SAXSdb — 5a5t

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT A

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–1362	未记录	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT C × 1 （G1U971） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT E × 1 （G1SUC8） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT F × 1 （U3KNL5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT H × 1 （G1ST95） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT K × 1 （G1T3L2） UNCHARACTERIZED PROTEIN × 1 （G1SED9） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT M × 1 （G1SLW8）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,	分辨率 6.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5A5T	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric	链 1 1–1362（1362 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric	链 1 1–1362（1362 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.36 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 o 1–1362（1362 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 y 1–1362（1362 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5	分辨率 2.90 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G1SMZ5_RABIT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1362； UniProt 1–1362

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT C

物种未注明

UniProt G1U971

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 71–913	未记录	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT A × 1 （G1SMZ5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT E × 1 （G1SUC8） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT F × 1 （U3KNL5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT H × 1 （G1ST95） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT K × 1 （G1T3L2） UNCHARACTERIZED PROTEIN × 1 （G1SED9） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT M × 1 （G1SLW8）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,	分辨率 6.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5A5T	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric	链 2 1–913（913 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric	链 2 1–913（913 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.36 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric	链 v 1–913（913 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 k 1–913（913 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.00 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 v 1–913（913 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5	分辨率 2.90 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G1U971_RABIT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–843； UniProt 71–913

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT E

物种未注明

UniProt G1SUC8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 18–462	未记录	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT A × 1 （G1SMZ5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT C × 1 （G1U971） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT F × 1 （U3KNL5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT H × 1 （G1ST95） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT K × 1 （G1T3L2） UNCHARACTERIZED PROTEIN × 1 （G1SED9） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT M × 1 （G1SLW8）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,	分辨率 6.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5A5T	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric	链 3 1–462（462 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric	链 3 1–462（462 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.36 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric	链 w 18–462（445 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 q 18–462（445 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 Q 1–462（462 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.00 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 w 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5	分辨率 2.90 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G1SUC8_RABIT
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–445； UniProt 18–462

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT F

物种未注明

UniProt U3KNL5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 1–364	未记录	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT A × 1 （G1SMZ5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT C × 1 （G1U971） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT E × 1 （G1SUC8） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT H × 1 （G1ST95） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT K × 1 （G1T3L2） UNCHARACTERIZED PROTEIN × 1 （G1SED9） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT M × 1 （G1SLW8）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,	分辨率 6.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	U3KNL5_RABIT
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–364； UniProt 1–364

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT H

物种未注明

UniProt G1ST95

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–352	未记录	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT A × 1 （G1SMZ5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT C × 1 （G1U971） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT E × 1 （G1SUC8） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT F × 1 （U3KNL5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT K × 1 （G1T3L2） UNCHARACTERIZED PROTEIN × 1 （G1SED9） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT M × 1 （G1SLW8）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,	分辨率 6.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5A5T	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric	链 5 1–363（363 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric	链 5 1–363（363 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.36 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 s 12–363（352 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G1ST95_RABIT
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–352； UniProt 1–352

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT K

物种未注明

UniProt G1T3L2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 1–218	未记录	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT A × 1 （G1SMZ5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT C × 1 （G1U971） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT E × 1 （G1SUC8） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT F × 1 （U3KNL5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT H × 1 （G1ST95） UNCHARACTERIZED PROTEIN × 1 （G1SED9） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT M × 1 （G1SLW8）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,	分辨率 6.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5A5T	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric	链 6 1–218（218 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric	链 6 1–218（218 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.36 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric	链 s 1–218（218 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 t 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18	聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 s 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.00 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 s 1–218（218 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5	分辨率 2.90 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G1T3L2_RABIT
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–218； UniProt 1–218

UNCHARACTERIZED PROTEIN

物种未注明

UniProt G1SED9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 43–606	未记录	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT A × 1 （G1SMZ5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT C × 1 （G1U971） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT E × 1 （G1SUC8） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT F × 1 （U3KNL5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT H × 1 （G1ST95） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT K × 1 （G1T3L2） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT M × 1 （G1SLW8）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,	分辨率 6.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5A5T	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric	链 7 1–607（607 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric	链 7 1–607（607 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.36 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 u 44–607（564 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 t 44–607（564 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.00 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 t 1–607（607 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5	分辨率 2.90 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G1SED9_RABIT
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–564； UniProt 43–606

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT M

物种未注明

UniProt G1SLW8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 1–374	未记录	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT A × 1 （G1SMZ5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT C × 1 （G1U971） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT E × 1 （G1SUC8） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT F × 1 （U3KNL5） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT H × 1 （G1ST95） EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT K × 1 （G1T3L2） UNCHARACTERIZED PROTEIN × 1 （G1SED9）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,	分辨率 6.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5A5T	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric	链 8 1–374（374 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric	链 8 1–374（374 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane	分辨率 3.36 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric	链 u 1–374（374 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 v 1–374（374 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18	聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 u 1–374（374 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.00 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 u 1–374（374 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5	分辨率 2.90 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G1SLW8_RABIT
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–374； UniProt 1–374

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5a5t
沉积日期 deposition_date	2015-06-21
结构标题 title	Structure of mammalian eIF3 in the context of the 43S preinitiation complex
关键词 keywords	HYDROLASE, EIF3, EUKARYOTIC INITIATION FACTOR 3, PREINITIATION COMPLEX, PCI/MPN CORE, EIF3G/I/B, EIF3D; HYDROLASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	54.95 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	54.81 Å
零角强度 I(0) i0	1854520000.00
分子量 molecular_weight	361870.0 kDa
排除体积 excluded_volume	453880 Å³
包络体积 envelope_volume	686260 Å³
水化壳体积 shell_volume	104140 Å³
包络直径 envelope_diameter	194.5 Å
壳层 Rg shell_rg	57.40 Å
包络 Rg envelope_rg	54.05 Å
形状 Rg shape_rg	54.82 Å
总 Rg total_rg	54.86 Å
总原子数 total_atoms	25432
残基数 n_residues	3129
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	186.3 Å
Rg (实空间) rg_real	54.86 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.70 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.8550e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.5630e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	55.01 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1855000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8797
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	64.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.266
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.377
角度范围 angular_range	— – 0.1450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	128300000.0000
实空间数据点数 n_real_points	30
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.853; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.887

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT A
分子量 formula_weight	164902.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	25432

MPAYFQRPENALKRANEFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVDLRKSHLAKEGLYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKLAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDNIQTPESVLLSAVSGEDTQDRTDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQAFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVSTVFWKSGNALFHASTLHRLYHLSREMRKNLTQDEMQRMSTRVLLATLSIPITPERTDIARLLDMDGIIVEKQRRLATLLGLQAPPTRIGLINDMVRFNVLQYVVPEVKDLYNWLEVEFNPLKLCERVTKVLNWVREQPEKEPELQQYVPQLQSNTILRLLQQVAQIYQSIEFSRLTSLVPFVDAFQLERAIVDAARHCDLQVRIDHTSRTLSFGSDLNYATREDAPIGPHLQSMPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHILQEKEEQHQLAVTAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLKQFEERLAEERHNRLEERKRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEELREYQERVKKLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGEDPLSRRDSRWGDRDSEGTWRKGPEADSEWRRGPPEKEWRRGEGRDDERSHRRDEERPRRVGDDEDRESSLRPDDDRTLRRGMEDDRGPRRGPDEERFSRRGLEDERPSWRSTDDDRPPRRIGEEDRGSWRHAEDDRPPRRGLDDDRGSWRTADEDRGPRRMMDEDRGPRRGGADDERPSWRSADDDRGPRRGIDDDRGPRRGLDDDRGPWRNADDDRIPRRGADDDRGPWRNMDDDRMSRRADDDRISRRGEDSRPGPWRPFVKPGGWREKEKAREESWGPPRESRPPEEREWERERDRDNPDREENDKDPERERDRERDGDREERFRRPRDEGGWRRGPAEEASSWRDSSRRDDRDRDDRRRERDDRRDLRDRRDLRDDRDRRGPPLRSERDEVSSWRRADDRKDDRAEERDPPRRVPPPVLSRDRDRDRDRDRDRDREREREREREGEKEKTSWRAEKDRESLRRTKNETDEDGWTTVRR

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT C
分子量 formula_weight	97923.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGVSAAAFLKKKAEAPSGESRKFLKKMEDEDEDSEDSEDDEEWDTGSTSSDSDSEEEEGKQTALASRFLKKAPTTEEDKKAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGVPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVIVKIKFNIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLQNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHYLHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT E
分子量 formula_weight	52281.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MAEYDLTTRIAHFLDRHLVFPLLEFLSVKEIYNEKELLQGKLDLLSDTNMVDFAMDVYKNLYSDDIPHALREKRTTVVAQLKQLQAETEPIVKMFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVPATDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT F
分子量 formula_weight	37846.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.19.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MATPAVSASAPPATPAATPAAAAAPASAPAAAPAPTPAPAPAAAPAAGAAPAAAADPAAAAAAAGTGQTPASAQAPAQTSAPSLPGPALPGPFPGGRVVRLHPVILASIVDSYERRNEGAARVIGTLLGTVDKHSVEVTNCFSVPHNESEDEVAVDMEFAKNMYELHKKVSPNELILGWYATGHDITEHSVLIHEYYSREAPNPIHLTVDTSLQNGRMSIKAYVSTSMGVPGRTMGVMFTPLTVKYAYYDTERIGVDLIMKTCFSPNRVIGLSSDLQQVGGASARIQDALSTVLQYAEDVLSGKVSADNTVGRFLMSLVNQVPKIVPDDFETMLNSNINDLLMVTYLANLTQSQIALNEKLVNL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT H
分子量 formula_weight	39952.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MASRKEGTGSGGTSSSSATGVVGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSNHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIVKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNN

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT K
分子量 formula_weight	25129.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MAMFEQMRANVGKLLKGIDRYNPENLATLERYVETQAKENAYDLEANLAVLKLYQFNPAFFQTTVTAQILLKALTNLPHTDFTLCKCMIDQAHQEERPIRQILYLGDLLETCHFQAFWQALDENMDLLEGITGFEDSVRKFICHVVGITYQHIDRWLLAEMLGDLTDSQLKMWMSKYGWSADESGQIFICSQEESIKPKNIVEKIDFDSVSSIMASSQ

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	UNCHARACTERIZED PROTEIN
分子量 formula_weight	66804.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MSYPADDYESEAVYDPYAYPSDYDMHTGDPKQDLAYERQYEQQTYQVIPEVIRNFIQYFHKTVSDLIDQKVYELQASRVSSDVIDQKVYEIQDIYENSWTKLTERFFKNTPWPEAETIAPQVGNDAVFLILYKELYYRHIYAKVSGGPSLAQRFESYYNYCNLFNYILNADGPAPLELPNQWLWDIIDEFIYQFQSFSQYRCKTAKKSEEEIDFLRSNPKIWNVHSVLNVLHSLVDKSNINRQLEVYTSGGDPESVAGEYGRHSLYKMLGYFSLVGLLRLHSLLGDYYQAIKVLENIELNKKSMYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCPKFLSPVVPNYDSVHPNYHKEPFLQQLKVFSDEVQQQAQLSTIRSFLKLYTTMPVAKLAGFLDLTEQEFRIQLLVFKHKMKNLVWTSGISALDGEFQSASEVDFYIDKDMIHIADTKVARRYGDFFIRQIHKFEELNRTLKKMGQRP

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT M
分子量 formula_weight	42555.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWNLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSHSTHRTFGKQQWQQLYDTLNAWKQNLNKVKNSLLSLSDT

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	6.000 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	6.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	TEMPLATE MATCHING
颗粒数 num_particles	87192

fit	/app/data/saxs_computation/a5/5a5t/5a5t.fit
pddf	/app/data/pr_computation/a5/5a5t/5a5t.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/a5/5a5t/5a5t.dat

Structure of mammalian eIF3 in the context of the 43S preinitiation complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

UNCHARACTERIZED PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT M

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)