Saccharomyces cerevisiae S288C
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Osmolarity two-component system protein SSK1 × 1 （Q07084） GLYCEROL × 3 PHOSPHATE ION × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | YPD1_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–167； UniProt 1–167 |
Saccharomyces cerevisiae S288C
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Phosphorelay intermediate protein YPD1 × 1 （Q07688） GLYCEROL × 3 PHOSPHATE ION × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SSK1_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–218； UniProt 495–712 |
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| 条目编号 entry_id | 5kbx |
| 沉积日期 deposition_date | 2016-06-03 |
| 结构标题 title | Co-crystal structure of the Saccharomyces cerevisiae histidine phosphotransfer signaling protein Ypd1 and the receiver domain of its downstream response regulator Ssk1 |
| 关键词 keywords | ;two-component signaling, phosphorelay, Ypd1, Ssk1, response regulator, histidine phosphotransfer protein, Saccharomyces cerevisiae, co-crystal, phosphotransfer, SIGNALING PROTEIN ;; SIGNALING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 22.10 Å |
| Rg（电子密度） | 21.27 Å |
| 总 Rg | 22.19 Å |
| 原子数 | 2396 |
| 残基数 | 294 |
| 排除体积 | 43104 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5kbxa_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.24 — Four-helical up-and-down bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.24.10 — Histidine-containing phosphotransfer domain, HPT domain |
| 家族 Family family | a.24.10.2 — Phosphorelay protein-like |
| 结构域编号 domain_id | d5kbxb_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.23 — Flavodoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.23.1 — CheY-like |
| 家族 Family family | c.23.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 5kbxA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 160 — HPT domain |