5wnf

X-RAY CO-STRUCTURE OF RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE (ROCK1) WITH A HIGHLY SELECTIVE INHIBITOR

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 163.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Rho-associated protein kinase 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 6–415 链 B； UniProt 6–415	片段：UNP residues 6-415	B4V 1-(4-amino-1,2,5-oxadiazol-3-yl)-5-methyl-N-({3-[(5-methyl-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl)carbamoyl]phenyl}methyl)-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 MM CACL2, PH 6.0	分辨率 2.45 Å R-free 0.247
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 6–415 链 D； UniProt 6–415	片段：UNP residues 6-415	B4V 1-(4-amino-1,2,5-oxadiazol-3-yl)-5-methyl-N-({3-[(5-methyl-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl)carbamoyl]phenyl}methyl)-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 MM CACL2, PH 6.0	分辨率 2.45 Å R-free 0.247

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5WNF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1S1C Crystal structure of the complex between the human RhoA and Rho-binding domain of human ROCKI 提交 2004-01-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 X 946–1015（70 aa）片段：Rho-binding domain of ROCKI, residues 947-1015 链 Y 946–1015（70 aa）片段：Rho-binding domain of ROCKI, residues 947-1015	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；TRIS, PEG 3350, isopropyl alcohol, pH 7.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.257
2ESM Crystal Structure of ROCK 1 bound to fasudil 提交 2005-10-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain, residue 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain, residue 6-415	未记录	M77 5-(1,4-DIAZEPAN-1-SULFONYL)ISOQUINOLINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；298 K；0.45mM protein, 5% PEG3350, 100mM MES, 50mM CaCl2, 10mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 5.50	分辨率 3.20 Å R-free 0.269
2ETK Crystal Structure of ROCK 1 bound to hydroxyfasudil 提交 2005-10-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：N-terminal and kinase domain, residues 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：N-terminal and kinase domain, residues 6-415	未记录	HFS 1-(1-HYDROXY-5-ISOQUINOLINESULFONYL)HOMOPIPERAZINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；4.5% PEG3350, 100mM Mes, pH 5.5, 50mM CaCl2, 10mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.96 Å R-free 0.298
2ETR Crystal Structure of ROCK I bound to Y-27632 提交 2005-10-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：N-terminal and kinase domain, residues 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：N-terminal and kinase domain, residues 6-415	未记录	Y27 (R)-TRANS-4-(1-AMINOETHYL)-N-(4-PYRIDYL) CYCLOHEXANECARBOXAMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；4.5% PEG3350, 100mM MES, pH 5.5, 50mM CaCl2, 10mM DTT, 0.45 mM protein, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.266
2V55 Mechanism of multi-site phosphorylation from a ROCK-I:RhoE complex structure 提交 2008-10-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–406（406 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-406	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.6 - 1 M NA/K TARTRATE, 0.1 M MES [PH 5-6], 0.2 M LISO4	分辨率 3.71 Å R-free 0.269
2V55 Mechanism of multi-site phosphorylation from a ROCK-I:RhoE complex structure 提交 2008-10-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–406（406 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-406	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.6 - 1 M NA/K TARTRATE, 0.1 M MES [PH 5-6], 0.2 M LISO4	分辨率 3.71 Å R-free 0.269
3D9V CRYSTAL STRUCTURE OF ROCK I BOUND TO H-1152P A DI-METHYLATED VARIANT OF FASUDIL 提交 2008-05-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：N-terminal and kinase domain, residues 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：N-terminal and kinase domain, residues 6-415	未记录	H52 (S)-2-METHYL-1-[(4-METHYL-5-ISOQUINOLINE)SULFONYL]-HOMOPIPERAZINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；4.5% PEG3350, 100mM MES, PH 5.5,0.45mM PROTEIN, 50mM CACL2, 10mM DTT, pH 5.50, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.280
3NCZ X-Ray Co-structure of Rho-Associated Protein Kinase (ROCK1) with a potent 2H-isoquinolin-1-one inhibitor 提交 2010-06-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：N-TERMINAL AND KINASE DOMAIN, RESIDUES 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：N-TERMINAL AND KINASE DOMAIN, RESIDUES 6-415	未记录	3NC cis-4-amino-N-(7-chloro-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-6-yl)cyclohexanecarboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 mM CaCl2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.328
3NCZ X-Ray Co-structure of Rho-Associated Protein Kinase (ROCK1) with a potent 2H-isoquinolin-1-one inhibitor 提交 2010-06-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–415（410 aa）片段：N-TERMINAL AND KINASE DOMAIN, RESIDUES 6-415 链 D 6–415（410 aa）片段：N-TERMINAL AND KINASE DOMAIN, RESIDUES 6-415	未记录	3NC cis-4-amino-N-(7-chloro-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-6-yl)cyclohexanecarboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 mM CaCl2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.328
3NDM Crystal structure of Rho-Associated Protein Kinase (ROCK1) with a potent isoquinolone derivative 提交 2010-06-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：N-TERMINAL AND KINASE DOMAIN, RESIDUES 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：N-TERMINAL AND KINASE DOMAIN, RESIDUES 6-415	未记录	3ND (3S,4R)-N-(7-chloro-1-oxo-1,4-dihydroisoquinolin-6-yl)-4-(4-chlorophenyl)pyrrolidine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 mM CaCl2, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.310
3NDM Crystal structure of Rho-Associated Protein Kinase (ROCK1) with a potent isoquinolone derivative 提交 2010-06-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–415（410 aa）片段：N-TERMINAL AND KINASE DOMAIN, RESIDUES 6-415 链 D 6–415（410 aa）片段：N-TERMINAL AND KINASE DOMAIN, RESIDUES 6-415	未记录	3ND (3S,4R)-N-(7-chloro-1-oxo-1,4-dihydroisoquinolin-6-yl)-4-(4-chlorophenyl)pyrrolidine-3-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 mM CaCl2, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.310
3O0Z Crystal structure of a coiled-coil domain from human ROCK I 提交 2010-07-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 535–700（166 aa）片段：coiled-coil domain (unp residues 535-700) 链 B 535–700（166 aa）片段：coiled-coil domain (unp residues 535-700)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；13% MPD, 100 mM NaCl, 100 mM sodium acetate, 10 mM DTT, 5% glycerol, 10 mM spermidine, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.33 Å R-free 0.286
3O0Z Crystal structure of a coiled-coil domain from human ROCK I 提交 2010-07-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 535–700（166 aa）片段：coiled-coil domain (unp residues 535-700) 链 D 535–700（166 aa）片段：coiled-coil domain (unp residues 535-700)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；13% MPD, 100 mM NaCl, 100 mM sodium acetate, 10 mM DTT, 5% glycerol, 10 mM spermidine, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.33 Å R-free 0.286
3TV7 Human Rho-associated protein kinase 1 (ROCK 1) in COMPLEX WITH RKI1342 提交 2011-09-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain, residue 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain, residue 6-415	未记录	07Q 1-[(1R)-1-(3-methoxyphenyl)ethyl]-3-(4-pyridin-4-yl-1,3-thiazol-2-yl)urea × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；292 K；10 mg/ml ROCK1, 75 mm hepes pH 7.4, 2.5 % tacsimate ph 7.4, 5 % PEG 5000 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.75 Å R-free 0.253
3TV7 Human Rho-associated protein kinase 1 (ROCK 1) in COMPLEX WITH RKI1342 提交 2011-09-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain, residue 6-415 链 D 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain, residue 6-415	未记录	07Q 1-[(1R)-1-(3-methoxyphenyl)ethyl]-3-(4-pyridin-4-yl-1,3-thiazol-2-yl)urea × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；292 K；10 mg/ml ROCK1, 75 mm hepes pH 7.4, 2.5 % tacsimate ph 7.4, 5 % PEG 5000 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.75 Å R-free 0.253
3TWJ Rho-associated protein kinase 1 (ROCK 1) IN COMPLEX WITH RKI1447 提交 2011-09-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain, residue 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain, residue 6-415	未记录	07R 1-[(3-hydroxyphenyl)methyl]-3-(4-pyridin-4-yl-1,3-thiazol-2-yl)urea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；291 K；10 MG/ML ROCK1, 75 MM hepes ph 7.4, 2.5 % tacsimate pH 7.4, 5 % PEG 5000 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.289
3TWJ Rho-associated protein kinase 1 (ROCK 1) IN COMPLEX WITH RKI1447 提交 2011-09-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain, residue 6-415 链 D 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain, residue 6-415	未记录	07R 1-[(3-hydroxyphenyl)methyl]-3-(4-pyridin-4-yl-1,3-thiazol-2-yl)urea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；291 K；10 MG/ML ROCK1, 75 MM hepes ph 7.4, 2.5 % tacsimate pH 7.4, 5 % PEG 5000 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.289
3V8S Human RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE 1 (ROCK 1) IN COMPLEX WITH INDAZOLE DERIVATIVE (COMPOUND 18) 提交 2011-12-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：RESIDUE 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：RESIDUE 6-415	未记录	0HD 1-(1H-indazol-5-yl)-3-(2-phenylethyl)urea × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；10 MG/ML ROCK1, 25 MM HEPES PH 7.4, 50 MM MES PH 6.5, 2.5% TACSIMATE PH 7.0, 5% PEG 5000 MME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K	分辨率 2.29 Å R-free 0.236
3V8S Human RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE 1 (ROCK 1) IN COMPLEX WITH INDAZOLE DERIVATIVE (COMPOUND 18) 提交 2011-12-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–415（410 aa）片段：RESIDUE 6-415 链 D 6–415（410 aa）片段：RESIDUE 6-415	未记录	0HD 1-(1H-indazol-5-yl)-3-(2-phenylethyl)urea × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；10 MG/ML ROCK1, 25 MM HEPES PH 7.4, 50 MM MES PH 6.5, 2.5% TACSIMATE PH 7.0, 5% PEG 5000 MME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K	分辨率 2.29 Å R-free 0.236
4L2W Crystal structure of the Shroom-Binding domain of human Rock1 提交 2013-06-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 834–914（81 aa）片段：Shroom binding Domain (UNP residues 834-914) 链 D 834–914（81 aa）片段：Shroom binding Domain (UNP residues 834-914)	突变：E884A, K885A, E886A 突变：E884A, K885A, E886A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；277 K；0.1M Citrate, 1.0M Ammonium Sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.49 Å R-free 0.276
4L2W Crystal structure of the Shroom-Binding domain of human Rock1 提交 2013-06-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 834–914（81 aa）片段：Shroom binding Domain (UNP residues 834-914) 链 B 834–914（81 aa）片段：Shroom binding Domain (UNP residues 834-914)	突变：E884A, K885A, E886A 突变：E884A, K885A, E886A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；277 K；0.1M Citrate, 1.0M Ammonium Sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.49 Å R-free 0.276
4W7P Crystal Structure of ROCK 1 bound to YB-15-QD37 提交 2014-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–410（409 aa）链 B 2–410（409 aa）	未记录	3J7 N~1~-[2-(1H-indazol-5-yl)pyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-2-methylpropane-1,2-diamine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MES PH 5.5, 50 mM CACL2, 7% PEG 3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.246
4W7P Crystal Structure of ROCK 1 bound to YB-15-QD37 提交 2014-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–410（409 aa）链 D 2–410（409 aa）	未记录	3J7 N~1~-[2-(1H-indazol-5-yl)pyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-2-methylpropane-1,2-diamine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MES PH 5.5, 50 mM CACL2, 7% PEG 3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.246
4W7P Crystal Structure of ROCK 1 bound to YB-15-QD37 提交 2014-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–410（409 aa）链 B 2–410（409 aa）链 C 2–410（409 aa）链 D 2–410（409 aa）	未记录	3J7 N~1~-[2-(1H-indazol-5-yl)pyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-2-methylpropane-1,2-diamine × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MES PH 5.5, 50 mM CACL2, 7% PEG 3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.246
4YVC ROCK 1 bound to thiazole inhibitor 提交 2015-03-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain (UNP residues 6-415) 链 B 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain (UNP residues 6-415)	未记录	4KH 2-fluoro-N-[4-(pyridin-4-yl)-1,3-thiazol-2-yl]benzamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.45 mM protein, 5% PEG3350, 100 mM MES, 50 mM calcium chloride, 10 mM DTT	分辨率 3.20 Å R-free 0.221
4YVE ROCK 1 bound to methoxyphenyl thiazole inhibitor 提交 2015-03-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain (UNP residues 6-415) 链 B 6–415（410 aa）片段：N-terminal kinase domain (UNP residues 6-415)	未记录	4KK 2-(3-methoxyphenyl)-N-[4-(pyridin-4-yl)-1,3-thiazol-2-yl]acetamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.45 mM protein, 5% PEG3350, 100 mM MES, 50 mM calcium chloride, 10 mM DTT	分辨率 3.40 Å R-free 0.244
5BML ROCK 1 bound to a pyridine thiazole inhibitor 提交 2015-05-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）链 B 6–415（410 aa）	未记录	4TW N-[4-(2-fluoropyridin-4-yl)thiophen-2-yl]-2-{3-[(methylsulfonyl)amino]phenyl}acetamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；4.5% PEG3350, 100mM MES, pH 5.5, 50mM CaCl2, 10mM DTT, 0.45 mM protein, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.95 Å R-free 0.235
5F5P Molecular Basis for Shroom2 Recognition by Rock1 提交 2015-12-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 834–913（80 aa）链 D 834–913（80 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 200 mM Magnesium Chloride, 100 mM Tris pH 8.5	分辨率 3.57 Å R-free 0.287
5F5P Molecular Basis for Shroom2 Recognition by Rock1 提交 2015-12-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 834–913（80 aa）链 F 834–913（80 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 200 mM Magnesium Chloride, 100 mM Tris pH 8.5	分辨率 3.57 Å R-free 0.287
5HVU Rho-associated protein kinase 1 (ROCK 1) in complex with a pyridine thiazole piperidine inhibitor 提交 2016-01-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）链 B 6–415（410 aa）	未记录	65R 2-{3-[3-(piperidin-4-yl)propoxy]phenyl}-N-[4-(pyridin-4-yl)-1,3-thiazol-2-yl]acetamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；4.5% PEG3350, 100mM MES, pH 5.5, 50mM CaCl2, 10mM DTT, 0.45 mM protein, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.248
5KKS ROCK 1 bound to azaindole thiazole inhibitor 提交 2016-06-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）链 B 6–415（410 aa）	未记录	6U1 2-[3-(methylsulfonylamino)phenyl]-~{N}-[4-(1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)-1,3-thiazol-2-yl]ethanamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.45 mM protein, 5% PEG3350, 100 mM MES, 50 mM calcium chloride, 10 mM DTT	分辨率 3.30 Å R-free 0.254
5KKT ROCK 1 bound to azaindole thiazole piperazine inhibitor 提交 2016-06-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）链 B 6–415（410 aa）	未记录	6U2 2-[3-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propoxy]phenyl]-~{N}-[4-(1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)-1,3-thiazol-2-yl]ethanamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.45 mM protein, 5% PEG3350, 100 mM MES, 50 mM calcium chloride, 10 mM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.237
5UZJ Crystal Structure of ROCK1 bound to an aminopyridine inhibitor 提交 2017-02-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：kinase domain 链 B 6–415（410 aa）片段：kinase domain	未记录	8UV N-[4-(2-aminopyridin-4-yl)-1,3-thiazol-2-yl]-2-(3-methoxyphenyl)acetamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；4.5% PEG3350, 100MM MES, 50MM CACL2, 10MM DTT, 0.45 MM PROTEIN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.241
5WNE X-RAY CO-STRUCTURE OF RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE (ROCK1) WITH A HIGHLY SELECTIVE INHIBITOR 提交 2017-07-31	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415	未记录	B4J 3,4-dimethoxy-N-({3-[(5-methyl-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl)carbamoyl]phenyl}methyl)benzamide × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 MM CACL2, PH 6.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.246
5WNE X-RAY CO-STRUCTURE OF RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE (ROCK1) WITH A HIGHLY SELECTIVE INHIBITOR 提交 2017-07-31	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415 链 D 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415	未记录	B4J 3,4-dimethoxy-N-({3-[(5-methyl-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl)carbamoyl]phenyl}methyl)benzamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 MM CACL2, PH 6.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.246
5WNG X-RAY CO-STRUCTURE OF RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE (ROCK1) WITH A HIGHLY SELECTIVE INHIBITOR 提交 2017-07-31	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415	未记录	B4Y (2R)-N-(3-cyanophenyl)-2-(3-{[(6S)-6-(dimethylamino)-4,5,6,7-tetrahydro-1,3-benzothiazol-2-yl]carbamoyl}phenyl)pyrrolidine-1-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 MM CACL2, PH 6.0	分辨率 2.90 Å R-free 0.250
5WNG X-RAY CO-STRUCTURE OF RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE (ROCK1) WITH A HIGHLY SELECTIVE INHIBITOR 提交 2017-07-31	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415 链 D 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415	未记录	B4Y (2R)-N-(3-cyanophenyl)-2-(3-{[(6S)-6-(dimethylamino)-4,5,6,7-tetrahydro-1,3-benzothiazol-2-yl]carbamoyl}phenyl)pyrrolidine-1-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 MM CACL2, PH 6.0	分辨率 2.90 Å R-free 0.250
5WNH X-RAY CO-STRUCTURE OF RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE (ROCK1) WITH A HIGHLY SELECTIVE INHIBITOR 提交 2017-07-31	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415 链 B 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415	未记录	B5G (2R)-N-(3-cyanophenyl)-2-{3-[(5-methyl-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl)carbamoyl]phenyl}pyrrolidine-1-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 MM CACL2, PH 6.0	分辨率 3.10 Å R-free 0.234
5WNH X-RAY CO-STRUCTURE OF RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE (ROCK1) WITH A HIGHLY SELECTIVE INHIBITOR 提交 2017-07-31	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415 链 D 6–415（410 aa）片段：UNP residues 6-415	未记录	B5G (2R)-N-(3-cyanophenyl)-2-{3-[(5-methyl-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl)carbamoyl]phenyl}pyrrolidine-1-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；8.5% PEG3350, 0.1M MES, 50 MM CACL2, PH 6.0	分辨率 3.10 Å R-free 0.234
6E9W Crystal structure of Rock1 with a pyridinylbenzamide based inhibitor 提交 2018-08-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）链 B 6–415（410 aa）	未记录	J0P N-[(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-5-yl)methyl]-4-(pyridin-4-yl)benzamide × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；1-1.5 M lithium sulfate, 0.1 M sodium citrate pH 6.2 to 6.6, 0.5 M ammonium sulfate	分辨率 2.96 Å R-free 0.255
7JOU CRYSTAL STRUCTURE OF RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE 1 (ROCK1) IN COMPLEX WITH A PHENYLPYRAZOLE AMIDE INHIBITOR 提交 2020-08-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）	未记录	VFS N-[(1S)-2-hydroxy-1-phenylethyl]-3-methoxy-4-(1H-pyrazol-4-yl)benzamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；NULL	分辨率 3.32 Å R-free 0.248
7S25 ROCK1 IN COMPLEX WITH LIGAND G4998 提交 2021-09-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 7–402（396 aa）片段：KINASE DOMAIN 链 B 7–402（396 aa）片段：KINASE DOMAIN	未记录	CL CHLORIDE ION × 3 86G 2-[3-(methoxymethyl)phenyl]-N-[4-(1H-pyrazol-4-yl)phenyl]acetamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；15-17% PEG 5K MME, 0.1 M HEPES/NaOH pH 7.5, 5% (v/v) tacsimate pH 7.5	分辨率 2.34 Å R-free 0.271
7S25 ROCK1 IN COMPLEX WITH LIGAND G4998 提交 2021-09-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 7–402（396 aa）片段：KINASE DOMAIN 链 D 7–402（396 aa）片段：KINASE DOMAIN	未记录	86G 2-[3-(methoxymethyl)phenyl]-N-[4-(1H-pyrazol-4-yl)phenyl]acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；15-17% PEG 5K MME, 0.1 M HEPES/NaOH pH 7.5, 5% (v/v) tacsimate pH 7.5	分辨率 2.34 Å R-free 0.271
7S26 ROCK1 IN COMPLEX WITH LIGAND G5018 提交 2021-09-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–402（397 aa）片段：KINASE DOMAIN 链 B 6–402（397 aa）片段：KINASE DOMAIN	未记录	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 86K 2-[methyl(phenyl)amino]-1-[4-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)-3,6-dihydropyridin-1(2H)-yl]ethan-1-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；15-17% PEG 5K MME, 0.1 M HEPES/NaOH pH 7.5, 5% (v/v) tacsimate pH 7.5	分辨率 2.74 Å R-free 0.269
7S26 ROCK1 IN COMPLEX WITH LIGAND G5018 提交 2021-09-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–402（397 aa）片段：KINASE DOMAIN 链 D 6–402（397 aa）片段：KINASE DOMAIN	未记录	86K 2-[methyl(phenyl)amino]-1-[4-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)-3,6-dihydropyridin-1(2H)-yl]ethan-1-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；15-17% PEG 5K MME, 0.1 M HEPES/NaOH pH 7.5, 5% (v/v) tacsimate pH 7.5	分辨率 2.74 Å R-free 0.269
8P0S Crystal structure HR1 domain of Rho-associated coiled-coil protein kinases (ROCK-HR1) 提交 2023-05-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 420–550（131 aa）链 B 420–550（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；23% PEG 3350, 150 mM Tri-potassium citrate and 4% MPD (2-methyl-2,4-pentanediol)	分辨率 2.20 Å R-free 0.293
8ZH5 The Crystal Structure of the ROCK1 from Biortus. 提交 2024-05-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–415（410 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MgAC2, 0.1M NaAC pH4.5, 8% PEG 8000, 1.0M NDSB-256	分辨率 3.70 Å R-free 0.260

共 31 个其他 PDB 条目、47 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ROCK1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–415； UniProt 6–415 作者链 B； PDB构建体 6–415； UniProt 6–415 作者链 C； PDB构建体 6–415； UniProt 6–415 作者链 D； PDB构建体 6–415； UniProt 6–415

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5wnf
沉积日期 deposition_date	2017-07-31
结构标题 title	X-RAY CO-STRUCTURE OF RHO-ASSOCIATED PROTEIN KINASE (ROCK1) WITH A HIGHLY SELECTIVE INHIBITOR
关键词 keywords	;RHO KINASE, KINASE INHIBITOR, PHOSPHORYLATION, TRANSFERASE-INHIBITOR COMPLEX, TRANSFERASE, TRANSFERASE-TRANSFERASE inhibitor complex ;; TRANSFERASE/TRANSFERASE inhibitor
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	46.27 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	46.64 Å
零角强度 I(0) i0	470682000.00
分子量 molecular_weight	180010.0 kDa
排除体积 excluded_volume	225520 Å³
包络体积 envelope_volume	313290 Å³
水化壳体积 shell_volume	59395 Å³
包络直径 envelope_diameter	176.9 Å
壳层 Rg shell_rg	47.20 Å
包络 Rg envelope_rg	46.15 Å
形状 Rg shape_rg	46.65 Å
总 Rg total_rg	46.62 Å
总原子数 total_atoms	12674
残基数 n_residues	1535
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	163.1 Å
Rg (实空间) rg_real	46.65 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.72 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.7070e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.6700e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	46.27 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	470500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7707
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	48.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.538
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.012
角度范围 angular_range	— – 0.1700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	42570000.0000
实空间数据点数 n_real_points	35
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.712; Stabil: 0.976; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.951; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Rho-associated protein kinase 1
分子量 formula_weight	48012.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	12844

GSLHMSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYDVPEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNSLTFPDDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKAFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANPNDNR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;1-(4-amino-1,2,5-oxadiazol-3-yl)-5-methyl-N-({3-[(5-methyl-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl)carbamoyl]phenyl}methyl)-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide ;
分子量 formula_weight	494.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	162

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	5wnfA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	5wnfA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	5wnfB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	5wnfB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	5wnfC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	5wnfC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	5wnfD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	5wnfD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	162.905 Å
晶胞边长 b length_b	82.292 Å
晶胞边长 c length_c	169.739 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	115.87 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.450 Å
最低分辨率 resolution_low	24.700 Å
R 因子 r_factor	0.2370
R_work r_work	0.2360
R_free r_free	0.2470

fit	/app/data/saxs_computation/wn/5wnf/5wnf.fit
pddf	/app/data/pr_computation/wn/5wnf/5wnf.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/wn/5wnf/5wnf.dat