5xon

RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R4Y0_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1743； UniProt 1–1743

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

物种未注明

UniProt C4QZQ7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4QZQ7_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1227； UniProt 1–1227

RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core

物种未注明

UniProt C4R7L2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R7L2_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304

RNA polymerase II subunit B32

物种未注明

UniProt C4R2U9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R2U9_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–186； UniProt 1–186

RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III

物种未注明

UniProt C4R3P8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R3P8_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–214； UniProt 1–214

RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III

物种未注明

UniProt C4R1V1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R1V1_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

RNA polymerase II subunit

物种未注明

UniProt C4R9A1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R9A1_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–171； UniProt 1–171

RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III

物种未注明

UniProt C4R273

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R273_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

DNA-directed RNA polymerase subunit

物种未注明

UniProt C4QY79

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4QY79_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 3–115； UniProt 1–113

RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III

物种未注明

UniProt C4R009

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R009_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72

RNA polymerase II subunit B12.5

物种未注明

UniProt C4R3Z5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R3Z5_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III

物种未注明

UniProt C4QWA8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4QWA8_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72

General transcription elongation factor TFIIS

Komagataella phaffii (strain GS115 / ATCC 20864)

UniProt C4R2R6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4R2R6_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 4–190； UniProt 99–285

Transcription elongation factor SPT4

Komagataella phaffii (strain GS115 / ATCC 20864)

UniProt C4R0E6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Protein that forms a complex with Spt4p × 1 （C4R370） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R0E6_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 2–108； UniProt 8–114

Protein that forms a complex with Spt4p

Komagataella phaffii (strain GS115 / ATCC 20864)

UniProt C4R370

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4QY79） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III × 1 （C4QWA8） RNA (30-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 DNA (48-MER) × 1 General transcription elongation factor TFIIS × 1 （C4R2R6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4R370_KOMPG
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 3–612； UniProt 206–815

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5xon
沉积日期 deposition_date	2017-05-29
结构标题 title	RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS
关键词 keywords	transcription, complex, TRANSCRIPTION-RNA complex; TRANSCRIPTION/RNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5xon__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5xon__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5xon__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	55.08 Å
Rg（电子密度）	54.76 Å
总 Rg	54.89 Å
原子数	38369
残基数	4648
排除体积	676490 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5xon__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit
分子量 formula_weight	194107.4 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	38369

MSQFPYSSAPLRSVKEVQFGLLSPEEIRAISVVKIEYPEIMDESRQRPREGGLNDPKLGSIDRNFKCQTCGEGMAECPGHFGHMELAKPVFHIGFIPKIKKVCECICMNCGKLLLDETNPTMAQAIRIRDPKKRFNAVWQLCKTKMVCEADAPVDEYSEQKVVSRGGCGNTQPVVRKDGMKLWGTWKKSGFSDRDAQPERKLLTPGEILNVFKHISPEDCFRLGFNEDYARPEWMIITVLPVPPPQVRPSIAMDETTQGQDDLTHKLSDILKANINVQKLEMDGSPQHIINEVEQLLQFHVATYMDNDIAGQPQALQKSGRPVKAIRARLKGKEGRLRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLELDQVGVPISIAKTLSYPETVTQYNIHRLTEYVRNGPNEHPGAKYVIRDNGDRIDLRYHKRAGDIVLQYGWKVERHLMDDDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVKVMPYSTFRLNLSVTSPYNADFDGDEMNLHVPQSEETRAELSQLCAVPLQIVSPQSNKPVMGIVQDTLCGVRKMTLRDTFIEYEQVMNMLFWVPSWDGVVPQPAILKPKPLWTGKQLLSIAIPSGIHLQRTDGGNSLLSPKDNGMLIVDGKVMFGVVDKKTVGSGGGGLIHTVMREKGPKICAELFGNIQKVVNYWLLHNGFSIGIGDAIADASTMKEITHAISSAKEQVQEIIYKAQHNELELKPGMTLRESFEGEVSRTLNDARDSAGRSAEMNLKDLNNVKQMVSAGSKGSFINIAQMSACVGQQMVEGKRIAFGFADRSLPHFTKDDFSPESKGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMAGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKALEDIMVHYDGTTRNSLGDIIQFLYGEDGLDGTQVERQTIDTIPGSDKAFHKRYYVDLMDEKNSIKPDVIEYAADILGDVELQKELNSEYEQLVSDRKFLREIVFVNGDHNWPLPVNLRRIIQNAQQIFHLDRAKASDLTIPEIIHGVRDLCKKLFVLRGENELIKEAQQNATSLFQCLVRARLATRRILEEFRLNRDAFEWVLGTIEAQFQRSLVHPGEMVGVIAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSSKNVTLGVPRLKEILNVAKNIKTPALTVYLDREIALDIEKAKVIQSSIEYTTLKNVTSATEIYYDPDPTSTVIEEDFDTVEAYFSIPDEKVEETIDKQSPWLLRLELDRARMLDKQLTMNQVADKISEVFSDDLFVMWSEDNADKLIIRCRVIRDPKAMDEELEAEEDQMLKRIEAHMLDLIALRGIPGISKVYMVKHKVSVPDESGEYKNEELWALETDGINLAEVMAVPGVDSSRTYSNSFVEILSVLGIEATRSSLYKEILNVIAFDGSYVNYRHMALLVDVMTSRGYLMAITRHGINRADTGALMRCSFEETVEILFEAGAAAELDDCRGVSENVMLGQLAPMGTGAFDVMIDEKLLTSLPADYAPTMPLFKGKATQGSATPYDNNAQYDDEFNHDDVADVMFSPMAETGSGDDRSGGLTEYAGIQSPYQPTSPGLSATSPGFAPTSPGFAPTSPRYSPTSPGYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPQYSPASPQYSPSRHSPNGESKEGE

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit beta
分子量 formula_weight	139746.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSYDPYSIDDTITTEDCWTVISAFFEEKGLVSQQLDSFDEFMETSIQDLVWEEPRLILDQPAQHTNEKDNINKRYEIRFGKIYLSRPTMTEADGTTHAMFPQEARLRNLTYSSPVYLDMEKSMFTSIDDEGNPNATLDWQQVHEPIKDGVEEGNKVHIGKVPIMLRSKFCSLRTLDEVDLYKMKECPYDMGGYFVINGSEKVLIAQERSAANIVQVFKKAAPSPISHVAEIRSALEKGSRLISTMQIKLYGREDKGTGRTIKATLPYVKQDIPIVIVFRALGVVPDGEILQHICYDENDWQMLEMLKPCIEEGFVIQDKEVALDFIGRRGSAALGIRREKRIQYAKDILQKELLPHITQEEGFETRKTFFLGYMVNRLLLCALERKDQDDRDHFGKKRLDLAGPLLANLFRILFRKLTREIYRYMQRCIETDRDFNLNLAVKSTTITSGLKYSLATGNWGEQKKAMSSRAGVSQVLNRYTYSSTLSHLRRTNTPIGRDGKLAKPRQLHNTHWGLVCPAETPEGQACGLVKNLSLLSGISIGSPSEPIINFLEEWGMEPLEDYDPAQHTKSTRIFVNGVWTGIHRDPSMLVSTMRDLRRSGAISPEVSIIRDIREREFKIFTDVGRVYRPLFIVEDDESKDNKGELRITKEHIRKIQQGYDDDAMNDDSEEQEQDVYGWSSLVTSGVIEYVDGEEEETIMIAMTPEDLQTRSLEQKEIDLNDTAKRIKPEMSTSSHHTFTHCEIHPSMILGVAASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVFLTNYNVRMDTMANILYYPQKPLAKTQAMEYLKFRELPAGQNAIVAIACYSGYNQEDSMIMNQSSIDRGLFRSLFFRSYMDQEKRFGISIVEEFEKPTRATTLRLKHGTYEKLDEDGLIAPGVRVSGDDIIIGKTTPIPPDTEELGQRTKYHTKRDASTPLRSTENGIVDQVLLTTNQEGLKFVKVRMRTTKVPQIGDKFASRHGQKGTIGVTYRHEDMPFSAEGIVPDLIINPHAIPSRMTVAHLIECLLSKVGSIRGYEGDATPFTDLTVDAVSNLLRDNGYQSRGFEVMYNGHTGKKLMAQVFFGPTYYQRLRHMVDDKIHARARGPVQVLTRQPVEGRSRDGGLRFGEMERDCMIAHGAAGFLKERLMEASDAFRVHVCGICGLMSVIANLKKNQFECRSCKNKTNIYQLHIPYAAKLLFQELMAMNIAPRLYTERSGVSMRS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core
分子量 formula_weight	34216.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSKEPKVNIINAQDDEVELMLSDVNLSLANSLRRTMLAEVPTLAIDLVEIKMNTSVLADEFISHRLGLIPLVSEDVEEMKYSRDCTCEDYCDECSVVLELSARHEGEEGTTDVYSSSLIKVSGPGNLNVGEPVRRDDYDQGILLCKLRNHQELNIRCIAKKGIAKEHAKWSPCSAIAFEYDPHNKLKHTDFWFEVDAKKEWPDSKYATWEEPPKPGEVFDYKAKPNRFYMTVETTGSLKANQVFSRGIKTLQEKLANVLFELENSRPANTTAYGGATAYGGQTVYGRETSYGGNTNYGDYNAPY

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	RNA polymerase II subunit B32
分子量 formula_weight	20623.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MNVSTSTVGARRRRAKQQVDDEENATLLRLGPEFALKQYDHDGNEHDLIALSLSESRLLIREALKARSRARNGGVDIESSNGEIDDDELAKVTSGAVANGVVKKTLDYLNTFARFKDEETCTAVDQLLHNSSDCSVLHPFEIAQLSSLGCEDVDEAITLIPSLAAKKEVNLQRILDELNRLEDPYK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III
分子量 formula_weight	24962.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MEDNNRIISRLWRSFRTVKEMAADRGYFISQEEMDQSLEEFRSKICDSMGNPQRKLMSFLANPTPEALEKYSDLGTLWVEFCDEPSVGIKTMRNFCLRIQEKNFSTGIFIYQNNITPSANKMIPTVSPAIIETFQESDLVVNITHHELVPKHIRLSDGEKSQLLQRYKLKESQLPRIQREDPVARYLGLKRGQVVKIIRRSETSGRYASYRICL

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III
分子量 formula_weight	17803.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSEDEAFNEQTENFENFEDEHFSDDNFEDRSTQPEDYAVGVTADGRQIINGDGIQEVNGTIKAHRKRSNKELAILKEERTTTPYLTKYERARILGTRALQISMNAPVLVDIEGETDPLQIAMKELSQRKIPLVIRRYLPDGSYEDWGCDELIVDN

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	RNA polymerase II subunit
分子量 formula_weight	18802.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MFFLKDLSLILTLHPSYFGPQMNQYLREKLLTDVEGTCTGQFGYIVTVLDGMNIDVGKGRIIPGSGSAEFEVKYRAVVWKPFKGEVVDAIVSNVSPIGFFADVGPLNVFVSTRLIPDNLVYNPSNSPPAYMSNDELITKGSKVRLKVVGTRTDVNEIYAIGSIKEDFLGAI

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III
分子量 formula_weight	16249.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSSALFDDIFTVQTVDNGRYNKVSRIIGISTTNSAIKLTLDINNEMFPVSQDDSLTVTLANSLSLDGEDESANFSKSWRPPKPTDKSLADDYDYVMFGTVYKFEEGDEDKIKVYVSFGGLLMCLEGGYKSLASLKQDNLYILIRR

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit
分子量 formula_weight	13612.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MASFRFCLECNNMLYPKEDKENQRLLYSCRNCDYTELAEDPKVYRHELITNIGETAGIVDDIGQDPTLPRSDKECPECHSRDCVFFQSQQRRKDTNMTLFYVCLNCKKTFRDESE

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III
分子量 formula_weight	8554.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MIIPVRCFSCGKVVGDKWDAYLRLLEEGKQEGDALDELKLKRYCCRRMVLTHVDLIEKFLRYNPLEKKDFDS

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	RNA polymerase II subunit B12.5
分子量 formula_weight	13832.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MNAPDRFELFILPDDVPKLKITPDSRVPNCIIIKFEREDHTLANLLREELALYPDVTFVAYKVEHPLFANFVMRLQTEEGTRPKQALERACASIINKLKTLDHKFNEEWNIKNFSLND

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	RNA polymerase subunit, found in RNA polymerase complexes I, II, and III
分子量 formula_weight	7862.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MSREGFVAPSGTDLAAAASGVAPNKHYGVKYTCGACAHNFSLNKSDPVRCKECGHRVIYKARTKRMIQFDAR

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	RNA (30-MER)
分子量 formula_weight	9492.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	P

AUCUUGAAUCUAUUUCUUUUAUCGAGAGGU

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	DNA (48-MER)
分子量 formula_weight	14659.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

CACTCTACCGATAAGCAGACGTACCTCTCGACCCTGTGCTAGACACGG

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	DNA (48-MER)
分子量 formula_weight	14917.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	N

CCGTGTCTAGCACAGGGAAATGGTTTGTGTCTGCTTATCGGTAGAGTG

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	General transcription elongation factor TFIIS
分子量 formula_weight	21694.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

GPGTNERFVSKGPRTPKNDGVKVEIYENKTRNGSISAIYTALAMDSDEQPSKIFELVKDIEKQCFKAVNFTVDDTYRNKLRSLIMNLKNKNNPTLRRSILDHEIIPSKLVTMSAQELAPDSLKKEMEEIYKKNLFDAQGATENNSVTDRFECGKCKQRKVSYFQKQTRSAAAPLTTFCKCENCGNRWKFS

来源 Source

来源生物 organism	Komagataella phaffii (strain GS115 / ATCC 20864)
通用名 common_name	Yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	644223
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Transcription elongation factor SPT4
分子量 formula_weight	12039.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MRERACMLCGIVLPGRVFMQNGCPNCDSVLNLRDSDQATVNECTSSSFEGLVAVGDNEHSWVAKWLRVDRFQPGLYAVRVDGRLPSDIVAALEQYGVYYRPRDGSVID

来源 Source

来源生物 organism	Komagataella phaffii (strain GS115 / ATCC 20864)
通用名 common_name	Yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	644223
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Protein that forms a complex with Spt4p
分子量 formula_weight	68284.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

GPGSASTTAPQRLLIPTVDDPGIWGVKVRLGKEKDVVRQILKKKLAREGTKNPLEIYSAFQRDSFKGHVYIEARKAEAINDALKGNVNVFSNNSKFLVGIVEYKDLLRPVKSSDVKLTRGSYVRVKNGKFKGDLAQVDEVLENGLEARLKLVPRLDYGKDLSHLSTSSSVDSTKNRRKFYTSKFRPAQRLFSEAEARVHEPTIRRDRDGFVTYGGEEYYEGFLYKTFRLQNLIVNSINPTLNELSLFQSNEESTTIDLSTIADSLKETAKNLVSFQPGDNVEIINGELNHLTGTVSSVNQSTIVSVRLHSDDDTINSETVEIPTSDLRKIFNVGDHVRVIHGKHTDDTGLIVEVNGDKVEFISNQTKRTVIVFSNYLIKSTDSTVSINESGRFELHDLVQVNSDLVGIVIRAQKDSFDVLCSDGKLLSLPPVSIYSKLNLNPNQQIAIDSNGVEVKVGDTVREFTGERRQGTILHVYRNFLFLRSREIVENQGVFVTSSNRVKTITSKSNGTGGQISGPDLSRMNPSRVIPPPSIPVANQRMTGRDPTLNKTVKIRQGGYKGKIGIVKEANGDRFRVELHNPNKTIPIPCSFLLIESTHGWVPYEDFVASDR

来源 Source

来源生物 organism	Komagataella phaffii (strain GS115 / ATCC 20864)
通用名 common_name	Yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	644223
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 19 domains

CATH v4.4 (19 domains)

结构域编号 domain_id	5xonA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	274 — Enzyme I; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase Rpb1, domain 3

结构域编号 domain_id	5xonA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 —

结构域编号 domain_id	5xonB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1110 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase Rpb2, domain 2

结构域编号 domain_id	5xonC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit

结构域编号 domain_id	5xonC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain

结构域编号 domain_id	5xonD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RNA Polymerase II, Rpb4 subunit

结构域编号 domain_id	5xonE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1340 — Dna-directed Rna Polymerases I, Ii, And Iii 27 Kd Polypeptide; Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, Rpb5, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5xonE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — RPB5-like RNA polymerase subunit

结构域编号 domain_id	5xonF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase subunit, RPB6/omega

结构域编号 domain_id	5xonG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5xonG02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	5xonH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	5xonI01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	5xonI02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	5xonJ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	5xonK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit

结构域编号 domain_id	5xonL00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase ii, chain L

结构域编号 domain_id	5xonV00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 —

结构域编号 domain_id	5xonW01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	940 — NusG, N-terminal domain

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.83 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	682749

RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase II subunit B32

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase subunit ABC27, common to RNA polymerases I, II, and III

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase II subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase subunit ABC14.5, common to RNA polymerases I, II, and III

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体