African swine fever virus (strain Badajoz 1971 Vero-adapted)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | DNA (36-MER) × 1 DNA (23-mer) × 1 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | DNA (36-MER) × 1 DNA (23-mer) × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | DPOLX_ASFB7 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–177； UniProt 1–174 作者链 B； PDB构建体 4–177； UniProt 1–174 作者链 C； PDB构建体 4–177； UniProt 1–174 作者链 D； PDB构建体 4–177； UniProt 1–174 |
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| 条目编号 entry_id | 5xm9 |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-05-13 |
| 结构标题 title | Crystal structure of AsfvPolX in complex with DNA enzyme. |
| 关键词 keywords | PolX, DNA enzyme, complex, TRANSFERASE-DNA complex; TRANSFERASE/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 29.41 Å |
| Rg（电子密度） | 29.71 Å |
| 总 Rg | 30.39 Å |
| 原子数 | 4075 |
| 残基数 | 407 |
| 排除体积 | 70501 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 5xm9A01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 460 — Beta Polymerase; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Beta Polymerase, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5xm9A02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 210 — Beta Polymerase; domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA polymerase, thumb domain |
| 结构域编号 domain_id | 5xm9B01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 460 — Beta Polymerase; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Beta Polymerase, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5xm9B02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 210 — Beta Polymerase; domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA polymerase, thumb domain |
| 结构域编号 domain_id | 5xm9C01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 460 — Beta Polymerase; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Beta Polymerase, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5xm9C02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 210 — Beta Polymerase; domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA polymerase, thumb domain |
| 结构域编号 domain_id | 5xm9D01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 460 — Beta Polymerase; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Beta Polymerase, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5xm9D02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 210 — Beta Polymerase; domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA polymerase, thumb domain |