Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1B
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–108 链 F; UniProt 1–108 链 H; UniProt 1–108 链 J; UniProt 1–108 | 未记录 | Ryanodine receptor 1 × 4 (P11716) ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds | 分辨率 4.00 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 5T9M | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1C9H CRYSTAL STRUCTURE OF FKBP12.6 IN COMPLEX WITH RAPAMYCIN 提交 1999-08-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–108(107 aa)
片段:FKBP12.6
|
未记录 | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;298 K;PEG 4000, LITHIUM SULFATE, HEPES BUFFER, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 4C02 Crystal structure of human ACVR1 (ALK2) in complex with FKBP12.6 and dorsomorphin 提交 2013-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–108(108 aa)
|
未记录 | FLC CITRATE ANION × 8 TAK 6-[4-(2-piperidin-1-ylethoxy)phenyl]-3-pyridin-4-ylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.2;1.8M AMMONIUM CITRATE, pH 7.2
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.198 |
| 4IQ2 P21 crystal form of FKBP12.6 提交 2013-01-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–108(107 aa)
|
突变:C22V, C76I | MLA MALONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;2.0 M malonic acid, pH 7.0, 4% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.251 |
| 4IQ2 P21 crystal form of FKBP12.6 提交 2013-01-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–108(107 aa)
|
突变:C22V, C76I | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;2.0 M malonic acid, pH 7.0, 4% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.251 |
| 4IQC P3121 crystal form of FKBP12.6 提交 2013-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–108(107 aa)
|
突变:C22V, C76I | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;62% ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 4% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 4IQC P3121 crystal form of FKBP12.6 提交 2013-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–108(107 aa)
|
突变:C22V, C76I | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;62% ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 4% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 5HKG Total chemical synthesis, refolding and crystallographic structure of a fully active immunophilin: calstabin 2 (FKBP12.6). 提交 2016-01-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–108(107 aa)
|
未记录 | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 CL CHLORIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;16 % PEG 8K, 10% Glycerol, 500 mM KCl, 100 mM Hepes
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.194 |
| 5L1D Structure of rabbit RyR2 in complex with FKBP12.6 in a closed state (conformation C1) 提交 2016-07-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
2–108(107 aa)
链 D
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;1x Protease Inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 11.00 Å |
| 5T15 Structural basis for gating and activation of RyR1 (30 uM Ca2+ dataset, all particles) 提交 2016-08-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 3.60 Å |
| 5T9N Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 2) 提交 2016-09-09 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 3.80 Å |
| 5T9R Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 3) 提交 2016-09-09 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 5.80 Å |
| 5T9S Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 4) 提交 2016-09-09 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.20 Å |
| 5T9V Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 1) 提交 2016-09-09 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å |
| 5TA3 Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 2) 提交 2016-09-09 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å |
| 5TAL Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 1&2) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å |
| 5TAM Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 4) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å |
| 5TAN Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 3) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å |
| 5TAP Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, all particles) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å |
| 5TAQ Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 3&4) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.10 Å |
| 5TAS Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 1) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 6.20 Å |
| 5TAT Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 2) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.80 Å |
| 5TAU Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 3) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 6.20 Å |
| 5TAV Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 4) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.80 Å |
| 5TAW Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, all particles) 提交 2016-09-10 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å |
| 5TAX Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 1) 提交 2016-09-10 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 6.60 Å |
| 5TAY Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 2) 提交 2016-09-10 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.60 Å |
| 5TAZ Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 3) 提交 2016-09-10 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å |
| 5TB0 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, all particles) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å |
| 5TB1 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 1) 提交 2016-09-10 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.60 Å |
| 5TB2 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 2) 提交 2016-09-11 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.60 Å |
| 5TB3 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 3) 提交 2016-09-11 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.70 Å |
| 5TB4 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 4) 提交 2016-09-11 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.50 Å |
| 6JGZ Structure of RyR2 (F/P/Ca2+ dataset) 提交 2019-02-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 C
1–108(108 aa)
链 E
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 6JH6 Structure of RyR2 (F/A/Ca2+ dataset) 提交 2019-02-17 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 C
1–108(108 aa)
链 E
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6JHN Structure of RyR2 (F/C/Ca2+ dataset) 提交 2019-02-18 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 D
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6JI0 Structure of RyR2 (F/A/C/Ca2+ dataset) 提交 2019-02-19 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 D
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6JI8 Structure of RyR2 (F/apoCaM dataset) 提交 2019-02-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 E
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 K
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6JII Structure of RyR2 (F/A/C/L-Ca2+/apo-CaM-M dataset) 提交 2019-02-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 D
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6JIU Structure of RyR2 (F/A/C/L-Ca2+/Ca2+CaM dataset) 提交 2019-02-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 E
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 K
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 12 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6JIY Structure of RyR2 (F/A/C/H-Ca2+/Ca2+CaM dataset) 提交 2019-02-24 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 E
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 K
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 20 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6JRR Structure of RyR2 (*F/A/C/L-Ca2+ dataset) 提交 2019-04-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 D
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6JRS Structure of RyR2 (*F/A/C/L-Ca2+/Ca2+-CaM dataset) 提交 2019-04-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 E
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 K
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 12 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6M2W Structure of RyR1 (Ca2+/Caffeine/ATP/CaM1234/CHL) 提交 2020-03-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 B
2–108(107 aa)
链 E
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 K
2–108(107 aa)
|
未记录 | CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6PV6 Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots 提交 2019-07-19 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6W1N Pig Ryanodine Receptor (WT) in 5mM EGTA condition 提交 2020-03-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 C
2–108(107 aa)
链 E
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6WOT Cryo-EM structure of recombinant rabbit Ryanodine Receptor type 1 mutant R164C in complex with FKBP12.6 提交 2020-04-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 6WOU Cryo-EM structure of recombinant mouse Ryanodine Receptor type 2 mutant R176Q in complex with FKBP12.6 in nanodisc 提交 2020-04-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 6WOV Cryo-EM structure of recombinant mouse Ryanodine Receptor type 2 wild type in complex with FKBP12.6 提交 2020-04-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.10 Å |
| 6X32 Wt pig RyR1 in complex with apoCaM, EGTA condition (class 1 and 2, closed) 提交 2020-05-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 D
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6X33 Wt pig RyR1 in complex with apoCaM, EGTA condition (class 3, open) 提交 2020-05-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 D
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6X34 Pig R615C RyR1 EGTA (all classes, open) 提交 2020-05-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
2–107(106 aa)
链 C
2–107(106 aa)
链 E
2–107(106 aa)
链 G
2–107(106 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 6X35 Pig R615C RyR1 in complex with CaM, EGTA (class 1, open) 提交 2020-05-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 D
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6X36 Pig R615C RyR1 in complex with CaM, EGTA (class 3, closed) 提交 2020-05-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 D
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 7CF9 Structure of RyR1 (Ca2+/CHL) 提交 2020-06-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
2–108(107 aa)
链 D
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 7JMF Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots - Frame 42 - State 6 (S6) 提交 2020-07-31 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7JMG Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots - Frame 22 - State 2 (S2) 提交 2020-07-31 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7JMH Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots - Frame 35 - State 4 (S4) 提交 2020-07-31 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7JMI Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots - Frame 29 - State 3 (S3) 提交 2020-07-31 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7JMJ Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots - Frame 37 - State 5 (S5) 提交 2020-07-31 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7M6A High resolution structure of the membrane embedded skeletal muscle ryanodine receptor 提交 2021-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
链 O
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 7M6L High resolution structure of the membrane embedded skeletal muscle ryanodine receptor 提交 2021-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 F
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 J
1–108(108 aa)
链 O
1–108(108 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 7T64 Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6 embedded in lipidic nanodisc in the closed state 提交 2021-12-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot force 2; blot for 1.0s before plunging
|
分辨率 4.00 Å |
| 7T65 Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6 embedded in lipidic nanodisc in the open state 提交 2021-12-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot force 2; blot for 1.0s before plunging
|
分辨率 4.05 Å |
| 7U9Q Structure of PKA phosphorylated human RyR2 in the closed state 提交 2022-03-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 7U9R Structure of PKA phosphorylated human RyR2 in the open state 提交 2022-03-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 7U9T Structure of PKA phosphorylated human RyR2 in the closed state in the presence of Calmodulin 提交 2022-03-11 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å |
| 7U9X Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the closed state 提交 2022-03-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.58 Å |
| 7U9Z Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the open state 提交 2022-03-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 7UA1 Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the closed state in the presence of ARM210 提交 2022-03-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 7UA3 Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the closed state in the presence of Calmodulin 提交 2022-03-11 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 7UA4 Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the open state in the presence of Calmodulin 提交 2022-03-11 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å |
| 7UA5 Structure of dephosphorylated human RyR2 in the closed state 提交 2022-03-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 7UA9 Structure of dephosphorylated human RyR2 in the open state 提交 2022-03-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.59 Å |
| 7VML Structure of recombinant RyR2 (EGTA dataset, class 1&2, closed state) 提交 2021-10-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 I
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7VMM Structure of recombinant RyR2 (EGTA dataset, class 1, closed state) 提交 2021-10-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 I
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7VMN Structure of recombinant RyR2 (EGTA dataset, class 2, closed state) 提交 2021-10-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 I
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7VMO Structure of recombinant RyR2 (Ca2+ dataset, class 1, open state) 提交 2021-10-09 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 I
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7VMP Structure of recombinant RyR2 (Ca2+ dataset, class 2, open state) 提交 2021-10-09 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 I
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7VMQ Structure of recombinant RyR2 (Ca2+ dataset, class 3, open state) 提交 2021-10-09 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 I
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7VMR Structure of recombinant RyR2 mutant K4593A (EGTA dataset) 提交 2021-10-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 I
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7VMS Structure of recombinant RyR2 mutant K4593A (Ca2+ dataset) 提交 2021-10-09 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 I
2–108(107 aa)
链 J
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8DTY Recombinant mouse RyR2 triple phosphomimetic mutant S2807D/S2813D/S2030D in complex with FKBP12.6 and nanodisc under closed-state conditions 提交 2022-07-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8DTZ Recombinant mouse RyR2 triple phosphonull mutant S2807A/S2813A/S2030A in complex with FKBP12.6 and nanodisc under closed-state conditions 提交 2022-07-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8DUJ Global map in C1 of RyR1 particles in complex with ImperaCalcin 提交 2022-07-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric |
链 B
2–108(107 aa)
链 E
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 K
2–108(107 aa)
|
未记录 | CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8DVE RyR1 in presence of IpCa-T26E phosphomimetic and activating ligands 提交 2022-07-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 B
2–108(107 aa)
链 E
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
链 K
2–108(107 aa)
|
未记录 | CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 8DVV Recombinant mouse RyR2 triple phosphomimetic mutant S2807D/S2813D/S2030D in complex with FKBP12.6 and nanodisc under open-state conditions 提交 2022-07-29 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å |
| 8SEN Cryo-EM Structure of RyR1 提交 2023-04-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 8SEO Cryo-EM Structure of RyR1 + ATP-gamma-S 提交 2023-04-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å |
| 8SEP Cryo-EM Structure of RyR1 + ADP 提交 2023-04-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 8SEQ Cryo-EM Structure of RyR1 + AMP 提交 2023-04-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8SER Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenosine 提交 2023-04-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ADN ADENOSINE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.42 Å |
| 8SES Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenine 提交 2023-04-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ADE ADENINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 8SET Cryo-EM Structure of RyR1 + cAMP 提交 2023-04-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.42 Å |
| 8UQ2 Structure of human RyR2-S2808D in the subprimed state 提交 2023-10-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 8UQ3 Structure of human RyR2-S2808D in the closed state in the presence of ARM210 提交 2023-10-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 8UQ4 Structure of human RyR2-S2808D in the subprimed state in the presence of H2O2/NOC-12/GSH 提交 2023-10-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;30 minute incubation with H2O2/NOC-12/GSH was stopped by flash freezing (vitrobot)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.64 Å |
| 8UXC Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420Q in the primed state 提交 2023-11-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 8UXE Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420Q in the closed state in the presence of ARM210 提交 2023-11-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 8UXF Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the primed state 提交 2023-11-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 8UXG Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the closed state in the presence of ARM210 提交 2023-11-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 8UXH Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the primed state in the presence of calcium 提交 2023-11-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 8UXI Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the open state in the presence of calcium 提交 2023-11-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 8UXL Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the primed state in the presence of calcium and calmodulin 提交 2023-11-09 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 20 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;0.020 mM Calmodulin was added to the final sample
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 8UXM Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the open state in the presence of calcium and calmodulin 提交 2023-11-09 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 E
1–108(108 aa)
链 F
1–108(108 aa)
链 G
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 20 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;0.020 mM Calmodulin was added to the final sample
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 8XJI Structure of chimeric RyR complex with flubendiamide 提交 2023-12-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | A1LVX Flubendiamide × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |
| 8XKH Structure of chimeric RyR Complex with tetraniliprole 提交 2023-12-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 A1LV1 tetraniliprole × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.87 Å |
| 8XLF Structure of chimeric RyR 提交 2023-12-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 8XLH Structure of chimeric RyR-I4657M/G4819E 提交 2023-12-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 8Y40 Structure of chimeric RyR-I4657M/G4819E complex with chlorantraniliprole 提交 2024-01-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å |
| 9C1E Mink RyR3 in closed conformation 提交 2024-05-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 C
2–108(107 aa)
链 E
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.02% GDN, 5 mM EGTA, 1:1000 diluted protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blotted for 3 s (blot force of 7 to 10) using ashless blotting paper (Whatman)
|
分辨率 2.89 Å |
| 9C1F Mink RyR3 in open conformation bound to Ca2+/ATP/caffeine 提交 2024-05-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
2–108(107 aa)
链 C
2–108(107 aa)
链 E
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CFF CAFFEINE × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.02% GDN, 0.03 mM free Ca2+ buffered with 2 mM EGTA, 5 mM ATP, 5 mM caffeine, 1:1000 diluted protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blotted for 3 s (blot force of 7 to 10) using ashless blotting paper (Whatman)
|
分辨率 3.22 Å |
| 9CGP RyR1 disease mutant Y523S with FKBP12.6, nanodisc and inhibitor dantrolene in the absence of calcium with refined P1 domain 提交 2024-06-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 U1C Dantrolene × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.34 Å |
| 9CGQ Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6, nanodisc and inhibitor dantrolene in the presence of activating calcium 提交 2024-06-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 E
2–108(107 aa)
链 F
2–108(107 aa)
链 G
2–108(107 aa)
链 H
2–108(107 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 U1C Dantrolene × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 9KDF CryoEM structure of Calcineurin-fusion Human endothelin receptor type-B in complex with RES-701-3 提交 2024-11-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 F
2–108(107 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9KDG CryoEM structure of Calcineurin-fusion Human endothelin receptor type-B in the ligand-free form 提交 2024-11-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
2–108(107 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.33 Å |
| 9OL4 Cryo-EM Structure of Ryanodine Receptor 1: Drug Bound Open Conformation 提交 2025-05-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 N
1–108(108 aa)
链 T
1–108(108 aa)
|
未记录 | CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 12 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9OL5 Rabbit Ryanodine Receptor 1: Atorvastatin Bound Closed Conformation 提交 2025-05-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 N
1–108(108 aa)
链 T
1–108(108 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9OL6 Rabbit Ryanodine Receptor 1: DMSO Control Closed Conformation 提交 2025-05-12 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 N
1–108(108 aa)
链 T
1–108(108 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 9PWO Pig Ryanodine Receptor 1 R615C Mutant: Atorvastatin Bound Open Conformation 提交 2025-08-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
1–108(108 aa)
链 H
1–108(108 aa)
链 N
1–108(108 aa)
链 T
1–108(108 aa)
|
未记录 | CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 12 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
共 117 个其他 PDB 条目、119 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | FKB1B_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–108; UniProt 1–108 作者链 F; PDB构建体 1–108; UniProt 1–108 作者链 H; PDB构建体 1–108; UniProt 1–108 作者链 J; PDB构建体 1–108; UniProt 1–108 |