26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 | 链 W； UniProt 1–377 | 未记录 | 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 × 1 （O00487） 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8 × 1 （P48556） 26S proteasome complex subunit DSS1 × 1 （P60896） 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 × 1 （Q13200） 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 × 1 （Q99460） 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 × 1 （O43242） 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 × 1 （O00232） 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 × 1 （O00231） 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 × 1 （Q15008） 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 × 1 （P51665） 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 × 1 （Q9UNM6） | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE | 分辨率 3.90 Å R-free 0.404 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 5L4K | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1P9C NMR solution structure of the C-terminal ubiquitin-interacting motif of the proteasome subunit S5a 提交 2003-05-10 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
263–307（45 aa）
片段：C-terminal ubiquitin-interacting motif
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）150mM；压力 ambient
NMR样品组成
2mM S5a peptide, unlabeled | 50mM sodium phosphate; 100mM sodium chloride; 5% D2O
NMR样品组成
2mM S5a peptide U-15N,13C | 50mM sodium phosphate; 100mM sodium chloride; 5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1P9D High-resolution structure of the complex of HHR23A ubiquitin-like domain and the C-terminal ubiquitin-interacting motif of proteasome subunit S5a 提交 2003-05-10 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 S
263–307（45 aa）
片段：C-terminal ubiquitin-interacting motif, PUBS2
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）150mM；压力 ambient
NMR样品组成
2mM S5a peptide unlabeled, 2mM ubiquitin-like domain of HHR23A U-15N,13C | 50mM sodium phosphate, 100mM sodium chloride, 5% D2O
NMR样品组成
2mM S5a peptide U-15N,13C, 2mM ubiquitin-like domain of HHR23A unlabeled | 50mM sodium phosphate, 100mM sodium chloride, 5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1UEL Solution structure of ubiquitin-like domain of hHR23B complexed with ubiquitin-interacting motif of proteasome subunit S5a 提交 2003-05-19 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
263–307（45 aa）
片段：ubiquitin-interacting motif (RESIDUES 201-248)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR样品组成
U-15N, U-13C | 20mM potassium phosphate buffer (pH 6.8), 5mM KCl, 90% H2O, 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1YX4 Structure of S5a bound to monoubiquitin provides a model for polyubiquitin recognition 提交 2005-02-19 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
192–306（115 aa）
片段：(poly)ubiquitin binding region
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 1
NMR测量条件
pH 6.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
0.35 mM S5a U-15N, 13C | 20 mM phosphate buffer pH 6.5, 100 mM NaCl, 10% D2O
NMR样品组成
1 mM S5a U-15N | 20 mM phosphate buffer pH 6.5, 100 mM NaCl, 10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM S5a unlabeled | 20 mM phosphate buffer pH 6.5, 100 mM NaCl, 10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM S5a U-N15 and 50% Deuterated | 20 mM phosphate buffer pH 6.5, 100 mM NaCl, 10% D2O
NMR样品组成
1 mM S5a U-C13 | 20 mM phosphate buffer pH 6.5, 100 mM NaCl, 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1YX5 Solution Structure of S5a UIM-1/Ubiquitin Complex 提交 2005-02-19 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
196–306（111 aa）
片段：polyubiquitin binding region of S5a
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
0.5 mM S5a U-15N, 2H
2.0 mM ubiquitin unlabeled | 20 mM Phosphate buffer, 100 mM NaCl, 10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM S5a U-15N, 2H
2.0 mM ubiquitin U-13C | 20 mM Phosphate buffer, 100 mM NaCl, 10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM S5a U-13C
2.0 mM ubiquitin unlabeled | 20 mM Phosphate buffer, 100 mM NaCl, 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1YX6 Solution Structure of S5a UIM-2/Ubiquitin Complex 提交 2005-02-19 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
196–306（111 aa）
片段：polyubiquitin binding region of S5a
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
0.5 mM S5a U-15N, 2H; 2.0 mM ubiquitin unlabeled | 20 mM Phosphate buffer, 100 mM NaCl, 10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM S5a U-15N, 2H; 2.0 mM ubiquitin U-13C | 20 mM Phosphate buffer, 100 mM NaCl, 10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM S5a U-13C; 2.0 mM ubiquitin unlabeled | 20 mM Phosphate buffer, 100 mM NaCl, 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KDE NMR structure of major S5a (196-306):K48 linked diubiquitin species 提交 2009-01-06 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
196–306（111 aa）
片段：UNP residues 196-306, S5a fragment
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM NaPO4; 100 mM NaCl；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM NaPO4; 50 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
0.4 mM [U-100% 15N; U-50% 2H] S5a (196-306)-1, 1.2 mM K48 linked diubiquitin-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C] S5a (196-306)-3, 1.5 mM K48 linked diubiquitin-4, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C of the proximal Ub; natural abundance of the distal subunit] K48 linked diubiquitin-5, 1.0 mM S5a (196-306)-6, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C of the distal subunit; natural abundance of the proximal Ub] K48 linked diubiquitin-7, 1.0 mM S5a (196-306)-8, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.4 mM [U-100% 13C] S5a (196-306)-9, 1.2 mM [U-100% 2H of the proximal Ub; natural abundance of the distal subunit] ] K48 linked diubiquitin-10, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KDF NMR structure of minor S5a (196-306):K48 linked diubiquitin species 提交 2009-01-06 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
196–306（111 aa）
片段：UNP residues 196-306, S5a fragment
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM NaPO4; 100 mM NaCl；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM NaPO4; 50 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
0.4 mM [U-100% 15N; U-50% 2H] S5a (196-306)-1, 1.2 mM K48 linked diubiquitin-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C] S5a (196-306)-3, 1.5 mM K48 linked diubiquitin-4, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C of the proximal Ub; natural abundance of the distal subunit] K48 linked diubiquitin-5, 1.0 mM S5a (196-306)-6, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C of the distal subunit; natural abundance of the proximal Ub] K48 linked diubiquitin-7, 1.0 mM S5a (196-306)-8, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.4 mM [U-100% 13C] S5a (196-306)-9, 1.2 mM [U-100% 2H of the proximal Ub; natural abundance of the distal subunit] K48 linked diubiquitin-10, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5GJQ Structure of the human 26S proteasome bound to USP14-UbAl 提交 2016-07-01 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 W
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 2 seconds before plunging
|
分辨率 4.35 Å |
| 5GJR An atomic structure of the human 26S proteasome 提交 2016-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：64-meric |
链 AA
1–377（377 aa）
链 W
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 2 seconds before plunging
|
分辨率 3.50 Å |
| 5LN3 The human 26S Proteasome at 6.8 Ang. 提交 2016-08-03 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric |
链 W
1–377（377 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 5M32 Human 26S proteasome in complex with Oprozomib 提交 2016-10-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：42-meric |
链 p
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot with sensor
|
分辨率 3.80 Å |
| 5T0C Structural basis for dynamic regulation of the human 26S proteasome 提交 2016-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：64-meric |
链 Ab
1–377（377 aa）
链 Bb
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 5T0G Structural basis for dynamic regulation of the human 26S proteasome 提交 2016-08-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 5T0H Structural basis for dynamic regulation of the human 26S proteasome 提交 2016-08-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 5T0I Structural basis for dynamic regulation of the human 26S proteasome 提交 2016-08-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.00 Å |
| 5T0J Structural basis for dynamic regulation of the human 26S proteasome 提交 2016-08-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.00 Å |
| 5VFP Nucleotide-driven Triple-state Remodeling of the AAA-ATPase Channel in the Activated Human 26S Proteasome 提交 2017-04-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 5VFQ Nucleotide-driven Triple-state Remodeling of the AAA-ATPase Channel in the Activated Human 26S Proteasome 提交 2017-04-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 5VFR Nucleotide-driven Triple-state Remodeling of the AAA-ATPase Channel in the Activated Human 26S Proteasome 提交 2017-04-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 5VFS Nucleotide-Driven Triple-State Remodeling of the AAA-ATPase Channel in the Activated Human 26S Proteasome 提交 2017-04-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 5VFT Nucleotide-driven Triple-state Remodeling of the AAA-ATPase Channel in the Activated Human 26S Proteasome 提交 2017-04-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 5VFU Nucleotide-driven Triple-state Remodeling of the AAA-ATPase Channel in the Activated Human 26S Proteasome 提交 2017-04-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.80 Å |
| 5VGZ Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å R-free 0.447 |
| 5VHF Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.70 Å |
| 5VHH Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 5VHI Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 5VHS Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.80 Å |
| 6MSB Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6MSD Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6MSE Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6MSG Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6MSH Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6MSJ Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6MSK Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6MUN Structure of hRpn10 bound to UBQLN2 UBL 提交 2018-10-23 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
196–306（111 aa）
片段：UNP Residues 196-306
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 15N] hRpn10 196-306, 1.38 mM UBQLN2 UBL, 20 mM NaPO4, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 0.1 % sodium azide, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C] hRpn10 196-306, 1.38 mM UBQLN2 UBL, 20 mM NaPO4, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 0.1 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 15N; U-100% 2H] hRpn10 196-306, 1.38 mM UBQLN2 UBL, 20 mM NaPO4, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 0.1 % sodium azide, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBQLN2 UBL, 0.6 mM hRpn10 196-306, 20 mM NaPO4, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 0.1 % sodium azide, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBQLN2 UBL, 0.6 mM hRpn10 196-306, 20 mM NaPO4, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 0.1 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBQLN2 UBL, 20 mM NaPO4, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 0.1 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6U19 Solution Structure of the RAZUL domain from 26S proteasome subunit hRpn10/S5a complexed with the AZUL domain from E3 ligase E6AP/UBE3A 提交 2019-08-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
305–377（73 aa）
片段：UNP Residues 305-377
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-35% 2H] 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 (305-377), 0.75 mM Ubiquitin-protein ligase E3A (24-87), 10 mM MOPS, 50 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 10 uM zinc sulphate, 0.1 % sodium azide, 1 mM pefabloc, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-35% 2H] 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 (305-377), 0.75 mM Ubiquitin-protein ligase E3A (24-87), 10 mM MOPS, 50 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 10 uM zinc sulphate, 0.1 % sodium azide, 1 mM pefabloc, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin-protein ligase E3A (24-87), 0.75 mM 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 (305-377), 10 mM MOPS, 50 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 10 uM zinc sulphate, 0.1 % sodium azide, 1 mM pefabloc, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin-protein ligase E3A (24-87), 0.75 mM 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 (305-377), 10 mM MOPS, 50 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 10 uM zinc sulphate, 0.1 % sodium azide, 1 mM pefabloc, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6WJD SA-like state of human 26S Proteasome with non-cleavable M1-linked hexaubiquitin and E3 ubiquitin ligase E6AP/UBE3A 提交 2020-04-13 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris, pH 7.5, 50 mM NaCl, 1.5 mM ATP-gamma-S, 5 mM MgCl2, 2 mM DTT, 10 uM zinc sulfate
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6WJN SD-like state of human 26S Proteasome with non-cleavable M1-linked hexaubiquitin and E3 ubiquitin ligase E6AP/UBE3A 提交 2020-04-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–191（191 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris, pH 7.5, 50 mM NaCl, 1.5 mM ATP-gamma-S, 5 mM MgCl2, 2 mM DTT, 10 uM zinc sulfate
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.70 Å |
| 7QXN Proteasome-ZFAND5 Complex Z+A state 提交 2022-01-26 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7QXP Proteasome-ZFAND5 Complex Z+B state 提交 2022-01-26 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7QXU Proteasome-ZFAND5 Complex Z+C state 提交 2022-01-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7QXW Proteasome-ZFAND5 Complex Z+D state 提交 2022-01-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7QXX Proteasome-ZFAND5 Complex Z+E state 提交 2022-01-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7QY7 Proteasome-ZFAND5 Complex Z-A state 提交 2022-01-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 7QYA Proteasome-ZFAND5 Complex Z-B state 提交 2022-01-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 7QYB Proteasome-ZFAND5 Complex Z-C state 提交 2022-01-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7W37 Structure of USP14-bound human 26S proteasome in state EA1_UBL 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7W38 Structure of USP14-bound human 26S proteasome in state EA2.0_UBL 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7W39 Structure of USP14-bound human 26S proteasome in state EA2.1_UBL 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7W3A Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED4_USP14 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7W3B Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED5_USP14 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7W3C Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED0_USP14 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7W3F Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED1_USP14 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7W3G Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED2.0_USP14 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7W3H Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED2.1_USP14 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7W3I Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-inhibited state SB_USP14 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7W3J Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-inhibited state SC_USP14 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7W3K Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-inhibited state SD4_USP14 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7W3M Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-inhibited state SD5_USP14 提交 2021-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8CVT Human 19S-20S proteasome, state SD2 提交 2022-05-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 LDZ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-L-leucinamide × 6 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8JRI Cryo-EM structure of human 26S proteasomal RP subcomplex (Ea state) without any bound substrate. 提交 2023-06-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；incubation time= 3 s
blotting time= 2.5 s
|
分辨率 3.40 Å |
| 8JRT Cryo-EM structure of human 26S proteasomal RP subcomplex (Ea state) bound to K11/K48-branched ubiquitin (Ub) chain composed of three Ub. 提交 2023-06-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；incubation time= 3 s
blotting time= 2.5 s
|
分辨率 3.60 Å |
| 8JTI Cryo-EM structure of human 26S RP (Eb state) bound to K11/K48-branched ubiquitin (Ub) chain composed of four Ub. 提交 2023-06-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；incubation time= 3 s
blotting time= 2.5 s
|
分辨率 3.80 Å |
| 8K0G Cryo-EM structure of human 26S RP (Ed state) bound to K11/K48-branched ubiquitin (Ub) chain composed of four Ub. 提交 2023-07-09 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；incubation time= 3 s
blotting time= 2.5 s
|
分辨率 3.80 Å |
| 8USB Non-substrate-engaged human 26S proteasome with Nub1/FAT10 bound to Rpn1 提交 2023-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH7.4, 25 mM NaCl, 25 mM KCl, 3% (v/v) glycerol, 5 mM MgCl2
2 mM ATP and 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.73 Å |
| 8USC Nub1/Fat10-processing human 26S proteasome 提交 2023-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH7.4, 25 mM NaCl, 25 mM KCl, 3% (v/v) glycerol, 5 mM MgCl2
2 mM ATP and 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9BUI M1A Midnolin-Proteasome (with Ubl) 提交 2024-05-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9BV1 M2A Midnolin-Proteasome (translocating) 提交 2024-05-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9BV2 M2B Midnolin-Proteasome (translocating) 提交 2024-05-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9BV3 M1B Midnolin-Proteasome 提交 2024-05-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9BW4 TXNL1-bound proteasome 提交 2024-05-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9E8G Nub1/Fat10-processing human 26S proteasome bound to Txnl1 with Rpt5 at top of spiral staircase 提交 2024-11-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH7.4, 25 mM NaCl, 25 mM KCl, 3% (v/v) glycerol, 5 mM MgCl2
2 mM ATP and 0.5 mM TCEP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9E8H Human proteasome in resting state conformation bound to TXNL1 in backward conformation 提交 2024-11-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH7.4, 25 mM NaCl, 25 mM KCl, 3% (v/v) glycerol, 5 mM MgCl2
2 mM ATP and 0.5 mM TCEP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9E8I Human proteasome in resting state conformation bound to TXNL1 in Forward conformation 提交 2024-11-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH7.4, 25 mM NaCl, 25 mM KCl, 3% (v/v) glycerol, 5 mM MgCl2
2 mM ATP and 0.5 mM TCEP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.87 Å |
| 9E8J Nub1/Fat10-processing human 26S proteasome bound to Txnl1 with Rpt1 at top of spiral staircase 提交 2024-11-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH7.4, 25 mM NaCl, 25 mM KCl, 3% (v/v) glycerol, 5 mM MgCl2
2 mM ATP and 0.5 mM TCEP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9E8L Nub1/Fat10-processing human 26S proteasome bound to Txnl1 with Rpt4 at top of spiral staircase 提交 2024-11-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH7.4, 25 mM NaCl, 25 mM KCl, 3% (v/v) glycerol, 5 mM MgCl2
2 mM ATP and 0.5 mM TCEP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.59 Å |
| 9E8O Nub1/Fat10-processing human 26S proteasome bound to Txnl1 with Rpt2 at top of spiral staircase and partially unfolded Eos 提交 2024-11-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH7.4, 25 mM NaCl, 25 mM KCl, 3% (v/v) glycerol, 5 mM MgCl2
2 mM ATP and 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9E8Q Nub1/Fat10-processing human 26S proteasome with Rpt2 at top of spiral staircase 提交 2024-11-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH7.4, 25 mM NaCl, 25 mM KCl, 3% (v/v) glycerol, 5 mM MgCl2
2 mM ATP and 0.5 mM TCEP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9HEU Co-chaperone Bag1-bound human 26S proteasome in SBAG1 state 提交 2024-11-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9K4J Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA1.0 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：50-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9K4K Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA1.1 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 9K4L Structure of substrate-engaged 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA1.2 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.50 Å |
| 9K4M Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA2.1 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9K4O Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA2.2 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：50-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.00 Å |
| 9K4P Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA2.3 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 9K4R Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EB.1 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9K4S Structure of substrate-engaged 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EB.2 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：50-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 9K4T Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EB.3 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 9K4U Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EC1 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9K4V Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EC2 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9K4W Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED0.1 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9K4X Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED0.2 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9K4Y Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED0.3 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9K4Z Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED1.1 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9K50 Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED1.2 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9K51 Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED1.3 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9K53 Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED2.1 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 9K54 Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED2.2 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9K55 Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED2.3 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：50-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 9K56 Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state EA1 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9K57 Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state EA2 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9K58 Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state EB 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9K59 Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state EC1 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 9K5A Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state EC2 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9K5B Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state ED0 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9K5C Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state ED1 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9K5D Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state ED2 提交 2024-10-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9K5E Structure of substrate-engaged double-cap human proteasome in state EA1-EA1 提交 2024-10-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 68 PDB 声明：68-meric |
链 Ab
1–377（377 aa）
链 Bb
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9M2W The cryo-EM structure of 26S proteasome-Midnolin complex in the MD state 提交 2025-02-28 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 9MBP Substrate-engaged human 26S proteasome bound to midnolin with RPT1 at top of spiral staircase 提交 2025-03-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 LDZ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-L-leucinamide × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 9MBQ Substrate-engaged human 26S proteasome bound to midnolin with RPT5 at top of spiral staircase 提交 2025-03-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 LDZ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-L-leucinamide × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 9NKF Structure of human substrate-free 26S proteasome in the presence of ATPgS and MG-132,SA-like state (composite map) 提交 2025-02-28 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 LDZ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-L-leucinamide × 6 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；50 mM Tris, pH 7.5, 150 mM NaCl, 20 mM KCl,5 mM MgCl2, 1 mM TECP,
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9NKG Structure of substrate engaged MIDN-bound human 26S proteasome, EB-MIDN (Composite map) 提交 2025-02-28 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | LDZ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-L-leucinamide × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；50 mM Tris, pH 7.5, 150 mM NaCl, 20 mM KCl,5 mM MgCl2, 1 mM TECP,
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9NKI Structure of substrate engaged MIDN-bound human 26S proteasome, EB MIDN_UBL state (Composite map) 提交 2025-02-28 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；50 mM Tris, pH 7.5, 150 mM NaCl, 20 mM KCl,5 mM MgCl2, 1 mM TECP,
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 9NKJ Structure of substrates-engaged MIDN-bound human 26S proteasome,ED-MIDN state (Composite map) 提交 2025-02-28 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 LDZ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-L-leucinamide × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 20 mM KCl, 5 mM MgCl2, and 1 mM TECP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 9SZT Co-chaperone Bag1-bound human 26S proteasome in SBAG1.2 state 提交 2025-10-15 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9SZV Co-chaperone Bag1-bound human 26S proteasome in SBAG1.3 state 提交 2025-10-15 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9U3L Substrate-engaged human 26S proteasome bound to midnolin with RPT2 at top of spiral staircase 提交 2025-03-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 LDZ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-L-leucinamide × 6 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 9U4M Focused refinement of 19S in the substrate-engaged human 26S proteasome bound to midnolin with RPT6 at top of spiral staircase 提交 2025-03-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.14 Å |
| 9UF8 The cryo-EM structure of 26S proteasome-Midnolin complex in the MA state 提交 2025-04-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.32 Å |
| 9UG9 The cryo-EM structure of 26S proteasome-Midnolin complex MB state 提交 2025-04-11 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9W39 Structure of human 26S proteasome complexed with midnolin, 19S proteasome with Ubl bound 提交 2025-07-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 9WBG Structure of human 26S proteasome complexed with midnolin, 19S proteasome with Ubl and Catch domain resolved 提交 2025-08-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric |
链 b
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
共 124 个其他 PDB 条目、124 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | PSMD4_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 W； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 |
