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5jrb

Rad52(1-212) K102A/K133A/E202A mutant

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA repair protein RAD52 homolog

Homo sapiens

UniProt P43351

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 11 water × 11 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
1h2i 1h2i 1kn0 5jrb 8bjm 8h1p 8ril 8rj3 8tkq

共 9 个 assembly

异源或核酸复合物
5xrz 5xs0 5xs0 8rjw

共 4 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RAD52_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212 作者链 B； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212 作者链 C； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212 作者链 D； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212 作者链 E； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212 作者链 F； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212 作者链 G； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212 作者链 H； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212 作者链 I； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212 作者链 J； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212 作者链 K； PDB构建体 4–215； UniProt 1–212

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5jrb
沉积日期 deposition_date2016-05-06
结构标题 titleRad52(1-212) K102A/K133A/E202A mutant
关键词 keywordsDNA annealing protein, ssDNA binding, multimeric ring formation, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5jrb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5jrb__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5jrb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）40.68 Å
Rg（电子密度）40.13 Å
总 Rg40.79 Å
原子数15852
残基数2028
排除体积279830 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5jrb__assembly_1__model_1 undecameric （11） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 22 domains

SCOP 2.08 (11 domains)

结构域编号 domain_idd5jrba_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase
结构域编号 domain_idd5jrbb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase
结构域编号 domain_idd5jrbc_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase
结构域编号 domain_idd5jrbd_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase
结构域编号 domain_idd5jrbe_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase
结构域编号 domain_idd5jrbf_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase
结构域编号 domain_idd5jrbg_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase
结构域编号 domain_idd5jrbh_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase
结构域编号 domain_idd5jrbi_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase
结构域编号 domain_idd5jrbj_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase
结构域编号 domain_idd5jrbk_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamilyd.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family familyd.50.1.3 — The homologous-pairing domain of Rad52 recombinase

CATH v4.4 (11 domains)

结构域编号 domain_id5jrbA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
结构域编号 domain_id5jrbB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
结构域编号 domain_id5jrbC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
结构域编号 domain_id5jrbD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
结构域编号 domain_id5jrbE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
结构域编号 domain_id5jrbF01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
结构域编号 domain_id5jrbG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
结构域编号 domain_id5jrbH01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
结构域编号 domain_id5jrbI01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
结构域编号 domain_id5jrbJ01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
结构域编号 domain_id5jrbK01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — DNA repair protein Rad52/59/22
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7. 引用文献 (1)