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5naj

ENAH EVH1 in complex with Ac-[2-Cl-F]-[ProM-1]-[ProM-1]-OH

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein enabled homolog

Homo sapiens

UniProt Q8N8S7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 ;(3~{S},7~{R},10~{R},13~{S})-4-[[(3~{S},7~{R},10~{R},13~{S})-4-[(2~{S})-2-acetamido-3-(2-chlorophenyl)propanoyl]-2-oxidanylidene-1,4-diazatricyclo[8.3.0.0^{3,7}]tridec-8-en-13-yl]carbonyl]-2-oxidanylidene-1,4-diazatricyclo[8.3.0.0^{3,7}]tridec-8-ene-13-carboxylic acid ; × 1 SULFATE ION × 3 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 ;(3~{S},7~{R},10~{R},13~{S})-4-[[(3~{S},7~{R},10~{R},13~{S})-4-[(2~{S})-2-acetamido-3-(2-chlorophenyl)propanoyl]-2-oxidanylidene-1,4-diazatricyclo[8.3.0.0^{3,7}]tridec-8-en-13-yl]carbonyl]-2-oxidanylidene-1,4-diazatricyclo[8.3.0.0^{3,7}]tridec-8-ene-13-carboxylic acid ; × 1 SULFATE ION × 3 ;(3~{S},7~{R},10~{R},13~{S})-4-[[(3~{R},7~{S},10~{S},13~{R})-4-[(2~{S})-2-acetamido-3-(2-chlorophenyl)propanoyl]-2-oxidanylidene-1,4-diazatricyclo[8.3.0.0^{3,7}]tridec-8-en-13-yl]carbonyl]-2-oxidanylidene-1,4-diazatricyclo[8.3.0.0^{3,7}]tridec-8-ene-13-carboxylic acid ; × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 ;(3~{S},7~{R},10~{R},13~{S})-4-[[(3~{S},7~{R},10~{R},13~{S})-4-[(2~{S})-2-acetamido-3-(2-chlorophenyl)propanoyl]-2-oxidanylidene-1,4-diazatricyclo[8.3.0.0^{3,7}]tridec-8-en-13-yl]carbonyl]-2-oxidanylidene-1,4-diazatricyclo[8.3.0.0^{3,7}]tridec-8-ene-13-carboxylic acid ; × 1 SULFATE ION × 2 water × 1 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 ;(3~{S},7~{R},10~{R},13~{S})-4-[[(3~{S},7~{R},10~{R},13~{S})-4-[(2~{S})-2-acetamido-3-(2-chlorophenyl)propanoyl]-2-oxidanylidene-1,4-diazatricyclo[8.3.0.0^{3,7}]tridec-8-en-13-yl]carbonyl]-2-oxidanylidene-1,4-diazatricyclo[8.3.0.0^{3,7}]tridec-8-ene-13-carboxylic acid ; × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
4my6 4my6 5naj 5naj 5naj 5naj 5nbf 5ncf 5ncf 5ncg 5ncg 5ncp

共 18 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
5neg

共 1 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2ho2 2iyb 2iyb 2iyb 2iyb 2xqn 5n91 5n91 5n9c 5n9p 5nbx 5nbx

共 27 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ENAH_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 3–113； UniProt 1–111 作者链 B； PDB构建体 3–113； UniProt 1–111 作者链 C； PDB构建体 3–113； UniProt 1–111 作者链 D； PDB构建体 3–113； UniProt 1–111

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5naj
沉积日期 deposition_date2017-02-28
结构标题 titleENAH EVH1 in complex with Ac-[2-Cl-F]-[ProM-1]-[ProM-1]-OH
关键词 keywordsproline-rich motif, Ena/VASP inhibitor, actin, protein-protein interaction, cell adhesion; CELL ADHESION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5naj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5naj__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5naj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）14.83 Å
Rg（电子密度）13.49 Å
总 Rg14.67 Å
原子数1799
残基数110
排除体积16274 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5naj__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5naj__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 5naj__assembly_3__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 5naj__assembly_4__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd5naja_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.55.1 — PH domain-like
家族 Family familyb.55.1.4 — Enabled/VASP homology 1 domain (EVH1 domain)
结构域编号 domain_idd5najb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.55.1 — PH domain-like
家族 Family familyb.55.1.4 — Enabled/VASP homology 1 domain (EVH1 domain)
结构域编号 domain_idd5najc_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.55.1 — PH domain-like
家族 Family familyb.55.1.4 — Enabled/VASP homology 1 domain (EVH1 domain)
结构域编号 domain_idd5najd_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.55.1 — PH domain-like
家族 Family familyb.55.1.4 — Enabled/VASP homology 1 domain (EVH1 domain)

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id5najA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)
结构域编号 domain_id5najB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)
结构域编号 domain_id5najC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)
结构域编号 domain_id5najD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)
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7. 引用文献 (2)