SAXSdb — 6bsb

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mucin-1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1041–1097 链 B； UniProt 1098–1152	片段：SEA domain, N-terminal 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）片段：SEA domain, C-terminal 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；Native crystals (see related entry) were used as seeds in a drop of 1:1 mix of the SeMet-derivative (9 mg/ml in 10 mM Tris-Cl, pH 7.4) and reservoir solution (0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 1.75 M sodium chloride, 0.2 M ammonium sulfate).	分辨率 1.60 Å R-free 0.222

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6BSB	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1SM3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE TUMOR SPECIFIC ANTIBODY SM3 COMPLEX WITH ITS PEPTIDE EPITOPE 提交 1997-12-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 139–151（13 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 1.95 Å R-free 0.283
6BSC Crystal structure of the Mucin-1 SEA domain 提交 2017-12-01	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1041–1097（57 aa）片段：SEA domain, N-terminal 链 B 1098–1152（55 aa）片段：SEA domain, C-terminal	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；Drop was a 1:1 mix of protein (10 mg/ml in 10 mM Tris-Cl, pH 7.4) and reservoir solution (0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 2.0 M sodium chloride)	分辨率 1.30 Å R-free 0.184
6FZQ Crystal structure of scFv-SM3 in complex with compound 3 提交 2018-03-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 141–146（6 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 EEN 2-deoxy-2-[(difluoroacetyl)amino]-alpha-D-galactopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PEG 3350 disodium hydrogen phosphate	分辨率 1.70 Å R-free 0.225
6FZR Crystal structure of scFv-SM3 in complex with compound 2 提交 2018-03-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 141–146（6 aa）片段：UNP residues 141-146	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 EEQ 2-deoxy-2-[(fluoroacetyl)amino]-alpha-D-galactopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PEG 3350 disodium hydrogen phosphate	分辨率 1.80 Å R-free 0.232
6TGG scFv-1SM3 in complex with glycopeptide containing an sp2-imino sugar 提交 2019-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 141–146（6 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 N8W ~{N}-[(6~{S},7~{R},8~{S},8~{a}~{R})-7,8-bis(oxidanyl)-3-oxidanylidene-1,5,6,7,8,8~{a}-hexahydro-[1,3]oxazolo[3,4-a]pyridin-6-yl]ethanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PEG 3350 disodium hydrogen phosphate	分辨率 2.00 Å R-free 0.237
7Q4I Crystal structure of DmC1GalT1 in complex with UDP-Mn2+ and the APD-TGalNAc-RP 提交 2021-10-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 141–146（6 aa）链 G 141–146（6 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；potassium thiocyanate, Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000	分辨率 2.40 Å R-free 0.235
7V4W Crystal structure of Antibody 16A in complex with MUC1 peptide 提交 2021-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 145–157（13 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；Di-sodium hydrogen phosphate 0.2M, PEG 3350 20%	分辨率 2.10 Å R-free 0.233
7V64 Crystal structure of Antibody 16A in complex with MUC1 Glycopeptide(GlycoT) 提交 2021-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 145–157（13 aa）	未记录	NGA 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% PEG 6000	分辨率 1.56 Å R-free 0.203
7V7K Crystal structure of Antibody 16A in complex with MUC1 Glycopeptide(GlycoST) 提交 2021-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 145–157（13 aa）	未记录	NGA 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.5, 20%(w/v) PEG 6000	分辨率 2.20 Å R-free 0.251
7V8Q Crystal structure of antibody 14A in complex with MUC1 Glycopeptide(GlycoT) 提交 2021-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 145–157（13 aa）	未记录	NGA 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；289 K；Crystal screen D4=JCSG F7, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 20% v/v 2-Propanol, 20% w/v Polyethylene glycol 4000	分辨率 3.20 Å R-free 0.244
7V8Q Crystal structure of antibody 14A in complex with MUC1 Glycopeptide(GlycoT) 提交 2021-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 145–157（13 aa）	未记录	NGA 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；289 K；Crystal screen D4=JCSG F7, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 20% v/v 2-Propanol, 20% w/v Polyethylene glycol 4000	分辨率 3.20 Å R-free 0.244
7V8Q Crystal structure of antibody 14A in complex with MUC1 Glycopeptide(GlycoT) 提交 2021-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 145–157（13 aa）	未记录	NGA 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；289 K；Crystal screen D4=JCSG F7, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 20% v/v 2-Propanol, 20% w/v Polyethylene glycol 4000	分辨率 3.20 Å R-free 0.244
7VAC Crystal structure of antibody 14A in complex with MUC1 glycopeptide(GlycoST) 提交 2021-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 145–157（13 aa）	未记录	NGA 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Sodium citrate pH 5.5, Isopropanol 10%, PEG 4000 20%	分辨率 3.50 Å R-free 0.219
7VAC Crystal structure of antibody 14A in complex with MUC1 glycopeptide(GlycoST) 提交 2021-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 145–157（13 aa）	未记录	NGA 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Sodium citrate pH 5.5, Isopropanol 10%, PEG 4000 20%	分辨率 3.50 Å R-free 0.219
7VAC Crystal structure of antibody 14A in complex with MUC1 glycopeptide(GlycoST) 提交 2021-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 145–157（13 aa）	未记录	NGA 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Sodium citrate pH 5.5, Isopropanol 10%, PEG 4000 20%	分辨率 3.50 Å R-free 0.219
7VAZ Crystal structure of antibody 14A in complex with MUC1 glycopeptide(GlycoS) 提交 2021-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 145–157（13 aa）	未记录	NGA 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Sodium citrate pH 5.5, Isopropanol 10%, PEG 4000 20%	分辨率 2.73 Å R-free 0.264
7VAZ Crystal structure of antibody 14A in complex with MUC1 glycopeptide(GlycoS) 提交 2021-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 145–157（13 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Sodium citrate pH 5.5, Isopropanol 10%, PEG 4000 20%	分辨率 2.73 Å R-free 0.264
7VAZ Crystal structure of antibody 14A in complex with MUC1 glycopeptide(GlycoS) 提交 2021-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 145–157（13 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Sodium citrate pH 5.5, Isopropanol 10%, PEG 4000 20%	分辨率 2.73 Å R-free 0.264
8AXH Crystal structure of a MUC1-like glycopeptide containing the unnatural L-4-hydroxynorvaline in complex with scFv-SM3 提交 2022-08-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 141–146（6 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PEG 3350 disodium hydrogen phosphate	分辨率 1.85 Å R-free 0.206
8P6I Crystal structure of the 139H2 Fab fragment bound to Muc1 peptide epitope 提交 2023-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 141–149（9 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；293 K；0.2M NaCl 20%w/v PEG 8K 0.1M Na Phos Cit pH 4.2	分辨率 2.50 Å R-free 0.254
8P6I Crystal structure of the 139H2 Fab fragment bound to Muc1 peptide epitope 提交 2023-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 141–149（9 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；293 K；0.2M NaCl 20%w/v PEG 8K 0.1M Na Phos Cit pH 4.2	分辨率 2.50 Å R-free 0.254
8S6K Crystal structure of ScFv-G2D11 complexed to a bis-Tn glycopeptide 提交 2024-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 127–133（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；lithium chloride Tris PEG 8000	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
8S6K Crystal structure of ScFv-G2D11 complexed to a bis-Tn glycopeptide 提交 2024-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 127–133（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；lithium chloride Tris PEG 8000	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
8S6T Crystal structure of Fab-3F1 complexed to a bis-STn glycopeptide 提交 2024-02-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 126–138（13 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Magnesium chloride hexahydrate calcium chloride dihydrate NDSB sodium HEPES MOPS ethylene glycol PEG 8000	分辨率 1.85 Å R-free 0.267
8S6V Crystal structure of Fab-2D9 chimera complexed to a bis-Tn glycopeptide 提交 2024-02-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 M 127–135（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；lithium sulfate Bis-Tris PEG 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.244
8S6V Crystal structure of Fab-2D9 chimera complexed to a bis-Tn glycopeptide 提交 2024-02-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 N 127–135（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 SO4 SULFATE ION × 3 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；lithium sulfate Bis-Tris PEG 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.244

共 17 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MUC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–57； UniProt 1041–1097 作者链 B； PDB构建体 1–55； UniProt 1098–1152

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6bsb
沉积日期 deposition_date	2017-12-01
结构标题 title	Crystal structure of the Mucin-1 SEA domain, L1105M mutant, Selenium-derivative
关键词 keywords	SEA domain Autoproteolysis MUC1, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	14.97 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	13.49 Å
零角强度 I(0) i0	3080730.00
分子量 molecular_weight	12284.0 kDa
排除体积 excluded_volume	15313 Å³
包络体积 envelope_volume	16872 Å³
水化壳体积 shell_volume	10885 Å³
包络直径 envelope_diameter	47.6 Å
壳层 Rg shell_rg	18.92 Å
包络 Rg envelope_rg	13.85 Å
形状 Rg shape_rg	13.51 Å
总 Rg total_rg	14.60 Å
总原子数 total_atoms	1686
残基数 n_residues	104
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	48.3 Å
Rg (实空间) rg_real	14.89 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.22 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.0810e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.4730e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	14.90 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	3081000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8869
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	18.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.207
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.301
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	448700.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.850; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.975

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mucin-1
分子量 formula_weight	6754.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1795

SFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Mucin-1
分子量 formula_weight	6176.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SVVVQLTMAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	64

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6bsbB00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	600 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	43.700 Å
晶胞边长 b length_b	43.700 Å
晶胞边长 c length_c	79.490 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.600 Å
最低分辨率 resolution_low	19.147 Å
R 因子 r_factor	0.1770
R_work r_work	0.1746
R_free r_free	0.2217

fit	/app/data/saxs_computation/bs/6bsb/6bsb.fit
pddf	/app/data/pr_computation/bs/6bsb/6bsb.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/bs/6bsb/6bsb.dat

Crystal structure of the Mucin-1 SEA domain, L1105M mutant, Selenium-derivative

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mucin-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)