5zz9

Crystal structure of Homer2 EVH1/Drebrin PPXXF complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Homer protein homolog 2

Mus musculus

UniProt Q9QWW1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Peptide from Drebrin × 1 (Q16643) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Peptide from Drebrin × 1 (Q16643) water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Peptide from Drebrin × 1 (Q16643) water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HOME2_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 9–123; UniProt 1–115 作者链 B; PDB构建体 9–123; UniProt 1–115 作者链 C; PDB构建体 9–123; UniProt 1–115

Peptide from Drebrin

Homo sapiens

UniProt Q16643

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Homer protein homolog 2 × 1 (Q9QWW1) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Homer protein homolog 2 × 1 (Q9QWW1) water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Homer protein homolog 2 × 1 (Q9QWW1) water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DREB_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–22; UniProt 530–551 作者链 E; PDB构建体 1–22; UniProt 530–551 作者链 F; PDB构建体 1–22; UniProt 530–551

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5zz9
沉积日期 deposition_date2018-05-31
结构标题 titleCrystal structure of Homer2 EVH1/Drebrin PPXXF complex
关键词 keywordsPOLYPROLINE RECOGNITION, SIGNALING PROTEIN, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5zz9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5zz9__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5zz9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)15.86 Å
Rg(电子密度)14.43 Å
总 Rg15.62 Å
原子数1020
残基数133
排除体积17957 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5zz9__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5zz9__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 5zz9__assembly_3__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd5zz9a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.55.1 — PH domain-like
家族 Family familyb.55.1.4 — Enabled/VASP homology 1 domain (EVH1 domain)
结构域编号 domain_idd5zz9b_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.55.1 — PH domain-like
家族 Family familyb.55.1.4 — Enabled/VASP homology 1 domain (EVH1 domain)
结构域编号 domain_idd5zz9c_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.55.1 — PH domain-like
家族 Family familyb.55.1.4 — Enabled/VASP homology 1 domain (EVH1 domain)

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id5zz9A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)
结构域编号 domain_id5zz9B00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)
结构域编号 domain_id5zz9C00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

7. 引用文献 (1)