SAXSdb — 5j70

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromo domain-containing protein 1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 单体蛋白 × 1 DNA 2 PDB 声明：trimeric（3）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 1006–1274	未记录	;DNA (5'-D(GPCPTPGPGPAPAPAPTPTPTPCPCPAPGPCPG)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(CPGPCPTPGPGPAPAPAPTPTPTPCPCPAPGPC)-3') ; × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；277 K；14% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.01M CaCl2, 0.05 M Na cacodylate, pH 5.5	分辨率 2.96 Å R-free 0.252
2	蛋白–DNA 单体蛋白 × 1 DNA 2 PDB 声明：trimeric（3）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 1006–1274	未记录	;DNA (5'-D(GPCPTPGPGPAPAPAPTPTPTPCPCPAPGPCPG)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(CPGPCPTPGPGPAPAPAPTPTPTPCPCPAPGPC)-3') ; × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；277 K；14% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.01M CaCl2, 0.05 M Na cacodylate, pH 5.5	分辨率 2.96 Å R-free 0.252

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5J70	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2DY7 Solution structure of the first chromodomain of yeast Chd1 提交 2006-09-07	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 172–252（81 aa）片段：chromodomain 1	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain; 20mM potassium phosphate buffer; 30mM d-DTT; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain; 20mM potassium phosphate buffer; 30mM d-DTT; 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-15N; 20mM potassium phosphate buffer; 30mM d-DTT; 90% H2O, 10% D2O \| 290% H2O, 10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-13C,15N; 20mM potassium phosphate buffer; 30mM d-DTT; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-13C,15N; 20mM potassium phosphate buffer; 30mM d-DTT; 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2DY8 Solution structure of the second chromodomain of yeast Chd1 提交 2006-09-07	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 279–347（69 aa）片段：chromodomain 2	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）300mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain; 20mM potassium phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain; 20mM potassium phosphate buffer; 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-15N; 20mM potassium phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-13C,15N; 20mM potassium phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-13C,15N; 20mM potassium phosphate buffer; 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2H1E Tandem chromodomains of budding yeast CHD1 提交 2006-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 174–339（166 aa）片段：chromodomain, residues 174-339 链 B 174–339（166 aa）片段：chromodomain, residues 174-339	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；283 K；10mM BTP, 12mM NaCl, 5mM TCEP, 0.9M ammonium sulfate, 3.75% isopropanol, 4.5mg/ml yeast CHD1 tandem chromodomains, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K, pH 8.00	分辨率 2.20 Å R-free 0.246
2H1E Tandem chromodomains of budding yeast CHD1 提交 2006-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 174–339（166 aa）片段：chromodomain, residues 174-339 链 B 174–339（166 aa）片段：chromodomain, residues 174-339	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；283 K；10mM BTP, 12mM NaCl, 5mM TCEP, 0.9M ammonium sulfate, 3.75% isopropanol, 4.5mg/ml yeast CHD1 tandem chromodomains, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K, pH 8.00	分辨率 2.20 Å R-free 0.246
2XB0 DNA-binding domain from Saccharomyces cerevisiae chromatin- remodelling protein Chd1 提交 2010-04-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 1009–1274（266 aa）片段：DNA BINDING DOMAIN, RESIDUES 1009-1274	未记录	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1 M TRIS, PH 8.5, 28% PEG 4K, 0.35 M MGCL2	分辨率 2.00 Å R-free 0.248
3MWY Crystal structure of the chromodomain-ATPase portion of the yeast Chd1 chromatin remodeler 提交 2010-05-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 W 142–939（798 aa）片段：double chromodomains and ATPase motor (UNP residues 142-939)	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；18% PEG 3350; 400 mM K+/Na+ tartrate; 5% xylitol; 10 mM MgCl2; 1 mM ATPgammaS, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.70 Å R-free 0.318
3MWY Crystal structure of the chromodomain-ATPase portion of the yeast Chd1 chromatin remodeler 提交 2010-05-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 W 142–939（798 aa）片段：double chromodomains and ATPase motor (UNP residues 142-939)	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；18% PEG 3350; 400 mM K+/Na+ tartrate; 5% xylitol; 10 mM MgCl2; 1 mM ATPgammaS, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.70 Å R-free 0.318
3TED Crystal structure of the Chd1 DNA-binding domain in complex with a DNA duplex 提交 2011-08-12	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1006–1274（269 aa）片段：SANT/SLIDE DNA-binding domain, UNP residues 1006-1274	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；14-18% PEG 400 0.1 M BisTris, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.249
5O9G Structure of nucleosome-Chd1 complex 提交 2017-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
6G0L Structure of two molecules of the chromatin remodelling enzyme Chd1 bound to a nucleosome 提交 2018-03-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 M 1–1468（1468 aa）链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
7NKX RNA polymerase II-Spt4/5-nucleosome-Chd1 structure 提交 2021-02-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7TN2 Composite model of a Chd1-nucleosome complex in the nucleotide-free state derived from 2.3A and 2.7A Cryo-EM maps 提交 2022-01-20	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 W 118–1274（1157 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；20 mM HEPES, pH 7.0, 60 mM KCl, 1.5 mM DTT, 1 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9GD1 Structure of Chd1 bound to a hexasome-nucleosome complex with a dyad-to-dyad distance of 103 bp. 提交 2024-08-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9GD2 Structure of Chd1 bound to a dinucleosome with a dyad-to-dyad distance of 103 bp. 提交 2024-08-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 S 1–1468（1468 aa）链 T 1–1468（1468 aa）链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9GD3 Structure of a mononucleosome bound by one copy of Chd1 with the DBD on the exit-side DNA. 提交 2024-08-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 T 1–1468（1468 aa）链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9N6H 2.54 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 1:1 complex 提交 2025-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 122–956（835 aa）片段：residues 122-956	突变：L886G, L889G, L891G	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å
9N6I 2.61 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex 提交 2025-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 122–956（835 aa）链 L 122–956（835 aa）	突变：L886G, L889G, L891G 突变：L886G, L889G, L891G	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.61 Å
9N6K 2.88 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex with DNA-binding domain 提交 2025-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 122–1265（1144 aa）链 L 122–1265（1144 aa）	突变：L886G, L889G, L891G 突变：L886G, L889G, L891G	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9R5S Structural characterisation of chromatin remodelling intermediates supports linker DNA dependent product inhibition as a mechanism for nucleosome spacing. 提交 2025-05-09	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 W 2–1468（1467 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Hepes, 120mM Nacl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Vitrified carried out in climate chamber with 100% humidity	分辨率 3.80 Å

共 17 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CHD1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–271； UniProt 1006–1274 作者链 B； PDB构建体 3–271； UniProt 1006–1274

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5j70
沉积日期 deposition_date	2016-04-05
结构标题 title	The Chd1 DNA-binding domain in complex with 17mer DNA duplex
关键词 keywords	DNA-bound complex, SANT domain, SLIDE domain, chromatin-binding protein-DNA complex; chromatin-binding protein/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	35.27 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.33 Å
零角强度 I(0) i0	113438000.00
分子量 molecular_weight	72845.0 kDa
排除体积 excluded_volume	86128 Å³
包络体积 envelope_volume	133390 Å³
水化壳体积 shell_volume	34096 Å³
包络直径 envelope_diameter	126.5 Å
壳层 Rg shell_rg	38.68 Å
包络 Rg envelope_rg	34.23 Å
形状 Rg shape_rg	34.24 Å
总 Rg total_rg	34.88 Å
总原子数 total_atoms	9555
残基数 n_residues	525
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	118.2 Å
Rg (实空间) rg_real	35.45 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.18 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.1340e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.9780e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	35.34 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	113400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8616
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	34.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.415
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.425
角度范围 angular_range	— – 0.2250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7287000.0000
实空间数据点数 n_real_points	46
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.850; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.908; Smooth: 0.739

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chromo domain-containing protein 1
分子量 formula_weight	30505.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	9555

GPDMDSIGESEVRALYKAILKFGNLKEILDELIADGTLPVKSFEKYGETYDEMMEAAKDCVHEEEKNRKEILEKLEKHATAYRAKLKSGEIKAENQPKDNPLTRLSLKKREKKAVLFNFKGVKSLNAESLLSRVEDLKYLKNLINSNYKDDPLKFSLGNNTPKPVQNWSSNWTKEEDEKLLIGVFKYGYGSWTQIRDDPFLGITDKIFLNEVHNPVAKKSASSSDTTPTPSKKGKGITGSSKKVPGAIHLGRRVDYLLSFLRGGLNTKSPS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(GPCPTPGPGPAPAPAPTPTPTPCPCPAPGPCP*G)-3') ;
分子量 formula_weight	5227.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	W,Y

GCTGGAAATTTCCAGCG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(CPGPCPTPGPGPAPAPAPTPTPTPCPCPAPGP*C)-3') ;
分子量 formula_weight	5187.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	X,Z

CGCTGGAAATTTCCAGC

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	5j70A01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1440 —

结构域编号 domain_id	5j70A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	5j70B01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1440 —

结构域编号 domain_id	5j70B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	86.076 Å
晶胞边长 b length_b	57.099 Å
晶胞边长 c length_c	99.493 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	103.90 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.956 Å
最低分辨率 resolution_low	46.985 Å
R 因子 r_factor	0.2318
R_work r_work	0.2307
R_free r_free	0.2518

fit	/app/data/saxs_computation/j7/5j70/5j70.fit
pddf	/app/data/pr_computation/j7/5j70/5j70.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/j7/5j70/5j70.dat

The Chd1 DNA-binding domain in complex with 17mer DNA duplex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromo domain-containing protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)