SAXSdb — 5v6y

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
4	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RAMP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 375–462； UniProt 24–111 作者链 B； PDB构建体 375–462； UniProt 24–111 作者链 C； PDB构建体 375–462； UniProt 24–111 作者链 D； PDB构建体 375–462； UniProt 24–111

Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor

Homo sapiens

UniProt P0AEY0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
4	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MALE_ECO57
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–368； UniProt 26–392 作者链 B； PDB构建体 2–368； UniProt 26–392 作者链 C； PDB构建体 2–368； UniProt 26–392 作者链 D； PDB构建体 2–368； UniProt 26–392

Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor

Homo sapiens

UniProt Q16602

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
4	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	ADM × 1 （P35318） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CALRL_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 472–587； UniProt 29–144 作者链 B； PDB构建体 472–587； UniProt 29–144 作者链 C； PDB构建体 472–587； UniProt 29–144 作者链 D； PDB构建体 472–587； UniProt 29–144

ADM

物种未注明

UniProt P35318

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor × 1 （O60894,P0AEY0,Q16602） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor × 1 （O60894,P0AEY0,Q16602） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor × 1 （O60894,P0AEY0,Q16602） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
4	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor × 1 （O60894,P0AEY0,Q16602） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ADML_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–16； UniProt 131–146 作者链 F； PDB构建体 1–16； UniProt 131–146 作者链 G； PDB构建体 1–16； UniProt 131–146 作者链 H； PDB构建体 1–16； UniProt 131–146

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5v6y
沉积日期 deposition_date	2017-03-17
结构标题 title	Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant
关键词 keywords	class B G protein-coupled receptor, GPCR, calcitonin family peptide, TRANSPORT PROTEIN - MEMBRANE PROTEIN complex; TRANSPORT PROTEIN / MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5v6y__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5v6y__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5v6y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.58 Å
Rg（电子密度）	26.79 Å
总 Rg	27.65 Å
原子数	4482
残基数	565
排除体积	79537 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5v6y__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5v6y__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`5v6y__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`5v6y__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor
分子量 formula_weight	66304.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	17855

MAKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFTTACQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPISGRAVGSAGSAGSAEDSIQLGVTRNKIMTAQYECYQKIMQDPIQQAEGVYCNRTWDGWLCWNDVAAGTESMQLCPDYFQDFDPSEKVTKICDQDGNWFRHPASNRTWTNYTQCNVNTHEKVKTALNLFYLHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ADM
分子量 formula_weight	1901.2 kDa
突变 mutation	S45W, K46L, Q50W, Y52F
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

DKDNVAPRWLISPWGFX

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	342.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

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晶胞边长 a length_a	195.496 Å
晶胞边长 b length_b	69.436 Å
晶胞边长 c length_c	200.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.43 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	45.114 Å
R 因子 r_factor	0.2131
R_work r_work	0.2120
R_free r_free	0.2445

Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ADM

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5v6y__assembly_1__model_1

5v6y__assembly_1__model_1 | I(q)

5v6y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 water

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Maltose-binding periplasmic protein,Receptor activity-modifying protein 1,Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ADM

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5v6y__assembly_1__model_1

5v6y__assembly_1__model_1 | I(q)

5v6y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 water

7. 引用文献 (1)