Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ZINC ION × 2 CALCIUM ION × 3 N-[(2R)-2-{[3-(3'-chlorobiphenyl-4-yl)-1,2-oxazol-5-yl]methyl}-4-(hydroxyamino)-4-oxobutanoyl]-L-alpha-glutamyl-L-alpha-glutamine × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | MMP12_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–159； UniProt 106–263 |
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| 条目编号 entry_id | 5d2b |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-08-05 |
| 结构标题 title | Crystal structure of a mutated catalytic domain of Human MMP12 in complex with an hydroxamate analogue of RXP470 |
| 关键词 keywords | Metzincin, Matrix Metallo Elastase, MMP12, human, RXP470, Macrophage, Hydrolase, Hydroxamate based inhibitor; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.86 Å |
| Rg（电子密度） | 14.50 Å |
| 总 Rg | 15.76 Å |
| 原子数 | 1297 |
| 残基数 | 159 |
| 排除体积 | 22884 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5d2ba1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.92 — Zincin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain |
| 家族 Family family | d.92.1.11 — Matrix metalloproteases, catalytic domain |
| 结构域编号 domain_id | d5d2ba2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 5d2bA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 390 — Collagenase (Catalytic Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Collagenase (Catalytic Domain) |