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5is6

Crystal structure of mouse CARM1 in complex with Sinefungin at 2.0 Angstroms resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 129.1 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone-arginine methyltransferase CARM1

Mus musculus

UniProt Q9WVG6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 130–487 链 B； UniProt 130–487 链 C； UniProt 130–487 链 D； UniProt 130–487 未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 SFG SINEFUNGIN × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 28 % NaCl 100 mM 分辨率 2.01 Å R-free 0.177

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IS6 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2V74 Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1), in complex with S-adenosyl-homocysteine 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
链 D 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；1.6M DI-AMMONIUM HYDROGENPHOSPHATE, 100MM HEPES PH 7.5.
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
2V74 Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1), in complex with S-adenosyl-homocysteine 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
链 H 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；1.6M DI-AMMONIUM HYDROGENPHOSPHATE, 100MM HEPES PH 7.5.
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
2V7E Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1), unliganded 提交 2007-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
链 B 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
未记录 HG MERCURY (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.6M DI-AMMONIUM HYDROGENPHOSPHATE, 100MM HEPES PH 7.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
5IH3 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with SAH at 1.8 Angstroms resolution 提交 2016-02-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 B 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 C 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 D 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 19%, NaCl 167 mM
分辨率 1.77 Å R-free 0.191
5IS7 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with decarboxylated SAH 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DSH 5'-S-(3-aminopropyl)-5'-thioadenosine × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 25% NaCl 167 mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.247
5IS8 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0271 提交 2016-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–507（378 aa）
链 B 130–507（378 aa）
链 C 130–507（378 aa）
链 D 130–507（378 aa）
未记录 6D1 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](2-chloroethyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；BTP pH 7.5 100 mM, PEG 3350 15%
分辨率 2.71 Å R-free 0.242
5IS9 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0375 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6D3 (2S)-2-amino-4-[(3-{4-[(2S)-2-amino-2-carboxyethyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}propyl){[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}amino]butanoic acid (non-preferred name) × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 13 % NaCl 100 mM
分辨率 2.40 Å R-free 0.206
5ISA Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0401 提交 2016-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–490（361 aa）
链 B 130–490（361 aa）
链 C 130–490（361 aa）
链 D 130–490（361 aa）
未记录 6D5 (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azidopropyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；MIB pH 7.0 100 mM PEG 1500 17.5 % NaCl 100 mM
分辨率 2.40 Å R-free 0.204
5ISB Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0435 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6CX 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl][(1H-imidazol-4-yl)methyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19% NaCl 133 mM
分辨率 2.00 Å R-free 0.190
5ISC Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0491 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 6D0 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-bromo-2-oxopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19 %
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
5ISD Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0592 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 3 6CZ 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-ethoxy-2,3-dioxopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19 % NaCl 133 mM
分辨率 2.60 Å R-free 0.226
5ISE Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0649 提交 2016-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
未记录 6D2 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-carbamimidamidopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 15 % NaCl 133 mM
分辨率 2.10 Å R-free 0.200
5ISE Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0649 提交 2016-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6D2 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-carbamimidamidopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 15 % NaCl 133 mM
分辨率 2.10 Å R-free 0.200
5ISF Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0705 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6D4 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl][2-(triazan-1-yl)ethyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 10 % NaCl 167 mM
分辨率 2.22 Å R-free 0.201
5ISG Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0707 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 6D6 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-aminopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 4 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 22% NaCl 200 mM
分辨率 2.42 Å R-free 0.207
5ISH Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0765 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 765 5'-{1-[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]aziridin-1-ium-1-yl}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 17 % NaCl 67 mM
分辨率 2.15 Å R-free 0.198
5ISI Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0920 (5'-amino-5'-deoxyadenosine) 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 5N5 5'-amino-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 16% NaCl 67 mM
分辨率 2.74 Å R-free 0.214
5K8V Crystal Structure of Mus musculus Protein Arginine Methyltransferase 4 (CARM1 130-487) with CP1 提交 2016-05-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6RE [[2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethylamino]-azanyl-methylidene]azanium × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 15 %, NaCl 100 mM
分辨率 2.25 Å R-free 0.235
5K8W Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor U2 提交 2016-05-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 GJV 9-(7-{[amino(iminio)methyl]amino}-5,6,7-trideoxy-beta-D-ribo-heptofuranosyl)-9H-purin-6-amine × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 15 %
分辨率 2.10 Å R-free 0.240
5K8X Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor U3 提交 2016-05-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6ZH [[[(~{E})-3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]prop-2-enyl]amino]-azanyl-methylidene]azanium × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 15 %, NaCl 100 mM
分辨率 1.99 Å R-free 0.211
5LGP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P1C3s 提交 2016-07-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 8ZB (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-propyl-oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5 16% PEG 3350 200 mM A.S.
分辨率 2.04 Å R-free 0.219
5LGQ Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P2C3s 提交 2016-07-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 8ZB (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-propyl-oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5 14% PEG 3350 200 mM A.S.
分辨率 2.11 Å R-free 0.236
5LGR Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P1C3u 提交 2016-07-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 LPD L-PROLINAMIDE × 4 ACE ACETYL GROUP × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；Tris-HCl pH 8.5 100 mM PEG 3350 14 % Ammonium Sulfate 200 mM
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
5LGS Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P2C3u 提交 2016-07-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.5 100 mM PEG 3350 20 % A.S. 200 mM
分辨率 2.10 Å R-free 0.215
5LKJ Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand SA684 提交 2016-07-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 6YB (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(2-carbamimidamidoethyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；100 mM BTP pH 7.5 30% PEG 1500
分辨率 2.60 Å R-free 0.220
5LV2 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1246 提交 2016-09-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 LHB 5-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]methyl]-4-azanyl-1-(methoxymethyl)pyrimidin-2-one × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 17 % NaCl 100 mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.238
5LV2 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1246 提交 2016-09-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 130–487（358 aa）
链 F 130–487（358 aa）
链 G 130–487（358 aa）
链 H 130–487（358 aa）
未记录 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 LHB 5-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]methyl]-4-azanyl-1-(methoxymethyl)pyrimidin-2-one × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 17 % NaCl 100 mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.238
5LV3 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand LH1561Br 提交 2016-09-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 LHF 5-[[2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethylamino]methyl]-4-azanyl-1-[2-(4-bromanylphenoxy)ethyl]pyrimidin-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 15% NaCl 100 mM
分辨率 1.80 Å R-free 0.203
5NTC Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0678 提交 2017-04-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 6L7 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(2-azaniumylethyl)-[(3~{S})-3-azaniumyl-4-oxidanyl-4-oxidanylidene-butyl]azanium × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；BTP pH 7.5 100 mM, PEG 2000 MME 25 %, NaCl 50 mM
分辨率 2.25 Å R-free 0.216
5TBH Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1236 提交 2016-09-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 78K (2~{R})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[[4-azanyl-1-(methoxymethyl)-2-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl]methyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19% NaCl 100 mM
分辨率 2.34 Å R-free 0.230
5TBI Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1427 提交 2016-09-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 B 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 C 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 D 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 78V 4-[2-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]ethylamino]-1-(methoxymethyl)pyrimidin-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 21% NaCl 100 mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.228
5TBJ Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1452 提交 2016-09-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 LHD 2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethyl-[[4-azanyl-1-(methoxymethyl)-2-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl]methyl]azanium × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19% NaCl 100 mM
分辨率 2.32 Å R-free 0.237
7OKP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-22 K18 acetylated 提交 2021-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
未记录 MLI MALONATE ION × 2 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M sodium malonate, 0.1M MES pH7.0, 0.2M sodium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
7OKP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-22 K18 acetylated 提交 2021-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 MLI MALONATE ION × 8 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M sodium malonate, 0.1M MES pH7.0, 0.2M sodium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
7OS4 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-31 K18 提交 2021-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
未记录 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.2M Sodium malonate 0.1M MES pH 5.5 0.2M NaCl
分辨率 2.54 Å R-free 0.255
7OS4 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-31 K18 提交 2021-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.2M Sodium malonate 0.1M MES pH 5.5 0.2M NaCl
分辨率 2.54 Å R-free 0.255
7PPQ CARM1 in complex with EML736 提交 2021-09-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 LSK methyl 6-[5-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]pentylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；15% PEG 2000, 0.1M sodium chloride, 0.1M tris-HCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
7PPY CARM1 in complex with EML709 提交 2021-09-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 7ZH methyl 6-[4-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；12% PEG 2000, 100mM NaCl, 100mM TrisHCl pH8
分辨率 2.42 Å R-free 0.235
7PU8 CARM1 in complex with EML980 提交 2021-09-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 4R7 methyl 6-[4-[[N-[2-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；15% PEG 2000, 0.1M Sodium Chloride, 0.1M Tris HCl
分辨率 2.19 Å R-free 0.229
7PUC CARM1 in complex with EML981 提交 2021-09-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 85U methyl 6-[4-[[~{N}-[(~{E})-3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]prop-2-enyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；15% PEG 3350, 200mM AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS HCL pH8.5
分辨率 2.19 Å R-free 0.231
7PUQ CARM1 in complex with EML982 提交 2021-09-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–486（357 aa）
链 B 130–486（357 aa）
链 C 130–486（357 aa）
链 D 130–486（357 aa）
未记录 867 methyl 6-[4-[[~{N}-[3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；12% PEG 3350, 0.1 M NaCl, 0.1 M TrisHCl pH8.5
分辨率 2.09 Å R-free 0.217
7PV6 CARM1 in complex with EML734 提交 2021-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
未记录 LRZ methyl 6-[3-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]propylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20 mM Tris pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP
分辨率 2.40 Å R-free 0.237
7PV6 CARM1 in complex with EML734 提交 2021-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 LRZ methyl 6-[3-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]propylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20 mM Tris pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP
分辨率 2.40 Å R-free 0.237
7QPH Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_22-31 K27 acetylated 提交 2022-01-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；16% PEG 3350, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M Tris HCl pH8.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.210
7QRD Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_10-25 提交 2022-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 130–507（378 aa）
链 B 130–507（378 aa）
链 C 130–507（378 aa）
链 D 130–507（378 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 MLI MALONATE ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20 mM Tris-HCl pH 7.5 50 mM NaCl 1 mM TCEP
分辨率 2.00 Å R-free 0.254
9I0A CARM1 in complex with arg-aDMA analog 提交 2025-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
未记录 A1IZI (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]-N-methyl-carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG3350, 100 mM tris pH7.5, 0.1M NaCl
分辨率 2.22 Å R-free 0.237
9I0A CARM1 in complex with arg-aDMA analog 提交 2025-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 A1IZI (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]-N-methyl-carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG3350, 100 mM tris pH7.5, 0.1M NaCl
分辨率 2.22 Å R-free 0.237
9I1T CARM1 in complex with arg-MMA analog 提交 2025-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
未记录 A1IZ2 (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；9% PEG3350, 100mM Tris HCl pH7.5, 0.2M ammonium sulfate
分辨率 2.39 Å R-free 0.238
9I1T CARM1 in complex with arg-MMA analog 提交 2025-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 A1IZ2 (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；9% PEG3350, 100mM Tris HCl pH7.5, 0.2M ammonium sulfate
分辨率 2.39 Å R-free 0.238
9I9U CARM1 in complex with arg-sDMA analog 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
未记录 A1I1H (phenylmethyl) (2S)-5-[(Z)-[[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propylamino]-(methylamino)methylidene]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12% PEG6000, 100 mM hepes pH7
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
9I9U CARM1 in complex with arg-sDMA analog 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 A1I1H (phenylmethyl) (2S)-5-[(Z)-[[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propylamino]-(methylamino)methylidene]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12% PEG6000, 100 mM hepes pH7
分辨率 2.20 Å R-free 0.245

共 42 个其他 PDB 条目、51 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CARM1_MOUSE
Isoform Q9WVG6-2
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 B； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 C； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 D； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5is6

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5is6
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5is6
沉积日期 deposition_date2016-03-15
结构标题 titleCrystal structure of mouse CARM1 in complex with Sinefungin at 2.0 Angstroms resolution
关键词 keywords;PROTEIN ARGININE METHYLTRANSFERASE, CATALYTIC DOMAIN, CHROMATIN REGULATOR, MRNA PROCESSING, MRNA SPLICING, NUCLEUS, S-ADENOSYL-L-METHIONINE, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION REGULATION, TRANSFERASE ;; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier39.73 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron39.41 Å
零角强度 I(0) i0356255000.00
分子量 molecular_weight159310.0 kDa
排除体积 excluded_volume201090 ų
包络体积 envelope_volume249860 ų
水化壳体积 shell_volume53035 ų
包络直径 envelope_diameter127.6 Å
壳层 Rg shell_rg45.21 Å
包络 Rg envelope_rg38.67 Å
形状 Rg shape_rg39.37 Å
总 Rg total_rg39.85 Å
总原子数 total_atoms22256
残基数 n_residues1371
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax129.1 Å
Rg (实空间) rg_real39.71 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.94 Å
I(0) (实空间) i0_real3.5630e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.8420e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal39.73 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal356300000.0000
解质量估计 total_estimate0.6127
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary45.2 Å
偏度 Skewness skewness0.235
峰度 Kurtosis kurtosis-0.657
角度范围 angular_range— – 0.2000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha42730000.0000
实空间数据点数 n_real_points41
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.930; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.062; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id5is6A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5is6A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
结构域编号 domain_id5is6B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5is6B02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
结构域编号 domain_id5is6C01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5is6C02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
结构域编号 domain_id5is6D01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5is6D02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)