4qx2

Cry3A Toxin structure obtained by injecting Bacillus thuringiensis cells in an XFEL beam, collecting data by serial femtosecond crystallographic methods and processing data with the cctbx.xfel software suite

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pesticidal crystal protein cry3Aa

Bacillus thuringiensis serovar tenebrionis

UniProt P0A379

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CR3AA_BACTT
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–587; UniProt 58–644

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4qx2
沉积日期 deposition_date2014-07-17
结构标题 titleCry3A Toxin structure obtained by injecting Bacillus thuringiensis cells in an XFEL beam, collecting data by serial femtosecond crystallographic methods and processing data with the cctbx.xfel software suite
关键词 keywords;in vivo crystals, microcrystals, serial femtosecond crystallography, SFX, LCLS, X-ray Free-electron laser, insecticidal toxin, TOXIN ;; TOXIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4qx2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4qx2__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4qx2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)26.76 Å
Rg(电子密度)25.55 Å
总 Rg26.27 Å
原子数4659
残基数584
排除体积82464 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4qx2__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd4qx2a1
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamilyf.1.3 — delta-Endotoxin (insectocide), N-terminal domain
家族 Family familyf.1.3.1 — delta-Endotoxin (insectocide), N-terminal domain
结构域编号 domain_idd4qx2a2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamilyb.77.2 — delta-Endotoxin (insectocide), middle domain
家族 Family familyb.77.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4qx2a3
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family familyb.18.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id4qx2A01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Pesticidal crystal protein, N-terminal domain
结构域编号 domain_id4qx2A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily260 — Galactose-binding domain-like
结构域编号 domain_id4qx2A03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Pesticidal crystal protein, central domain

7. 引用文献 (1)