Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 6 | Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1 × 2 （P51668） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 2 （P62992） ZINC ION × 4 water × 6 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | TRI25_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–85； UniProt 1–82 作者链 D； PDB构建体 4–85； UniProt 1–82 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 6 | E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25 × 2 （Q14258） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 2 （P62992） ZINC ION × 4 water × 6 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | UB2D1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 4–150； UniProt 1–147 作者链 E； PDB构建体 4–150； UniProt 1–147 |
物种未注明
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 6 | E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25 × 2 （Q14258） Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1 × 2 （P51668） ZINC ION × 4 water × 6 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | RS27A_BOVIN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 F； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 5fer |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-12-17 |
| 结构标题 title | Complex of TRIM25 RING with UbcH5-Ub |
| 关键词 keywords | E3 ligase, ubiquitin, Ligase; LIGASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 31.39 Å |
| Rg（电子密度） | 31.31 Å |
| 总 Rg | 31.46 Å |
| 原子数 | 4757 |
| 残基数 | 602 |
| 排除体积 | 85024 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5ferb_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.20 — UBC-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.20.1 — UBC-like |
| 家族 Family family | d.20.1.1 — UBC-related |
| 结构域编号 domain_id | d5ferc_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.15.1 — Ubiquitin-like |
| 家族 Family family | d.15.1.1 — Ubiquitin-related |
| 结构域编号 domain_id | d5fere_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.20 — UBC-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.20.1 — UBC-like |
| 家族 Family family | d.20.1.1 — UBC-related |
| 结构域编号 domain_id | d5ferf_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.15.1 — Ubiquitin-like |
| 家族 Family family | d.15.1.1 — Ubiquitin-related |
| 结构域编号 domain_id | 5ferA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Herpes Virus-1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) |
| 结构域编号 domain_id | 5ferB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme |
| 结构域编号 domain_id | 5ferD00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Herpes Virus-1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) |
| 结构域编号 domain_id | 5ferE00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme |