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5jrh

Crystal structure of Salmonella enterica acetyl-CoA synthetase (Acs) in complex with cAMP and Coenzyme A

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acetyl-coenzyme A synthetase

Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)

UniProt Q8ZKF6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 COENZYME A × 1 ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 2 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 COENZYME A × 1 ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 2 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1pg3 1pg3 1pg4 1pg4 2p20 2p20 2p2b 2p2b 2p2f 2p2f 2p2j 2p2j

共 18 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACSA_SALTY
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–652； UniProt 1–652 作者链 B； PDB构建体 1–652； UniProt 1–652

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5jrh
沉积日期 deposition_date2016-05-06
结构标题 titleCrystal structure of Salmonella enterica acetyl-CoA synthetase (Acs) in complex with cAMP and Coenzyme A
关键词 keywordsacetyl-Coenzyme A synthetase, cAMP, AMP-forming, acetyl-Coenzyme A, LIGASE; LIGASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5jrh__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5jrh__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5jrh__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）25.50 Å
Rg（电子密度）24.26 Å
总 Rg25.14 Å
原子数5060
残基数639
排除体积89491 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5jrh__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5jrh__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd5jrha_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.23 — Acetyl-CoA synthetase-like
超家族 Superfamily superfamilye.23.1 — Acetyl-CoA synthetase-like
家族 Family familye.23.1.1 — Acetyl-CoA synthetase-like
结构域编号 domain_idd5jrhb_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.23 — Acetyl-CoA synthetase-like
超家族 Superfamily superfamilye.23.1 — Acetyl-CoA synthetase-like
家族 Family familye.23.1.1 — Acetyl-CoA synthetase-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id5jrhA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12780 — ANL, N-terminal domain
结构域编号 domain_id5jrhA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — ANL, C-terminal domain
结构域编号 domain_id5jrhB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12780 — ANL, N-terminal domain
结构域编号 domain_id5jrhB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — ANL, C-terminal domain
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7. 引用文献 (1)