4wu5

HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-8(wt)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain

Homo sapiens

UniProt P05534

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) 8-Mer peptide from Protein Nef × 1 (Q9YYU8) water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) 8-Mer peptide from Protein Nef × 1 (Q9YYU8) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 1A24_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–275; UniProt 25–298 作者链 D; PDB构建体 2–275; UniProt 25–298

Beta-2-microglobulin

Homo sapiens

UniProt P61769

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain × 1 (P05534) 8-Mer peptide from Protein Nef × 1 (Q9YYU8) water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain × 1 (P05534) 8-Mer peptide from Protein Nef × 1 (Q9YYU8) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 B2MG_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 2–100; UniProt 21–119 作者链 E; PDB构建体 2–100; UniProt 21–119

8-Mer peptide from Protein Nef

物种未注明

UniProt Q9YYU8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain × 1 (P05534) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain × 1 (P05534) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9YYU8_9HIV1
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–8; UniProt 134–141 作者链 F; PDB构建体 1–8; UniProt 134–141

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4wu5
沉积日期 deposition_date2014-10-31
结构标题 titleHLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-8(wt)
关键词 keywordsIMMUNE RESPONSE, IMMUNE SYSTEM, HIV-1, NEF, HLA-A24, MHC CLASS I; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4wu5__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4wu5__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4wu5__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)24.05 Å
Rg(电子密度)22.93 Å
总 Rg23.77 Å
原子数3126
残基数381
排除体积54579 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4wu5__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4wu5__assembly_2__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id4wu5A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MHC class I-like antigen recognition-like
结构域编号 domain_id4wu5A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id4wu5B00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id4wu5D01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MHC class I-like antigen recognition-like
结构域编号 domain_id4wu5D02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id4wu5E00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
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7. 引用文献 (1)