5wko

Crystal structure of antibody 27F3 recognizing the HA from A/California/04/2009 (H1N1) influenza virus

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 276.9 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Antibody 27F3 heavy chain

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 135–244 链 E； UniProt 135–244 链 I； UniProt 135–244	未记录	Antibody 27F3 light chain × 3 （Q9UL78,Q6P5S8） Hemagglutinin × 3 （C3W5S1） Hemagglutinin × 3 （A0A023ZYH9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268
2	信息不足异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 135–244 链 G； UniProt 135–244 链 K； UniProt 135–244	未记录	Antibody 27F3 light chain × 3 （Q9UL78,Q6P5S8） Hemagglutinin × 3 （C3W5S1） Hemagglutinin × 3 （A0A023ZYH9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5WKO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1U6A Crystal Structure of the Broadly Neutralizing Anti-HIV Fab F105 提交 2004-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 21–243（223 aa）片段：ANTIGEN-BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；PEG 4000, ISOPROPANOL, NACL, NA-CITRATE, PEPTIDE 44 (RLTPEPDD-NH2), pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.81 Å R-free 0.251
2OQJ Crystal structure analysis of Fab 2G12 in complex with peptide 2G12.1 提交 2007-01-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 20–243（224 aa）链 E 20–243（224 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；1.33M Na/K phosphate, 0.2M isopropanol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K	分辨率 2.80 Å R-free 0.275
2OQJ Crystal structure analysis of Fab 2G12 in complex with peptide 2G12.1 提交 2007-01-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 H 20–243（224 aa）链 K 20–243（224 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；1.33M Na/K phosphate, 0.2M isopropanol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K	分辨率 2.80 Å R-free 0.275
2OQJ Crystal structure analysis of Fab 2G12 in complex with peptide 2G12.1 提交 2007-01-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 B 20–243（224 aa）链 E 20–243（224 aa）链 H 20–243（224 aa）链 K 20–243（224 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；1.33M Na/K phosphate, 0.2M isopropanol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K	分辨率 2.80 Å R-free 0.275
3MNV Crystal structure of the non-neutralizing HIV antibody 13H11 Fab fragment 提交 2010-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 143–243（101 aa）片段：FUSION PROTEIN between mouse Fv and a human Fc	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Qiagen AmSO4 suite, reservoir: 2.2 M ammonium sulfate, 0.2 M lithium nitrate. Drop: 0.5 uL protein + 0.5 uL reservoir., VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.228
3MNV Crystal structure of the non-neutralizing HIV antibody 13H11 Fab fragment 提交 2010-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 143–243（101 aa）片段：FUSION PROTEIN between mouse Fv and a human Fc	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Qiagen AmSO4 suite, reservoir: 2.2 M ammonium sulfate, 0.2 M lithium nitrate. Drop: 0.5 uL protein + 0.5 uL reservoir., VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.228
3QCT Crystal structure of the humanized apo LT3015 anti-lysophosphatidic acid antibody Fab fragment 提交 2011-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 139–243（105 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 2% PEG 400 (v/v), and 1.75 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.15 Å R-free 0.287
3QCU Crystal structure of the LT3015 antibody Fab fragment in complex with lysophosphatidic acid (14:0) 提交 2011-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 139–243（105 aa）	未记录	NKN (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl tetradecanoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；0.095 M sodium citrate pH 5.6, 19% (v/v) isopropanol, 19% (w/v) PEG 4000, and 5% (v/v) glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.98 Å R-free 0.252
3QCU Crystal structure of the LT3015 antibody Fab fragment in complex with lysophosphatidic acid (14:0) 提交 2011-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 139–243（105 aa）	未记录	NKN (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl tetradecanoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；0.095 M sodium citrate pH 5.6, 19% (v/v) isopropanol, 19% (w/v) PEG 4000, and 5% (v/v) glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.98 Å R-free 0.252
3QCV Crystal structure of the LT3015 antibody Fab fragment in complex with lysophosphatidic acid (18:2) 提交 2011-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 139–243（105 aa）	未记录	18L (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9Z,12Z)-octadeca-9,12-dienoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.095 M sodium citrate pH 5.6, 19% (v/v) isopropanol, 19% (w/v) PEG 4000, and 5% (v/v) glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.51 Å R-free 0.266
3QCV Crystal structure of the LT3015 antibody Fab fragment in complex with lysophosphatidic acid (18:2) 提交 2011-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 139–243（105 aa）	未记录	18L (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9Z,12Z)-octadeca-9,12-dienoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.095 M sodium citrate pH 5.6, 19% (v/v) isopropanol, 19% (w/v) PEG 4000, and 5% (v/v) glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.51 Å R-free 0.266
4NM4 Crystal structure of broadly neutralizing antibody CR8043 提交 2013-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 151–245（95 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG 6000, 0.1 M HEPES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.65 Å R-free 0.232
4NM4 Crystal structure of broadly neutralizing antibody CR8043 提交 2013-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 151–245（95 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG 6000, 0.1 M HEPES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.65 Å R-free 0.232
4NM8 Crystal structure of broadly neutralizing antibody CR8043 bound to H3 influenza hemagglutinin 提交 2013-11-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 H 151–245（95 aa）链 I 151–245（95 aa）链 J 151–245（95 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.5, 3% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 4.00 Å R-free 0.292
4NUJ Crystal structure of HIV-1 broadly neutralizing antibody PGT152 提交 2013-12-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 128–247（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.2；293.15 K；40% PEG 600, 0.1M phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.15K	分辨率 1.83 Å R-free 0.210
5EWI Crystal Structure of the Human Fab VRC38.01, an HIV-1 V1V2-Directed Neutralizing Antibody Isolated from Donor N90 提交 2015-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 135–247（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；14% PEG400, 13% PEG8000, 0.1M Tris pH 8.5, 0.1M MgCl, No Cryo	分辨率 1.60 Å R-free 0.202
5UG0 Human antibody H2897 in complex with influenza hemagglutinin H1 Solomon Islands/03/2006 提交 2017-01-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 D 143–247（105 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% w/v PEG8000, 100 mM HEPES	分辨率 3.40 Å R-free 0.278
5VKK Crystal structure of Fab fragment of anti-CD22 Epratuzumab 提交 2017-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 132–245（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；85 mM Tris, pH 8.5, 25.5% PEG 4000 (w/v), 170 mM sodium acetate and 15% glycerol	分辨率 2.01 Å R-free 0.237
5VKK Crystal structure of Fab fragment of anti-CD22 Epratuzumab 提交 2017-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 132–245（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；85 mM Tris, pH 8.5, 25.5% PEG 4000 (w/v), 170 mM sodium acetate and 15% glycerol	分辨率 2.01 Å R-free 0.237
5W1M MACV GP1 CR1-07 Fab complex 提交 2017-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 143–245（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 5.5；297 K；1.8 M AmSO4 and 100 mM NaCitrate pH 5.5.	分辨率 3.91 Å R-free 0.264
5W1M MACV GP1 CR1-07 Fab complex 提交 2017-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 143–245（103 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 5.5；297 K；1.8 M AmSO4 and 100 mM NaCitrate pH 5.5.	分辨率 3.91 Å R-free 0.264
5W1M MACV GP1 CR1-07 Fab complex 提交 2017-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 143–245（103 aa）	未记录	BMA beta-D-mannopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 5.5；297 K；1.8 M AmSO4 and 100 mM NaCitrate pH 5.5.	分辨率 3.91 Å R-free 0.264
5W1M MACV GP1 CR1-07 Fab complex 提交 2017-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 143–245（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 5.5；297 K；1.8 M AmSO4 and 100 mM NaCitrate pH 5.5.	分辨率 3.91 Å R-free 0.264
5W42 Crystal structure of human monoclonal antibody H3v-47 in complex with influenza virus hemagglutinin from A/Minnesota/11/2010 (H3N2) 提交 2017-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 H 138–245（108 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；10% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1M MES (pH 5.0)	分辨率 3.57 Å R-free 0.228
5XRQ Crystal structure of human monoclonal antibody H3v-47 提交 2017-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 138–245（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；20% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 6000, 0.1 M sodium citrate (pH 5.0)	分辨率 2.60 Å R-free 0.214
5XRQ Crystal structure of human monoclonal antibody H3v-47 提交 2017-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 138–245（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；20% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 6000, 0.1 M sodium citrate (pH 5.0)	分辨率 2.60 Å R-free 0.214
6DC3 RSV prefusion F bound to RSD5 Fab 提交 2018-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 132–245（114 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 13 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.8 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.205
6V8Z VRC03 and 10-1074 Bound BG505 F14 HIV-1 SOSIP Envelope Trimer Structure 提交 2019-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 D 138–245（108 aa）链 J 138–245（108 aa）链 P 138–245（108 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å

共 17 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6N089_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 116–225； UniProt 135–244 作者链 C； PDB构建体 116–225； UniProt 135–244 作者链 E； PDB构建体 116–225； UniProt 135–244 作者链 G； PDB构建体 116–225； UniProt 135–244 作者链 I； PDB构建体 116–225； UniProt 135–244 作者链 K； PDB构建体 116–225； UniProt 135–244

Antibody 27F3 light chain

Homo sapiens

UniProt Q6P5S8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 126–234 链 F； UniProt 126–234 链 J； UniProt 126–234	未记录	Antibody 27F3 heavy chain × 3 （Q6N089） Hemagglutinin × 3 （C3W5S1） Hemagglutinin × 3 （A0A023ZYH9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268
2	信息不足异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 126–234 链 H； UniProt 126–234 链 L； UniProt 126–234	未记录	Antibody 27F3 heavy chain × 3 （Q6N089） Hemagglutinin × 3 （C3W5S1） Hemagglutinin × 3 （A0A023ZYH9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5WKO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NXY HIV-1 gp120 Envelope Glycoprotein(S334A) Complexed with CD4 and Antibody 17b 提交 2006-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 22–234（213 aa）片段：ANTIGEN-BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 3 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；7.0 % PEG 8000, 7.5 % 1,6-Hexanediol, 100 mM Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.231
2NXZ HIV-1 gp120 Envelope Glycoprotein (T257S, S334A, S375W) Complexed with CD4 and Antibody 17b 提交 2006-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 22–234（213 aa）片段：ANTIGEN-BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；7.5% PEG 4000, 8.5% MPD, 100 mM Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.04 Å R-free 0.244
2NY0 HIV-1 gp120 Envelope Glycoprotein (M95W, W96C, T257S, V275C, S334A, S375W, A433M) Complexed with CD4 and Antibody 17b 提交 2006-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 22–234（213 aa）片段：ANTIGEN-BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；7.5% PEG 8000, 7.5% MPD, 100 mM Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.242
2NY1 HIV-1 gp120 Envelope Glycoprotein (I109C, T257S, S334A, S375W, Q428C) Complexed with CD4 and Antibody 17b 提交 2006-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 22–234（213 aa）片段：ANTIGEN-BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；7.5% PEG 8000, 7.5% MPD, 100 mM Na Citrate , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.99 Å R-free 0.250
2NY2 HIV-1 gp120 Envelope Glycoprotein (T123C, T257S, S334A, S375W, G431C) Complexed with CD4 and Antibody 17b 提交 2006-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 22–234（213 aa）片段：ANTIGEN-BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；7.2% PEG 8000, 7.8% MPD, 100 mM Na Citrate , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.223
2NY3 HIV-1 gp120 Envelope Glycoprotein (K231C, T257S, E267C, S334A, S375W) Complexed with CD4 and Antibody 17b 提交 2006-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 22–234（213 aa）片段：ANTIGEN-BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；8.5% PEG 4000, 8.5% MPD, 100 mM Na Citrate , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.243
2NY4 HIV-1 gp120 Envelope Glycoprotein (K231C, T257S, E268C, S334A, S375W) Complexed with CD4 and Antibody 17b 提交 2006-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 22–234（213 aa）片段：ANTIGEN-BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；7.0% PEG 8000, 8.0% MPD, 100 mM Na Citrate , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.241
2NY5 HIV-1 gp120 Envelope Glycoprotein (M95W, W96C, I109C, T257S, V275C, S334A, S375W, Q428C, A433M) Complexed with CD4 and Antibody 17b 提交 2006-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 22–234（213 aa）片段：ANTIGEN-BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；9.2% PEG 4000, 9.5% MPD, 100 mM Na Citrate , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.255
2NY6 HIV-1 gp120 Envelope Glycoprotein (M95W, W96C, I109C, T123C, T257S, V275C,S334A, S375W, Q428C, G431C) Complexed with CD4 and Antibody 17b 提交 2006-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 22–234（213 aa）片段：ANTIGEN-BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；8.3% PEG 8000, 7.4% MPD, 100 mM Na Citrate , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.276
6AL4 CRYSTAL STRUCTURE OF ANTI-CD19 ANTIBODY B43 FAB 提交 2017-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 127–236（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M NA PHOSPHATE DIBASIC	分辨率 2.45 Å R-free 0.236
6AL4 CRYSTAL STRUCTURE OF ANTI-CD19 ANTIBODY B43 FAB 提交 2017-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 127–236（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M NA PHOSPHATE DIBASIC	分辨率 2.45 Å R-free 0.236
6AL4 CRYSTAL STRUCTURE OF ANTI-CD19 ANTIBODY B43 FAB 提交 2017-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 127–236（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M NA PHOSPHATE DIBASIC	分辨率 2.45 Å R-free 0.236
6AL5 COMPLEX BETWEEN CD19 (N138Q MUTANT) AND B43 FAB 提交 2017-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 127–236（110 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES PH 7.5, 23% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.263
6UGS Crystal structure of the Fab fragment of PF06438179/GP1111 an infliximab biosimilar in a C-centered orthorhombic crystal form, Lot A 提交 2019-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 129–236（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；10 mg/mL PF06438179 Fab lot A against 19.5% PEG 10000, 0.1 M HEPES pH 7.8, supplemented with 20% ethylene glycol as cryoprotectant, crystal tracking ID 267659h4, unique puck ID lqb9-8	分辨率 1.95 Å R-free 0.198
6UGS Crystal structure of the Fab fragment of PF06438179/GP1111 an infliximab biosimilar in a C-centered orthorhombic crystal form, Lot A 提交 2019-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 129–236（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；10 mg/mL PF06438179 Fab lot A against 19.5% PEG 10000, 0.1 M HEPES pH 7.8, supplemented with 20% ethylene glycol as cryoprotectant, crystal tracking ID 267659h4, unique puck ID lqb9-8	分辨率 1.95 Å R-free 0.198
6UGT Crystal structure of the Fab fragment of PF06438179/GP1111 an infliximab biosimilar in a I-centered orthorhombic crystal form, Lot A 提交 2019-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 129–236（108 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；10 mg/mL PF06438179 Fab lot A against 2.16 M sodium malonate, 4% v/v t-butanol, crystal tracking ID 267662h2, unique puck ID sdw5-8	分辨率 2.15 Å R-free 0.228
6UGT Crystal structure of the Fab fragment of PF06438179/GP1111 an infliximab biosimilar in a I-centered orthorhombic crystal form, Lot A 提交 2019-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 129–236（108 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；10 mg/mL PF06438179 Fab lot A against 2.16 M sodium malonate, 4% v/v t-butanol, crystal tracking ID 267662h2, unique puck ID sdw5-8	分辨率 2.15 Å R-free 0.228
6UGU Crystal structure of the Fab fragment of anti-TNFa antibody infliximab (Remicade) in a C-centered orthorhombic crystal form, Lot C 提交 2019-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 129–236（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；10 mg/mL PF06438179 Fab lot C against Wiz 34 screen condition B4 (20% PEG3350, 0.2 M potassium citrate tribasic), supplemented with 20% ethylene glycol as cryoprotectant, crystal tracking ID 267668b4, unique puck ID sdw5-4	分辨率 2.20 Å R-free 0.218
6UGU Crystal structure of the Fab fragment of anti-TNFa antibody infliximab (Remicade) in a C-centered orthorhombic crystal form, Lot C 提交 2019-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 129–236（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；10 mg/mL PF06438179 Fab lot C against Wiz 34 screen condition B4 (20% PEG3350, 0.2 M potassium citrate tribasic), supplemented with 20% ethylene glycol as cryoprotectant, crystal tracking ID 267668b4, unique puck ID sdw5-4	分辨率 2.20 Å R-free 0.218
6UGV Crystal structure of the Fab fragment of anti-TNFa antibody infliximab (Remicade) in a I-centered orthorhombic crystal form, Lot C 提交 2019-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 129–236（108 aa）	未记录	MRY MESO-ERYTHRITOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；10 mg/mL PF06438179 Fab lot A against 2.16 M sodium malonate, 4% pentaerythritol ethoxylate, crystal tracking ID 267670e4, unique puck ID sar8-9	分辨率 2.40 Å R-free 0.210
6UGV Crystal structure of the Fab fragment of anti-TNFa antibody infliximab (Remicade) in a I-centered orthorhombic crystal form, Lot C 提交 2019-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 129–236（108 aa）	未记录	MRY MESO-ERYTHRITOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；10 mg/mL PF06438179 Fab lot A against 2.16 M sodium malonate, 4% pentaerythritol ethoxylate, crystal tracking ID 267670e4, unique puck ID sar8-9	分辨率 2.40 Å R-free 0.210
6V8Z VRC03 and 10-1074 Bound BG505 F14 HIV-1 SOSIP Envelope Trimer Structure 提交 2019-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 F 130–235（106 aa）链 L 130–235（106 aa）链 R 130–235（106 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å

共 16 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6P5S8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 105–213； UniProt 126–234 作者链 D； PDB构建体 105–213； UniProt 126–234 作者链 F； PDB构建体 105–213； UniProt 126–234 作者链 H； PDB构建体 105–213； UniProt 126–234 作者链 J； PDB构建体 105–213； UniProt 126–234 作者链 L； PDB构建体 105–213； UniProt 126–234

Antibody 27F3 light chain

Homo sapiens

UniProt Q9UL78

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–104 链 F； UniProt 1–104 链 J； UniProt 1–104	未记录	Antibody 27F3 heavy chain × 3 （Q6N089） Hemagglutinin × 3 （C3W5S1） Hemagglutinin × 3 （A0A023ZYH9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268
2	信息不足异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–104 链 H； UniProt 1–104 链 L； UniProt 1–104	未记录	Antibody 27F3 heavy chain × 3 （Q6N089） Hemagglutinin × 3 （C3W5S1） Hemagglutinin × 3 （A0A023ZYH9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9UL78_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104 作者链 D； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104 作者链 F； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104 作者链 H； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104 作者链 J； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104 作者链 L； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104

Hemagglutinin

Influenza A virus

UniProt C3W5S1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 18–344 链 N； UniProt 18–344 链 O； UniProt 18–344	未记录	Antibody 27F3 heavy chain × 3 （Q6N089） Antibody 27F3 light chain × 3 （Q9UL78,Q6P5S8） Hemagglutinin × 3 （A0A023ZYH9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268
2	信息不足异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 S； UniProt 18–344 链 T； UniProt 18–344 链 U； UniProt 18–344	未记录	Antibody 27F3 heavy chain × 3 （Q6N089） Antibody 27F3 light chain × 3 （Q9UL78,Q6P5S8） Hemagglutinin × 3 （A0A023ZYH9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5WKO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
24KR Structural basis of influenza A virus neutralization by broadly active single-domain antibody G2.3 recognizing glycosylated epitope within hemagglutinin stem 提交 2026-03-08	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–518（518 aa）链 B 1–518（518 aa）链 C 1–518（518 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.53 Å
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 B 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 D 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 F 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 H 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 J 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 L 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3LZG Crystal structure of a 2009 H1N1 influenza virus hemagglutinin 提交 2010-03-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 B 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 C 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 D 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 E 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 F 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.60 Å R-free 0.252
3LZG Crystal structure of a 2009 H1N1 influenza virus hemagglutinin 提交 2010-03-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 H 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 I 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 J 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 K 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 L 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.60 Å R-free 0.252
3UBE Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand LSTc 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 B 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 C 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 D 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 E 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 F 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.15 Å R-free 0.252
3UBE Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand LSTc 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 H 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 I 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 J 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 K 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 L 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.15 Å R-free 0.252
3UBJ Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand LSTa 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 B 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 C 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 D 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 E 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 F 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.25 Å R-free 0.252
3UBJ Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand LSTa 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 H 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 I 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 J 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 K 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 L 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.25 Å R-free 0.252
3UBN Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand 6SLN 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 B 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 C 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 D 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 E 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 F 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.51 Å R-free 0.253
3UBN Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand 6SLN 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 H 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 I 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 J 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 K 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 L 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.51 Å R-free 0.253
3UBQ Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand 3SLN 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 B 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 C 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 D 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 E 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 F 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.00 Å R-free 0.249
3UBQ Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand 3SLN 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 H 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 I 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 J 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 K 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 L 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.00 Å R-free 0.249
3UYW Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	未记录	TAU 2-AMINOETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
3UYW Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
3UYW Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	未记录	TAU 2-AMINOETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
3UYW Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
3UYX Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	突变：D228G	NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；20% PEG 3350, 0.2M ammonium nitrate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.201
3UYX Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	突变：D228G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；20% PEG 3350, 0.2M ammonium nitrate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.201
3ZTN STRUCTURE OF INFLUENZA A NEUTRALIZING ANTIBODY SELECTED FROM CULTURES OF SINGLE HUMAN PLASMA CELLS IN COMPLEX WITH HUMAN H1 INFLUENZA HAEMAGGLUTININ. 提交 2011-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 18–344（327 aa）片段：HA1, RESIDUES 18-344 链 B 345–520（176 aa）片段：HA2, RESIDUES 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SO4 SULFATE ION × 15 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
4JTV Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin complexed with human receptor analogue LSTc 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 B 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506 链 C 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 D 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506 链 E 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 F 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.275
4JTV Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin complexed with human receptor analogue LSTc 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 H 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506 链 I 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 J 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506 链 K 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 L 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.275
4JTX Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin mutant D225E 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 B 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510 链 C 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 D 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510 链 E 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 F 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510	突变：D228E 突变：D228E 突变：D228E	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.243
4JTX Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin mutant D225E 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 H 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510 链 I 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 J 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510 链 K 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 L 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510	突变：D228E 突变：D228E 突变：D228E	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.243
4JU0 Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin mutant D225E complexed with human receptor analogue LSTc 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 B 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508 链 C 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 D 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508 链 E 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 F 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508	突变：D228E 突变：D228E 突变：D228E	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.91 Å R-free 0.283
4JU0 Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin mutant D225E complexed with human receptor analogue LSTc 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 H 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508 链 I 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 J 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508 链 K 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 L 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508	突变：D228E 突变：D228E 突变：D228E	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.91 Å R-free 0.283
4M4Y Crystal structure of a 2009 H1N1 influenza virus hemagglutinin with a stabilization mutation HA2 E47G 提交 2013-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：ectodomain (residues 18-344) 链 B 345–518（174 aa）片段：ectodomain (residues 345-518) 链 C 18–344（327 aa）片段：ectodomain (residues 18-344) 链 D 345–518（174 aa）片段：ectodomain (residues 345-518) 链 E 18–344（327 aa）片段：ectodomain (residues 18-344) 链 F 345–518（174 aa）片段：ectodomain (residues 345-518)	突变：E47G 突变：E47G 突变：E47G	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295 K；0.1 M Tris, pH 8.8, 25% w/v MPEG2000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.20 Å R-free 0.232
5GJS Crystal structure of H1 hemagglutinin from A/California/04/2009 in complex with a neutralizing antibody 3E1 提交 2016-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 B 345–520（176 aa）片段：neutralizing antibody 3E1	突变：G212C, R227C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES and 16% PEG 550MME	分辨率 2.90 Å R-free 0.303
5K9O Crystal structure of multidonor HV1-18+HD3-9 class broadly neutralizing Influenza A antibody 31.b.09 in complex with Hemagglutinin H1 A/California/04/2009 提交 2016-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 F 18–520（503 aa）链 I 18–520（503 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M imidazole, pH 6.5, 0.1M MgCl2, 1.75M NaCl, and 15% PEG-3350	分辨率 3.39 Å R-free 0.346
7FAH Immune complex of head region of CA09 HA and neutralizing antibody 12H5 提交 2021-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 18–518（501 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M MES pH 6.5, 13% (w/v) PEG 2000	分辨率 3.15 Å R-free 0.289
7FAH Immune complex of head region of CA09 HA and neutralizing antibody 12H5 提交 2021-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 18–518（501 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M MES pH 6.5, 13% (w/v) PEG 2000	分辨率 3.15 Å R-free 0.289
7MEM CryoEM structure of monoclonal Fab 045-09 2B05 binding the lateral patch of influenza virus H1 HA 提交 2021-04-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 345–518（174 aa）链 B 345–518（174 aa）链 C 18–344（327 aa）链 D 345–518（174 aa）链 E 18–344（327 aa）链 F 18–344（327 aa）	突变：E47G 突变：E47G 突变：E47G	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；TBS + LMNG cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7T3D CryoEM map of anchor 222-1C06 Fab and lateral patch 2B05 Fab binding H1 HA 提交 2021-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 18–344（327 aa）链 B 345–518（174 aa）链 E 18–344（327 aa）链 F 18–344（327 aa）链 G 345–518（174 aa）链 I 345–518（174 aa）	突变：E47K 突变：E47K 突变：E47K	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Tris-buffered saline cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
8TXM Crystal structure of 05.GC.w13.02 Fab in complex with H1 HA from A/California/04/2009(H1N1) 提交 2023-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 18–341（324 aa）片段：HA1 subdomain (UNP residues 18-344)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate, pH 6.2, 20% PEG3350	分辨率 3.25 Å R-free 0.287
8TXP Crystal structure of 05.GC.w13.01 Fab in complex with H1 HA from A/California/04/2009(H1N1) 提交 2023-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 18–344（327 aa）片段：HA1 subdomain (UNP residues 18-344)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate, pH 6.2, 20% PEG3350	分辨率 2.75 Å R-free 0.292

共 21 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C3W5S1_I09A0
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 5–331； UniProt 18–344 作者链 N； PDB构建体 5–331； UniProt 18–344 作者链 O； PDB构建体 5–331； UniProt 18–344 作者链 S； PDB构建体 5–331； UniProt 18–344 作者链 T； PDB构建体 5–331； UniProt 18–344 作者链 U； PDB构建体 5–331； UniProt 18–344

Hemagglutinin

Influenza A virus

UniProt A0A023ZYH9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 345–518 链 Q； UniProt 345–518 链 R； UniProt 345–518	未记录	Antibody 27F3 heavy chain × 3 （Q6N089） Antibody 27F3 light chain × 3 （Q9UL78,Q6P5S8） Hemagglutinin × 3 （C3W5S1）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268
2	信息不足异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 V； UniProt 345–518 链 W； UniProt 345–518 链 X； UniProt 345–518	未记录	Antibody 27F3 heavy chain × 3 （Q6N089） Antibody 27F3 light chain × 3 （Q9UL78,Q6P5S8） Hemagglutinin × 3 （C3W5S1）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A023ZYH9_9INFA
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–174； UniProt 345–518 作者链 Q； PDB构建体 1–174； UniProt 345–518 作者链 R； PDB构建体 1–174； UniProt 345–518 作者链 V； PDB构建体 1–174； UniProt 345–518 作者链 W； PDB构建体 1–174； UniProt 345–518 作者链 X； PDB构建体 1–174； UniProt 345–518

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5wko
沉积日期 deposition_date	2017-07-25
结构标题 title	Crystal structure of antibody 27F3 recognizing the HA from A/California/04/2009 (H1N1) influenza virus
关键词 keywords	27F3 H1 HA A/California/04/2009, ANTIVIRAL PROTEIN; ANTIVIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	83.36 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	83.36 Å
零角强度 I(0) i0	5349720000.00
分子量 molecular_weight	614890.0 kDa
排除体积 excluded_volume	766310 Å³
包络体积 envelope_volume	1315200 Å³
水化壳体积 shell_volume	134830 Å³
包络直径 envelope_diameter	274.6 Å
壳层 Rg shell_rg	76.09 Å
包络 Rg envelope_rg	80.15 Å
形状 Rg shape_rg	83.34 Å
总 Rg total_rg	83.34 Å
总原子数 total_atoms	43322
残基数 n_residues	5494
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	276.9 Å
Rg (实空间) rg_real	87.30 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.58 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.3500e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0640e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	81.72 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	5324000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8849
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	87.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.406
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.514
角度范围 angular_range	— – 0.0950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	1.6680
最高正则化参数 α highest_alpha	139900000.0000
实空间数据点数 n_real_points	20
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.965; Stabil: 0.881; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.986; Smooth: 0.014

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Antibody 27F3 heavy chain
分子量 formula_weight	23817.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K
原子数 atom_count	43322

QVQLVQSGAEVKKPGSSVQVSCRASGGTFGNYAINWVRQAPGQGLEWMGGISPIFGPPKYAQKFQGRVTISADISSSTAYMDLSSLSSDDTAVYYCARKLEPPYYFYSYMDVWGKGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Antibody 27F3 light chain
分子量 formula_weight	23140.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L

EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVSSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYGASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTITRLEPEDFAVYYCQQYVSTPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Hemagglutinin
分子量 formula_weight	36729.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,N,O,S,T,U

ADPGDTLCIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVTHSVNLLEDKHNGKLCKLRGVAPLHLGKCNIAGWILGNPECESLSTASSWSYIVETPSSDNGTCYPGDFIDYEELREQLSSVSSFERFEIFPKTSSWPNHDSNKGVTAACPHAGAKSFYKNLIWLVKKGNSYPKLSKSYINDKGKEVLVLWGIHHPSTSADQQSLYQNADTYVFVGSSRYSKKFKPEIAIRPKVRDQEGRMNYYWTLVEPGDKITFEATGNLVVPRYAFAMERNAGSGIIISDTPVHDCNTTCQTPKGAINTSLPFQNIHPITIGKCPKYVKSTKLRLATGLRNIPSIQSR

来源 Source

来源生物 organism	Influenza A virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	641501
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Hemagglutinin
分子量 formula_weight	20206.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q,R,V,W,X

GLFGAIAGFIEGGWTGMVDGWYGYHHQNEQGSGYAADLKSTQNAIDGITNKVNSVIEKMNTQFTAVGKEFNHLEKRIENLNKKVDDGFLDIWTYNAELLVLLENERTLDYHDSNVKNLYEKVRSQLKNNAKEIGNGCFEFYHKCDNTCMESVKNGTYDYPKYSEEAKLNREEIDSGR

来源 Source

来源生物 organism	Influenza A virus
通用名 common_name	A/Uganda/MUWRP-176/2010(H1N1)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1487164
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

CATH v4.4 (36 domains)

结构域编号 domain_id	5wkoA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoF01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoF02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoG02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoH02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoI02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoJ01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoJ02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoK02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoL02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	5wkoM01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2

结构域编号 domain_id	5wkoM02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain

结构域编号 domain_id	5wkoN01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2

结构域编号 domain_id	5wkoN02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain

结构域编号 domain_id	5wkoO01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2

结构域编号 domain_id	5wkoO02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain

结构域编号 domain_id	5wkoP01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	5wkoQ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	5wkoR01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	5wkoS01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2

结构域编号 domain_id	5wkoS02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain

结构域编号 domain_id	5wkoT01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2

结构域编号 domain_id	5wkoT02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain

结构域编号 domain_id	5wkoU01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2

结构域编号 domain_id	5wkoU02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain

结构域编号 domain_id	5wkoV01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	5wkoW01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	5wkoX01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	190.580 Å
晶胞边长 b length_b	191.486 Å
晶胞边长 c length_c	391.050 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	17
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.492 Å
最低分辨率 resolution_low	49.451 Å
R 因子 r_factor	0.2473
R_work r_work	0.2462
R_free r_free	0.2683

fit	/app/data/saxs_computation/wk/5wko/5wko.fit
pddf	/app/data/pr_computation/wk/5wko/5wko.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/wk/5wko/5wko.dat

Crystal structure of antibody 27F3 recognizing the HA from A/California/04/2009 (H1N1) influenza virus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Antibody 27F3 heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Antibody 27F3 light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Antibody 27F3 light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Hemagglutinin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Hemagglutinin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

CATH v4.4 (36 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)