4wyb

Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
11	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
12	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Bud site selection protein 6 × 1 （P41697） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTS_RABIT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 C； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 E； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 G； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 I； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 K； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 M； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 O； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 Q； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 S； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 U； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 X； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377

Bud site selection protein 6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P41697

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
11	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
12	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68135） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BUD6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 D； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 F； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 H； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 J； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 L； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 N； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 P； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 R； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 T； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 V； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788 作者链 Y； PDB构建体 3–92； UniProt 699–788

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4wyb
沉积日期 deposition_date	2014-11-17
结构标题 title	Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin
关键词 keywords	nucleation promoting factor WH2 Domain, Formin, CONTRACTILE PROTEIN-PROTEIN BINDING complex; CONTRACTILE PROTEIN/PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4wyb__assembly_6__model_1

Assembly 6 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4wyb__assembly_6__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4wyb__assembly_6__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.48 Å
Rg（电子密度）	21.53 Å
总 Rg	22.35 Å
原子数	3110
残基数	394
排除体积	55137 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4wyb__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4wyb__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4wyb__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`4wyb__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`4wyb__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`4wyb__assembly_6__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`4wyb__assembly_7__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`4wyb__assembly_8__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
9	1	`4wyb__assembly_9__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
10	1	`4wyb__assembly_10__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
11	1	`4wyb__assembly_11__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
12	1	`4wyb__assembly_12__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Actin, alpha skeletal muscle
分子量 formula_weight	42097.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O,Q,S,U,X
原子数 atom_count	37515

MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Bud site selection protein 6
分子量 formula_weight	10540.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P,R,T,V,Y

GSGTFNQVREQVMVAVQSLNPDHDSRVEAIDKAEKMWEMERKLKASNEFDDELENFVGNSNLKKSGGFEEVERIRKQKDEANLRAYFGPGFT

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli-Pichia pastoris shuttle vector pPpARG4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

CATH v4.4 (48 domains)

结构域编号 domain_id	4wybA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybA04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybC03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybC04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybE03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybE04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybG02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybG03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybG04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybI01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybI02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybI03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybI04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybK02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybK03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybK04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybM01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybM02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybM03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybM04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybO01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybO02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybO03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybO04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybQ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybQ02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybQ03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybQ04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybS01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybS02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybS03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybS04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybU01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybU02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybU03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybU04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4wybX01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybX02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Actin; Chain A, domain 2

结构域编号 domain_id	4wybX03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4wybX04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

▶

晶胞边长 a length_a	138.753 Å
晶胞边长 b length_b	138.753 Å
晶胞边长 c length_c	356.651 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	P 32
空间群编号 int_tables_number	145
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.493 Å
最低分辨率 resolution_low	45.418 Å
R 因子 r_factor	0.2134
R_work r_work	0.2124
R_free r_free	0.2581

Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Bud site selection protein 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4wyb__assembly_6__model_1

4wyb__assembly_6__model_1 | I(q)

4wyb__assembly_6__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

CATH v4.4 (48 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Bud site selection protein 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4wyb__assembly_6__model_1

4wyb__assembly_6__model_1 | I(q)

4wyb__assembly_6__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

CATH v4.4 (48 domains)

7. 引用文献 (1)