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5k8w

Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor U2

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 128.9 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone-arginine methyltransferase CARM1

Mus musculus

UniProt Q9WVG6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 130–487 链 B； UniProt 130–487 链 C； UniProt 130–487 链 D； UniProt 130–487 未记录 GJV 9-(7-{[amino(iminio)methyl]amino}-5,6,7-trideoxy-beta-D-ribo-heptofuranosyl)-9H-purin-6-amine × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 15 % 分辨率 2.10 Å R-free 0.240

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5K8W Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2V74 Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1), in complex with S-adenosyl-homocysteine 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
链 D 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；1.6M DI-AMMONIUM HYDROGENPHOSPHATE, 100MM HEPES PH 7.5.
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
2V74 Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1), in complex with S-adenosyl-homocysteine 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
链 H 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；1.6M DI-AMMONIUM HYDROGENPHOSPHATE, 100MM HEPES PH 7.5.
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
2V7E Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1), unliganded 提交 2007-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
链 B 147–490（344 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490
未记录 HG MERCURY (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.6M DI-AMMONIUM HYDROGENPHOSPHATE, 100MM HEPES PH 7.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
5IH3 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with SAH at 1.8 Angstroms resolution 提交 2016-02-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 B 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 C 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 D 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 19%, NaCl 167 mM
分辨率 1.77 Å R-free 0.191
5IS6 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with Sinefungin at 2.0 Angstroms resolution 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 SFG SINEFUNGIN × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 28 % NaCl 100 mM
分辨率 2.01 Å R-free 0.177
5IS7 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with decarboxylated SAH 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DSH 5'-S-(3-aminopropyl)-5'-thioadenosine × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 25% NaCl 167 mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.247
5IS8 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0271 提交 2016-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–507（378 aa）
链 B 130–507（378 aa）
链 C 130–507（378 aa）
链 D 130–507（378 aa）
未记录 6D1 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](2-chloroethyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；BTP pH 7.5 100 mM, PEG 3350 15%
分辨率 2.71 Å R-free 0.242
5IS9 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0375 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6D3 (2S)-2-amino-4-[(3-{4-[(2S)-2-amino-2-carboxyethyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}propyl){[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}amino]butanoic acid (non-preferred name) × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 13 % NaCl 100 mM
分辨率 2.40 Å R-free 0.206
5ISA Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0401 提交 2016-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–490（361 aa）
链 B 130–490（361 aa）
链 C 130–490（361 aa）
链 D 130–490（361 aa）
未记录 6D5 (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azidopropyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；MIB pH 7.0 100 mM PEG 1500 17.5 % NaCl 100 mM
分辨率 2.40 Å R-free 0.204
5ISB Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0435 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6CX 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl][(1H-imidazol-4-yl)methyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19% NaCl 133 mM
分辨率 2.00 Å R-free 0.190
5ISC Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0491 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 6D0 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-bromo-2-oxopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19 %
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
5ISD Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0592 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 3 6CZ 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-ethoxy-2,3-dioxopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19 % NaCl 133 mM
分辨率 2.60 Å R-free 0.226
5ISE Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0649 提交 2016-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
未记录 6D2 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-carbamimidamidopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 15 % NaCl 133 mM
分辨率 2.10 Å R-free 0.200
5ISE Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0649 提交 2016-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6D2 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-carbamimidamidopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 15 % NaCl 133 mM
分辨率 2.10 Å R-free 0.200
5ISF Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0705 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6D4 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl][2-(triazan-1-yl)ethyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 10 % NaCl 167 mM
分辨率 2.22 Å R-free 0.201
5ISG Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0707 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 6D6 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-aminopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 4 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 22% NaCl 200 mM
分辨率 2.42 Å R-free 0.207
5ISH Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0765 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 765 5'-{1-[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]aziridin-1-ium-1-yl}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 17 % NaCl 67 mM
分辨率 2.15 Å R-free 0.198
5ISI Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0920 (5'-amino-5'-deoxyadenosine) 提交 2016-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 5N5 5'-amino-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 16% NaCl 67 mM
分辨率 2.74 Å R-free 0.214
5K8V Crystal Structure of Mus musculus Protein Arginine Methyltransferase 4 (CARM1 130-487) with CP1 提交 2016-05-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6RE [[2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethylamino]-azanyl-methylidene]azanium × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 15 %, NaCl 100 mM
分辨率 2.25 Å R-free 0.235
5K8X Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor U3 提交 2016-05-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 6ZH [[[(~{E})-3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]prop-2-enyl]amino]-azanyl-methylidene]azanium × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 15 %, NaCl 100 mM
分辨率 1.99 Å R-free 0.211
5LGP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P1C3s 提交 2016-07-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 8ZB (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-propyl-oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5 16% PEG 3350 200 mM A.S.
分辨率 2.04 Å R-free 0.219
5LGQ Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P2C3s 提交 2016-07-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 8ZB (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-propyl-oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5 14% PEG 3350 200 mM A.S.
分辨率 2.11 Å R-free 0.236
5LGR Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P1C3u 提交 2016-07-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 LPD L-PROLINAMIDE × 4 ACE ACETYL GROUP × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；Tris-HCl pH 8.5 100 mM PEG 3350 14 % Ammonium Sulfate 200 mM
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
5LGS Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P2C3u 提交 2016-07-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.5 100 mM PEG 3350 20 % A.S. 200 mM
分辨率 2.10 Å R-free 0.215
5LKJ Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand SA684 提交 2016-07-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 6YB (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(2-carbamimidamidoethyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；100 mM BTP pH 7.5 30% PEG 1500
分辨率 2.60 Å R-free 0.220
5LV2 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1246 提交 2016-09-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 LHB 5-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]methyl]-4-azanyl-1-(methoxymethyl)pyrimidin-2-one × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 17 % NaCl 100 mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.238
5LV2 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1246 提交 2016-09-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 130–487（358 aa）
链 F 130–487（358 aa）
链 G 130–487（358 aa）
链 H 130–487（358 aa）
未记录 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 LHB 5-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]methyl]-4-azanyl-1-(methoxymethyl)pyrimidin-2-one × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 17 % NaCl 100 mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.238
5LV3 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand LH1561Br 提交 2016-09-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 LHF 5-[[2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethylamino]methyl]-4-azanyl-1-[2-(4-bromanylphenoxy)ethyl]pyrimidin-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 15% NaCl 100 mM
分辨率 1.80 Å R-free 0.203
5NTC Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0678 提交 2017-04-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 6L7 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(2-azaniumylethyl)-[(3~{S})-3-azaniumyl-4-oxidanyl-4-oxidanylidene-butyl]azanium × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；BTP pH 7.5 100 mM, PEG 2000 MME 25 %, NaCl 50 mM
分辨率 2.25 Å R-free 0.216
5TBH Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1236 提交 2016-09-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 78K (2~{R})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[[4-azanyl-1-(methoxymethyl)-2-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl]methyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19% NaCl 100 mM
分辨率 2.34 Å R-free 0.230
5TBI Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1427 提交 2016-09-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 B 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 C 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
链 D 130–487（358 aa） 片段：UNP residues 130-487
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 78V 4-[2-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]ethylamino]-1-(methoxymethyl)pyrimidin-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 21% NaCl 100 mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.228
5TBJ Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1452 提交 2016-09-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 LHD 2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethyl-[[4-azanyl-1-(methoxymethyl)-2-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl]methyl]azanium × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19% NaCl 100 mM
分辨率 2.32 Å R-free 0.237
7OKP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-22 K18 acetylated 提交 2021-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
未记录 MLI MALONATE ION × 2 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M sodium malonate, 0.1M MES pH7.0, 0.2M sodium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
7OKP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-22 K18 acetylated 提交 2021-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 MLI MALONATE ION × 8 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M sodium malonate, 0.1M MES pH7.0, 0.2M sodium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
7OS4 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-31 K18 提交 2021-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
未记录 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.2M Sodium malonate 0.1M MES pH 5.5 0.2M NaCl
分辨率 2.54 Å R-free 0.255
7OS4 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-31 K18 提交 2021-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.2M Sodium malonate 0.1M MES pH 5.5 0.2M NaCl
分辨率 2.54 Å R-free 0.255
7PPQ CARM1 in complex with EML736 提交 2021-09-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 LSK methyl 6-[5-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]pentylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；15% PEG 2000, 0.1M sodium chloride, 0.1M tris-HCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
7PPY CARM1 in complex with EML709 提交 2021-09-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 7ZH methyl 6-[4-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；12% PEG 2000, 100mM NaCl, 100mM TrisHCl pH8
分辨率 2.42 Å R-free 0.235
7PU8 CARM1 in complex with EML980 提交 2021-09-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 4R7 methyl 6-[4-[[N-[2-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；15% PEG 2000, 0.1M Sodium Chloride, 0.1M Tris HCl
分辨率 2.19 Å R-free 0.229
7PUC CARM1 in complex with EML981 提交 2021-09-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 85U methyl 6-[4-[[~{N}-[(~{E})-3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]prop-2-enyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；15% PEG 3350, 200mM AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS HCL pH8.5
分辨率 2.19 Å R-free 0.231
7PUQ CARM1 in complex with EML982 提交 2021-09-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–486（357 aa）
链 B 130–486（357 aa）
链 C 130–486（357 aa）
链 D 130–486（357 aa）
未记录 867 methyl 6-[4-[[~{N}-[3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；12% PEG 3350, 0.1 M NaCl, 0.1 M TrisHCl pH8.5
分辨率 2.09 Å R-free 0.217
7PV6 CARM1 in complex with EML734 提交 2021-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
未记录 LRZ methyl 6-[3-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]propylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20 mM Tris pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP
分辨率 2.40 Å R-free 0.237
7PV6 CARM1 in complex with EML734 提交 2021-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 LRZ methyl 6-[3-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]propylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20 mM Tris pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP
分辨率 2.40 Å R-free 0.237
7QPH Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_22-31 K27 acetylated 提交 2022-01-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；16% PEG 3350, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M Tris HCl pH8.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.210
7QRD Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_10-25 提交 2022-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 130–507（378 aa）
链 B 130–507（378 aa）
链 C 130–507（378 aa）
链 D 130–507（378 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 MLI MALONATE ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20 mM Tris-HCl pH 7.5 50 mM NaCl 1 mM TCEP
分辨率 2.00 Å R-free 0.254
9I0A CARM1 in complex with arg-aDMA analog 提交 2025-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
未记录 A1IZI (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]-N-methyl-carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG3350, 100 mM tris pH7.5, 0.1M NaCl
分辨率 2.22 Å R-free 0.237
9I0A CARM1 in complex with arg-aDMA analog 提交 2025-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 A1IZI (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]-N-methyl-carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG3350, 100 mM tris pH7.5, 0.1M NaCl
分辨率 2.22 Å R-free 0.237
9I1T CARM1 in complex with arg-MMA analog 提交 2025-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 130–487（358 aa）
链 B 130–487（358 aa）
未记录 A1IZ2 (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；9% PEG3350, 100mM Tris HCl pH7.5, 0.2M ammonium sulfate
分辨率 2.39 Å R-free 0.238
9I1T CARM1 in complex with arg-MMA analog 提交 2025-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 130–487（358 aa）
链 D 130–487（358 aa）
未记录 A1IZ2 (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；9% PEG3350, 100mM Tris HCl pH7.5, 0.2M ammonium sulfate
分辨率 2.39 Å R-free 0.238
9I9U CARM1 in complex with arg-sDMA analog 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 130–497（368 aa）
链 B 130–497（368 aa）
未记录 A1I1H (phenylmethyl) (2S)-5-[(Z)-[[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propylamino]-(methylamino)methylidene]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12% PEG6000, 100 mM hepes pH7
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
9I9U CARM1 in complex with arg-sDMA analog 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 130–497（368 aa）
链 D 130–497（368 aa）
未记录 A1I1H (phenylmethyl) (2S)-5-[(Z)-[[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propylamino]-(methylamino)methylidene]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12% PEG6000, 100 mM hepes pH7
分辨率 2.20 Å R-free 0.245

共 42 个其他 PDB 条目、51 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CARM1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 B； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 C； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 D； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5k8w

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5k8w
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5k8w
沉积日期 deposition_date2016-05-31
结构标题 titleCrystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor U2
关键词 keywords;PROTEIN ARGININE METHYLTRANSFERASE, CATALYTIC DOMAIN, CHROMATIN REGULATOR, MRNA PROCESSING, MRNA SPLICING, NUCLEUS, S-ADENOSYL-L-METHIONINE, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION REGULATION, TRANSFERASE ;; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier39.95 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron39.63 Å
零角强度 I(0) i0355417000.00
分子量 molecular_weight158960.0 kDa
排除体积 excluded_volume200590 ų
包络体积 envelope_volume252670 ų
水化壳体积 shell_volume53286 ų
包络直径 envelope_diameter130.0 Å
壳层 Rg shell_rg45.43 Å
包络 Rg envelope_rg38.86 Å
形状 Rg shape_rg39.59 Å
总 Rg total_rg40.08 Å
总原子数 total_atoms22265
残基数 n_residues1373
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax128.9 Å
Rg (实空间) rg_real39.93 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.93 Å
I(0) (实空间) i0_real3.5540e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.8780e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal39.95 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal355400000.0000
解质量估计 total_estimate0.8311
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary45.1 Å
偏度 Skewness skewness0.236
峰度 Kurtosis kurtosis-0.656
角度范围 angular_range— – 0.2000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha46720000.0000
实空间数据点数 n_real_points41
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.938; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.985; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id5k8wA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5k8wA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
结构域编号 domain_id5k8wB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5k8wB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
结构域编号 domain_id5k8wC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5k8wC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
结构域编号 domain_id5k8wD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5k8wD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)