SAXSdb — 5yud

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baculoviral IAP repeat-containing protein 1e

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Phase 2 flagellin,Flagellin × 1 （P06179,P52616） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8CGT2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1403； UniProt 1–1403

Phase 2 flagellin,Flagellin

Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)

UniProt P06179

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Baculoviral IAP repeat-containing protein 1e × 1 （Q8CGT2） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLIC_SALTY
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 32–75； UniProt 452–495

Phase 2 flagellin,Flagellin

Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)

UniProt P52616

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Baculoviral IAP repeat-containing protein 1e × 1 （Q8CGT2） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLJB_SALTY
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 4–25； UniProt 31–52

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5yud
沉积日期 deposition_date	2017-11-21
结构标题 title	Flagellin derivative in complex with the NLR protein NAIP5
关键词 keywords	Flagellin, NAIP5, NLRC4, Cryo-EM, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5yud__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5yud__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5yud__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	41.18 Å
Rg（电子密度）	41.09 Å
总 Rg	41.40 Å
原子数	10510
残基数	1313
排除体积	187770 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5yud__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Baculoviral IAP repeat-containing protein 1e
分子量 formula_weight	160018.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	10510

MAEHGESSEDRISEIDYEFLPELSALLGVDAFQVAKSQEEEEHKERMKMKKGFNSQMRSEAKRLKTFETYDTFRSWTPQEMAAAGFYHTGVRLGVQCFCCSLILFGNSLRKLPIERHKKLRPECEFLQGKDVGNIGKYDIRVKRPEKMLRGGKARYHEEEARLESFEDWPFYAHGTSPRVLSAAGFVFTGKRDTVQCFSCGGSLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLQSKKSSEEIAQYIQSYEGFVHVTGEHFVKSWVRRELPMVSAYCNDSVFANEELRMDMFKDWPQESPVGVEALVRAGFFYTGKKDIVRCFSCGGCLEKWAEGDDPMEDHIKFFPECVFLQTLKSSAEVIPTLQSQYALPEATETTRESNHGDAAAVHSTVVDLGRSEAQWFQEARSLSEQLRDNYTKATFRHMNLPEVCSSLGTDHLLSCDVSIISKHISQPVQEALTIPEVFSNLNSVMCVEGETGSGKTTFLKRIAFLWASGCCPLLYRFQLVFYLSLSSITPDQGLANIICAQLLGAGGCISEVCLSSSIQQLQHQVLFLLDDYSGLASLPQALHTLITKNYLSRTCLLIAVHTNRVRDIRLYLGTSLEIQEFPFYNTVSVLRKFFSHDIICVEKLIIYFIDNKDLQGVYKTPLFVAAVCTDWIQNASAQDKFQDVTLFQSYMQYLSLKYKATAEPLQATVSSCGQLALTGLFSSCFEFNSDDLAEAGVDEDEKLTTLLMSKFTAQRLRPVYRFLGPLFQEFLAAVRLTELLSSDRQEDQDLGLYYLRQIDSPLKAINSFNIFLYYVSSHSSSKAAPTVVSHLLQLVDEKESLENMSENEDYMKLHPQTFLWFQFVRGLWLVSPESSSSFVSEHLLRLALIFAYESNTVAECSPFILQFLRGKTLALRVLNLQYFRDHPESLLLLRSLKVSINGNKMSSYVDYSFKTYFENLQPPAIDEEYTSAFEHISEWRRNFAQDEEIIKNYENIRPRALPDISEGYWKLSPKPCKIPKLEVQVNNTDAADQALLQVLMEVFSASQSIEFRLFNSSGFLESICPALELSKASVTKCSMSRLELSRAEQELLLTLPALQSLEVSETNQLPEQLFHNLHKFLGLKELCVRLDGKPNVLSVLPREFPNLLHMEKLSIQTSTESDLSKLVKFIQNFPNLHVFHLKCDFLSNCESLMAVLASCKKLREIEFSGRCFEAMTFVNILPNFVSLKILNLKDQQFPDKETSEKFAQALGSLRNLEELLVPTGDGIHQVAKLIVRQCLQLPCLRVLTFHDILDDDSVIEIARAATSGGFQKLENLDISMNHKITEEGYRNFFQALDNLPNLQELNICRNIPGRIQVQATTVKALGQCVSRLPSLIRLHMLSWLLDEEDMKVINDVKERHPQSKRLIIFWKLIVPFSPVILE

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Phase 2 flagellin,Flagellin
分子量 formula_weight	7665.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

AAARLSSGLRINSAKDDAAGQAIANSGSGSGSRIEDSDYATEVSNMSRAQILQQAGTSVLAQANQVPQNVLSLLR

来源 Source

来源生物 organism	Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	99287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.28 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	626608

Flagellin derivative in complex with the NLR protein NAIP5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baculoviral IAP repeat-containing protein 1e

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Phase 2 flagellin,Flagellin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Phase 2 flagellin,Flagellin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5yud__assembly_1__model_1

5yud__assembly_1__model_1 | I(q)

5yud__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Flagellin derivative in complex with the NLR protein NAIP5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baculoviral IAP repeat-containing protein 1e

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Phase 2 flagellin,Flagellin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Phase 2 flagellin,Flagellin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5yud__assembly_1__model_1

5yud__assembly_1__model_1 | I(q)

5yud__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)