5bug

Crystal structure of human phosphatase PTEN oxidized by H2O2

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 126.7 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 14–351	片段：PTEN wt 14-351 delta 286-309 突变：Deletion 286-309	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrat, 7.5% glycerol	分辨率 2.40 Å R-free 0.211
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 14–351	片段：PTEN wt 14-351 delta 286-309 突变：Deletion 286-309	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrat, 7.5% glycerol	分辨率 2.40 Å R-free 0.211
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 14–351	片段：PTEN wt 14-351 delta 286-309 突变：Deletion 286-309	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrat, 7.5% glycerol	分辨率 2.40 Å R-free 0.211
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 14–351	片段：PTEN wt 14-351 delta 286-309 突变：Deletion 286-309	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrat, 7.5% glycerol	分辨率 2.40 Å R-free 0.211

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5BUG	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1D5R Crystal Structure of the PTEN Tumor Suppressor 提交 1999-10-11	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–285（279 aa）片段：RESIDUES 7-353 链 A 310–353（44 aa）片段：RESIDUES 7-353	突变：RESIDUES 286-309 ARE REPLACED BY VAL 突变：RESIDUES 286-309 ARE REPLACED BY VAL	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；NA/K TARTRATE, 5% GLYCEROL, 100MM TRIS-CL, 10MM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.276
2KYL Solution structure of MAST2-PDZ complexed with the C-terminus of PTEN 提交 2010-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 391–403（13 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient NMR样品组成 0.6mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PDZ-domain-1, 1.2mM PTEN-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4O1V SPOP Promotes Tumorigenesis by Acting as a Key Regulatory Hub in Kidney Cancer 提交 2013-12-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 354–368（15 aa）片段：UNP residues 354-368	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；100 mM Tris, 100 mM sodium malonate, 36% PEG400, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.221
5BZX Crystal structure of human phosphatase PTEN treated with a bisperoxovanadium complex 提交 2015-06-11	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 14–351（338 aa）片段：PTEN wt 7-353 delta 286-309	突变：Deletion 286-309	VO4 VANADATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrat, 7.5% glycerol	分辨率 2.50 Å R-free 0.204
5BZX Crystal structure of human phosphatase PTEN treated with a bisperoxovanadium complex 提交 2015-06-11	构建体不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 14–351（338 aa）片段：PTEN wt 7-353 delta 286-309	突变：Deletion 286-309	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrat, 7.5% glycerol	分辨率 2.50 Å R-free 0.204
5BZX Crystal structure of human phosphatase PTEN treated with a bisperoxovanadium complex 提交 2015-06-11	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 14–351（338 aa）片段：PTEN wt 7-353 delta 286-309	突变：Deletion 286-309	VO4 VANADATE ION × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrat, 7.5% glycerol	分辨率 2.50 Å R-free 0.204
5BZX Crystal structure of human phosphatase PTEN treated with a bisperoxovanadium complex 提交 2015-06-11	构建体不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 14–351（338 aa）片段：PTEN wt 7-353 delta 286-309	突变：Deletion 286-309	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrat, 7.5% glycerol	分辨率 2.50 Å R-free 0.204
5BZZ Crystal structure of human phosphatase PTEN in its reduced state 提交 2015-06-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 14–351（338 aa）片段：PTEN wt 7-353 delta 286-309	突变：Deletion 286-309	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrate, 7.5% glycerol	分辨率 2.20 Å R-free 0.221
5BZZ Crystal structure of human phosphatase PTEN in its reduced state 提交 2015-06-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 14–351（338 aa）片段：PTEN wt 7-353 delta 286-309	突变：Deletion 286-309	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrate, 7.5% glycerol	分辨率 2.20 Å R-free 0.221
5BZZ Crystal structure of human phosphatase PTEN in its reduced state 提交 2015-06-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 14–351（338 aa）片段：PTEN wt 7-353 delta 286-309	突变：Deletion 286-309	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrate, 7.5% glycerol	分辨率 2.20 Å R-free 0.221
5BZZ Crystal structure of human phosphatase PTEN in its reduced state 提交 2015-06-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 14–351（338 aa）片段：PTEN wt 7-353 delta 286-309	突变：Deletion 286-309	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.25 M L-tartrate, 7.5% glycerol	分辨率 2.20 Å R-free 0.221
7JUK Crystal structure of PTEN with a tetra-phosphorylated tail (4p-crPTEN-13sp-T2, SDTTDSDPENEG) 提交 2020-08-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–285（279 aa）链 A 310–353（44 aa）链 A 378–390（13 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.2 M DL-malic acid	分辨率 3.15 Å R-free 0.289
7JUL Crystal structure of non phosphorylated PTEN (n-crPTEN-13sp-T1, SDTTDSDPENEG) 提交 2020-08-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–285（279 aa）链 A 310–353（44 aa）链 A 378–390（13 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；1:1 volume of well solution: 100 mM Bis-Tris propane pH 7.0, 1.2 M DL-malic acid	分辨率 2.53 Å R-free 0.234
7JVX Crystal structure of PTEN (aa 7-353 followed by spacer TGGGSGGTGGGSGGTGGGCY ligated to peptide pSDpTpTDpSDPENEPFDED) 提交 2020-08-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–403（403 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；300 mM citrate	分辨率 3.20 Å R-free 0.296
7PC7 The PDZ domain of SNTG1 complexed with the acetylated PDZ-binding motif of PTEN 提交 2021-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 394–403（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris 8.5, 22 % v/v PEG Smear Broad	分辨率 2.10 Å R-free 0.218
7PC7 The PDZ domain of SNTG1 complexed with the acetylated PDZ-binding motif of PTEN 提交 2021-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 394–403（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris 8.5, 22 % v/v PEG Smear Broad	分辨率 2.10 Å R-free 0.218
8X3S Crystal structure of human WDR5 in complex with PTEN 提交 2023-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 115–148（34 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M HEPES at pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 1.87 Å R-free 0.259

共 10 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PTEN_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–314； UniProt 14–351 作者链 B； PDB构建体 1–314； UniProt 14–351 作者链 C； PDB构建体 1–314； UniProt 14–351 作者链 D； PDB构建体 1–314； UniProt 14–351

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5bug
沉积日期 deposition_date	2015-06-03
结构标题 title	Crystal structure of human phosphatase PTEN oxidized by H2O2
关键词 keywords	Hydrolase, C2 domain, disulfide, oxidized; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	39.85 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	38.82 Å
零角强度 I(0) i0	310850000.00
分子量 molecular_weight	146940.0 kDa
排除体积 excluded_volume	184890 Å³
包络体积 envelope_volume	250270 Å³
水化壳体积 shell_volume	53427 Å³
包络直径 envelope_diameter	125.9 Å
壳层 Rg shell_rg	45.27 Å
包络 Rg envelope_rg	37.72 Å
形状 Rg shape_rg	38.83 Å
总 Rg total_rg	39.17 Å
总原子数 total_atoms	10378
残基数 n_residues	1256
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	126.7 Å
Rg (实空间) rg_real	39.63 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.86 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.1080e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.3850e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	39.77 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	310900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9001
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	53.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.082
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.600
角度范围 angular_range	— – 0.2000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	28580000.0000
实空间数据点数 n_real_points	41
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.925; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.923

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN
分子量 formula_weight	37307.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.3.16,3.1.3.48,3.1.3.67
突变 mutation	Deletion 286-309
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	11129

RRYQEDGFDLDLTYIYPNIIAMGFPAERLEGVYRNNIDDVVRFLDSKHKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPFEDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQEALDFYGEVRTRDKKGVTIPSQRRYVYYYSYLLKNHLDYRPVALLFHKMMFETIPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSNSGPTRREDKFMYFEFPQPLPVCGDIKVEFFHKQNKMLKKDKMFHFWVNTFFIPGPEEDNDKEYLVLTLTKNDLDKANKDKANRYFSPNFKVKLYFTKTV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	L(+)-TARTARIC ACID
分子量 formula_weight	150.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	751

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d5buga1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.45 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
超家族 Superfamily superfamily	c.45.1 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
家族 Family family	c.45.1.1 — Dual specificity phosphatase-like

结构域编号 domain_id	d5buga2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.7 — C2 domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.7.1 — C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB)
家族 Family family	b.7.1.1 — PLC-like (P variant)

结构域编号 domain_id	d5bugb1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.45 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
超家族 Superfamily superfamily	c.45.1 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
家族 Family family	c.45.1.1 — Dual specificity phosphatase-like

结构域编号 domain_id	d5bugb2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.7 — C2 domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.7.1 — C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB)
家族 Family family	b.7.1.1 — PLC-like (P variant)

结构域编号 domain_id	d5bugc1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.45 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
超家族 Superfamily superfamily	c.45.1 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
家族 Family family	c.45.1.1 — Dual specificity phosphatase-like

结构域编号 domain_id	d5bugc2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.7 — C2 domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.7.1 — C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB)
家族 Family family	b.7.1.1 — PLC-like (P variant)

结构域编号 domain_id	d5bugd1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.45 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
超家族 Superfamily superfamily	c.45.1 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
家族 Family family	c.45.1.1 — Dual specificity phosphatase-like

结构域编号 domain_id	d5bugd2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.7 — C2 domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.7.1 — C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB)
家族 Family family	b.7.1.1 — PLC-like (P variant)

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	5bugA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	190 — Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Protein tyrosine phosphatase superfamily

结构域编号 domain_id	5bugA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1110 —

结构域编号 domain_id	5bugB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	190 — Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Protein tyrosine phosphatase superfamily

结构域编号 domain_id	5bugB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1110 —

结构域编号 domain_id	5bugC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	190 — Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Protein tyrosine phosphatase superfamily

结构域编号 domain_id	5bugC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1110 —

结构域编号 domain_id	5bugD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	190 — Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Protein tyrosine phosphatase superfamily

结构域编号 domain_id	5bugD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1110 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	206.870 Å
晶胞边长 b length_b	206.830 Å
晶胞边长 c length_c	87.430 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	48.760 Å
R 因子 r_factor	0.1769
R_work r_work	0.1752
R_free r_free	0.2106

fit	/app/data/saxs_computation/bu/5bug/5bug.fit
pddf	/app/data/pr_computation/bu/5bug/5bug.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/bu/5bug/5bug.dat