4qx0

Cry3A Toxin structure obtained by Serial Femtosecond Crystallography from in vivo grown crystals isolated from Bacillus thuringiensis and data processed with the cctbx.xfel software suite

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pesticidal crystal protein cry3Aa

Bacillus thuringiensis serovar tenebrionis

UniProt P0A379

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CR3AA_BACTT
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–587; UniProt 58–644

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4qx0
沉积日期 deposition_date2014-07-17
结构标题 titleCry3A Toxin structure obtained by Serial Femtosecond Crystallography from in vivo grown crystals isolated from Bacillus thuringiensis and data processed with the cctbx.xfel software suite
关键词 keywords;in vivo crystals, microcrystals, serial femtosecond crystallography, SFX, LCLS, X-ray Free-electron laser, insecticidal toxin, TOXIN ;; TOXIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4qx0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4qx0__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4qx0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)26.76 Å
Rg(电子密度)25.55 Å
总 Rg26.27 Å
原子数4659
残基数584
排除体积82464 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4qx0__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd4qx0a1
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamilyf.1.3 — delta-Endotoxin (insectocide), N-terminal domain
家族 Family familyf.1.3.1 — delta-Endotoxin (insectocide), N-terminal domain
结构域编号 domain_idd4qx0a2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamilyb.77.2 — delta-Endotoxin (insectocide), middle domain
家族 Family familyb.77.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4qx0a3
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family familyb.18.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id4qx0A01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Pesticidal crystal protein, N-terminal domain
结构域编号 domain_id4qx0A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily260 — Galactose-binding domain-like
结构域编号 domain_id4qx0A03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Pesticidal crystal protein, central domain

7. 引用文献 (1)