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4qev

Crystal structure of BRD2(BD2) mutant with ligand ME bound (METHYL (2R)- 2-[(4S)-6-(4-CHLOROPHENYL)-8-METHOXY-1-METHYL-4H-[1,2,4]TRIAZOLO[4,3-A][1, 4]BENZODIAZEPIN-4-YL]PROPANOATE)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Bromodomain-containing protein 2

Homo sapiens

UniProt P25440

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 methyl (2R)-2-[(4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepin-4-yl]propanoate × 1 NONAETHYLENE GLYCOL × 1 NICKEL (II) ION × 1 GLYCEROL × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 methyl (2R)-2-[(4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepin-4-yl]propanoate × 2 NONAETHYLENE GLYCOL × 2 NICKEL (II) ION × 2 GLYCEROL × 2 water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 methyl (2R)-2-[(4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepin-4-yl]propanoate × 2 NONAETHYLENE GLYCOL × 2 NICKEL (II) ION × 2 GLYCEROL × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
2dvv 2g4a 3aqa 3aqa 3aqa 4mr5 4mr6 4qeu 4qev 4qew 4uyf 4uyf

共 163 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
1x0j 1x0j 2dvq 2dvr 2dvs 2ydw 2ydw 2yek 2yek 3aqa 3aqa 4a9e

共 72 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源四聚体
7wln 7wmq 8wyg 8z69

共 4 个 assembly

其他同源多聚体
7dpn 7wna

共 2 个 assembly

异源或核酸复合物
2dvq 2dvr 2dvs 2e3k 2e3k 5u5s 6u71 6ult 6ult 6ult 6ult 7jx7

共 24 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BRD2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 3–114； UniProt 344–455

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4qev
沉积日期 deposition_date2014-05-19
结构标题 titleCrystal structure of BRD2(BD2) mutant with ligand ME bound (METHYL (2R)- 2-[(4S)-6-(4-CHLOROPHENYL)-8-METHOXY-1-METHYL-4H-[1,2,4]TRIAZOLO[4,3-A][1, 4]BENZODIAZEPIN-4-YL]PROPANOATE)
关键词 keywordsBromodomain-containing protein 2, KIAA9001, RING3, Transcription regulation, transcription-transcription inhibitor complex; transcription/transcription inhibitor
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4qev__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4qev__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4qev__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）15.60 Å
Rg（电子密度）14.40 Å
总 Rg15.52 Å
原子数966
残基数110
排除体积17230 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4qev__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4qev__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 4qev__assembly_3__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd4qeva_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamilya.29.2 — Bromodomain
家族 Family familya.29.2.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id4qevA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bromodomain-like
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7. 引用文献 (1)