SAXSdb — 5fq7

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BT_2263

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	BT_2264 × 2 （Q8A5H5） BT_2261 × 2 （Q8A5H8） BT_2262 × 2 （Q8A5H7） PEPTIDE × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8A5H6_BACTN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–480； UniProt 19–498 作者链 C； PDB构建体 1–480； UniProt 19–498

BT_2264

物种未注明

UniProt Q8A5H5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	BT_2263 × 2 （Q8A5H6） BT_2261 × 2 （Q8A5H8） BT_2262 × 2 （Q8A5H7） PEPTIDE × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8A5H5_BACTN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–984； UniProt 1–984 作者链 D； PDB构建体 1–984； UniProt 1–984

BT_2261

物种未注明

UniProt Q8A5H8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	BT_2263 × 2 （Q8A5H6） BT_2264 × 2 （Q8A5H5） BT_2262 × 2 （Q8A5H7） PEPTIDE × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8A5H8_BACTN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–148； UniProt 19–166 作者链 F； PDB构建体 1–148； UniProt 19–166

BT_2262

物种未注明

UniProt Q8A5H7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	BT_2263 × 2 （Q8A5H6） BT_2264 × 2 （Q8A5H5） BT_2261 × 2 （Q8A5H8） PEPTIDE × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8A5H7_BACTN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–212； UniProt 19–230 作者链 H； PDB构建体 1–212； UniProt 19–230

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5fq7
沉积日期 deposition_date	2015-12-07
结构标题 title	Crystal structure of the SusCD complex BT2261-2264 from Bacteroides thetaiotaomicron
关键词 keywords	MEMBRANE PROTEIN, SUGAR BINDING PROTEIN, OUTER MEMBRANE NUTRIENT IMPORTER SUSCD COMPLEX; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5fq7__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5fq7__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5fq7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	48.08 Å
Rg（电子密度）	48.14 Å
总 Rg	48.35 Å
原子数	25886
残基数	3329
排除体积	456280 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5fq7__assembly_1__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BT_2263
分子量 formula_weight	53145.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	25886

CDLNINDDPNYPMNDQVTADLIFPSISASIASAVGGEIYNYAGFFAQYYEQKPESNQYNTLCEYTFTESSQQMDYSYRILFAGALEDAKQVLEKTTNPADRFATTILRAYAFQIMVDNTSDSPYSEALQGNANATPKWDTGETVYKGILGEIDAAEAALDGSGMDVPDLIFNKNIAQWKGFANALRLRMYLRFIDANIDAASYTEKVKTLVQNNEFFTGDVKLDCFLDETDKRNPWYNTNAVGLTGNHCAAYPLVSYLSSTGDPRIAYGISKTDADGKYVGQLPGGKTHMQSILGTDNWKNKNVSAIDYSIGATKPVYFFTQAELQFLIAEVYARFHNDDANAKSAYEAGVTADFAVRGFAGQENTILEGACAWSAASTQADKLNLIYMQKWVSLFYMDHMEAWSEIRRTDCPKLSSYSAAQIQASESVYTPGELVAPWTNGLEAGGLMKRMTYPLSARQQNVNTPAGVPGSTPVWWDIK

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	BT_2264
分子量 formula_weight	108954.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

MQTQEVAIKPNLKVVLRSDAQQIDEVVVTAMGIKRSEKALGYAATSVGGEKIAESRTSDVMSSLAGKIAGVQISSTSSDPGASNSVIIRGVSSLSGTNQPLYVVDGVPLNNSTVYSTDGLNSGYDFGNGANAINPDDVANMTILKGAAATALYGSRAANGVVMITTKSGRKEKGVGIEYNGGVQWSTVLRLPEFQNEFGMGWNGNHTELENGSWGPRFDGSMQLWGNVYNNSQKLKPYVAMPDNIKDFFDAGFRYSNSLSFNGATDKSDYYVSFSQISDDGMIPTDADSYDKYTFSARGSHKAGALTFSSSLNYAYQKNNFATTGQGLSMLNSLYQTPRDISIIGLEDQNDPFNTPGYYYTPYGVMNPYYILNNYLNEYESERFYGKFQLDYEFLKYFKFTYRMGLDTTTGQSDKGKPNLYALYYEGTPNGEGQGSSSPFSGETGQYSEQITRRREINQDIMVNFNMPVNDFNINALVGFNGNERKVSYQYSEVNDLTIPTWFNLKNSGKTPIVEQHMELRRLMGVFGQFEGSWKNMLYLTVTARNDWSSTLPKENRSFFYPGITGSFIFSELLNDNLQDVITFGKIRASWGKTGNDADVYMVNPVYAQSSNRIPFGSLTFPLGGVNAYSAGNVLGSNTLSPEMTTESEVGLNMAFFKNRLSFDVSYYNRNTDKQIFSLAMDPASGYTAQNMNLGKIRNRGIELLISGTPIRTKDFSWELTWNFTKNWSKVISLPEELGGITTIYGLNGGTSMYAITGMPVGVFKAQVAERDPQGRIVVNSSTGLPVEASEFGICGDMNNKYQMGVSTNLKYKGISLGIDFDIRQGGVMYSRTKDINYFTGNAIQTAYNDRNPLIVPNSVNKIVNGENVTYVENTTPITSSNIYKYWGDGGSDMGSCFLVDKSYVKLRSVVLGWDLPKRWLAKTPFQAVKVSAYGNNLFVWTPSSNTFIDPEMTSFGNDLEGNYGEYTANPSSRRFGFNLMVKF

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	BT_2261
分子量 formula_weight	16429.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

CDNDTEPGGTAVEKMAGDWWVTVNAFIDGKEVEDPFGAGHLQMSTYNTASNSETEMWLDDLGNFWEYKLKVNVNYAARTFSTTGFVDNVTYESKVKITDGKVLEKAATTPSGMPADSIVYMVQFDDDEDGLTYKVSGFRRTGFPADDF

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	BT_2262
分子量 formula_weight	23399.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H

CDKSTDDTSKVTYFVTLEREGDEKIVLEKGQPFVEPGYYAEMNGEDITESVQIKGSVDVNTPGIYNLVYAAYNEDGFAKTFTRTVYVADNTASPLKSGIYTVAEGSKRTAPSVVAFSGYEIVIFQMEPGIFYISDFLGGWYDQRAGYGPDYAMVGKFELNDDNTITPLESYVAGWGDSMDQMTNTLLDPATGTLKWTVAYAGQLSFDIIVKQ

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	PEPTIDE
分子量 formula_weight	588.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,P

GGGGGGGGGG

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	5fq7A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	390 —

结构域编号 domain_id	5fq7C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	390 —

结构域编号 domain_id	5fq7E00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	220 —

结构域编号 domain_id	5fq7F00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	220 —

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晶胞边长 a length_a	123.591 Å
晶胞边长 b length_b	180.159 Å
晶胞边长 c length_c	245.747 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.400 Å
最低分辨率 resolution_low	48.432 Å
R 因子 r_factor	0.2060
R_work r_work	0.2006
R_free r_free	0.2554

Crystal structure of the SusCD complex BT2261-2264 from Bacteroides thetaiotaomicron

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BT_2263

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

BT_2264

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

BT_2261

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

BT_2262

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5fq7__assembly_1__model_1

5fq7__assembly_1__model_1 | I(q)

5fq7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the SusCD complex BT2261-2264 from Bacteroides thetaiotaomicron

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BT_2263

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BT_2264

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BT_2261

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BT_2262

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5fq7__assembly_1__model_1

5fq7__assembly_1__model_1 | I(q)

5fq7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)