5tzy

GPR40 in complex with AgoPAM AP8 and partial agonist MK-8666

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Free fatty acid receptor 1,Endolysin,Free fatty acid receptor 1

Homo sapiens

UniProt O14842

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 单体 蛋白 1 (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 ;(5aR,6S,6aS)-3-({2',6'-dimethyl-4'-[3-(methylsulfonyl)propoxy][1,1'-biphenyl]-3-yl}methoxy)-5,5a,6,6a-tetrahydrocyclopropa[4,5]cyclopenta[1,2-c]pyridine-6-carboxylic acid ; × 1 ;(2S,3R)-3-cyclopropyl-3-[(2R)-2-(1-{(1S)-1-[5-fluoro-2-(trifluoromethoxy)phenyl]ethyl}piperidin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-7-yl]-2-methylpropanoic acid ; × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FFAR1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 14–224; UniProt 1–211 作者链 A; PDB构建体 389–475; UniProt 214–300

Free fatty acid receptor 1,Endolysin,Free fatty acid receptor 1

Homo sapiens

UniProt P00720

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 单体 蛋白 1 (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 ;(5aR,6S,6aS)-3-({2',6'-dimethyl-4'-[3-(methylsulfonyl)propoxy][1,1'-biphenyl]-3-yl}methoxy)-5,5a,6,6a-tetrahydrocyclopropa[4,5]cyclopenta[1,2-c]pyridine-6-carboxylic acid ; × 1 ;(2S,3R)-3-cyclopropyl-3-[(2R)-2-(1-{(1S)-1-[5-fluoro-2-(trifluoromethoxy)phenyl]ethyl}piperidin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-7-yl]-2-methylpropanoic acid ; × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ENLYS_BPT4
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 227–386; UniProt 2–161

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5tzy
沉积日期 deposition_date2016-11-22
结构标题 titleGPR40 in complex with AgoPAM AP8 and partial agonist MK-8666
关键词 keywordsFFAR1, partial agonist, FATTY ACID BINDING PROTEIN-HYDROLASE complex; FATTY ACID BINDING PROTEIN/HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5tzy__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5tzy__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5tzy__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)30.16 Å
Rg(电子密度)29.74 Å
总 Rg30.11 Å
原子数3017
残基数418
排除体积54252 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5tzy__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id5tzyA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology530 — Lysozyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 —
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7. 引用文献 (1)