4wk4

Metal Ion and Ligand Binding of Integrin

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 118.3 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrin alpha-5

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 7 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 42–491	片段：UNP residues 42-491	Integrin beta-1 × 1 （P05556） ALA-CYS-ARG-GLY-ASP-GLY-TRP-CYS × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 2.50 Å R-free 0.236

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4WK4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3VI3 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece (ligand-free form) 提交 2011-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 42–664（623 aa）片段：UNP residues 42-664	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.267
3VI3 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece (ligand-free form) 提交 2011-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 42–664（623 aa）片段：UNP residues 42-664	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.267
3VI4 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece in complex with RGD peptide 提交 2011-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 42–664（623 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
3VI4 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece in complex with RGD peptide 提交 2011-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 42–664（623 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
4WJK Metal Ion and Ligand Binding of Integrin 提交 2014-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 42–493（452 aa）片段：UNP residues 42-493	突变：I451V	CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 1.85 Å R-free 0.238
4WK0 Metal Ion and Ligand Binding of Integrin 提交 2014-10-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 42–493（452 aa）片段：UNP residues 42-493	突变：I451V	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 1.78 Å R-free 0.223
4WK2 Metal Ion and Ligand Binding of Integrin 提交 2014-10-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 42–493（452 aa）片段：UNP residues 42-493	突变：I451V	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 2.50 Å R-free 0.254
7NWL Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 (open form) in complex with fibronectin and TS2/16 Fv-clasp 提交 2021-03-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 42–1049（1008 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7NXD Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 in the half-bent conformation 提交 2021-03-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 42–1049（1008 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
9B9J Integrin alpha-5 beta-1 in complex with BIIG2 Fab 提交 2024-04-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–995（995 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM Tris-HCL, 150mM NaCl, 5mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9B9K Integrin alpha-5 beta-1 in complex with MINT1526A Fab 提交 2024-04-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–995（995 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9CKV Cryo-EM structure of alpha5beta1 integrin in complex with NeoNectin 提交 2024-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–996（996 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MN MANGANESE (II) ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å
9DIA Cryo-EM structure of alpha5beta1 integrin in complex with NeoNectin candidate 2 提交 2024-09-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–996（996 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
9EF2 Cryo-EM structure of alpha5beta1 integrin in complex with NeoNectin candidate 2, open conformation 提交 2024-11-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–996（996 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MN MANGANESE (II) ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.36 Å
9HMH Crystal structure of the Calf domains of Integrin Alpha5 提交 2024-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 641–993（353 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bistris pH 5.5, 0.2M MgCl2, 25% PEG 3350 (wt/vol)	分辨率 1.92 Å R-free 0.282
9HMI Crystal structure of the Calf domains of Integrin Alpha5 in complex with angiopoietin2 peptide 提交 2024-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 641–993（353 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium formate; 20% polyethylene glycol 3350 (wt/vol)	分辨率 2.78 Å R-free 0.306
9P6S Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 in complex with fibronectin (FN 7-10) 提交 2025-06-19	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 42–642（601 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.61 Å

共 15 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ITA5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–450； UniProt 42–491

Integrin beta-1

Homo sapiens

UniProt P05556

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 7 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 21–465	片段：UNP residues 21-465	Integrin alpha-5 × 1 （P08648） ALA-CYS-ARG-GLY-ASP-GLY-TRP-CYS × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 2.50 Å R-free 0.236

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 4WK4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3G9W Crystal Structure of Talin2 F2-F3 in Complex with the Integrin Beta1D Cytoplasmic Tail 提交 2009-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 752–801（50 aa）片段：Cytoplasmic Tail	未记录	GOL GLYCEROL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M ammonium acetate, 0.02M magnesium chloride, 0.05M HEPES, 5% PEG 8k, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.17 Å R-free 0.248
3G9W Crystal Structure of Talin2 F2-F3 in Complex with the Integrin Beta1D Cytoplasmic Tail 提交 2009-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 752–801（50 aa）片段：Cytoplasmic Tail	未记录	GOL GLYCEROL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M ammonium acetate, 0.02M magnesium chloride, 0.05M HEPES, 5% PEG 8k, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.17 Å R-free 0.248
3T9K Crystal Structure of ACAP1 C-portion mutant S554D fused with integrin beta1 peptide 提交 2011-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 758–769（12 aa）	突变：S554D	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；289 K；0.2M ammonium sulfate, 14% PEG 3350, 0.1M Sodium Citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.30 Å R-free 0.225
3T9K Crystal Structure of ACAP1 C-portion mutant S554D fused with integrin beta1 peptide 提交 2011-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 758–769（12 aa）	突变：S554D	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；289 K；0.2M ammonium sulfate, 14% PEG 3350, 0.1M Sodium Citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.30 Å R-free 0.225
3VI3 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece (ligand-free form) 提交 2011-09-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.267
3VI3 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece (ligand-free form) 提交 2011-09-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.267
3VI4 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece in complex with RGD peptide 提交 2011-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 21–465（445 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
3VI4 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece in complex with RGD peptide 提交 2011-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 21–465（445 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 V 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 X 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 13 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 14 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 b 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 15 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 d 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 16 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 f 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 17 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 h 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 18 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 j 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 19 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 l 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 20 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 n 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 21 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 p 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 22 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 r 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 23 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 t 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 24 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 v 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 25 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 x 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 26 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 z 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 27 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 8 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 28 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 6 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 29 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 9 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 30 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 7 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4WJK Metal Ion and Ligand Binding of Integrin 提交 2014-09-30	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 1.85 Å R-free 0.238
4WK0 Metal Ion and Ligand Binding of Integrin 提交 2014-10-01	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 1.78 Å R-free 0.223
4WK2 Metal Ion and Ligand Binding of Integrin 提交 2014-10-01	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 2.50 Å R-free 0.254
7CEB Crystal structure of alpha6beta1 integrin headpiece 提交 2020-06-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 21–465（445 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；23% PEG1000, 0.2 M NaCl, 0.1 M Na/K phosphate, pH 6.5	分辨率 2.89 Å R-free 0.249
7CEC Structure of alpha6beta1 integrin in complex with laminin-511 提交 2020-06-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 21–465（445 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MN MANGANESE (II) ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NWL Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 (open form) in complex with fibronectin and TS2/16 Fv-clasp 提交 2021-03-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 21–798（778 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7NXD Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 in the half-bent conformation 提交 2021-03-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–798（778 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
8RPQ Solution NMR structure of Integrin beta-1 TMD 提交 2024-01-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 726–761（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1 NMR样品组成 0.5 uM NA Itgb1, trifluoroethanol/water \| trifluoroethanol/water	分辨率未提供
8W30 Crystal structure of alpha-V beta-1 integrin headpiece in complex with TR01225179 提交 2024-02-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–465（445 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 A1AFA N-(2,4-dichlorobenzoyl)-L-phenylalanine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；28% pentaerythritol ethoxylate (15/4_EO/OH), 0.05M ammonium sulfate, 0.05M Bis Tris pH 6.5	分辨率 2.45 Å R-free 0.275
9B9J Integrin alpha-5 beta-1 in complex with BIIG2 Fab 提交 2024-04-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–728（728 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM Tris-HCL, 150mM NaCl, 5mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9B9K Integrin alpha-5 beta-1 in complex with MINT1526A Fab 提交 2024-04-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–728（728 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9CKV Cryo-EM structure of alpha5beta1 integrin in complex with NeoNectin 提交 2024-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–728（728 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MN MANGANESE (II) ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å
9DIA Cryo-EM structure of alpha5beta1 integrin in complex with NeoNectin candidate 2 提交 2024-09-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–728（728 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
9EF2 Cryo-EM structure of alpha5beta1 integrin in complex with NeoNectin candidate 2, open conformation 提交 2024-11-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–728（728 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MN MANGANESE (II) ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.36 Å
9NAB Cryo-EM structure of the alpha5beta1 integrin headpiece with OS2966 Fab 提交 2025-02-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–465（445 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å
9P6S Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 in complex with fibronectin (FN 7-10) 提交 2025-06-19	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 26–465（440 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.61 Å

共 21 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ITB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–445； UniProt 21–465

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4wk4
沉积日期 deposition_date	2014-10-01
结构标题 title	Metal Ion and Ligand Binding of Integrin
关键词 keywords	CELL ADHESION-FIBRONECTIN RECEPTOR, CELL ADHESION-IMMUNE SYSTEM complex; CELL ADHESION/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	33.17 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	32.18 Å
零角强度 I(0) i0	173737000.00
分子量 molecular_weight	103220.0 kDa
排除体积 excluded_volume	128220 Å³
包络体积 envelope_volume	168200 Å³
水化壳体积 shell_volume	43487 Å³
包络直径 envelope_diameter	125.4 Å
壳层 Rg shell_rg	38.96 Å
包络 Rg envelope_rg	32.82 Å
形状 Rg shape_rg	32.10 Å
总 Rg total_rg	33.00 Å
总原子数 total_atoms	14143
残基数 n_residues	893
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	118.3 Å
Rg (实空间) rg_real	33.22 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.15 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7370e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.1350e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.20 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	173700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8593
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	37.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.395
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.279
角度范围 angular_range	— – 0.2400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	36340000.0000
实空间数据点数 n_real_points	49
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.754; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.924; Smooth: 0.979

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Integrin alpha-5
分子量 formula_weight	47918.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	14331

FNLDAEAPAVLSGPPGSFFGFSVEFYRPGTDGVSVLVGAPKANTSQPGVLQGGAVYLCPWGASPTQCTPIEFDSKGSRLLESSLSSSEGEEPVEYKSLQWFGATVRAHGSSILACAPLYSWRTEKEPLSDPVGTCYLSTDNFTRILEYAPCRSDFSWAAGQGYCQGGFSAEFTKTGRVVLGGPGSYFWQGQILSATQEQIAESYYPEYLINLVQGQLQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEFSGDDTEDFVAGVPKGNLTYGYVTILNGSDIRSLYNFSGEQMASYFGYAVAATDVNGDGLDDLLVGAPLLMDRTPDGRPQEVGRVYVYLQHPAGIEPTPTLTLTGHDEFGRFGSSLTPLGDLDQDGYNDVAIGAPFGGETQQGVVFVFPGGPGGLGSKPSQVLQPLWAASHTPDFFGSALRGGRDLDGNGYPDLIVGSFGVDKAVVYRGRP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Integrin beta-1
分子量 formula_weight	49502.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

QTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPTSARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQNCTTPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQCHLENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ALA-CYS-ARG-GLY-ASP-GLY-TRP-CYS
分子量 formula_weight	868.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

ACRGDGWC

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1073.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	748.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1235.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 12 Entity 12 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	188

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4wk4A00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	130 — Integrin alpha, N-terminal

结构域编号 domain_id	4wk4B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1680 — ligand-binding face of the semaphorins, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ligand-binding face of the semaphorins, domain 2

结构域编号 domain_id	4wk4B02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1510 — ntegrin, alpha v. Chain A, domain 3

结构域编号 domain_id	4wk4B03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	57.520 Å
晶胞边长 b length_b	112.160 Å
晶胞边长 c length_c	169.540 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	47.597 Å
R 因子 r_factor	0.1892
R_work r_work	0.1866
R_free r_free	0.2358

fit	/app/data/saxs_computation/wk/4wk4/4wk4.fit
pddf	/app/data/pr_computation/wk/4wk4/4wk4.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/wk/4wk4/4wk4.dat

Metal Ion and Ligand Binding of Integrin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrin alpha-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Integrin beta-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 branched

实体 8 Entity 8 branched

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 non-polymer

实体 12 Entity 12 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)