Escherichia coli O157:H7
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 8 | Maltose-binding periplasmic protein × 4 （P0AEY0） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SECB_ECO57 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 B； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 C； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 D； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 |
Escherichia coli O157:H7
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 8 | Protein-export protein SecB × 4 （P0AG88） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | MALE_ECO57 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 E； PDB构建体 1–40； UniProt 168–207 作者链 F； PDB构建体 1–40； UniProt 168–207 作者链 G； PDB构建体 1–40； UniProt 168–207 作者链 H； PDB构建体 1–40； UniProt 168–207 |
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| 条目编号 entry_id | 5jtr |
| 沉积日期 deposition_date | 2016-05-09 |
| 结构标题 title | The structure of chaperone SecB in complex with unstructured MBP binding site e |
| 关键词 keywords | Molecular Chaperone, CHAPERONE-PROTEIN BINDING complex; CHAPERONE/PROTEIN BINDING |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 3 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 29.87 Å |
| Rg（电子密度） | 28.46 Å |
| 总 Rg | 29.29 Å |
| 原子数 | 12032 |
| 残基数 | 780 |
| 排除体积 | 108960 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 5jtr__assembly_1__model_1 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 5jtr__assembly_1__model_2 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 5jtr__assembly_1__model_3 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 5jtr__assembly_1__model_4 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 5jtr__assembly_1__model_5 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 5jtr__assembly_1__model_6 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 5jtr__assembly_1__model_7 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 5jtr__assembly_1__model_8 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 5jtr__assembly_1__model_9 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 5jtr__assembly_1__model_10 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 5jtr__assembly_1__model_11 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 5jtr__assembly_1__model_12 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 5jtr__assembly_1__model_13 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 5jtr__assembly_1__model_14 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 15 | 5jtr__assembly_1__model_15 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 16 | 5jtr__assembly_1__model_16 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 17 | 5jtr__assembly_1__model_17 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 18 | 5jtr__assembly_1__model_18 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 19 | 5jtr__assembly_1__model_19 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 20 | 5jtr__assembly_1__model_20 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d5jtra_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.33 — SecB-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.33.1 — SecB-like |
| 家族 Family family | d.33.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5jtrb_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.33 — SecB-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.33.1 — SecB-like |
| 家族 Family family | d.33.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5jtrc_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.33 — SecB-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.33.1 — SecB-like |
| 家族 Family family | d.33.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5jtrd_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.33 — SecB-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.33.1 — SecB-like |
| 家族 Family family | d.33.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 5jtrA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Bacterial Protein-export protein SecB |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — SecB-like |
| 结构域编号 domain_id | 5jtrB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Bacterial Protein-export protein SecB |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — SecB-like |
| 结构域编号 domain_id | 5jtrC00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Bacterial Protein-export protein SecB |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — SecB-like |
| 结构域编号 domain_id | 5jtrD00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Bacterial Protein-export protein SecB |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — SecB-like |