← 返回搜索
5qst

PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2447286438

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 142.2 Å Quality: GOOD
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cohesin subunit SA-1

Homo sapiens

UniProt Q8WVM7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 86–420 未记录 O3A (3S)-N-methyl-N-phenylpyrrolidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol 分辨率 2.58 Å R-free 0.271
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 86–420 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol 分辨率 2.58 Å R-free 0.271
3 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 86–420 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol 分辨率 2.58 Å R-free 0.271
4 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 86–420 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol 分辨率 2.58 Å R-free 0.271

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5QST Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5QSM PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z57261895 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 O2D 2-cyclohexyl-N-(4H-1,2,4-triazol-4-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.74 Å R-free 0.299
5QSM PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z57261895 提交 2019-05-25 构建体不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.74 Å R-free 0.299
5QSN PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z1272480091 提交 2019-05-25 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.66 Å R-free 0.288
5QSN PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z1272480091 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 O2J (2R)-2-(methoxymethyl)-4-(pyridin-2-yl)morpholine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.66 Å R-free 0.288
5QSO PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z466628048 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 O2M N-[(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.70 Å R-free 0.295
5QSO PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z466628048 提交 2019-05-25 构建体不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.70 Å R-free 0.295
5QSP PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434929 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 LVV 4-[(4-methylphenyl)methyl]-1,4-thiazinane 1,1-dioxide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.89 Å R-free 0.263
5QSP PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434929 提交 2019-05-25 构建体不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.89 Å R-free 0.263
5QSQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z396380540 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 HR5 ~{N}-(cyclobutylmethyl)-1,5-dimethyl-pyrazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.48 Å R-free 0.289
5QSQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z396380540 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 HR5 ~{N}-(cyclobutylmethyl)-1,5-dimethyl-pyrazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.48 Å R-free 0.289
5QSR PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z136583524 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 NU4 2-methyl-N-(pyridin-4-yl)furan-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 3.28 Å R-free 0.294
5QSR PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z136583524 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 NU4 2-methyl-N-(pyridin-4-yl)furan-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 3.28 Å R-free 0.294
5QSS PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z33452282 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 O2P N-(2-hydroxy-4-methylphenyl)-2-methylbenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 3.08 Å R-free 0.296
5QSS PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z33452282 提交 2019-05-25 构建体不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 3.08 Å R-free 0.296
5QSU PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434926 提交 2019-05-25 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 86–420（335 aa）
未记录 O3D 4-[(furan-2-yl)methyl]-1lambda~6~,4-thiazinane-1,1-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.73 Å R-free 0.263
5QSU PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434926 提交 2019-05-25 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.73 Å R-free 0.263
5QSU PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434926 提交 2019-05-25 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.73 Å R-free 0.263
5QSU PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434926 提交 2019-05-25 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.73 Å R-free 0.263
5QSV PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434783 提交 2019-05-25 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.76 Å R-free 0.264
5QSV PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434783 提交 2019-05-25 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.76 Å R-free 0.264
5QSV PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434783 提交 2019-05-25 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.76 Å R-free 0.264
5QSV PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434783 提交 2019-05-25 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 86–420（335 aa）
未记录 O3G N-benzyl-1-(4-fluorophenyl)methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.76 Å R-free 0.264
5QSW PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434884 提交 2019-05-25 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 86–420（335 aa）
未记录 O3J 1-[4-(3-phenylpropyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 3.03 Å R-free 0.267
5QSW PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434884 提交 2019-05-25 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 86–420（335 aa）
未记录 O3J 1-[4-(3-phenylpropyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 3.03 Å R-free 0.267
5QSW PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434884 提交 2019-05-25 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 86–420（335 aa）
未记录 O3J 1-[4-(3-phenylpropyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 3.03 Å R-free 0.267
5QSW PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434884 提交 2019-05-25 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 86–420（335 aa）
未记录 O3J 1-[4-(3-phenylpropyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 3.03 Å R-free 0.267
5QSX PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434812 提交 2019-07-16 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 86–420（335 aa）
未记录 O3M 4-[(3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl)methyl]phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.34 Å R-free 0.275
5QSX PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434812 提交 2019-07-16 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.34 Å R-free 0.275
5QSX PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434812 提交 2019-07-16 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 86–420（335 aa）
未记录 O3M 4-[(3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl)methyl]phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.34 Å R-free 0.275
5QSX PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2856434812 提交 2019-07-16 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 86–420（335 aa）
未记录 O3M 4-[(3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl)methyl]phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.34 Å R-free 0.275
5QSY PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z755044716 提交 2019-05-25 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.40 Å R-free 0.297
5QSY PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z755044716 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 K0J N-ethyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.40 Å R-free 0.297
5QSZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z1267773786 提交 2019-05-25 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 K3J N-ethyl-6-methylpyridazin-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 3.08 Å R-free 0.292
5QSZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z1267773786 提交 2019-05-25 构建体不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 3.08 Å R-free 0.292
6QB5 Crystal structure of the N-terminal region of human cohesin subunit STAG1 提交 2018-12-20 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Na/K Phosphate pH 6.0, 0.2 M NaCl, 34% PEG200
分辨率 2.02 Å R-free 0.245
6QB5 Crystal structure of the N-terminal region of human cohesin subunit STAG1 提交 2018-12-20 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Na/K Phosphate pH 6.0, 0.2 M NaCl, 34% PEG200
分辨率 2.02 Å R-free 0.245
6QB5 Crystal structure of the N-terminal region of human cohesin subunit STAG1 提交 2018-12-20 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Na/K Phosphate pH 6.0, 0.2 M NaCl, 34% PEG200
分辨率 2.02 Å R-free 0.245
6QB5 Crystal structure of the N-terminal region of human cohesin subunit STAG1 提交 2018-12-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 86–420（335 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Na/K Phosphate pH 6.0, 0.2 M NaCl, 34% PEG200
分辨率 2.02 Å R-free 0.245
6R7O Crystal structure of the central region of human cohesin subunit STAG1 提交 2019-03-29 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.31 Å R-free 0.264
6R7O Crystal structure of the central region of human cohesin subunit STAG1 提交 2019-03-29 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 7.0, 0.2 M Sodium Malonate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene Glycol
分辨率 2.31 Å R-free 0.264
6RRC Crystal structure of the N-terminal region of human cohesin subunit STAG1 in complex with RAD21 peptide 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 86–420（335 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；277 K；2.1 M Ammonium Sulfate, 0.1 M MES pH 6.3
分辨率 2.37 Å R-free 0.248
6RRC Crystal structure of the N-terminal region of human cohesin subunit STAG1 in complex with RAD21 peptide 提交 2019-05-17 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 86–420（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；277 K；2.1 M Ammonium Sulfate, 0.1 M MES pH 6.3
分辨率 2.37 Å R-free 0.248
6RRK Crystal structure of the central region of human cohesin subunit STAG1 in complex with RAD21 peptide 提交 2019-05-20 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16 % PEG 3350, 0.2 M DL-Mallic acid
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
6RRK Crystal structure of the central region of human cohesin subunit STAG1 in complex with RAD21 peptide 提交 2019-05-20 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 459–915（457 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16 % PEG 3350, 0.2 M DL-Mallic acid
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
6WG3 Cryo-EM structure of human Cohesin-NIPBL-DNA complex 提交 2020-04-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 D 1–1258（1258 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
7W1M Cryo-EM structure of human cohesin-CTCF-DNA complex 提交 2021-11-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1258（1258 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å

共 19 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 STAG1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 5–339； UniProt 86–420 作者链 B； PDB构建体 5–339； UniProt 86–420 作者链 C； PDB构建体 5–339； UniProt 86–420 作者链 D； PDB构建体 5–339； UniProt 86–420

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5qst

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5qst
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5qst
沉积日期 deposition_date2019-05-25
结构标题 titlePanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of human STAG1 in complex with Z2447286438
关键词 keywordsSGC - Diamond I04-1 fragment screening, PanDDA, XChemExplorer, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier44.47 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron43.72 Å
零角强度 I(0) i0298498000.00
分子量 molecular_weight143320.0 kDa
排除体积 excluded_volume180260 ų
包络体积 envelope_volume275720 ų
水化壳体积 shell_volume53334 ų
包络直径 envelope_diameter140.0 Å
壳层 Rg shell_rg48.80 Å
包络 Rg envelope_rg41.57 Å
形状 Rg shape_rg43.70 Å
总 Rg total_rg44.04 Å
总原子数 total_atoms10048
残基数 n_residues1221
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax142.2 Å
Rg (实空间) rg_real44.38 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.42 Å
I(0) (实空间) i0_real2.9850e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.7420e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal44.47 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal298500000.0000
解质量估计 total_estimate0.8909
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary56.9 Å
偏度 Skewness skewness0.127
峰度 Kurtosis kurtosis-0.684
角度范围 angular_range— – 0.1750 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha10290000.0000
实空间数据点数 n_real_points36
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.891; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.911
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)