SAXSdb — 5iqo

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein FimG

Escherichia coli (strain K12)

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 36–167	未记录	Protein FimF × 1 （P08189） CO COBALT (II) ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.6 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl	分辨率 1.30 Å R-free 0.170
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 36–167	未记录	Protein FimF × 1 （P08189） CO COBALT (II) ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.6 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl	分辨率 1.30 Å R-free 0.170

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5IQO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3BFQ Crystal structure of truncated FimG (FimGt) in complex with the donor strand peptide of FimF (DSF) 提交 2007-11-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 36–167（132 aa）片段：sequence database residues 36-167	未记录	CO COBALT (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 80 mM NaCl, 27.5% PEG 1500, 20 mM cobalt chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.34 Å R-free 0.179
3BFW Crystal structure of truncated FimG (FimGt) in complex with the donor strand peptide of FimF (DSF) 提交 2007-11-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 36–167（132 aa）片段：sequence database residues 36-167	未记录	YT3 YTTRIUM (III) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 80 mM NaCl, 27.5% PEG 1500, 20 mM yttrium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
3BFW Crystal structure of truncated FimG (FimGt) in complex with the donor strand peptide of FimF (DSF) 提交 2007-11-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 36–167（132 aa）片段：sequence database residues 36-167	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 80 mM NaCl, 27.5% PEG 1500, 20 mM yttrium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
3JWN Complex of FimC, FimF, FimG and FimH 提交 2009-09-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 24–167（144 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；293 K；1.6 M potassium chloride, 0.1 M sodium citrate, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.69 Å R-free 0.272
3JWN Complex of FimC, FimF, FimG and FimH 提交 2009-09-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 M 24–167（144 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；293 K；1.6 M potassium chloride, 0.1 M sodium citrate, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.69 Å R-free 0.272
4J3O Crystal structure of the FimD usher traversed by the pilus tip complex assembly composed of FimC:FimF:FimG:FimH 提交 2013-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 24–167（144 aa）片段：UNP residues 24-167	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；1.6-2.0M sodium formate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.299
5IQM Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_T4R-T6R-D13N 提交 2016-03-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 36–167（132 aa）片段：UNP residues 36-167	未记录	CO COBALT (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.0 (RT), PEG-1500, NaCl, CoCl2	分辨率 1.50 Å R-free 0.185
5IQM Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_T4R-T6R-D13N 提交 2016-03-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 36–167（132 aa）片段：UNP residues 36-167	未记录	CO COBALT (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.0 (RT), PEG-1500, NaCl, CoCl2	分辨率 1.50 Å R-free 0.185
5IQN Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_SRIRIRGYVR 提交 2016-03-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 36–167（132 aa）片段：UNP residues 36-167	未记录	CO COBALT (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 6.8 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl	分辨率 1.00 Å R-free 0.146
5IQN Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_SRIRIRGYVR 提交 2016-03-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 36–167（132 aa）片段：UNP residues 36-167	未记录	CO COBALT (II) ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 6.8 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl	分辨率 1.00 Å R-free 0.146
6E14 Handover mechanism of the growing pilus by the bacterial outer membrane usher FimD 提交 2018-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 11–167（157 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6E15 Handover mechanism of the growing pilus by the bacterial outer membrane usher FimD 提交 2018-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 11–167（157 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
8V3J Structure-Based Engineering of a Highly Immunogenic, Conformationally Stabilized FimH Antigen for a Urinary Tract Infection Vaccine 提交 2023-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–37（14 aa）	突变：N7S,G15A,G16A,V27A,N70S,N228Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1 M Sodium Acetate (pH 4.5), 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
8V3J Structure-Based Engineering of a Highly Immunogenic, Conformationally Stabilized FimH Antigen for a Urinary Tract Infection Vaccine 提交 2023-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 24–37（14 aa）	突变：N7S,G15A,G16A,V27A,N70S,N228Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1 M Sodium Acetate (pH 4.5), 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
8V3J Structure-Based Engineering of a Highly Immunogenic, Conformationally Stabilized FimH Antigen for a Urinary Tract Infection Vaccine 提交 2023-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 24–37（14 aa）	突变：N7S,G15A,G16A,V27A,N70S,N228Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1 M Sodium Acetate (pH 4.5), 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
8V3J Structure-Based Engineering of a Highly Immunogenic, Conformationally Stabilized FimH Antigen for a Urinary Tract Infection Vaccine 提交 2023-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 24–37（14 aa）	突变：N7S,G15A,G16A,V27A,N70S,N228Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1 M Sodium Acetate (pH 4.5), 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
8V93 Cryo-EM structure of E. coli FimH lectin domain bound to Fabs 329-2 and 454-3 提交 2023-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 24–37（14 aa）	突变：N7S, G15A, G16A, V27A, N70S, N228Q within FimH	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
9D6F Cryo-EM structure of E. coli FimH lectin domain bound to Fabs 440-2 and 454-3 提交 2024-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 24–37（14 aa）	突变：N7S, G15A, G16A, V27A, N70S, N228Q within FimH	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.24 Å
9FY9 Cryo-EM structure of the type 1 chaperone-usher pilus FimD-tip complex (FimDHGFC) - Conformer 1 提交 2024-07-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 24–167（144 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9ME4 Antibody fragments from mAb475 and mAb824 bound to the adhesin protein FimH 提交 2024-12-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–167（167 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9ME5 Antibody fragments from mAb824 and mAb926 bound to the adhesin protein FimH 提交 2024-12-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–167（167 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9PTM Antibody fragment from mAb824 bound to the adhesin protein FimH. 提交 2025-07-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 1–167（167 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 15 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FIMG_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–132； UniProt 36–167 作者链 C； PDB构建体 1–132； UniProt 36–167

Protein FimF

物种未注明

UniProt P08189

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 23–37	片段：UNP residues 23-37	Protein FimG × 1 （P08190） CO COBALT (II) ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.6 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl	分辨率 1.30 Å R-free 0.170
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 23–37	片段：UNP residues 23-37	Protein FimG × 1 （P08190） CO COBALT (II) ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.6 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl	分辨率 1.30 Å R-free 0.170

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5IQO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2JMR NMR structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimF 提交 2006-11-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–176（154 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；310.1 K NMR样品组成 1.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] FimF, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 0.05 % sodium azide, 5 % D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
3BFQ Crystal structure of truncated FimG (FimGt) in complex with the donor strand peptide of FimF (DSF) 提交 2007-11-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 23–37（15 aa）片段：sequence database residues 23-37	未记录	CO COBALT (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 80 mM NaCl, 27.5% PEG 1500, 20 mM cobalt chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.34 Å R-free 0.179
3BFW Crystal structure of truncated FimG (FimGt) in complex with the donor strand peptide of FimF (DSF) 提交 2007-11-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–37（15 aa）片段：sequence database residues 23-37	未记录	YT3 YTTRIUM (III) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 80 mM NaCl, 27.5% PEG 1500, 20 mM yttrium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
3BFW Crystal structure of truncated FimG (FimGt) in complex with the donor strand peptide of FimF (DSF) 提交 2007-11-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 23–37（15 aa）片段：sequence database residues 23-37	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 80 mM NaCl, 27.5% PEG 1500, 20 mM yttrium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
3BWU Crystal structure of the ternary complex of FimD (N-Terminal Domain, FimDN) with FimC and the N-terminally truncated pilus subunit FimF (FimFt) 提交 2008-01-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 35–176（142 aa）片段：N-terminal truncation construct of pilus subunit fimF, Residues 13-154	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20 mM Tris/HCl pH 8.0, 20% PEG 8000, 50 mM succinic acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.76 Å R-free 0.212
3JWN Complex of FimC, FimF, FimG and FimH 提交 2009-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 23–176（154 aa）片段：UNP residues 23-176 链 F 23–176（154 aa）片段：UNP residues 23-176	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；293 K；1.6 M potassium chloride, 0.1 M sodium citrate, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.69 Å R-free 0.272
3JWN Complex of FimC, FimF, FimG and FimH 提交 2009-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 K 23–176（154 aa）片段：UNP residues 23-176 链 L 23–176（154 aa）片段：UNP residues 23-176	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；293 K；1.6 M potassium chloride, 0.1 M sodium citrate, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.69 Å R-free 0.272
4J3O Crystal structure of the FimD usher traversed by the pilus tip complex assembly composed of FimC:FimF:FimG:FimH 提交 2013-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 23–176（154 aa）片段：UNP residues 21-176	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；1.6-2.0M sodium formate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.299
5IQM Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_T4R-T6R-D13N 提交 2016-03-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 23–37（15 aa）片段：UNP residues 23-37	未记录	CO COBALT (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.0 (RT), PEG-1500, NaCl, CoCl2	分辨率 1.50 Å R-free 0.185
5IQM Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_T4R-T6R-D13N 提交 2016-03-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–37（15 aa）片段：UNP residues 23-37	未记录	CO COBALT (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.0 (RT), PEG-1500, NaCl, CoCl2	分辨率 1.50 Å R-free 0.185
5IQN Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_SRIRIRGYVR 提交 2016-03-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 25–34（10 aa）片段：UNP residues 35-34	未记录	CO COBALT (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 6.8 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl	分辨率 1.00 Å R-free 0.146
5IQN Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_SRIRIRGYVR 提交 2016-03-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 25–34（10 aa）片段：UNP residues 35-34	未记录	CO COBALT (II) ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 6.8 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl	分辨率 1.00 Å R-free 0.146
6E14 Handover mechanism of the growing pilus by the bacterial outer membrane usher FimD 提交 2018-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 22–176（155 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6E15 Handover mechanism of the growing pilus by the bacterial outer membrane usher FimD 提交 2018-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 22–176（155 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
9BOG Structural basis for adhesin secretion by the outer-membrane usher in type 1 pili 提交 2024-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 23–176（154 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.99 Å
9FX0 Cryo-EM structure of the type 1 pilus tip-to-rod transition 提交 2024-07-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 23–176（154 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
9FY9 Cryo-EM structure of the type 1 chaperone-usher pilus FimD-tip complex (FimDHGFC) - Conformer 1 提交 2024-07-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 23–176（154 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	FIMF_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–15； UniProt 23–37 作者链 D； PDB构建体 1–15； UniProt 23–37

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5iqo
沉积日期 deposition_date	2016-03-11
结构标题 title	Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitutions Q134E and S138E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_T4R-T6R-D13N
关键词 keywords	Complex, Protein, FimGt, cell adhesion; CELL ADHESION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	20.23 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.23 Å
零角强度 I(0) i0	19554800.00
分子量 molecular_weight	31312.0 kDa
排除体积 excluded_volume	38207 Å³
包络体积 envelope_volume	44628 Å³
水化壳体积 shell_volume	19578 Å³
包络直径 envelope_diameter	61.8 Å
壳层 Rg shell_rg	25.29 Å
包络 Rg envelope_rg	19.37 Å
形状 Rg shape_rg	19.21 Å
总 Rg total_rg	20.05 Å
总原子数 total_atoms	4267
残基数 n_residues	293
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	60.2 Å
Rg (实空间) rg_real	20.10 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.26 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.9550e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2420e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.13 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	19560000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9149
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	24.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.074
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.614
角度范围 angular_range	— – 0.3950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2990000.0000
实空间数据点数 n_real_points	71
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.969; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.990; Smooth: 0.992

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein FimG
分子量 formula_weight	13708.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	4648

AKPCTVSTTNATVDLGDLYSFSLMSAGAASAWHDVALELTNCPVGTSRVTASFSGAADSTGYYKNQGTAQNIQLELQDDSGNTLNTGATKTVQVDDSSQSAHFPLQVRALTVNGGATQGTIEAVIEITYTYS

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein FimF
分子量 formula_weight	1751.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

ADSRIRIRGYVRNNG

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	COBALT (II) ION
分子量 formula_weight	58.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	PENTAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	287

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5iqoA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1090 — Fimbrial-type adhesion domain

结构域编号 domain_id	5iqoC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1090 — Fimbrial-type adhesion domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	48.060 Å
晶胞边长 b length_b	61.850 Å
晶胞边长 c length_c	50.280 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	109.12 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.302 Å
最低分辨率 resolution_low	45.409 Å
R 因子 r_factor	0.1414
R_work r_work	0.1410
R_free r_free	0.1696

fit	/app/data/saxs_computation/iq/5iqo/5iqo.fit
pddf	/app/data/pr_computation/iq/5iqo/5iqo.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/iq/5iqo/5iqo.dat

Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitutions Q134E and S138E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_T4R-T6R-D13N

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein FimG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein FimF

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)