SAXSdb — 5w7g

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ORF140

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 42 DNA 2	ORF132 × 21 （Q70LC7） DNA (253-MER) × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Y140_AFV1Y
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 C； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 E； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 G； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 I； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 K； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 M； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 O； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 Q； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 S； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 U； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 W； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 Y； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 a； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 c； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 e； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 g； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 i； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 k； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 m； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 o； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140

ORF132

物种未注明

UniProt Q70LC7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 42 DNA 2	ORF140 × 21 （Q70LC6） DNA (253-MER) × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Y132_AFV1Y
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 D； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 F； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 H； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 J； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 L； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 N； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 P； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 R； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 T； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 V； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 X； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 Z； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 b； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 d； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 f； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 h； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 j； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 l； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 n； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 p； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5w7g
沉积日期 deposition_date	2017-06-19
结构标题 title	An envelope of a filamentous hyperthermophilic virus carries lipids in a horseshoe conformation
关键词 keywords	AFV1, hyperthermophile, filamentous virus, A-form DNA, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5w7g__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5w7g__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5w7g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	56.92 Å
Rg（电子密度）	57.03 Å
总 Rg	57.14 Å
原子数	53508
残基数	5901
排除体积	923090 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5w7g__assembly_1__model_1`	44-meric （44）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ORF140
分子量 formula_weight	15832.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	21

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O,Q,S,U,W,Y,a,c,e,g,i,k,m,o
原子数 atom_count	53508

MAKLNRKLRQDSTDRYKTKLYLWRNLGGLIPEDMAISVTESITADWKQYNDMMSKVRNETLDILKTNKVATEDYIGYIAFAEELAHQVWKNKNSSPDPNTANEASKTDLESKYSDVYGLDVTVLDAIYNAVIPIIMGGGS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ORF132
分子量 formula_weight	15017.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	21

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P,R,T,V,X,Z,b,d,f,h,j,l,n,p

MVNKKYRQDSKDRYQYKQYIYRSIGGIVPPEMAETVTANQTAQWEAGFTPYHKLRLAIKEICKTDGIPNIKWGMYIAFGEKLLKSYLKMKAGSASSDMIAEYINNAISAFSSRTGISQETAQKIADFITSNY

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA (253-MER)
分子量 formula_weight	77747.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	q,r

ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT

▶

分辨率 resolution	4.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	119495

An envelope of a filamentous hyperthermophilic virus carries lipids in a horseshoe conformation

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ORF140

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ORF132

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5w7g__assembly_1__model_1

5w7g__assembly_1__model_1 | I(q)

5w7g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

An envelope of a filamentous hyperthermophilic virus carries lipids in a horseshoe conformation

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ORF140

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ORF132

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5w7g__assembly_1__model_1

5w7g__assembly_1__model_1 | I(q)

5w7g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)