SAXSdb — 5y81

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription-associated protein 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–2627 链 B； UniProt 2630–3744	片段：UNP residues 2630-3744 片段：UNP residues 1-2627	Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （Q06337） Eaf1-disorder domain × 1 Chromatin modification-related protein EAF5 × 1 （P39995） Actin-related protein 4 × 1 （P80428） Actin × 1 （P60010） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （Q06337）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5Y81	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5OJS Cryo-EM structure of the SAGA and NuA4 coactivator subunit Tra1 提交 2017-07-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Two subsequent applications of protein were required to achieve the desired particle density on grids. Each application was followed by 20 sec waiting time, with a short 0.5 sec blotting after first application and 5 sec blotting after the second.	分辨率 3.70 Å
6IG9 Tra1 subunit from Saccharomyces cerevisiae SAGA complex 提交 2018-09-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5；20mM HEPES pH 8.5 150mM Nacl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds and wait for 30 seconds before plunging	分辨率 4.60 Å
6T9I cryo-EM structure of transcription coactivator SAGA 提交 2019-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.90 Å
6T9J SAGA Tra1 module 提交 2019-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.40 Å
7VVY TRA module of NuA4 提交 2021-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 L 1–3744（3744 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.10 Å
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 L 1–3744（3744 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP* ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
7YFN Core module of the NuA4 complex in S. cerevisiae 提交 2022-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7YFP The NuA4 histone acetyltransferase complex from S. cerevisiae 提交 2022-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8ESC Structure of the Yeast NuA4 Histone Acetyltransferase Complex 提交 2022-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 Z 1–3744（3744 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRA1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1, 5
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1115； UniProt 2630–3744 作者链 A； PDB构建体 1–2627； UniProt 1–2627

Chromatin modification-related protein EAF1

物种未注明

UniProt Q06337

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 647–982 链 E； UniProt 357–397	片段：UNP residues 647-982 片段：UNP residues 357-397	Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） Eaf1-disorder domain × 1 Chromatin modification-related protein EAF5 × 1 （P39995） Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） Actin-related protein 4 × 1 （P80428） Actin × 1 （P60010）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5Y81	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7VVY TRA module of NuA4 提交 2021-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–982（982 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.10 Å
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 E 1–982（982 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP* ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
8ESC Structure of the Yeast NuA4 Histone Acetyltransferase Complex 提交 2022-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–982（982 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EAF1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2, 8
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 2–336； UniProt 647–982 作者链 E； PDB构建体 1–41； UniProt 357–397

Chromatin modification-related protein EAF5

物种未注明

UniProt P39995

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–279	未记录	Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （Q06337） Eaf1-disorder domain × 1 Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） Actin-related protein 4 × 1 （P80428） Actin × 1 （P60010） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （Q06337）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EAF5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–279； UniProt 1–279

Actin-related protein 4

物种未注明

UniProt P80428

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 1–489	未记录	Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （Q06337） Eaf1-disorder domain × 1 Chromatin modification-related protein EAF5 × 1 （P39995） Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） Actin × 1 （P60010） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （Q06337）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5Y81	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3QB0 Crystal structure of Actin-related protein Arp4 from S. cerevisiae complexed with ATP 提交 2011-01-12	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–489（489 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；27 % PEG2000MME, 0.1 M HEPES-NaOH, 6 % D+-Trehalose, 50 mM Glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.40 Å R-free 0.221
3QB0 Crystal structure of Actin-related protein Arp4 from S. cerevisiae complexed with ATP 提交 2011-01-12	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–489（489 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；27 % PEG2000MME, 0.1 M HEPES-NaOH, 6 % D+-Trehalose, 50 mM Glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.40 Å R-free 0.221
3QB0 Crystal structure of Actin-related protein Arp4 from S. cerevisiae complexed with ATP 提交 2011-01-12	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–489（489 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；27 % PEG2000MME, 0.1 M HEPES-NaOH, 6 % D+-Trehalose, 50 mM Glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.40 Å R-free 0.221
3QB0 Crystal structure of Actin-related protein Arp4 from S. cerevisiae complexed with ATP 提交 2011-01-12	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–489（489 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；27 % PEG2000MME, 0.1 M HEPES-NaOH, 6 % D+-Trehalose, 50 mM Glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.40 Å R-free 0.221
5I9E Crystal structure of a nuclear actin ternary complex 提交 2016-02-20	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–489（489 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；291 K；polyethylene glycol (PEG) 3350, citric acid, BIS-TRIS propane	分辨率 2.80 Å R-free 0.284
5I9E Crystal structure of a nuclear actin ternary complex 提交 2016-02-20	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–489（489 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；291 K；polyethylene glycol (PEG) 3350, citric acid, BIS-TRIS propane	分辨率 2.80 Å R-free 0.284
5NBL Crystal structure of the Arp4-N-actin(APO-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–489（489 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ADP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate at pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 2.80 Å R-free 0.204
5NBL Crystal structure of the Arp4-N-actin(APO-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–489（489 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ADP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate at pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 2.80 Å R-free 0.204
5NBM Crystal structure of the Arp4-N-actin(ATP-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–489（489 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ATP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 3.40 Å R-free 0.193
5NBM Crystal structure of the Arp4-N-actin(ATP-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–489（489 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ATP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 3.40 Å R-free 0.193
5NBN Crystal structure of the Arp4-N-actin-Arp8-Ino80HSA module of INO80 提交 2017-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–489（489 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LAR LATRUNCULIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 18% (w/v) polyethylene glycol 3,350, latrunculin A solved in DMSO molar ration 1:1.5 (protein : latrunculin A)	分辨率 4.00 Å R-free 0.242
5NBN Crystal structure of the Arp4-N-actin-Arp8-Ino80HSA module of INO80 提交 2017-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–489（489 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LAR LATRUNCULIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 18% (w/v) polyethylene glycol 3,350, latrunculin A solved in DMSO molar ration 1:1.5 (protein : latrunculin A)	分辨率 4.00 Å R-free 0.242
7VVY TRA module of NuA4 提交 2021-11-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 F 1–489（489 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.10 Å
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 F 1–489（489 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP* ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
8A5A Structure of Arp4-Ies4-N-actin-Arp8-Ino80HSA subcomplex (A-module) of INO80 提交 2022-06-14	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 W 1–489（489 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8A5O Structure of Arp4-Ies4-N-actin-Arp8-Ino80HSA subcomplex (A-module) of S. cerevisiae INO80 提交 2022-06-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 W 1–489（489 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8ESC Structure of the Yeast NuA4 Histone Acetyltransferase Complex 提交 2022-10-13	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 1–489（489 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 10 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARP4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 2–490； UniProt 1–489

Actin

物种未注明

UniProt P60010

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–375	未记录	Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （Q06337） Eaf1-disorder domain × 1 Chromatin modification-related protein EAF5 × 1 （P39995） Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） Actin-related protein 4 × 1 （P80428） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （Q06337）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5Y81	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1YAG STRUCTURE OF THE YEAST ACTIN-HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1 COMPLEX 提交 1998-10-09	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–375（375 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.50	分辨率 1.90 Å R-free 0.231
1YAG STRUCTURE OF THE YEAST ACTIN-HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1 COMPLEX 提交 1998-10-09	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–375（375 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.50	分辨率 1.90 Å R-free 0.231
1YVN THE YEAST ACTIN VAL 159 ASN MUTANT COMPLEX WITH HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1. 提交 1999-03-23	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–375（375 aa）	突变：V159N	MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.1 M HEPES, 1.60 M (NH4)2SO4, 2 MM MG-ATP, PH=8.0.	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
1YVN THE YEAST ACTIN VAL 159 ASN MUTANT COMPLEX WITH HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1. 提交 1999-03-23	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–375（375 aa）	突变：V159N	MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.1 M HEPES, 1.60 M (NH4)2SO4, 2 MM MG-ATP, PH=8.0.	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
5NBL Crystal structure of the Arp4-N-actin(APO-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ADP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate at pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 2.80 Å R-free 0.204
5NBL Crystal structure of the Arp4-N-actin(APO-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ADP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate at pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 2.80 Å R-free 0.204
5NBM Crystal structure of the Arp4-N-actin(ATP-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ATP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 3.40 Å R-free 0.193
5NBM Crystal structure of the Arp4-N-actin(ATP-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ATP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 3.40 Å R-free 0.193
5NBN Crystal structure of the Arp4-N-actin-Arp8-Ino80HSA module of INO80 提交 2017-03-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LAR LATRUNCULIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 18% (w/v) polyethylene glycol 3,350, latrunculin A solved in DMSO molar ration 1:1.5 (protein : latrunculin A)	分辨率 4.00 Å R-free 0.242
5NBN Crystal structure of the Arp4-N-actin-Arp8-Ino80HSA module of INO80 提交 2017-03-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LAR LATRUNCULIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 18% (w/v) polyethylene glycol 3,350, latrunculin A solved in DMSO molar ration 1:1.5 (protein : latrunculin A)	分辨率 4.00 Å R-free 0.242
7VVY TRA module of NuA4 提交 2021-11-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–375（375 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.10 Å
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 G 1–375（375 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP* ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
7YFN Core module of the NuA4 complex in S. cerevisiae 提交 2022-07-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 4–375（372 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7YFP The NuA4 histone acetyltransferase complex from S. cerevisiae 提交 2022-07-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 4–375（372 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8A5A Structure of Arp4-Ies4-N-actin-Arp8-Ino80HSA subcomplex (A-module) of INO80 提交 2022-06-14	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 V 1–375（375 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8A5O Structure of Arp4-Ies4-N-actin-Arp8-Ino80HSA subcomplex (A-module) of S. cerevisiae INO80 提交 2022-06-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 V 1–375（375 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8ESC Structure of the Yeast NuA4 Histone Acetyltransferase Complex 提交 2022-10-13	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–375（375 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9GO5 CryoEM Reconstruction of Yeast ADP-Actin Filament at 2.5 A resolution. 提交 2024-09-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–375（375 aa）链 B 1–375（375 aa）链 C 1–375（375 aa）链 D 1–375（375 aa）链 E 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 10 mM Tris cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACT_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5y81
沉积日期 deposition_date	2017-08-18
结构标题 title	NuA4 TEEAA sub-complex
关键词 keywords	NuA4 complex, Histone acetyltransferases, Tra1/TRRAP, PIKK family, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	68.82 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	69.27 Å
零角强度 I(0) i0	2369650000.00
分子量 molecular_weight	361480.0 kDa
排除体积 excluded_volume	430940 Å³
包络体积 envelope_volume	939900 Å³
水化壳体积 shell_volume	119590 Å³
包络直径 envelope_diameter	233.6 Å
壳层 Rg shell_rg	62.68 Å
包络 Rg envelope_rg	67.60 Å
形状 Rg shape_rg	69.26 Å
总 Rg total_rg	69.15 Å
总原子数 total_atoms	25712
残基数 n_residues	4455
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	214.7 Å
Rg (实空间) rg_real	68.97 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.79 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.3700e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.2760e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	68.10 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2366000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8401
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	65.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.374
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.510
角度范围 angular_range	— – 0.1150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0003
最高正则化参数 α highest_alpha	213900000.0000
实空间数据点数 n_real_points	24
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.970; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.016

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Transcription-associated protein 1
分子量 formula_weight	130470.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	25723

YNAWYQSINILESIQSNTSIDNTKIIEANEDALLELYVNLQEEDMFYGLWRRRAKYTETNIGLSYEQIGLWDKAQQLYEVAQVKARSGALPYSQSEYALWEDNWIQCAEKLQHWDVLTELAKHEGFTDLLLECGWRVADWNSDRDALEQSVKSVMDVPTPRRQMFKTFLALQNFAESRKGDQEVRKLCDEGIQLSLIKWVSLPIRYTPAHKWLLHGFQQYMEFLEATQIYANLHTTTVQNLDSKAQEIKRILQAWRDRLPNTWDDVNMWNDLVTWRQHAFQVINNAYLPLIPALQQSNSNSNINTHAYRGYHEIAWVINRFAHVARKHNMPDVCISQLARIYTLPNIEIQEAFLKLREQAKCHYQNMNELTTGLDVISNTNLVYFGTVQKAEFFTLKGMFLSKLRAYEEANQAFATAVQIDLNLAKAWAQWGFFNDRRLSEEPNNISFASNAISCYLQAAGLYKNSKIRELLCRILWLISIDDASGMLTNAFDSFRGEIPVWYWITFIPQLLTSLSHKEANMVRHILIRIAKSYPQALHFQLRTTKEDFAVIQRQTMAVMGDKPDTNDRNGRRQPWEYLQELNNILKTAYPLLALSLESLVAQINDRFKSTTDEDLFRLINVLLIDGTLNYNRLPFPRKNPKLPENTEKNLVKFSTTLLAPYIRPKFNADFIDNKPDYETYIKRLRYWRRRLENKLDRASKKENLEVLCPHLSNFHHQKFEDIEIPGQYLLNKDNNVHFIKIARFLPTVDFVRGTHSSYRRLMIRGHDGSVHSFAVQYPAVRHSRREERMFQLYRLFNKSLSKNVETRRRSIQFNLPIAIPLSPQVRIMNDSVSFTTLHEIHNEFCKKKGFDPDDIQDFMADKLNAAHDDALPAPDMTILKVEIFNSIQTMFVPSNVLKDHFTSLFTQFEDFWLFRKQFASQYSSFVFMSYMMMINNRTPHKIHVDKTSGNVFTLEMLPSRFPYERVKPLLKNHDLSLPPDSPIFHNNEPVPFRLTPNIQSLIGDSALEGIFAVNLFTISRALIEPDNELNTYLALFIRDEIISWFSNLHRPIIENPQLREMVQTNVDLIIRKVAQLGHLNSTPTVTTQFILDCIGSAVSPRNLARTDVNFMPWF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Chromatin modification-related protein EAF1
分子量 formula_weight	39431.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

PTIWLSEDDQELVKNINTYGYNWELISAHMTHRLTYSYLSNIERRTPWQCFERFVQLNERFNFSDLKGPRAHSAQQWLIEAHKFQQRQNRRISPLGVNTESIQRGHRRLRWASMFEAIRKCMKKRENTPRPNPTQPRKPLDCKNMKVPTPAEMSLLKAQRDEALRRDIQLRRTVKNRLQQRQQQSQQAHSSRAQSPIPSNGKSSSNLARNGQASAPRPNQKQYTEQDIIESYSRKLLEQKPDIGPEMALKAAKNYYRTLREQQQQLKQHQIQQQRQQLQEESSHVQQLQQLQPGSQAPPPKSSPSQSSLSNISNINSAPRIKSPTPQEILQRFQKQ

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Eaf1-disorder domain
分子量 formula_weight	42570.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Chromatin modification-related protein EAF5
分子量 formula_weight	31689.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MDKEVSELVVLQLIHTLISNKNEELVRNGGGINMIGNNLRISLVKLTNEIQNNLLINELTNLRRQSNVANGNRKLGINDILTIVKNLFPEYRTTLNDGQLSLHGLEMHDIEKLLDEKYDRFKKTQVEQIRMMEDEILKNGIKTGASQLQPHANAGKSGSAGTSATITTTTPHMAHSMDPKREKLLKLYRDTVLNKLESKTGNFQKLFKSPDGSIIKNEINYEDIKNETPGSVHELQLILQKSITDGVMRKVIGTDDWKLARQVQFELDDTVQFMRRALE

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Transcription-associated protein 1
分子量 formula_weight	303020.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MSLTEQIEQFASRFRDDDATLQSRYSTLSELYDIMELLNSPEDYHFFLQAVIPLLLNQLKEVPISYDAHSPEQKLRNSMLDIFNRCLMNQTFQPYAMEVLEFLLSVLPKENEENGILCMKVLTTLFKSFKSILQDKLDSFIRIIIQIYKNTPNLINQTFYEAGKAEQGDLDSPKEPQADELLDEFSKNDEEKDFPSKQSSTEPRFENSTSSNGLRSSMFSFKILSECPITMVTLYSSYKQLTSTSLPEFTPLIMNLLNIQIKQQQEAREQAESRGEHFTSISTEIINRPAYCDFILAQIKATSFLAYVFIRGYAPEFLQDYVNFVPDLIIRLLQDCPSELSSARKELLHATRHILSTNYKKLFLPKLDYLFDERILIGNGFTMHETLRPLAYSTVADFIHNIRSELQLSEIEKTIKIYTGYLLDESLALTVQIMSAKLLLNLVERILKLGKENPQEAPRAKKLLMIIIDSYMNRFKTLNRQYDTIMKYYGRYETHKKEKAEKLKNSIQDNDKESEEFMRKVLEPSDDDHLMPQPKKEDINDSPDVEMTESDKVVKNDVEMFDIKNYAPILLLPTPTNDPIKDAFYLYRTLMSFLKTIIHDLKVFNPPPNEYTVANPKLWASVSRVFSYEEVIVFKDLFHECIIGLKFFKDHNEKLSPETTKKHFDISMPSLPVSATKDARELMDYLAFMFMQMDNATFNEIIEQELPFVYERMLEDSGLLHVAQSFLTSEITSPNFAGILLRFLKGKLKDLGNVDFNTSNVLIRLFKLSFMSVNLFPNINEVVLLPHLNDLILNSLKYSTTAEEPLVYFYLIRTLFRSIGGGRFENLYRSIKPILQVLLQSLNQMILTARLPHERELYVELCITVPVRLSVLAPYLPFLMKPLVFALQQYPDLVSQGLRTLELCIDNLTAEYFDPIIEPVIDDVSKALFNLLQPQPFNHAISHNVVRILGKLGGRNRQFLKPPTDLTEKTELDIDAIADFKINGMPEDVPLSVTPGIQSALNILQSYKSDIHYRKSAYKYLTCVLLLMTKSSAEFPTNYTELLKTAVNSIKLERIGIEKNFDLEPTVNKRDYSNQENLFLRLLESVFYATSIKELKDDAMDLLNNLLDHFCLLQVNTTLLNKRNYNGTFNIDLKNPNFMLDSSLILDAIPFALSYYIPEVREVGVLAYKRIYEKSCLIYGEELALSHSFIPELAKQFIHLCYDETYYNKRGGVLGIKVLIDNVKSSSVFLKKYQYNLANGLLFVLKDTQSEAPSAITDSAEKLLIDLLSITFADVKEEDLGNKVLENTLTDIVCELSNANPKVRNACQKSLHTISNLTGIPIVKLMDHSKQFLLSPIFAKPLRALPFTMQIGNVDAITFCLSLPNTFLTFNEELFRLLQESIVLADAEDESLSTNIQKTTEYSTSEQLVQLRIACIKLLAIALKNEEFATAQQGNIRIRILAVFFKTMLKTSPEIINTTYEALKGSLAENSKLPKELLQNGLKPLLMNLSDHQKLTVPGLDALSKLLELLIAYFKVEIGRKLLDHLTAWCRVEVLDTLFGQDLAEQMPTKIIVSIINIFHLLPPQADMFLNDLLLKVMLLERKLRLQLDSPFRTPLARYLNRFHNPVTEYFKKNMTLRQLVLFMCNIVQRPEAKELAEDFEKELDNFYDFYISNIPKNQVRVVSFFTNMVDLFNTMVITNGDEWLKKKGNMILKLKDMLNLTLKTIKENSFYIDHLQLNQSIAKFQALYLRFTELSERDQNPLLLDFIDFSFSNGIKASYSLKKFIFHNIIASSNKEKQNNFINDATLFVLSDKCLDARIFVLKNVINSTLIYEVATSGSLKSYLVEDKKPKWLELLHNKIWKNSNAILAYDVLDHHDLFRFELLQLSAIFIKADPEIIAEIKKDIIKFCWNFIKLEDTLIKQSAYLVTSYFISKFDFPIKVVTQVFVALLRSSHVEARYLVKQSLDVLTPVLHERMNAAGTPDTWINWVKRVMVENSSSQNNILYQFLISHPDLFFNSRDLFISNIIHHMNKITFMSNSNSDSHTLAIDLASLILYWENKTLEITNVNNTKTDSDGDVVMSDSKSDINPVEADTTAIIVDANNNSPISLHLREACTAFLIRYVCASNHRAIETELGLRAINILSELISDKHWTNVNVKLVYFEKFLIFQDLDSENILYYCMNALDVLYVFFKNKTKEWIMENLPTIQNLLEKCIKSDHHDVQEALQKVLQVIMKAIKAQGVSVIIEEESPGKTFIQMLTSVITQDLQETSSVTAGVTLAWVLFMNFPDNIVPLLTPLMKTFSKLCKDHLSISQPKDAMALEEARITTKLLEKVLYILSLKVSLLGDSRRPFLSTVALLIDHSMDQNFLRKIVNMSRSWIFNTEIFPTVKEKAAILTKMLAFEIRGEPSLSKLFYEIVLKLFDQEHFNNTEITVRMEQPFLVGTRVEDIGIRKRFMTILDNSLERDIKERLYYVIRDQNWEFIADYPWLNQALQLLYGSFNREKELSLKNIYCLSPPSILQEYLPENAEMVTEVNDLELSNFVKGHIASMQGLCRIISSDFIDSLIEIFYQDPKAIHRAWVTLFPQVYKSIPKNEKYGFVRSIITLLSKPYHTRQISSRTNVINMLLDSISKIESLELPPHLVKYLA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Actin-related protein 4
分子量 formula_weight	54991.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

PMSNAALQVYGGDEVSAVVIDPGSYTTNIGYSGSDFPQSILPSVYGKYTADEGNKKIFSEQSIGIPRKDYELKPIIENGLVIDWDTAQEQWQWALQNELYLNSNSGIPALLTEPVWNSTENRKKSLEVLLEGMQFEACYLAPTSTCVSFAAGRPNCLVVDIGHDTCSVSPIVDGMTLSKSTRRNFIAGKFINHLIKKALEPKEIIPLFAIKQRKPEFIKKTFDYEVDKSLYDYANNRGFFQECKETLCHICPTKTLEETKTELSSTAKRSIESPWNEEIVFDNETRYGFAEELFLPKEDDIPANWPRSNSGVVKTWRNDYVPLKRTKPSGVNKSDKKVTPTEEKEQEAVSKSTSPAANSADTPNETGKRPLEEEKPPKENNELIGLADLVYSSIMSSDVDLRATLAHNVVLTGGTSSIPGLSDRLMTELNKILPSLKFRILTTGHTIERQYQSWLGGSILTSLGTFHQLWVGKKEYEEVGVERLLNDRFR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Actin
分子量 formula_weight	41735.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MDSEVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Chromatin modification-related protein EAF1
分子量 formula_weight	4882.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

THQNILLEEAKWMQADFKEGHKYKVAICTAMAQAIKDYWTY

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.700 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	4.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	63197

fit	/app/data/saxs_computation/y8/5y81/5y81.fit
pddf	/app/data/pr_computation/y8/5y81/5y81.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/y8/5y81/5y81.dat

NuA4 TEEAA sub-complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription-associated protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chromatin modification-related protein EAF1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chromatin modification-related protein EAF5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Actin-related protein 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Actin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)