5u0p

Cryo-EM structure of the transcriptional Mediator

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mediator complex subunit 14

物种未注明

UniProt Q9P7Y4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED14_SCHPO
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–879; UniProt 1–879

Mediator complex subunit 6

物种未注明

UniProt Q9US45

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED6_SCHPO
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–216; UniProt 1–216

Mediator complex subunit 8

物种未注明

UniProt O94646

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED8_SCHPO
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–200; UniProt 1–200

Mediator complex subunit 17

物种未注明

UniProt P87306

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED17_SCHPO
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–545; UniProt 1–545

Mediator complex subunit 18

物种未注明

UniProt O14198

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED18_SCHPO
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–207; UniProt 1–207

Mediator complex subunit 20

物种未注明

UniProt Q10317

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED20_SCHPO
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 T; PDB构建体 1–193; UniProt 1–193

Mediator complex subunit 11

物种未注明

UniProt Q9P6Q0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED11_SCHPO
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–111; UniProt 1–111

Mediator complex subunit 22

物种未注明

UniProt O14010

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED22_SCHPO
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 V; PDB构建体 1–136; UniProt 1–136

Mediator complex subunit 7

物种未注明

UniProt O60104

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED7_SCHPO
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376

Mediator complex subunit 21

物种未注明

UniProt O94376

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED21_SCHPO
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–138; UniProt 1–138

Mediator complex subunit 31

物种未注明

UniProt Q9USH1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED31_SCHPO
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 3; PDB构建体 1–139; UniProt 1–139

Mediator complex subunit 9

物种未注明

UniProt O13964

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 27 × 1 (Q10477) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 YE44_SCHPO
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–121; UniProt 1–121

Mediator complex subunit 27

物种未注明

UniProt Q10477

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Mediator complex subunit 14 × 1 (Q9P7Y4) Mediator complex subunit 6 × 1 (Q9US45) Mediator complex subunit 8 × 1 (O94646) Mediator complex subunit 17 × 1 (P87306) Mediator complex subunit 18 × 1 (O14198) Mediator complex subunit 20 × 1 (Q10317) Mediator complex subunit 11 × 1 (Q9P6Q0) Mediator complex subunit 22 × 1 (O14010) Mediator complex subunit 4 × 1 Mediator complex subunit 7 × 1 (O60104) Mediator complex subunit 21 × 1 (O94376) Mediator complex subunit 31 × 1 (Q9USH1) Mediator complex subunit 9 × 1 (O13964) Mediator complex subunit 19 × 1 Mediator complex subunit 10 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MED27_SCHPO
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 2; PDB构建体 1–273; UniProt 1–273

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5u0p
沉积日期 deposition_date2016-11-26
结构标题 titleCryo-EM structure of the transcriptional Mediator
关键词 keywordstranscription, transcriptional, Mediator, Head, Middle, Tail, Srb, RNA polymerase II, Med; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5u0p__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5u0p__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5u0p__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)64.76 Å
Rg(电子密度)64.46 Å
总 Rg63.82 Å
原子数20268
残基数2929
排除体积353030 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5u0p__assembly_1__model_1 hexadecameric (16) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

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7. 引用文献 (1)