5wko

Crystal structure of antibody 27F3 recognizing the HA from A/California/04/2009 (H1N1) influenza virus

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Antibody 27F3 heavy chain

Homo sapiens

UniProt Q6N089

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Antibody 27F3 light chain × 3 (Q6P5S8,Q9UL78) Hemagglutinin × 3 (C3W5S1) Hemagglutinin × 3 (A0A023ZYH9) 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Antibody 27F3 light chain × 3 (Q6P5S8,Q9UL78) Hemagglutinin × 3 (C3W5S1) Hemagglutinin × 3 (A0A023ZYH9) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6N089_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 116–225; UniProt 135–244 作者链 C; PDB构建体 116–225; UniProt 135–244 作者链 E; PDB构建体 116–225; UniProt 135–244 作者链 G; PDB构建体 116–225; UniProt 135–244 作者链 I; PDB构建体 116–225; UniProt 135–244 作者链 K; PDB构建体 116–225; UniProt 135–244

Antibody 27F3 light chain

Homo sapiens

UniProt Q6P5S8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Antibody 27F3 heavy chain × 3 (Q6N089) Hemagglutinin × 3 (C3W5S1) Hemagglutinin × 3 (A0A023ZYH9) 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Antibody 27F3 heavy chain × 3 (Q6N089) Hemagglutinin × 3 (C3W5S1) Hemagglutinin × 3 (A0A023ZYH9) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6P5S8_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 105–213; UniProt 126–234 作者链 D; PDB构建体 105–213; UniProt 126–234 作者链 F; PDB构建体 105–213; UniProt 126–234 作者链 H; PDB构建体 105–213; UniProt 126–234 作者链 J; PDB构建体 105–213; UniProt 126–234 作者链 L; PDB构建体 105–213; UniProt 126–234

Antibody 27F3 light chain

Homo sapiens

UniProt Q9UL78

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Antibody 27F3 heavy chain × 3 (Q6N089) Hemagglutinin × 3 (C3W5S1) Hemagglutinin × 3 (A0A023ZYH9) 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Antibody 27F3 heavy chain × 3 (Q6N089) Hemagglutinin × 3 (C3W5S1) Hemagglutinin × 3 (A0A023ZYH9) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9UL78_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 作者链 D; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 作者链 F; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 作者链 H; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 作者链 J; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 作者链 L; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104

Hemagglutinin

Influenza A virus

UniProt C3W5S1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Antibody 27F3 heavy chain × 3 (Q6N089) Antibody 27F3 light chain × 3 (Q6P5S8,Q9UL78) Hemagglutinin × 3 (A0A023ZYH9) 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Antibody 27F3 heavy chain × 3 (Q6N089) Antibody 27F3 light chain × 3 (Q6P5S8,Q9UL78) Hemagglutinin × 3 (A0A023ZYH9) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C3W5S1_I09A0
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 5–331; UniProt 18–344 作者链 N; PDB构建体 5–331; UniProt 18–344 作者链 O; PDB构建体 5–331; UniProt 18–344 作者链 S; PDB构建体 5–331; UniProt 18–344 作者链 T; PDB构建体 5–331; UniProt 18–344 作者链 U; PDB构建体 5–331; UniProt 18–344

Hemagglutinin

Influenza A virus

UniProt A0A023ZYH9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Antibody 27F3 heavy chain × 3 (Q6N089) Antibody 27F3 light chain × 3 (Q6P5S8,Q9UL78) Hemagglutinin × 3 (C3W5S1) 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Antibody 27F3 heavy chain × 3 (Q6N089) Antibody 27F3 light chain × 3 (Q6P5S8,Q9UL78) Hemagglutinin × 3 (C3W5S1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A023ZYH9_9INFA
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–174; UniProt 345–518 作者链 Q; PDB构建体 1–174; UniProt 345–518 作者链 R; PDB构建体 1–174; UniProt 345–518 作者链 V; PDB构建体 1–174; UniProt 345–518 作者链 W; PDB构建体 1–174; UniProt 345–518 作者链 X; PDB构建体 1–174; UniProt 345–518

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5wko
沉积日期 deposition_date2017-07-25
结构标题 titleCrystal structure of antibody 27F3 recognizing the HA from A/California/04/2009 (H1N1) influenza virus
关键词 keywords27F3 H1 HA A/California/04/2009, ANTIVIRAL PROTEIN; ANTIVIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5wko__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5wko__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5wko__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)53.27 Å
Rg(电子密度)52.91 Å
总 Rg53.02 Å
原子数21661
残基数2804
排除体积383150 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5wko__assembly_1__model_1 dodecameric (12) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5wko__assembly_2__model_1 dodecameric (12) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

CATH v4.4 (36 domains)

结构域编号 domain_id5wkoA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoD01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoE02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoF01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoF02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoG02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoH01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoH02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoI02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoJ01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoJ02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoK02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoL01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoL02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5wkoM01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2
结构域编号 domain_id5wkoM02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain
结构域编号 domain_id5wkoN01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2
结构域编号 domain_id5wkoN02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain
结构域编号 domain_id5wkoO01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2
结构域编号 domain_id5wkoO02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain
结构域编号 domain_id5wkoP01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id5wkoQ01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id5wkoR01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id5wkoS01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2
结构域编号 domain_id5wkoS02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain
结构域编号 domain_id5wkoT01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2
结构域编号 domain_id5wkoT02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain
结构域编号 domain_id5wkoU01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2
结构域编号 domain_id5wkoU02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain
结构域编号 domain_id5wkoV01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id5wkoW01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id5wkoX01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
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7. 引用文献 (1)