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1AFV
HIV-1 CAPSID PROTEIN (P24) COMPLEX WITH FAB25.3
提交 1997-03-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 H
20–238(219 aa)
片段:LIGHT CHAIN RESIDUES 1 - 217, HEAVY CHAIN RESIDUES 1 - 220
链 K
20–238(219 aa)
片段:LIGHT CHAIN RESIDUES 1 - 217, HEAVY CHAIN RESIDUES 1 - 220
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未记录
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PB LEAD (II) ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;16% PEG 3350, 50 MM BISTRIS-HCL, PH 7.0, 0.1% BETA-OCTYLGLUCOSIDE, 1 MM NAN3
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分辨率 3.70 Å
R-free 0.324
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2NTF
Crystal Structure of a Quorum-Quenching Antibody in Complex with an N-Acyl-L-Homoserine Lactone Analog
提交 2006-11-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 H
20–239(220 aa)
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未记录
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OHM 3-OXO-N-[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]DODECANAMIDE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;298 K;1.0M Na/K Tartrate, 0.2M NaCl, 0.1 Imidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 8.00
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分辨率 3.18 Å
R-free 0.265
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2NTF
Crystal Structure of a Quorum-Quenching Antibody in Complex with an N-Acyl-L-Homoserine Lactone Analog
提交 2006-11-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
20–239(220 aa)
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未记录
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OHM 3-OXO-N-[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]DODECANAMIDE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;298 K;1.0M Na/K Tartrate, 0.2M NaCl, 0.1 Imidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 8.00
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分辨率 3.18 Å
R-free 0.265
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2NTF
Crystal Structure of a Quorum-Quenching Antibody in Complex with an N-Acyl-L-Homoserine Lactone Analog
提交 2006-11-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 B
20–239(220 aa)
链 H
20–239(220 aa)
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未记录
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OHM 3-OXO-N-[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]DODECANAMIDE × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;298 K;1.0M Na/K Tartrate, 0.2M NaCl, 0.1 Imidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 8.00
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分辨率 3.18 Å
R-free 0.265
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3HKF
Murine unglycosylated IgG Fc fragment
提交 2009-05-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
252–463(212 aa)
片段:UNP residues 252-463
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;2-ethoxyethanol, pH8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.50 Å
R-free 0.305
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6C5H
S25-5 Fab in complex with Chlamydiaceae-specific LPS antigen
提交 2018-01-16
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 H
126–239(114 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289.15 K;0.1 M BIS-Tris HCl
25% [w/v] polyethylene glycol [PEG] 3350
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分辨率 1.99 Å
R-free 0.226
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6C5I
Unliganded S25-5 Fab
提交 2018-01-16
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 H
126–239(114 aa)
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未记录
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NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
CL CHLORIDE ION × 1
NI NICKEL (II) ION × 2
PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;289.15 K;0.01 M NiCl2,
0.1 M Tris-HCl,
20% [w/v] PEG 2000 MME
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分辨率 1.89 Å
R-free 0.231
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6C5J
S25-23 Fab in complex with Chlamydiaceae LPS (Crystal form 1)
提交 2018-01-16
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 H
126–239(114 aa)
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未记录
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NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289.15 K;0.1 M MES,
20% [w/v] polyethylene glycol [PEG] 10000
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分辨率 2.29 Å
R-free 0.239
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6C5K
S25-23 Fab in complex with Chlamydiaceae LPS (Crystal form 2)
提交 2018-01-16
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构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 H
126–239(114 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.2 M Potassium nitrate,
20% [w/v] polyethylene glycol 3350
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分辨率 1.75 Å
R-free 0.218
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6C5K
S25-23 Fab in complex with Chlamydiaceae LPS (Crystal form 2)
提交 2018-01-16
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
126–239(114 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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NO3 NITRATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.2 M Potassium nitrate,
20% [w/v] polyethylene glycol 3350
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分辨率 1.75 Å
R-free 0.218
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