5g06

Cryo-EM structure of yeast cytoplasmic exosome

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6 × 1 （P46948） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43 × 1 （P25359） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46 × 1 （P53256） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42 × 1 （Q12277） EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3 × 1 （P48240） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40 × 1 （Q08285） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4 × 1 （P38792） EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4 × 1 （P53859） EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3 × 1 （Q08162） SUPERKILLER PROTEIN 7 × 1 （Q08491）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RRP45_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305

EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6

物种未注明

UniProt P46948

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45 × 1 （Q05636） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43 × 1 （P25359） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46 × 1 （P53256） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42 × 1 （Q12277） EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3 × 1 （P48240） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40 × 1 （Q08285） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4 × 1 （P38792） EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4 × 1 （P53859） EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3 × 1 （Q08162） SUPERKILLER PROTEIN 7 × 1 （Q08491）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RRP41_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43

物种未注明

UniProt P25359

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45 × 1 （Q05636） EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6 × 1 （P46948） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46 × 1 （P53256） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42 × 1 （Q12277） EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3 × 1 （P48240） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40 × 1 （Q08285） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4 × 1 （P38792） EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4 × 1 （P53859） EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3 × 1 （Q08162） SUPERKILLER PROTEIN 7 × 1 （Q08491）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RRP43_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–394； UniProt 1–394

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46

物种未注明

UniProt P53256

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45 × 1 （Q05636） EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6 × 1 （P46948） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43 × 1 （P25359） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42 × 1 （Q12277） EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3 × 1 （P48240） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40 × 1 （Q08285） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4 × 1 （P38792） EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4 × 1 （P53859） EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3 × 1 （Q08162） SUPERKILLER PROTEIN 7 × 1 （Q08491）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RRP46_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–223； UniProt 1–223

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42

物种未注明

UniProt Q12277

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45 × 1 （Q05636） EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6 × 1 （P46948） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43 × 1 （P25359） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46 × 1 （P53256） EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3 × 1 （P48240） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40 × 1 （Q08285） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4 × 1 （P38792） EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4 × 1 （P53859） EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3 × 1 （Q08162） SUPERKILLER PROTEIN 7 × 1 （Q08491）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RRP42_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–265； UniProt 1–265

EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3

物种未注明

UniProt P48240

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45 × 1 （Q05636） EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6 × 1 （P46948） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43 × 1 （P25359） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46 × 1 （P53256） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42 × 1 （Q12277） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40 × 1 （Q08285） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4 × 1 （P38792） EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4 × 1 （P53859） EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3 × 1 （Q08162） SUPERKILLER PROTEIN 7 × 1 （Q08491）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MTR3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40

物种未注明

UniProt Q08285

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45 × 1 （Q05636） EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6 × 1 （P46948） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43 × 1 （P25359） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46 × 1 （P53256） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42 × 1 （Q12277） EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3 × 1 （P48240） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4 × 1 （P38792） EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4 × 1 （P53859） EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3 × 1 （Q08162） SUPERKILLER PROTEIN 7 × 1 （Q08491）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RRP40_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4

物种未注明

UniProt P38792

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45 × 1 （Q05636） EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6 × 1 （P46948） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43 × 1 （P25359） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46 × 1 （P53256） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42 × 1 （Q12277） EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3 × 1 （P48240） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40 × 1 （Q08285） EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4 × 1 （P53859） EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3 × 1 （Q08162） SUPERKILLER PROTEIN 7 × 1 （Q08491）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RRP4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–359； UniProt 1–359

EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4

物种未注明

UniProt P53859

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45 × 1 （Q05636） EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6 × 1 （P46948） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43 × 1 （P25359） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46 × 1 （P53256） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42 × 1 （Q12277） EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3 × 1 （P48240） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40 × 1 （Q08285） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4 × 1 （P38792） EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3 × 1 （Q08162） SUPERKILLER PROTEIN 7 × 1 （Q08491）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CSL4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–292； UniProt 1–292

EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3

物种未注明

UniProt Q08162

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45 × 1 （Q05636） EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6 × 1 （P46948） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43 × 1 （P25359） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46 × 1 （P53256） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42 × 1 （Q12277） EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3 × 1 （P48240） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40 × 1 （Q08285） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4 × 1 （P38792） EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4 × 1 （P53859） SUPERKILLER PROTEIN 7 × 1 （Q08491）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RRP44_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–1001； UniProt 1–1001

SUPERKILLER PROTEIN 7

物种未注明

UniProt Q08491

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45 × 1 （Q05636） EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6 × 1 （P46948） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43 × 1 （P25359） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46 × 1 （P53256） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42 × 1 （Q12277） EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3 × 1 （P48240） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40 × 1 （Q08285） EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4 × 1 （P38792） EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4 × 1 （P53859） EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3 × 1 （Q08162）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SKI7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–747； UniProt 1–747

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5g06
沉积日期 deposition_date	2016-03-17
结构标题 title	Cryo-EM structure of yeast cytoplasmic exosome
关键词 keywords	HYDROLASE, RNA DECAY, EXOSOME, RNA QUALITY CONTROL; HYDROLASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5g06__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5g06__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5g06__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	49.30 Å
Rg（电子密度）	48.83 Å
总 Rg	49.04 Å
原子数	26794
残基数	3420
排除体积	478040 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5g06__assembly_1__model_1`	undecameric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45
分子量 formula_weight	34001.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	26794

MAKDIEISASESKFILEALRQNYRLDGRSFDQFRDVEITFGKEFGDVSVKMGNTKVHCRISCQIAQPYEDRPFEGLFVISTEISPMAGSQFENGNITGEDEVLCSRIIEKSVRRSGALDVEGLCIVAGSKCWAVRADVHFLDCDGGFIDASCIAVMAGLMHFKKPDITVHGEQIIVHPVNEREPVPLGILHIPICVTFSFFNPQDTEENIKGETNSEISIIDATLKEELLRDGVLTVTLNKNREVVQVSKAGGLPMDALTLMKCCHEAYSIIEKITDQILQLLKEDSEKRNKYAAMLTSENAREI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6
分子量 formula_weight	27599.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSRLEIYSPEGLRLDGRRWNELRRFESSINTHPHAADGSSYMEQGNNKIITLVKGPKEPRLKSQMDTSKALLNVSVNITKFSKFERSKSSHKNERRVLEIQTSLVRMFEKNVMLNIYPRTVIDIEIHVLEQDGGIMGSLINGITLALIDAGISMFDYISGISVGLYDTTPLLDTNSLEENAMSTVTLGVVGKSEKLSLLLVEDKIPLDRLENVLAIGIAGAHRVRDLMDEELRKHAQKRVSNASAR

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43
分子量 formula_weight	44093.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MAESTTLETIEIHPITFPPEVLARISPELSLQRHLSLGIRPCLRKYEEFRDVAIENNTLSRYADAGNIDTKNNILGSNVLKSGKTIVITSITGGIIEETSAAIKDLDDFGEEELFEVTKEEDIIANYASVYPVVEVERGRVGACTDEEMTISQKLHDSILHSRILPKKALKVKAGVRSANEDGTFSVLYPDELEDDTLNETNLKMKRKWSYVLYAKIVVLSRTGPVFDLCWNSLMYALQSVKLPRAFIDERASDLRMTIRTRGRSATIRETYEIICDQTKSVPLMINAKNIAFASNYGIVELDPECQLQNSDNSEEEEVDIDMDKLNTVLIADLDTEAEETSIHSTISILAAPSGNYKQLTLMGGGAKITPEMIKRSLLLSRVRADDLSTRFNI

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46
分子量 formula_weight	24430.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MSVQAEIGILDHVDGSSEFVSQDTKVICSVTGPIEPKARQELPTQLALEIIVRPAKGVATTREKVLEDKLRAVLTPLITRHCYPRQLCQITCQILESGEDEAEFSLRELSCCINAAFLALVDAGIALNSMCASIPIAIIKDTSDIIVDPTAEQLKISLSVHTLALEFVNGGKVVKNVLLLDSNGDFNEDQLFSLLELGEQKCQELVTNIRRIIQDNISPRLVV

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42
分子量 formula_weight	29099.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MSLSVAEKSYLYDSLASTPSIRPDGRLPHQFRPIEIFTDFLPSSNGSSRIIASDGSECIVSIKSKVVDHHVENELLQVDVDIAGQRDDALVVETITSLLNKVLKSGSGVDSSKLQLTKKYSFKIFVDVLVISSHSHPISLISFAIYSALNSTYLPKLISAFDDLEVEELPTFHDYDMVKLDINPPLVFILAVVGNNMLLDPAANESEVANNGLIISWSNGKITSPIRSVALNDSNVKSFKPHLLKQGLAMVEKYAPDVVRSLENL

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3
分子量 formula_weight	27590.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MNVQDRRRLLGPAAAKPMAFSNTTTHVPEKKSTDLTPKGNESEQELSLHTGFIENCNGSALVEARSLGHQTSLISAVYGPRSIRGSFTSQGTISIQLKNGLLEKYNTNELKEVSSFLMGIFNSVVNLSRYPKSGIDIFVYLTYDKDLTNNPQDDDSQSKMMSSQISSLIPHCITSITLALADAGIELVDMAGAGEANGTVVSFIKNGEEIVGFWKDDGDDEDLLECLDRCKEQYNRYRDLMISCLMNQET

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40
分子量 formula_weight	26583.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MSTFIFPGDSFPVDPTTPVKLGPGIYCDPNTQEIRPVNTGVLHVSAKGKSGVQTAYIDYSSKRYIPSVNDFVIGVIIGTFSDSYKVSLQNFSSSVSLSYMAFPNASKKNRPTLQVGDLVYARVCTAEKELEAEIECFDSTTGRDAGFGILEDGMIIDVNLNFARQLLFNNDFPLLKVLAAHTKFEVAIGLNGKIWVKCEELSNTLACYRTIMECCQKNDTAAFKDIAKRQFKEILTVKEE

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4
分子量 formula_weight	39470.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSEVITITKRNGAFQNSSNLSYNNTGISDDENDEEDIYMHDVNSASKSESDSQIVTPGELVTDDPIWMRGHGTYFLDNMTYSSVAGTVSRVNRLLSVIPLKGRYAPETGDHVVGRIAEVGNKRWKVDIGGKQHAVLMLGSVNLPGGILRRKSESDELQMRSFLKEGDLLNAEVQSLFQDGSASLHTRSLKYGKLRNGMFCQVPSSLIVRAKNHTHNLPGNITVVLGVNGYIWLRKTSQMDLARDTPSANNSSSIKSTGPTGAVSLNPSITRLEEESSWQIYSDENDPSISNNIRQAICRYANVIKALAFCEIGITQQRIVSAYEASMVYSNVGELIEKNVMESIGSDILTAEKMRGNGN

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4
分子量 formula_weight	31619.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MACNFQFPEIAYPGKLICPQYGTENKDGEDIIFNYVPGPGTKLIQYEHNGRTLEAITATLVGTVRCEEEKKTDQEEEREGTDQSTEEEKSVDASPNDVTRRTVKNILVSVLPGTEKGRKTNKYANNDFANNLPKEGDIVLTRVTRLSLQRANVEILAVEDKPSPIDSGIGSNGSGIVAAGGGSGAATFSVSQASSDLGETFRGIIRSQDVRSTDRDRVKVIECFKPGDIVRAQVLSLGDGTNYYLTTARNDLGVVFARAANGAGGLMYATDWQMMTSPVTGATEKRKCAKPF

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3
分子量 formula_weight	113855.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.13.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MSVPAIAPRRKRLADGLSVTQKVFVRSRNGGATKIVREHYLRSDIPCLSRSCTKCPQIVVPDAQNELPKFILSDSPLELSAPIGKHYVVLDTNVVLQAIDLLENPNCFFDVIVPQIVLDEVRNKSYPVYTRLRTLCRDSDDHKRFIVFHNEFSEHTFVERLPNETINDRNNRAIRKTCQWYSEHLKPYDINVVLVTNDRLNREAATKEVESNIITKSLVQYIELLPNADDIRDSIPQMDSFDKDLERDTFSDFTFPEYYSTARVMGGLKNGVLYQGNIQISEYNFLEGSVSLPRFSKPVLIVGQKNLNRAFNGDQVIVELLPQSEWKAPSSIVLDSEHFDVNDNPDIEAGDDDDNNESSSNTTVISDKQRRLLAKDAMIAQRSKKIQPTAKVVYIQRRSWRQYVGQLAPSSVDPQSSSTQNVFVILMDKCLPKVRIRTRRAAELLDKRIVISIDSWPTTHKYPLGHFVRDLGTIESAQAETEALLLEHDVEYRPFSKKVLECLPAEGHDWKAPTKLDDPEAVSKDPLLTKRKDLRDKLICSIDPPGCVDINDALHAKKLPNGNWEVGVHIADVTHFVKPGTALDAEGAARGTSVYLVDKRIDMLPMLLGTDLCSLKPYVDRFAFSVIWELDDSANIVNVNFMKSVIRSREAFSYEQAQLRIDDKTQNDELTMGMRALLKLSVKLKQKRLEAGALNLASPEVKVHMDSETSDPNEVEIKKLLATNSLVEEFMLLANISVARKIYDAFPQTAMLRRHAAPPSTNFEILNEMLNTRKNMSISLESSKALADSLDRCVDPEDPYFNTLVRIMSTRCMMAAQYFYSGAYSYPDFRHYGLAVDIYTHFTSPIRRYCDVVAHRQLAGAIGYEPLSLTHRDKNKMDMICRNINRKHRNAQFAGRASIEYYVGQVMRNNESTETGYVIKVFNNGIVVLVPKFGVEGLIRLDNLTEDPNSAAFDEVEYKLTFVPTNSDKPRDVYVFDKVEVQVRSVMDPITSKRKAELLLK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	SUPERKILLER PROTEIN 7
分子量 formula_weight	84888.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MSLLEQLARKRIEKSKGLLSADQSHSTSKSASLLERLHKNRETKDNNAETKRKDLKTLLAKDKVKRSDFTPNQHSVSLSLKLSALKKSNSDLEKQGKSVTLDSKENELPTKRKSPDDKLNLEESWKAIKEMNHYCFLKNDPCINQTDDFAFTNFIIKDKKNSLSTSIPLSSQNSSFLSLKKHNNELLGIFVPCNLPKTTRKVAIENFNRPSPDDIIQSAQLNAFNEKLENLNIKSVPKAEKKEPINLQTPPTESIDIHSFIATHPLNLTCLFLGDTNAGKSTLLGHLLYDLNEISMSSMRELQKKSSNLDPSSSNSFKVILDNTKTERENGFSMFKKVIQVENDLLPPSSTLTLIDTPGSIKYFNKETLNSILTFDPEVYVLVIDCNYDSWEKSLDGPNNQIYEILKVISYLNKNSACKKHLIILLNKADLISWDKHRLEMIQSELNYVLKENFQWTDAEFQFIPCSGLLGSNLNKTENITKSKYKSEFDSINYVPEWYEGPTFFSQLYLLVEHNMNKIETTLEEPFVGTILQSSVLQPIAEINYVSLKVLINSGYIQSGQTIEIHTQYEDFHYYGIVSRMKNSKQILETNTKNNISVGLNPDILEVLVKIHNTEDFTKKQFHIRKGDIIIHSRKTNTLSPNLPNTLKLLALRLIKLSIQTHALSDPVDLGSELLLYHNLTHNAVKLVKILGTNDISINPNQSLIVEVEIIEPDFALNVIDSKYITNNIVLTSIDHKVIAVGRIACQ

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.200 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	4.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	25000

Cryo-EM structure of yeast cytoplasmic exosome

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP45

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXOSOME COMPLEX COMPONENT SKI6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP43

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP46

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP42

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXOSOME COMPLEX COMPONENT MTR3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP40

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXOSOME COMPLEX COMPONENT CSL4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE DIS3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体