6cj6

Structure of the poxvirus protein F9

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein F9

Vaccinia virus (strain Western Reserve)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 4 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 1,2-ETHANEDIOL × 9 GLYCEROL × 1 1,3-PROPANDIOL × 7 ETHANOL × 13 METHANOL × 8 S-1,2-PROPANEDIOL × 3 2-ETHOXYETHANOL × 2 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 1,2-ETHANEDIOL × 6 1,3-PROPANDIOL × 3 ETHANOL × 12 METHANOL × 3 S-1,2-PROPANEDIOL × 3 2-ETHOXYETHANOL × 3 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 TRIETHYLENE GLYCOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白单体	单体	蛋白 1	2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 1,2-ETHANEDIOL × 7 GLYCEROL × 4 1,3-PROPANDIOL × 2 ETHANOL × 10 METHANOL × 6 S-1,2-PROPANEDIOL × 1 2-ETHOXYETHANOL × 1 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 TRIETHYLENE GLYCOL × 3 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白单体	单体	蛋白 1	TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 1,2-ETHANEDIOL × 11 GLYCEROL × 1 1,3-PROPANDIOL × 2 ETHANOL × 12 METHANOL × 8 S-1,2-PROPANEDIOL × 3 2-ETHOXYETHANOL × 2 TRIETHYLENE GLYCOL × 1 HEXAETHYLENE GLYCOL × 3 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F9_VACCW
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–176； UniProt 1–176 作者链 B； PDB构建体 1–176； UniProt 1–176 作者链 C； PDB构建体 1–176； UniProt 1–176 作者链 D； PDB构建体 1–176； UniProt 1–176

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6cj6
沉积日期 deposition_date	2018-02-26
结构标题 title	Structure of the poxvirus protein F9
关键词 keywords	entry fusion complex associated protein, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6cj6__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6cj6__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6cj6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	17.61 Å
Rg（电子密度）	16.62 Å
总 Rg	18.02 Å
原子数	1470
残基数	165
排除体积	27206 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6cj6__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6cj6__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`6cj6__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`6cj6__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein F9
分子量 formula_weight	19635.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	6060

MAETKEFKTLYNLFIDSYLQKLAQHSIPTNVTCAIHIGEVIGQFKNCALRITNKCMSNSRLSFTLMVESFIEVISLLPEKDRRAIAEEIGIDLDDVPSAVSKLEKNCNAYAEVNNIIDIQKLDIGECSAPPGQHMLLQIVNTGSAEANCGLQTIVKSLNKIYVPPIIENRLPYYDP

来源 Source

来源生物 organism	Vaccinia virus (strain Western Reserve)
通用名 common_name	VACV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10254
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	TETRAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL
分子量 formula_weight	120.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	11

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	33

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	1,3-PROPANDIOL
分子量 formula_weight	76.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	ETHANOL
分子量 formula_weight	46.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	47

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	METHANOL
分子量 formula_weight	32.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	25

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	S-1,2-PROPANEDIOL
分子量 formula_weight	76.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	2-ETHOXYETHANOL
分子量 formula_weight	90.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL
分子量 formula_weight	208.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	TRIETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	150.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL
分子量 formula_weight	326.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	HEXAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	282.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 16 Entity 16 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	216

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晶胞边长 a length_a	65.450 Å
晶胞边长 b length_b	75.080 Å
晶胞边长 c length_c	136.250 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	38.860 Å
R 因子 r_factor	0.2279
R_work r_work	0.2257
R_free r_free	0.2685

Structure of the poxvirus protein F9

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein F9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6cj6__assembly_1__model_1

6cj6__assembly_1__model_1 | I(q)

6cj6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 non-polymer

实体 12 Entity 12 non-polymer

实体 13 Entity 13 non-polymer

实体 14 Entity 14 non-polymer

实体 15 Entity 15 non-polymer

实体 16 Entity 16 water

7. 引用文献 (1)

Structure of the poxvirus protein F9

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein F9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6cj6__assembly_1__model_1

6cj6__assembly_1__model_1 | I(q)

6cj6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 non-polymer

实体 12 Entity 12 non-polymer

实体 13 Entity 13 non-polymer

实体 14 Entity 14 non-polymer

实体 15 Entity 15 non-polymer

实体 16 Entity 16 water

7. 引用文献 (1)