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5u4x

Coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with TP-064

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone-arginine methyltransferase CARM1

Homo sapiens

UniProt Q86X55

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 140–480 链 B； UniProt 140–480 片段：UNP residues 140-480 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 7VM N-methyl-N-[(2-{1-[2-(methylamino)ethyl]piperidin-4-yl}pyridin-4-yl)methyl]-3-phenoxybenzamide × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 7 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M Tris pH8.5 分辨率 1.88 Å R-free 0.215
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 140–480 链 D； UniProt 140–480 片段：UNP residues 140-480 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 7VM N-methyl-N-[(2-{1-[2-(methylamino)ethyl]piperidin-4-yl}pyridin-4-yl)methyl]-3-phenoxybenzamide × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 11 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M Tris pH8.5 分辨率 1.88 Å R-free 0.215

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5U4X Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2Y1W CRYSTAL STRUCTURE OF COACTIVATOR ASSOCIATED ARGININE METHYLTRANSFERASE 1 (CARM1) IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND INDOLE INHIBITOR 提交 2010-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
链 B 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
链 C 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
链 D 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
未记录 SFG SINEFUNGIN × 4 849 2-{4-[3-FLUORO-2-(2-METHOXYPHENYL)-1H-INDOL-5-YL] PIPERIDIN-1-YL}-N-METHYLETHANAMINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；20-30% PEG 2000K, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE DIHYDRATE.
分辨率 2.10 Å R-free 0.244
2Y1X CRYSTAL STRUCTURE OF COACTIVATOR ASSOCIATED ARGININE METHYLTRANSFERASE 1 (CARM1) IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND INDOLE INHIBITOR 提交 2010-12-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
链 D 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 845 N-(3-{5-[5-(1H-INDOL-4-YL)-1,3,4-OXADIAZOL-2-YL]-3-(TRIFLUOROMETHYL)-1H-PYRAZOL-1-YL}BENZYL)-L-ALANINAMIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；20-30% PEG 2000K, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE DIHYDRATE
分辨率 2.40 Å R-free 0.264
2Y1X CRYSTAL STRUCTURE OF COACTIVATOR ASSOCIATED ARGININE METHYLTRANSFERASE 1 (CARM1) IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND INDOLE INHIBITOR 提交 2010-12-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
链 C 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 845 N-(3-{5-[5-(1H-INDOL-4-YL)-1,3,4-OXADIAZOL-2-YL]-3-(TRIFLUOROMETHYL)-1H-PYRAZOL-1-YL}BENZYL)-L-ALANINAMIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；20-30% PEG 2000K, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE DIHYDRATE
分辨率 2.40 Å R-free 0.264
4IKP Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with methylenesinefungin 提交 2012-12-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
链 B 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
未记录 4IK (2S,5S)-2,6-diamino-5-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}hexanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 25 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Di-AMMONIUM TARTRATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.231
4IKP Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with methylenesinefungin 提交 2012-12-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
链 D 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
未记录 4IK (2S,5S)-2,6-diamino-5-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}hexanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Di-AMMONIUM TARTRATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.231
5DWQ Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated H3 peptide (R17) 提交 2015-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
突变：aa 134-479 突变：aa 134-479 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.257
5DWQ Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated H3 peptide (R17) 提交 2015-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
突变：aa 134-479 突变：aa 134-479 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.257
5DX0 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and H3 peptide (R17) 提交 2015-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.263
5DX0 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and H3 peptide (R17) 提交 2015-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.263
5DX1 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.93 Å R-free 0.238
5DX1 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.93 Å R-free 0.238
5DX8 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.94 Å R-free 0.246
5DX8 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.94 Å R-free 0.246
5DXA Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R460) 提交 2015-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.07 Å R-free 0.244
5DXA Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R460) 提交 2015-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.07 Å R-free 0.244
5DXJ Crystal structure of CARM1 and sinefungin 提交 2015-09-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.231
5DXJ Crystal structure of CARM1 and sinefungin 提交 2015-09-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.231
6ARJ Crystal structure of CARM1 with EPZ022302 and SAH 提交 2017-08-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW4 methyl 2-[2-{2-chloro-5-[(2R)-2-hydroxy-3-(methylamino)propoxy]phenyl}-6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methylpyrimidin-4-yl]-2,7-diazaspiro[3.5]nonane-7-carboxylate × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.212
6ARJ Crystal structure of CARM1 with EPZ022302 and SAH 提交 2017-08-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW4 methyl 2-[2-{2-chloro-5-[(2R)-2-hydroxy-3-(methylamino)propoxy]phenyl}-6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methylpyrimidin-4-yl]-2,7-diazaspiro[3.5]nonane-7-carboxylate × 2 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.212
6ARV Crystal structure of CARM1 with Compound 2 and SAH 提交 2017-08-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW7 (2R)-1-amino-3-{3-[4-(morpholin-4-yl)-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-6-yl]phenoxy}propan-2-ol × 2 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.232
6ARV Crystal structure of CARM1 with Compound 2 and SAH 提交 2017-08-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW7 (2R)-1-amino-3-{3-[4-(morpholin-4-yl)-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-6-yl]phenoxy}propan-2-ol × 2 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.232
6D2L Crystal structure of human CARM1 with (S)-SKI-72 提交 2018-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 146–489（344 aa）
链 B 146–489（344 aa）
链 C 146–489（344 aa）
链 D 146–489（344 aa）
链 E 146–489（344 aa）
链 F 146–489（344 aa）
未记录 FTG (2S,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-5-[(benzylamino)methyl]-N-[2-(4-hydroxyphenyl)ethyl]hexanamide × 6 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH7.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.236
6DVR Crystal structure of human CARM1 with (R)-SKI-72 提交 2018-06-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 146–489（344 aa）
链 B 146–489（344 aa）
未记录 HDG (2R,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-5-[(benzylamino)methyl]-N-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]hexanamide (non-preferred name) × 2 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH7.5
分辨率 1.54 Å R-free 0.215
6DVR Crystal structure of human CARM1 with (R)-SKI-72 提交 2018-06-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 146–489（344 aa）
链 B 146–489（344 aa）
未记录 HDG (2R,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-5-[(benzylamino)methyl]-N-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]hexanamide (non-preferred name) × 8 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH7.5
分辨率 1.54 Å R-free 0.215
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 145–477（333 aa）
未记录 XJ2 (2R)-1-(methylamino)-3-(1,3,4,5-tetrahydro-2-benzazepin-2-yl)propan-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 145–477（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 145–477（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 145–477（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 145–477（333 aa）
链 B 145–477（333 aa）
链 C 145–477（333 aa）
链 D 145–477（333 aa）
未记录 XJ2 (2R)-1-(methylamino)-3-(1,3,4,5-tetrahydro-2-benzazepin-2-yl)propan-2-ol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6S70 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM251 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KYB 1-[5-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]pentyl]guanidine × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 24 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.211
6S70 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM251 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KYB 1-[5-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]pentyl]guanidine × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 24 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.211
6S71 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor WH5C 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KYE (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(5-carbamimidamidopentyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.06 Å R-free 0.210
6S71 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor WH5C 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KYE (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(5-carbamimidamidopentyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.06 Å R-free 0.210
6S74 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM305 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KY8 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyrimidin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.216
6S74 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM305 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KY8 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyrimidin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.216
6S77 Crystal structure of CARM1 N265Y mutant in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
突变：N265Y 突变：N265Y KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.12 Å R-free 0.246
6S77 Crystal structure of CARM1 N265Y mutant in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
突变：N265Y 突变：N265Y KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.12 Å R-free 0.246
6S79 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.231
6S79 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.231
6S7A Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA175 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KY5 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 1.86 Å R-free 0.220
6S7A Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA175 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KY5 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 1.86 Å R-free 0.220
6S7B Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM249 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KYH 1-[4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]butyl]guanidine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M potassium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.66 Å R-free 0.227
6S7B Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM249 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KYH 1-[4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]butyl]guanidine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M potassium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.66 Å R-free 0.227
6S7C Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM079 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KY2 1-[3-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]propyl]guanidine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 21 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.233
6S7C Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM079 提交 2019-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KY2 1-[3-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]propyl]guanidine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 21 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.233
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 142–477（336 aa）
未记录 XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 142–477（336 aa）
未记录 XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 142–477（336 aa）
未记录 XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 142–477（336 aa）
未记录 XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 142–477（336 aa）
未记录 XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 142–477（336 aa）
未记录 XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 142–477（336 aa）
未记录 XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 142–477（336 aa）
未记录 XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7U9I Co-crystal structure of human CARM1 in complex with MT556 inhibitor 提交 2022-03-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 146–489（344 aa）
链 B 146–489（344 aa）
未记录 44T 7-[5-S-(4-{[(4-ethylpyridin-3-yl)methyl]amino}butyl)-5-thio-beta-D-ribofuranosyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2M di-Sodium Tartrate
分辨率 2.00 Å R-free 0.267
8G2H Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1113 提交 2023-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 140–480（341 aa） 片段：methyltransferase domain
未记录 YVU 5'-S-[2-(benzylcarbamamido)ethyl]-5'-thioadenosine × 2 GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Calcium chloride dihydrate, 0.05 M HEPES sodium pH 7.5, 28% v/v Polyethylene glycol 400, 0.002 M Spermine
分辨率 1.49 Å R-free 0.177
8G2I Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1290 提交 2023-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 140–480（341 aa） 片段：methyltransferase domain
未记录 I0B 5'-([2-(benzylcarbamamido)ethyl]{3-[N'-(3-bromophenyl)carbamimidamido]propyl}amino)-5'-deoxyadenosine × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；0.1 M BICINE pH 9.0, 2.0 M Magnesium chloride hexahydrate
分辨率 2.17 Å R-free 0.225
8SIG Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1-288 提交 2023-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 140–480（341 aa） 片段：methyltransferase domain
未记录 GWU 5'-{(3-aminopropyl)[2-(benzylcarbamamido)ethyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 2 NA SODIUM ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.2 M Calcium chloride dihydrate, 0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 28% v/v Polyethylene glycol 400
分辨率 1.78 Å R-free 0.199
8SIH Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1-289 提交 2023-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 140–480（341 aa） 片段：methyltransferase domain
未记录 I1K 5'-{[2-(benzylcarbamamido)ethyl][3-(N'-cyclopentylcarbamimidamido)propyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；3.5 M Ammonium chloride, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.246
8UQH X-ray crystal structure of PRMT4 bound to compound YD-1130 提交 2023-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 139–479（341 aa）
链 B 139–479（341 aa）
链 C 139–479（341 aa）
链 D 139–479（341 aa）
未记录 X9L 5'-S-(2-{[(3-bromophenyl)methyl]amino}ethyl)-5'-thioadenosine × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；7.5% (w/v) PEG 20,000, 0.1M Tris, 0.08M sodium formate, pH 7.5
分辨率 1.87 Å R-free 0.253
9O37 The structure of PRMT4 in complex with YD1305 提交 2025-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 145–477（333 aa） 片段：UNP Residues 145-477
未记录 A1B7X 5'-{[2-(benzylcarbamamido)ethyl](3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M calcium acetate hydrate, 0.1M HEPES: NaOH, pH 7.5, 10% (w/v) PEG 8,000
分辨率 2.11 Å R-free 0.233
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 146–476（331 aa）
未记录 A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350
分辨率 1.97 Å R-free 0.269
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 146–476（331 aa）
未记录 A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350
分辨率 1.97 Å R-free 0.269
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 146–476（331 aa）
未记录 A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350
分辨率 1.97 Å R-free 0.269
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 146–476（331 aa）
未记录 A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350
分辨率 1.97 Å R-free 0.269

共 32 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CARM1_HUMAN
Isoform Q86X55-1
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–341； UniProt 140–480 作者链 B； PDB构建体 1–341； UniProt 140–480 作者链 C； PDB构建体 1–341； UniProt 140–480 作者链 D； PDB构建体 1–341； UniProt 140–480

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5u4x
沉积日期 deposition_date2016-12-06
结构标题 titleCoactivator-associated arginine methyltransferase 1 with TP-064
关键词 keywordsCARM1, methyltransferase, TP-064, Structural Genomics, Structural Genomics Consortium, SGC, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd5u4xa_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamilyc.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family familyc.66.1.6 — Arginine methyltransferase
结构域编号 domain_idd5u4xb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamilyc.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family familyc.66.1.6 — Arginine methyltransferase
结构域编号 domain_idd5u4xc_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamilyc.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family familyc.66.1.6 — Arginine methyltransferase
结构域编号 domain_idd5u4xd_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamilyc.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family familyc.66.1.6 — Arginine methyltransferase

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id5u4xA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5u4xA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
结构域编号 domain_id5u4xB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5u4xB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
结构域编号 domain_id5u4xC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5u4xC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
结构域编号 domain_id5u4xD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id5u4xD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (0)