5lv2

Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1246

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 140.4 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone-arginine methyltransferase CARM1

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 130–487 链 B； UniProt 130–487 链 C； UniProt 130–487 链 D； UniProt 130–487	未记录	SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 LHB 5-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]methyl]-4-azanyl-1-(methoxymethyl)pyrimidin-2-one × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 17 % NaCl 100 mM	分辨率 2.29 Å R-free 0.238
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 130–487 链 F； UniProt 130–487 链 G； UniProt 130–487 链 H； UniProt 130–487	未记录	SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 LHB 5-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]methyl]-4-azanyl-1-(methoxymethyl)pyrimidin-2-one × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 17 % NaCl 100 mM	分辨率 2.29 Å R-free 0.238

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5LV2	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2V74 Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1), in complex with S-adenosyl-homocysteine 提交 2007-07-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 147–490（344 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490 链 D 147–490（344 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；1.6M DI-AMMONIUM HYDROGENPHOSPHATE, 100MM HEPES PH 7.5.	分辨率 2.70 Å R-free 0.273
2V74 Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1), in complex with S-adenosyl-homocysteine 提交 2007-07-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 147–490（344 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490 链 H 147–490（344 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；1.6M DI-AMMONIUM HYDROGENPHOSPHATE, 100MM HEPES PH 7.5.	分辨率 2.70 Å R-free 0.273
2V7E Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1), unliganded 提交 2007-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 147–490（344 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490 链 B 147–490（344 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 147-490	未记录	HG MERCURY (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.6M DI-AMMONIUM HYDROGENPHOSPHATE, 100MM HEPES PH 7.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.276
5IH3 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with SAH at 1.8 Angstroms resolution 提交 2016-02-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）片段：UNP residues 130-487 链 B 130–487（358 aa）片段：UNP residues 130-487 链 C 130–487（358 aa）片段：UNP residues 130-487 链 D 130–487（358 aa）片段：UNP residues 130-487	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 19%, NaCl 167 mM	分辨率 1.77 Å R-free 0.191
5IS6 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with Sinefungin at 2.0 Angstroms resolution 提交 2016-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 SFG SINEFUNGIN × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 28 % NaCl 100 mM	分辨率 2.01 Å R-free 0.177
5IS7 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with decarboxylated SAH 提交 2016-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DSH 5'-S-(3-aminopropyl)-5'-thioadenosine × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 25% NaCl 167 mM	分辨率 2.29 Å R-free 0.247
5IS8 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0271 提交 2016-03-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–507（378 aa）链 B 130–507（378 aa）链 C 130–507（378 aa）链 D 130–507（378 aa）	未记录	6D1 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](2-chloroethyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；BTP pH 7.5 100 mM, PEG 3350 15%	分辨率 2.71 Å R-free 0.242
5IS9 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0375 提交 2016-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	6D3 (2S)-2-amino-4-[(3-{4-[(2S)-2-amino-2-carboxyethyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}propyl){[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}amino]butanoic acid (non-preferred name) × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 13 % NaCl 100 mM	分辨率 2.40 Å R-free 0.206
5ISA Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0401 提交 2016-03-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–490（361 aa）链 B 130–490（361 aa）链 C 130–490（361 aa）链 D 130–490（361 aa）	未记录	6D5 (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azidopropyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；MIB pH 7.0 100 mM PEG 1500 17.5 % NaCl 100 mM	分辨率 2.40 Å R-free 0.204
5ISB Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0435 提交 2016-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	6CX 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl][(1H-imidazol-4-yl)methyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19% NaCl 133 mM	分辨率 2.00 Å R-free 0.190
5ISC Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0491 提交 2016-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 6D0 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-bromo-2-oxopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19 %	分辨率 2.60 Å R-free 0.239
5ISD Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0592 提交 2016-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 3 6CZ 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-ethoxy-2,3-dioxopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19 % NaCl 133 mM	分辨率 2.60 Å R-free 0.226
5ISE Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0649 提交 2016-03-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）	未记录	6D2 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-carbamimidamidopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 15 % NaCl 133 mM	分辨率 2.10 Å R-free 0.200
5ISE Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0649 提交 2016-03-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	6D2 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-carbamimidamidopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 15 % NaCl 133 mM	分辨率 2.10 Å R-free 0.200
5ISF Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0705 提交 2016-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	6D4 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl][2-(triazan-1-yl)ethyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 4 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 10 % NaCl 167 mM	分辨率 2.22 Å R-free 0.201
5ISG Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0707 提交 2016-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 6D6 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-aminopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 4 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 22% NaCl 200 mM	分辨率 2.42 Å R-free 0.207
5ISH Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0765 提交 2016-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	765 5'-{1-[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]aziridin-1-ium-1-yl}-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 17 % NaCl 67 mM	分辨率 2.15 Å R-free 0.198
5ISI Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0920 (5'-amino-5'-deoxyadenosine) 提交 2016-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	5N5 5'-amino-5'-deoxyadenosine × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 16% NaCl 67 mM	分辨率 2.74 Å R-free 0.214
5K8V Crystal Structure of Mus musculus Protein Arginine Methyltransferase 4 (CARM1 130-487) with CP1 提交 2016-05-31	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	6RE [[2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethylamino]-azanyl-methylidene]azanium × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 15 %, NaCl 100 mM	分辨率 2.25 Å R-free 0.235
5K8W Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor U2 提交 2016-05-31	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	GJV 9-(7-{[amino(iminio)methyl]amino}-5,6,7-trideoxy-beta-D-ribo-heptofuranosyl)-9H-purin-6-amine × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 15 %	分辨率 2.10 Å R-free 0.240
5K8X Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor U3 提交 2016-05-31	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	6ZH [[[(~{E})-3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]prop-2-enyl]amino]-azanyl-methylidene]azanium × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 6 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM, PEG 2000 MME 15 %, NaCl 100 mM	分辨率 1.99 Å R-free 0.211
5LGP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P1C3s 提交 2016-07-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 8ZB (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-propyl-oxolane-3,4-diol × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5 16% PEG 3350 200 mM A.S.	分辨率 2.04 Å R-free 0.219
5LGQ Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P2C3s 提交 2016-07-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 8ZB (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-propyl-oxolane-3,4-diol × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5 14% PEG 3350 200 mM A.S.	分辨率 2.11 Å R-free 0.236
5LGR Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P1C3u 提交 2016-07-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 LPD L-PROLINAMIDE × 4 ACE ACETYL GROUP × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；Tris-HCl pH 8.5 100 mM PEG 3350 14 % Ammonium Sulfate 200 mM	分辨率 2.00 Å R-free 0.234
5LGS Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P2C3u 提交 2016-07-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.5 100 mM PEG 3350 20 % A.S. 200 mM	分辨率 2.10 Å R-free 0.215
5LKJ Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand SA684 提交 2016-07-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–497（368 aa）链 B 130–497（368 aa）链 C 130–497（368 aa）链 D 130–497（368 aa）	未记录	6YB (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(2-carbamimidamidoethyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；100 mM BTP pH 7.5 30% PEG 1500	分辨率 2.60 Å R-free 0.220
5LV3 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand LH1561Br 提交 2016-09-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 LHF 5-[[2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethylamino]methyl]-4-azanyl-1-[2-(4-bromanylphenoxy)ethyl]pyrimidin-2-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 15% NaCl 100 mM	分辨率 1.80 Å R-free 0.203
5NTC Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0678 提交 2017-04-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–497（368 aa）链 B 130–497（368 aa）链 C 130–497（368 aa）链 D 130–497（368 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 2 M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 6L7 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(2-azaniumylethyl)-[(3~{S})-3-azaniumyl-4-oxidanyl-4-oxidanylidene-butyl]azanium × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；BTP pH 7.5 100 mM, PEG 2000 MME 25 %, NaCl 50 mM	分辨率 2.25 Å R-free 0.216
5TBH Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1236 提交 2016-09-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 78K (2~{R})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[[4-azanyl-1-(methoxymethyl)-2-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl]methyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19% NaCl 100 mM	分辨率 2.34 Å R-free 0.230
5TBI Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1427 提交 2016-09-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）片段：UNP residues 130-487 链 B 130–487（358 aa）片段：UNP residues 130-487 链 C 130–487（358 aa）片段：UNP residues 130-487 链 D 130–487（358 aa）片段：UNP residues 130-487	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 78V 4-[2-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]ethylamino]-1-(methoxymethyl)pyrimidin-2-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 21% NaCl 100 mM	分辨率 2.29 Å R-free 0.228
5TBJ Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1452 提交 2016-09-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	LHD 2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethyl-[[4-azanyl-1-(methoxymethyl)-2-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl]methyl]azanium × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.0 100 mM PEG 2000 MME 19% NaCl 100 mM	分辨率 2.32 Å R-free 0.237
7OKP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-22 K18 acetylated 提交 2021-05-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 130–497（368 aa）链 B 130–497（368 aa）	未记录	MLI MALONATE ION × 2 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M sodium malonate, 0.1M MES pH7.0, 0.2M sodium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.254
7OKP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-22 K18 acetylated 提交 2021-05-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 130–497（368 aa）链 D 130–497（368 aa）	未记录	MLI MALONATE ION × 8 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M sodium malonate, 0.1M MES pH7.0, 0.2M sodium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.254
7OS4 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-31 K18 提交 2021-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 130–497（368 aa）链 B 130–497（368 aa）	未记录	QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.2M Sodium malonate 0.1M MES pH 5.5 0.2M NaCl	分辨率 2.54 Å R-free 0.255
7OS4 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-31 K18 提交 2021-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 130–497（368 aa）链 D 130–497（368 aa）	未记录	QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.2M Sodium malonate 0.1M MES pH 5.5 0.2M NaCl	分辨率 2.54 Å R-free 0.255
7PPQ CARM1 in complex with EML736 提交 2021-09-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	LSK methyl 6-[5-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]pentylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；15% PEG 2000, 0.1M sodium chloride, 0.1M tris-HCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.228
7PPY CARM1 in complex with EML709 提交 2021-09-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	7ZH methyl 6-[4-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；12% PEG 2000, 100mM NaCl, 100mM TrisHCl pH8	分辨率 2.42 Å R-free 0.235
7PU8 CARM1 in complex with EML980 提交 2021-09-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	4R7 methyl 6-[4-[[N-[2-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；15% PEG 2000, 0.1M Sodium Chloride, 0.1M Tris HCl	分辨率 2.19 Å R-free 0.229
7PUC CARM1 in complex with EML981 提交 2021-09-29	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	85U methyl 6-[4-[[~{N}-[(~{E})-3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]prop-2-enyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；15% PEG 3350, 200mM AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS HCL pH8.5	分辨率 2.19 Å R-free 0.231
7PUQ CARM1 in complex with EML982 提交 2021-09-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–486（357 aa）链 B 130–486（357 aa）链 C 130–486（357 aa）链 D 130–486（357 aa）	未记录	867 methyl 6-[4-[[~{N}-[3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]carbamimidoyl]amino]butylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；12% PEG 3350, 0.1 M NaCl, 0.1 M TrisHCl pH8.5	分辨率 2.09 Å R-free 0.217
7PV6 CARM1 in complex with EML734 提交 2021-10-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 130–497（368 aa）链 B 130–497（368 aa）	未记录	LRZ methyl 6-[3-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]propylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20 mM Tris pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP	分辨率 2.40 Å R-free 0.237
7PV6 CARM1 in complex with EML734 提交 2021-10-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 130–497（368 aa）链 D 130–497（368 aa）	未记录	LRZ methyl 6-[3-[[~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]carbamimidoyl]amino]propylcarbamoylamino]-4-oxidanyl-naphthalene-2-carboxylate × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20 mM Tris pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP	分辨率 2.40 Å R-free 0.237
7QPH Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_22-31 K27 acetylated 提交 2022-01-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；16% PEG 3350, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M Tris HCl pH8.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.210
7QRD Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_10-25 提交 2022-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 130–507（378 aa）链 B 130–507（378 aa）链 C 130–507（378 aa）链 D 130–507（378 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 MLI MALONATE ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20 mM Tris-HCl pH 7.5 50 mM NaCl 1 mM TCEP	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
9I0A CARM1 in complex with arg-aDMA analog 提交 2025-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）	未记录	A1IZI (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]-N-methyl-carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG3350, 100 mM tris pH7.5, 0.1M NaCl	分辨率 2.22 Å R-free 0.237
9I0A CARM1 in complex with arg-aDMA analog 提交 2025-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	A1IZI (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]-N-methyl-carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG3350, 100 mM tris pH7.5, 0.1M NaCl	分辨率 2.22 Å R-free 0.237
9I1T CARM1 in complex with arg-MMA analog 提交 2025-01-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 130–487（358 aa）链 B 130–487（358 aa）	未记录	A1IZ2 (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；9% PEG3350, 100mM Tris HCl pH7.5, 0.2M ammonium sulfate	分辨率 2.39 Å R-free 0.238
9I1T CARM1 in complex with arg-MMA analog 提交 2025-01-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 130–487（358 aa）链 D 130–487（358 aa）	未记录	A1IZ2 (phenylmethyl) (2S)-5-[[N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propyl]carbamimidoyl]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；9% PEG3350, 100mM Tris HCl pH7.5, 0.2M ammonium sulfate	分辨率 2.39 Å R-free 0.238
9I9U CARM1 in complex with arg-sDMA analog 提交 2025-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 130–497（368 aa）链 B 130–497（368 aa）	未记录	A1I1H (phenylmethyl) (2S)-5-[(Z)-[[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propylamino]-(methylamino)methylidene]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12% PEG6000, 100 mM hepes pH7	分辨率 2.20 Å R-free 0.245
9I9U CARM1 in complex with arg-sDMA analog 提交 2025-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 130–497（368 aa）链 D 130–497（368 aa）	未记录	A1I1H (phenylmethyl) (2S)-5-[(Z)-[[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propylamino]-(methylamino)methylidene]amino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12% PEG6000, 100 mM hepes pH7	分辨率 2.20 Å R-free 0.245

共 42 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CARM1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 B； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 C； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 D； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 E； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 F； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 G； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487 作者链 H； PDB构建体 4–361； UniProt 130–487

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5lv2
沉积日期 deposition_date	2016-09-12
结构标题 title	Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor LH1246
关键词 keywords	;PROTEIN ARGININE METHYLTRANSFERASE, CATALYTIC DOMAIN, CHROMATIN REGULATOR, MRNA PROCESSING, MRNA SPLICING, NUCLEUS, S-ADENOSYL-L-METHIONINE, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION REGULATION, TRANSFERASE ;; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	47.48 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	46.68 Å
零角强度 I(0) i0	1366920000.00
分子量 molecular_weight	316910.0 kDa
排除体积 excluded_volume	399640 Å³
包络体积 envelope_volume	542850 Å³
水化壳体积 shell_volume	93570 Å³
包络直径 envelope_diameter	135.8 Å
壳层 Rg shell_rg	55.43 Å
包络 Rg envelope_rg	44.23 Å
形状 Rg shape_rg	46.64 Å
总 Rg total_rg	47.16 Å
总原子数 total_atoms	44307
残基数 n_residues	2741
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	140.4 Å
Rg (实空间) rg_real	47.03 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.97 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3670e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.1880e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	47.47 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1368000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8994
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	68.1 Å
偏度 Skewness skewness	-0.105
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.682
角度范围 angular_range	— – 0.1650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	68880000.0000
实空间数据点数 n_real_points	34
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.937; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.968; Smooth: 0.909

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone-arginine methyltransferase CARM1
分子量 formula_weight	40850.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.319
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H
原子数 atom_count	45590

GHMGHTLERSVFSERTEESSAVQYFQFYGYLSQQQNMMQDYVRTGTYQRAILQNHTDFKDKIVLDVGCGSGILSFFAAQAGARKIYAVEASTMAQHAEVLVKSNNLTDRIVVIPGKVEEVSLPEQVDIIISEPMGYMLFNERMLESYLHAKKYLKPSGNMFPTIGDVHLAPFTDEQLYMEQFTKANFWYQPSFHGVDLSALRGAAVDEYFRQPVVDTFDIRILMAKSVKYTVNFLEAKEGDLHRIEIPFKFHMLHSGLVHGLAFWFDVAFIGSIMTVWLSTAPTEPLTHWYQVRCLFQSPLFAKAGDTLSGTCLLIANKRQSYDISIVAQVDQTGSKSSNLLDLKNPFFRYTGTTPSPPPG

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	House Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine
分子量 formula_weight	385.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	13

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	;5-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]methyl]-4-azanyl-1-(methoxymethyl)pyrimidin-2-one ;
分子量 formula_weight	433.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	TETRAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE
分子量 formula_weight	134.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	1,2-DIMETHOXYETHANE
分子量 formula_weight	90.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 10 Entity 10 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1166

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	5lv2A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	5lv2A02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	5lv2B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	5lv2B02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	5lv2C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	5lv2C02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	5lv2D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	5lv2D02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	5lv2E01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	5lv2E02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	5lv2F01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	5lv2F02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	5lv2G01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	5lv2G02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	5lv2H01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	5lv2H02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	98.684 Å
晶胞边长 b length_b	74.832 Å
晶胞边长 c length_c	206.639 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.53 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.290 Å
最低分辨率 resolution_low	49.340 Å
R 因子 r_factor	0.2067
R_work r_work	0.2051
R_free r_free	0.2380

fit	/app/data/saxs_computation/lv/5lv2/5lv2.fit
pddf	/app/data/pr_computation/lv/5lv2/5lv2.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/lv/5lv2/5lv2.dat