Simian immunodeficiency virus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Tyrosine-protein kinase HCK,Tyrosine-protein kinase HCK × 1 （P08631） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Tyrosine-protein kinase HCK,Tyrosine-protein kinase HCK × 1 （P08631） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q5QGG3_SIV |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–172； UniProt 68–235 作者链 B； PDB构建体 5–172； UniProt 68–235 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Protein Nef × 1 （Q5QGG3） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Protein Nef × 1 （Q5QGG3） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | HCK_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–13； UniProt 78–90 作者链 C； PDB构建体 18–60； UniProt 96–138 作者链 D； PDB构建体 1–13； UniProt 78–90 作者链 D； PDB构建体 18–60； UniProt 96–138 |
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| 条目编号 entry_id | 5nuh |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-04-30 |
| 结构标题 title | Crystal structure of SIVmac239 Nef bound to an engineered Hck SH3 domain |
| 关键词 keywords | SIV, Virus, Nef, SH3, TRANSFERASE; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 20.31 Å |
| Rg（电子密度） | 19.60 Å |
| 总 Rg | 20.49 Å |
| 原子数 | 1487 |
| 残基数 | 181 |
| 排除体积 | 26397 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5nuha_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.102 — Regulatory factor Nef |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.102.1 — Regulatory factor Nef |
| 家族 Family family | d.102.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5nuhb_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.102 — Regulatory factor Nef |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.102.1 — Regulatory factor Nef |
| 家族 Family family | d.102.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5nuhc_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.34 — SH3-like barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.34.2 — SH3-domain |
| 家族 Family family | b.34.2.1 — SH3-domain |
| 结构域编号 domain_id | d5nuhd_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.34 — SH3-like barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.34.2 — SH3-domain |
| 家族 Family family | b.34.2.1 — SH3-domain |
| 结构域编号 domain_id | 5nuhA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 62 — Nef Regulatory Factor |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nef Regulatory Factor |
| 结构域编号 domain_id | 5nuhB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 62 — Nef Regulatory Factor |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nef Regulatory Factor |
| 结构域编号 domain_id | 5nuhC00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — SH3 Domains |
| 结构域编号 domain_id | 5nuhD00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — SH3 Domains |