mM MES pH 5.0, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.37 Å R-free 0.271
8U6B Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenethyl)acrylamide (JLJ731), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A VTN N-{2-[4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenyl]ethyl}prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM MES pH 5.5, 21.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.35 Å R-free 0.264
8U6C Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 2-chloro-N-(4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenethyl)acetamide (JLJ732), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VWU 2-chloro-N-{2-[4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenyl]ethyl}acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；50 mM MES pH 5.0, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
8U6D Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ736), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VTS N-{2-[4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenoxy]ethyl}-N-methylprop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；50 mM MES pH 5.0, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.33 Å R-free 0.266
8U6E Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenethyl)-N-methylacrylamide (JLJ738), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VTV N-{2-[4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenyl]ethyl}-N-methylprop-2-enamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM Imidazole pH 6.0, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.31 Å R-free 0.293
8U6F Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(5-chloro-2-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ742), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1151（552 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VU8 N-{2-[5-chloro-2-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenoxy]ethyl}-N-methylprop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM Imidazole pH 6.5, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.69 Å R-free 0.284
8U6G Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-(2-(3-acryloyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-1-yl)ethoxy)-4-chlorophenoxy)-5-chlorobenzonitrile (JLJ744), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1152（553 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VVE 3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2-oxo-3-propanoyl-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-1-yl)ethoxy]phenoxy}benzonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM Imidazole pH 6.8, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.77 Å R-free 0.270
8U6H Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-(2-(3-acryloyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-1-yl)ethoxy)-4-chlorophenoxy)-5-chlorobenzonitrile (JLJ744), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VVE 3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2-oxo-3-propanoyl-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-1-yl)ethoxy]phenoxy}benzonitrile × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；50 mM Imidazole pH 6.3, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.99 Å R-free 0.279
8U6H Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-(2-(3-acryloyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-1-yl)ethoxy)-4-chlorophenoxy)-5-chlorobenzonitrile (JLJ744), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VVE 3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2-oxo-3-propanoyl-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-1-yl)ethoxy]phenoxy}benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；50 mM Imidazole pH 6.3, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.99 Å R-free 0.279
8U6I Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(2-((2-cyanoindolizin-8-yl)oxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ745), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VVN N-[2-(2-{[(4R)-2-cyanoindolizin-8-yl]oxy}phenoxy)ethyl]-N-methylpropanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；50 mM Imidazole pH 6.3, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.46 Å R-free 0.278
8U6J Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(5-chloro-2-((2-cyanoindolizin-8-yl)oxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ746), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VR9 N-[2-(5-chloro-2-{[(4R)-2-cyanoindolizin-8-yl]oxy}phenoxy)ethyl]-N-methylpropanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.64 Å R-free 0.274
8U6K Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(2-((6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ747), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VRF N-(2-{2-[(6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy]phenoxy}ethyl)-N-methylprop-2-enamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；50 mM MES pH 5.0, 11% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.72 Å R-free 0.276
8U6L Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(5-chloro-2-((6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ748), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VRQ N-(2-{5-chloro-2-[(6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy]phenoxy}ethyl)-N-methylprop-2-enamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM MES pH 5.5, 11% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.49 Å R-free 0.267
8U6M Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(2-((6-chloro-2-cyanoindolizin-8-yl)oxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ751), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VW2 N-[2-(2-{[(4R)-6-chloro-2-cyanoindolizin-8-yl]oxy}phenoxy)ethyl]-N-methylpropanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 22.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.62 Å R-free 0.266
8U6N Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-((6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy)phenoxy)-N,N-dimethylpropanamide (JLJ752), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1136（537 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VWK 3-{2-[(6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy]phenoxy}-N,N-dimethylpropanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM Tris pH 7.5, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.74 Å R-free 0.291
8U6O Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with5-(2-(3-oxo-3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ753), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VWB 5-{2-[3-oxo-3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.48 Å R-free 0.269
8U6P Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-((2-cyanoindolizin-8-yl)oxy)phenoxy)-N,N-dimethylpropanamide (JLJ754), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VOI 3-(2-{[(4S)-2-cyanoindolizin-8-yl]oxy}phenoxy)-N,N-dimethylpropanamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM MES pH 5.5, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.81 Å R-free 0.260
8U6Q Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 8-(2-(3-oxo-3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ755), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VOU (4S)-8-{2-[3-oxo-3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；50 mM Imidazole pH 6.3, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.55 Å R-free 0.270
8U6R Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-((2-cyanoindolizin-8-yl)oxy)phenoxy)-N-(2,2-difluoroethyl)propanamide (JLJ756), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1151（552 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VP2 3-(2-{[(4R)-2-cyanoindolizin-8-yl]oxy}phenoxy)-N-(2,2-difluoroethyl)propanamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM Imidazole pH 6.5, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.87 Å R-free 0.261
8U6S Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 8-(2-(3-morpholino-3-oxopropoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ757), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1151（552 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VPB (4S)-8-{2-[3-(morpholin-4-yl)-3-oxopropoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM Imidazole pH 6.8, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.99 Å R-free 0.299
8U6T Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(3-acryloyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-1-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ758), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VO8 5-(2-{2-[2-oxo-3-(prop-2-enoyl)-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-1-yl]ethoxy}phenoxy)naphthalene-2-carbonitrile × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM MES pH 5.5, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.25 Å R-free 0.287
8VB6 Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VB7 Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N MG MAGNESIUM ION × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VB8 Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8VB9 Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8VBC Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8VBD Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VBE Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8VBF Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8VBG Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N F2A 2'-deoxy-5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]adenosine × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8VBH Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.20 Å
8VBI Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8VU9 Crystal structure of wild-type HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 5i3 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S WB3 (2E)-3-[4-({2-[(1-{[4-(methanesulfonyl)phenyl]methyl}piperidin-4-yl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)-3,5-dimethylphenyl]prop-2-enenitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% (v/v) poly(ethylene glycol) (PEG) 8000, 4% (v/v) PEG 400, 100 mM MES, pH 6.3, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 1.99 Å R-free 0.244
8VUB Crystal structure of wild-type HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 5e2 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S PKX 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)-6,7-dimethoxyquinazolin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzamide × 1 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% (v/v) poly(ethylene glycol) (PEG) 8000, 4% (v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.18 Å R-free 0.242
8VUF Crystal structure of GH9 (K101P, K103N, V108I) HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 5i3 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S, K101P, K103N, V108I 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 8 WB3 (2E)-3-[4-({2-[(1-{[4-(methanesulfonyl)phenyl]methyl}piperidin-4-yl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)-3,5-dimethylphenyl]prop-2-enenitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% (v/v) poly(ethylene glycol) (PEG) 8000, 4% (v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.36 Å R-free 0.247
8VUM Crystal structure of GH9 (K101P, K103N, V108I) HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 5e2 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S, K101P, K103N, V108I 突变：C280S EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 SO4 SULFATE ION × 7 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PKX 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)-6,7-dimethoxyquinazolin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% (v/v) poly(ethylene glycol) (PEG) 8000, 4% (v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.15 Å R-free 0.265
9MXB Crystal Structure of WT HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy] phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile (JLJ648), a non-nucleoside inhibitor 提交 2025-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 A1BTU 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM Citric Acid pH 5.5, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.37 Å R-free 0.275
9MXQ Cryo-EM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase p66 Homodimer 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1154（555 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM Tris pH 7.0, 25mM NaCl, 5% Glycerol, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
9MXR Cryo-EM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase p66 Homodimer in Complex with 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy] phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile (JLJ648), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1154（555 aa）
未记录 A1BTU 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM Tris pH 7.0, 25mM NaCl, 5% Glycerol, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9MXS Cryo-EM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase p66 Homodimer in Complex with 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy] phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile, a Non-nucleoside Inhibitor, with an Additional Pocket of Density 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1154（555 aa）
未记录 A1BTU 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM Tris pH 7.0, 25mM NaCl, 5% Glycerol, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9MXT Cryo-EM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase p66 tetramer in Complex with 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile (JLJ648), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1154（555 aa）
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1154（555 aa）
未记录 A1BTU 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM Tris pH 7.0, 25mM NaCl, 5% Glycerol, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9NW9 CA117v2v8 Fab bound to HLA-E-RL9HIV 提交 2025-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 275–283（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M magnesium chloride, 20% PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.239

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 POL_HV1B1
Isoform —
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 3–556； UniProt 600–1153 作者链 C； PDB构建体 3–556； UniProt 600–1153 作者链 B； PDB构建体 1–428； UniProt 600–1027 作者链 D； PDB构建体 1–428； UniProt 600–1027

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4puo

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4puo
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4puo
沉积日期 deposition_date2014-03-13
结构标题 titleCrystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with RNA/DNA and Nevirapine
关键词 keywords;fingers, palm, thumb, connection, RNase H, nucleotidyltransferase, DNA-directed DNA polymerase, RNA-directed DNA polymerase, Nuclease, Ribonuclease H, tRNA, TRANSFERASE, HYDROLASE-DNA-RNA-INHIBITOR complex ;; TRANSFERASE, HYDROLASE/DNA/RNA/INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier47.31 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron47.07 Å
零角强度 I(0) i0931078000.00
分子量 molecular_weight248310.0 kDa
排除体积 excluded_volume308560 ų
包络体积 envelope_volume446770 ų
水化壳体积 shell_volume77845 ų
包络直径 envelope_diameter151.3 Å
壳层 Rg shell_rg52.22 Å
包络 Rg envelope_rg46.25 Å
形状 Rg shape_rg47.03 Å
总 Rg total_rg47.39 Å
总原子数 total_atoms17462
残基数 n_residues2011
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax154.2 Å
Rg (实空间) rg_real47.21 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.22 Å
I(0) (实空间) i0_real9.3110e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.6120e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal47.31 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal931200000.0000
解质量估计 total_estimate0.8296
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary56.1 Å
偏度 Skewness skewness0.200
峰度 Kurtosis kurtosis-0.674
角度范围 angular_range— – 0.1650 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha103400000.0000
实空间数据点数 n_real_points34
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.927; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 26 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd4puoa1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.2 — Reverse transcriptase
结构域编号 domain_idd4puoa2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.3 — Ribonuclease H-like
家族 Family familyc.55.3.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4puoa3
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd4puob_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.2 — Reverse transcriptase
结构域编号 domain_idd4puoc1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.2 — Reverse transcriptase
结构域编号 domain_idd4puoc2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.3 — Ribonuclease H-like
家族 Family familyc.55.3.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4puoc3
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd4puod_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.2 — Reverse transcriptase

CATH v4.4 (18 domains)

结构域编号 domain_id4puoA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase, subunit A, domain 1
结构域编号 domain_id4puoA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoA04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoA05
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H
结构域编号 domain_id4puoB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase, subunit A, domain 1
结构域编号 domain_id4puoB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoB03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoB04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase, subunit A, domain 1
结构域编号 domain_id4puoC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoC03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoC04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoC05
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H
结构域编号 domain_id4puoD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase, subunit A, domain 1
结构域编号 domain_id4puoD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoD03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4puoD04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
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8. 引用文献 (6)

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9. 文件与曲线 (10)