Physeter catodon
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 SULFATE ION × 3 NITRIC OXIDE × 1 NITRITE ION × 7 GLYCEROL × 3 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 3 | PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 SULFATE ION × 9 NITRIC OXIDE × 3 NITRITE ION × 21 GLYCEROL × 9 water × 3 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | MYG_PHYCD |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–154； UniProt 1–154 |
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| 条目编号 entry_id | 5vzp |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-05-29 |
| 结构标题 title | Sperm whale myoglobin H64Q with nitric oxide |
| 关键词 keywords | Heme, Myoglobin, nitrosyl, nitric oxide, OXYGEN TRANSPORT; OXYGEN TRANSPORT |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.75 Å |
| Rg（电子密度） | 15.27 Å |
| 总 Rg | 16.46 Å |
| 原子数 | 1315 |
| 残基数 | 153 |
| 排除体积 | 23316 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5vzpa_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.1 — Globin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.1.1 — Globin-like |
| 家族 Family family | a.1.1.2 — Globins |
| 结构域编号 domain_id | 5vzpA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 490 — Globin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Globins |