4wjg

Structure of T. brucei haptoglobin-hemoglobin receptor binding to human haptoglobin-hemoglobin

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemoglobin subunit alpha

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 3	Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Haptoglobin × 2 （P00738） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 4	Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Haptoglobin × 2 （P00738） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
3	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 3	Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Haptoglobin × 2 （P00738） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HBA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–141； UniProt 2–142 作者链 F； PDB构建体 1–141； UniProt 2–142 作者链 K； PDB构建体 1–141； UniProt 2–142 作者链 P； PDB构建体 1–141； UniProt 2–142 作者链 U； PDB构建体 1–141； UniProt 2–142 作者链 Z； PDB构建体 1–141； UniProt 2–142

Hemoglobin subunit beta

物种未注明

UniProt P68871

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 3	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Haptoglobin × 2 （P00738） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 4	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Haptoglobin × 2 （P00738） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
3	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 3	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Haptoglobin × 2 （P00738） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HBB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–146； UniProt 2–147 作者链 B； PDB构建体 1–146； UniProt 2–147 作者链 G； PDB构建体 1–146； UniProt 2–147 作者链 L； PDB构建体 1–146； UniProt 2–147 作者链 Q； PDB构建体 1–146； UniProt 2–147 作者链 V； PDB构建体 1–146； UniProt 2–147

Haptoglobin

物种未注明

UniProt P00738

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 3	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 4	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
3	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 3	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HPT_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–315； UniProt 92–406 作者链 C； PDB构建体 1–315； UniProt 92–406 作者链 H； PDB构建体 1–315； UniProt 92–406 作者链 M； PDB构建体 1–315； UniProt 92–406 作者链 R； PDB构建体 1–315； UniProt 92–406 作者链 W； PDB构建体 1–315； UniProt 92–406

Iron-regulated surface determinant protein H

Staphylococcus aureus subsp. aureus N315

UniProt Q99TD3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 3	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Haptoglobin × 2 （P00738） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 4	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Haptoglobin × 2 （P00738） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
3	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 3	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Haptoglobin × 2 （P00738） Haptoglobin-hemoglobin receptor × 2 （I7BA80） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ISDH_STAAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 3–146； UniProt 86–229 作者链 D； PDB构建体 3–146； UniProt 86–229 作者链 I； PDB构建体 3–146； UniProt 86–229 作者链 N； PDB构建体 3–146； UniProt 86–229 作者链 S； PDB构建体 3–146； UniProt 86–229 作者链 X； PDB构建体 3–146； UniProt 86–229

Haptoglobin-hemoglobin receptor

Trypanosoma brucei brucei

UniProt I7BA80

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 3	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Haptoglobin × 2 （P00738） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 4	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Haptoglobin × 2 （P00738） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
3	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 3	Hemoglobin subunit alpha × 2 （P69905） Hemoglobin subunit beta × 2 （P68871） Haptoglobin × 2 （P00738） Iron-regulated surface determinant protein H × 2 （Q99TD3） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXYGEN MOLECULE × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I7BA80_TRYBB
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–343； UniProt 36–378 作者链 E； PDB构建体 1–343； UniProt 36–378 作者链 J； PDB构建体 1–343； UniProt 36–378 作者链 O； PDB构建体 1–343； UniProt 36–378 作者链 T； PDB构建体 1–343； UniProt 36–378 作者链 Y； PDB构建体 1–343； UniProt 36–378

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4wjg
沉积日期 deposition_date	2014-09-30
结构标题 title	Structure of T. brucei haptoglobin-hemoglobin receptor binding to human haptoglobin-hemoglobin
关键词 keywords	Endocytosis, Trypanosome, Receptor; ENDOCYTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4wjg__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4wjg__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4wjg__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	63.89 Å
Rg（电子密度）	65.01 Å
总 Rg	64.78 Å
原子数	15912
残基数	2004
排除体积	282650 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4wjg__assembly_1__model_1`	Decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4wjg__assembly_2__model_1`	Decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4wjg__assembly_3__model_1`	Decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Hemoglobin subunit alpha
分子量 formula_weight	15150.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,F,K,P,U,Z
原子数 atom_count	47792

VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Hemoglobin subunit beta
分子量 formula_weight	15890.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,G,L,Q,V,1

VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Haptoglobin
分子量 formula_weight	35267.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,H,M,R,W,2

CPKPPEIAHGYVEHSVRYQCKNYYKLRTEGDGVYTLNNEKQWINKAVGDKLPECEAVCGKPKNPANPVQRILGGHLDAKGSFPWQAKMVSHHNLTTGATLINEQWLLTTAKNLFLNHSENATAKDIAPTLTLYVGKKQLVEIEKVVLHPNYSQVDIGLIKLKQKVSVNERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNANFKFTDHLKYVMLPVADQDQCIRHYEGSTVPEKKTPKSPVGVQPILNEHTFCAGMSKYQEDTCYGDAGSAFAVHDLEEDTWYATGILSFDKSCAVAEYGVYVKVTSIQDWVQKTIAEN

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Iron-regulated surface determinant protein H
分子量 formula_weight	16877.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,I,N,S,X,3

GSADESLKDAIKDPALENKEHDIGPREQVNFQLLDKNNETQYYHFFSIKDPADVYYTKKKAEVELDINTASTWKKFEVYENNQKLPVRLVSYSPVPEDHAYIRFPVSDGTQELKIVSSTQIDDGEETNYDYTKLVFAKPIYNDPSL

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus subsp. aureus N315
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	158879
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Haptoglobin-hemoglobin receptor
分子量 formula_weight	36848.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,J,O,T,Y,4

AEGLKTKDEVEKACHLAQQLKEVSITLGVIYRTTERHSVQVEAHKTAIDKHADAVSRAVEALTRVDVALQRLKELGKANDTKAVKIIENITSARENLALFNNETQAVLTARDHVHKHRAAALQGWSDAKEKGDAAAEDVWVLLNAAKKGNGSADVKAAAEKCSRYSSSSTSETELQKAIDAAANVGGLSAHKSKYGDVLNKFKLSNASVGAVRDTSGRGGKHMEKVNNVAKLLKDAEVSLAAAAAEIEEVKNAHETKAQEEMKRNGNPIENESETNSGGNAESQGNGDREDKNDEQQQVDEEETKVENGSSEEGSCCGNESNGPHVMKKRHGVEGPRPVDVVS

来源 Source

来源生物 organism	Trypanosoma brucei brucei
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5702
宿主生物 host_organism	Komagataella pastoris

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

来源 Source

来源生物 organism	Trypanosoma brucei brucei
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5702
宿主生物 host_organism	Komagataella pastoris

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	OXYGEN MOLECULE
分子量 formula_weight	32.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	23

来源 Source

来源生物 organism	Trypanosoma brucei brucei
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5702
宿主生物 host_organism	Komagataella pastoris

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 60 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

结构域编号 domain_id	d4wjg1_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjg3_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.28 — NEAT domain-like
家族 Family family	b.1.28.1 — NEAT domain

结构域编号 domain_id	d4wjga_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjgb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjgd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.28 — NEAT domain-like
家族 Family family	b.1.28.1 — NEAT domain

结构域编号 domain_id	d4wjgf_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjgg_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjgi_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.28 — NEAT domain-like
家族 Family family	b.1.28.1 — NEAT domain

结构域编号 domain_id	d4wjgk_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjgl_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjgn_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.28 — NEAT domain-like
家族 Family family	b.1.28.1 — NEAT domain

结构域编号 domain_id	d4wjgp_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjgq_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjgs_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.28 — NEAT domain-like
家族 Family family	b.1.28.1 — NEAT domain

结构域编号 domain_id	d4wjgu_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjgv_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

结构域编号 domain_id	d4wjgx_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.28 — NEAT domain-like
家族 Family family	b.1.28.1 — NEAT domain

结构域编号 domain_id	d4wjgz_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

CATH v4.4 (42 domains)

结构域编号 domain_id	4wjg100
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjg201
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4wjg202
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjg203
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjg300
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1850 —

结构域编号 domain_id	4wjg400
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1260 — Ferritin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 —

结构域编号 domain_id	4wjgA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjgB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjgC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4wjgC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjgC03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjgD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1850 —

结构域编号 domain_id	4wjgE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1260 — Ferritin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 —

结构域编号 domain_id	4wjgF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjgG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjgH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4wjgH02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjgH03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjgI00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1850 —

结构域编号 domain_id	4wjgJ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1260 — Ferritin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 —

结构域编号 domain_id	4wjgK00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjgL00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjgM01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4wjgM02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjgM03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjgN00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1850 —

结构域编号 domain_id	4wjgO00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1260 — Ferritin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 —

结构域编号 domain_id	4wjgP00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjgQ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjgR01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4wjgR02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjgR03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjgS00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1850 —

结构域编号 domain_id	4wjgT00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1260 — Ferritin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 —

结构域编号 domain_id	4wjgU00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjgV00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

结构域编号 domain_id	4wjgW01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4wjgW02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjgW03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4wjgX00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1850 —

结构域编号 domain_id	4wjgY00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1260 — Ferritin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 —

结构域编号 domain_id	4wjgZ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

▶

晶胞边长 a length_a	143.230 Å
晶胞边长 b length_b	140.950 Å
晶胞边长 c length_c	267.180 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	98.54 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.100 Å
最低分辨率 resolution_low	29.000 Å
R 因子 r_factor	0.2553
R_work r_work	0.2551
R_free r_free	0.2709

Structure of T. brucei haptoglobin-hemoglobin receptor binding to human haptoglobin-hemoglobin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemoglobin subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Hemoglobin subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Haptoglobin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Iron-regulated surface determinant protein H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Haptoglobin-hemoglobin receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4wjg__assembly_3__model_1

4wjg__assembly_3__model_1 | I(q)

4wjg__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 branched

来源 Source

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 60 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

CATH v4.4 (42 domains)

7. 引用文献 (1)